Protein
Protein
PROTEIN
• Molekul yg sangat vital untuk
organisme terdapt di semua sel
• Polimer disusun oleh 20 mcm
asam amino standar
• Rantai asam amino dihubungkan dg
iktn kovalen yg spesifik
• Struktur & fungsi ditentukan oleh
kombinasi, jumlah dan urutan asam
amino
• Sifat fisik dan kimiawi dipengaruhi
oleh asam amino penyusunnya
• Reaksi kimia enzymes
• Immune system antibodies
• Mechanical structure tendons
• Generation of force muscles
• Nerve conduction ion channels
• Vision eye lens
• . . . and much more!
www.themegallery.com
ww.themegallery.com
STRUCTUR ASAM AMINO
Non-ionized form
H
O
Amino
group H2N C C Carboxyl
group
O
R H
Side chain
w
• Dua asam amino berikatan melalui suatu
ikatan peptida dengan melepas sebuah
molekul air. Reaksi keseimbangan ini
cenderung untuk berjalan ke arah
hidrolisis daripada sintesis.
• Beberapa asam amino, biasanya lebih dari
100 buah, dapat mengadakan ikatan
peptida dan membentuk rantai polipeptida
yang tidak bercabang.
www.themegallery.com
• Dalam teknologi pangan, asam amino
mempunyai beberapa sifat yang
menguntungkan maupun yang kurang
menguntungkan. Misalnya D-triptofan
mempunyai rasa manis 35 kali kemanisan
sukrosa, sebaliknya L-triptofan mempunyai rasa
yang sangat pahit. Asam glutamat sangat
penting peranannya dalam pengolahan
makanan, karena dapat menimbulkan rasa yang
lezat.
www.themegallery.com
• Asam amino endogen dapat dibentuk dalam
tubuh manusia, sedangkan 10 asam amino
eksogen tidak dapat dibentuk oleh tubuh
manusia, karena itu disebut asam amino
esensial, artinya harus didapatkan dari makanan
sehari-hari.
www.t
• merupakan unit penyusun
protein
• Struktur:
satu atom C sentral yang
mengikat secara kovalent:
– gugus amino,
– gugus karboksil,
– satu atom H dan
– rantai samping (gugus R)
www.themegallery.com
www.themegallery.com
PENGARUH GUGUS SAMPING (R)
• Asam amino bersifat : asam, basa dan netral
NHa – CH - COOH
CH2 – CH2 – COOH
(Glutamat) asam
NHa – CH - COOH
(CH2)4 – NH2
(Lisin) basa
NHa – CH - COOH
CH2OH
(Serin) netral
www.themegallery.com
• Asam amino yang menyusun
protein organisme ada 20
macam disebut sebagai asam
amino standar
• Diketahui asam amino ke 21
disebut selenosistein (jarang
ditemukan) Terdapat di
beberapa enzim seperti
gluthatione peroxidase
• Selenenosistein mempy kode
genetik: UGA biasa utk stop
kodon tjd pd mRNA dgn
struktur 2nd yg banyak.
www.themegallery.com
• Diklasifikasikan berdasar gugus R (rantai samping)
• Biasanya sifat-sifat seperti: hidrofobik/hidrofilik, polar/non
polar, ada/tidaknya gugus terionisasi
Polar Non
Polar
Aromatik
www.themegallery.com
• Memiliki gugus R alifatik
• Glisin, alanin, valin, leusin, isoleusin dan prolin
• Bersifat hidrofobik. Semakin hidrofobik suatu a.a spt
Ile (I) biasa terdapat di bagian dlm protein.
• Prolin berbeda dgn a.a siklis. Tapi mempunyai
byk kesamaan sifat dgn kelompok alifatis ini.
