Pengantar Perkuliahan

Biokimia (PBO-6144)
Pertemuan 1

Fakultas Sains dan Teknologi

UIN Walisongo Semarang
2019

Oleh,
Abdul Malik, M.Si.
NIP. 198911032018011001
ABDUL MALIK, M.Si.
Dosen Biologi Fakultas Sains dan Teknologi UIN Walisongo Semarang

 TTL : Jepara, 3 November 1989

 TK Kemala Bayangkara Solok, Sumatera Barat pada
tahun 1996
 SD Negeri Wanusobo Kab. Jepara pada tahun 2002,
 MTs Matholi’ul Huda Bugel Kab. Jepara pada tahun 2005,
 MA-MAK Matholi’ul Huda Bugel Kab. Jepara pada tahun
2008,
 S1 di Fakultas Tarbiyah Jurusan Tadris Kimia dan meraih
gelar Sarjana S1 lulus pada tahun 2013.
 S2 melalui Program Beasiswa IsDB UIN Walisongo
Semarang 2014 di Program Magister Ilmu Lingkungan
Sekolah Pascasarjana Universitas Diponegoro Semarang
dengan bidang konsentrasi Rekayasa Lingkungan lulus
pada tahun 2017.
 2018 mengabdi di UIN Walisongo Semarang.
 Pengalaman Organisasi

1. Himpunan Mahasiswa Kimia sebagai Ketua tahun 2010

2. PMII Rayon Tarbiyah, Komisariat Walisongo, PC Kota Semarang tahun 2008-2013
3. HMJ Tadris sebagai Sekretaris tahun 2011
4. Racana Walisongo Semarang sebagai Bendahara tahun 2012
5. Ikatan Mahasiswa Kimia (IKAHIMKI Jateng) sebagai Koordinator Pengembangan
SDM tahun 2011-2012
6. Dewan Eksekutif Mahasiswa (DEMA Walisongo) sebagai Sekjend tahun 2012

Aktivitas Sekarang

Dosen Biologi Fordissa Institute Kota Semarang

 TODAY’S TOPICS
Apa yang akan kita capai hari ini?

2 5
1 Kontrak 4 Biokimia
Perkuliahan
Visi dan Misi UIN
Walisongo
Memahami kontrak 3 Mendiskripsikan
tentang Ilmu
perkuliahan, tata Rencana Materi
Biokimia
Memahami Visi tertib perkuliahan, Menjelaskan
dan Misi Institusi, dan prosentase Deskripsi Biokimia deskripsi
Fakultas, Prodi nilai akhir Memahami perkuliahan dan
Biologi diskripsi Mata materi
Kuliah Biokimia pembelajaran
biokimia
VISI DAN MISI INSTITUSI

1. UIN Walisongo Semarang

2. Fakultas Sains dan Teknologi

3. Prodi Biologi
 VISI & MISI UIN WALISONGO SEMARANG
Becoming the best campus Unity of Sciences

”Universitas Islam 1. Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran iptek

berbasis kesatuan ilmu pengetahuan untuk menghasilkan
Riset Terdepan lulusan professional dan berakhlak al-karimah;
Berbasis pada 2. Meningkatkan kualitas penelitian untuk kepentingan Islam,
Kesatuan Ilmu ilmu dan masyarakat;
3. Menyelenggarakan pengabdian yang bermanfaat untuk
Pengetahuan untuk pengembangan masyarakat;
Kemanusiaan dan 4. Menggali, mengembangkan dan menerapkan nilai-nilai
Peradaban pada kearifan lokal;
5. Mengembangkan kerjasama dengan berbagai lembaga
Tahun 2038”. dalam skala regional, nasional, dan internasional;
6. Mewujudkan tata pengelolaan kelembagaan professional
berstandar internasional.
 VISI & MISI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
Becoming the best campus Unity of Sciences

”Fakultas 1. Menyelenggarakan pendidikan sains dan teknologi

Terkemuka dalam berbasis kesatuan ilmu pengetahuan;
Riset dan 2. Mengembangkan sains dan teknologi melalui kajian dan
Pendidikan di riset yang inovatif secara berkelanjutan;
Bidang Sains dan 3. Menyelenggarakan program pengabdian yang responsif
Teknologi Berbasis terhadap permasalahan di masyarakat;
Kesatuan Ilmu 4. Menjunjung tinggi nilai-nilai kearifan lokal yang sejalan
Pengetahuan untuk dengan nilai-nilai Islam dan budaya luhur bangsa
Kemanusiaan dan Indonesia;
Peradaban pada 5. Mengembangkan kerjasama bidang sains dan teknologi
Tahun 2038”. yang saling menguntungkan dengan berbagai lembaga
dalam skala regional, nasional, dan internasional;
6. Mewujudkan tata kelola kelembagaan yang prima
berstandar nasional dan internasional.
 VISI & MISI PRODI BIOLOGI
Becoming the best campus Unity of Sciences