• Umum terdapat pada protein yang berinteraksi
dengan lipid
www.themegallery.com
www.themegallery.com
www.themegallery.com
• Memiliki gugus R yang tidak bermuatan
• Serin , threonin, sistein, metionin, asparagin,
glutamin
• Bersifat hidrofilik mudah larut dalam air
• Cenderung terdapat di bagian luar protein
• Sistein berbeda dgn yg lain, karena ggs R
terionisasi pada pH tinggi (pH = 8.3) sehingga dapat
mengalami oksidasi dengan sistein membentuk
ikatan disulfide
• (-S-S-) sistin (tdk tmsk dlm a.a. standar karena
selalu tjd dari 2 buah molekul sistein dan tidak
dikode oleh DNA)
www.themegallery.com
• Fenilalanin, tirosin dan triptofan
• Bersifat relatif non polar hidrofobik
• Fenilalanin bersama dgn V, L & I a.a plg
hidrofobik
• Tirosin gugus hidroksil , triptofan cincin indol
• Sehingga mampu membentuk ikatan hidrogen
penting untuk menentukan struktur ensim
• Asam amino aromatik mampu menyerap sinar UV λ
280 nm sering digunakan utk menentukan kadar
protein
www.themegallery.com
• Lisin, arginin, dan histidin
• Mempunyai gugus yg bsft basa pd rantai
sampingnya
• Bersifat polar terletak di permukaan protein dapat
mengikat air.
• Histidin mempunyai muatan mendekati netral (pd
gugus imidazol) dibanding
– lisin gugus amino
– arginin gugus guanidino
• Krn histidin dpt terionisasi pada pH mendekati pH
fisioligis sering berperan dlm reaksi ensimatis yg
melibatkan pertukaran proton
www.themegallery.com
• Aspartat dan glutamat
• Mempunyai gugus karboksil pada rantai
sampingnya bermuatan (-) / acid pada pH 7
www.themegallery.com
www.themegallery.com
• Merupakan asam amino
diluar 20 mcm as. Amino
standar
• Terjadi karena modifikasi
yang terjadi setelah suatu
asam amino standar
menjadi protein.
• Kurang lebih 300 asam
amino non standar
modifikasi serin yang
dijumpai pada sel
mengalami fosforilasi
oleh protein kinase
www.themegallery.com
• modifikasi prolin dlm proses
modifikasi posttranslasi, oleh
prokolagen prolin hidroksilase.
www.themegallery.com
•Modifikasi lisin. Terdapat di kolagen dan miosin (protein
kontraksi pd otot) dan berperan untuk sisi terikatnya
polisakarida
•Beberapa ditemukan asam amino nonstandar yang tidak
menyusun protein merupakan senyawa antara
metabolisme (biosintesis arginin dan urea)
www.themegallery.com
www.themegallery.com
STRUKTUR PROTEIN
Struktur primer
- sifat kovalen pada ikatan peptida stabil, tidak
dipengaruhi oleh : pH, pelarut.
- Atom-atom C, H, N terletak pada satu bidang datar
- R diproyeksikan pada arah tertentu pada bidang
Struktur sekunder
- Terbentuk karena ikatan hidrogen
- Bentuk spiral (α helix)
- Gugus karbonil dari setiap asam amino membentuk
ikatan hidrogen dengan gugus amino dari asam
amino ke tiga di sepanjang rantai polipeptida
www.themegallery.com
Struktur tertier
- Dibentuk oleh interaksi antara gugus samping (R) dari
asam – asam amino.
-Hasil interaksi : pelipatan α – helix struktur globular,
gugus R yang hidrofobik disembunyikan di dalam lipatan
protein menjadi sangat larut dlm air.
- Contoh : insulin, hemoglobin dan albumin telur
- Ditemukan : ikatan disulfida, jembatan garam, ikatan
hidrogen, atraksi hidrofobik.
Struktur Kuartener
– Struktur karena interaksi antara polipeptida satu
dengan yang lain
www.themegallery.com
www.themegallery.com
ENZIM
Bagaimana sel dapat mengendalikan sebagian
lintasan metaboliknya menjadi anabolik atau
katabolik, dan reaksi khusus mana yang akan
terjadi?
Contoh : hidrolase
Commision on Enzyme of International Union of
Biochemistry telah menetapkan tatanama yang
sistematik berdasarkan pada fungsinya
Protein terdiri dari satu atau lebih rantai polipeptida yang masing-
masing terdiri dari ratusan asam amino
www.the
www.themegallery.com