“Program Studi 1. Menyelenggarakan Pendidikan Biologi yang inovatif,

Pendidikan Biologi kreatif, dan bermakna berbasis kesatuan ilmu
yang Unggul dan pengetahuan.
Kompetitif dalam 2. Menyelenggarakan riset dalam bidang Pendidikan
Biologi berbasis kesatuan ilmu pengetahuan;
Riset Berbasis 3. Menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat
Kesatuan Ilmu sebagai implementasi hasil riset dan pengembangan
Pengetahuan untuk bidang Pendidikan Biologi yang berwawasan
pelestarian lingkungan;
Kemanusiaan,
4. Mengembangkan kegiatan pendidikan, penelitian dan
Peradaban dan pengabdian kepada masyarakat yang
Kelestarian berwawasan pada nilai-nilai kearifan lokal
Lingkungan Hidup 5. Melakukan kerjasama kemitraan dengan lembaga riset
pada Tahun 2038”. Biologi dan pendidikan Biologi di tingkat regional,
nasional, dan internasional;
6. Melaksanakan pelayanan akademik yang prima dan
Islami.
 TATA TERTIB & PROSENTASE NILAI

Tata Tertib Perkuliahan

1. Menggunakan pakaian yang rapi dan ropan

2. Tidak diizinkan menggunakan sandal jepit atau sepatu sandal
3. Toleransi keterlambatan miaksimal 15-20 menit
4. Jika berhalangan hadir harap disertai dengan surat izin/ keterangan sakit dari
dokter, jika dari orang tua atau wali (Tetap tidak terhitung menjadi presensi)
5. Melaksanakan kegiatan perkuliahan dengan baik dan tertib

Prosentase Nilai
Kontrak Perkuliahan : Kehadiran perkuliahan minimal 75 % sebagai syarat mengikuti
UAS
Kontrak Penilaian :
Keaktifan dan kuis (a) : 10 %
Tugas Individu (b) : 15 %
Tugas kelompok (c) : 20 %
Ujian Tengah Semester (d) : 25 %
Ujian Akhir Semester (e) : 30 %
Nilai Akhir = (a x 10%)+(b x 15%)+(c x 20%)+(d x 25%)+(e x 30%)
 Materi Perkuliahan 14 Topik
3 dari 14
NO Topik
1 1. Memahami visi misi institusi kontrak
perkuliahan, tata tertib perkuliahan,
dan prosentase nilai akhir.
2. Menguraikan deskripsi mata kuliah
biokimia.
3. Menguraikan secara umum rencana
pembelajaran biokimia yang akan
dilakukan selama satu semester.
4. Mendeskripsikan tentang ilmu biokimia
2 1. Menjelaskan air dan perannya dalam
kehidupan makhluk hidup.
2. Tinjauan umum sel
3 Karbohidrat
Materi Pembelajaran
1. Menyebutkan visi misi institusi (UIN, Fakultas dan Prodi)
2. Menjelaskan kontrak perkuliahan, tata tertib perkuliahan dan prosentase nilai
akhir mata kuliah biokimia.
3. Menjelaskan deskripsi perkuliahan dan materi pembelajaran biokimia.
4. Menemukan semangat dan kesulitan sebelum mempelajari konsep biokimia.
5. Menjelaskan tentang ilmu biokimia dan hal-hal yang akan dipelajari
1. Menjelaskan tentang molekul air.
2. Menyebutkan peran air bagi makhluk hidup.
3. Menjelaskan pengertian sel.
4. Mengidentifikasi karakteristik persamaan dan perbedaaan prokariotik dan
eukariotik.
1. Menjelaskan pengertian karbohidrat.
2. Menyebutkan jenis-jenis monosakarida, disakarida dan polisakarida serta
contohnya di alam.
3. Mempelajari manfaat karbohidrat bagi makhluk hidup
 Materi Perkuliahan 14 Topik
7 dari 14

4 Menjelaskan tentang lipid dan 1. Menjelaskan pengertian lipid.

jenis-jenis lipid 2. Menyebutkan jenis-jenis lipid.
3. Mempelajari manfaat lipid bagi makhluk hidup

5 Menjelaskan struktur dan jenis 1. Menjelaskan perbedaan asam amino dan protein.
asam amino serta protein 2. Menyebutkan jenis-jenis asam amino dan protein di alam.
3. Mempelajari manfaat asam amino dan protein bagi makhluk hidup

6 Menjelaskan enzim, penggolongan 1. Menjelaskan pengertian enzim dan manfaatnya bagi tubuh makhluk hidup.
dan kinerja enzim dalam 2. Menjelaskan penggolongan jenis enzim berdasarkan reaksi yang dikatalisis.
3. Menjelaskan struktur enzim dan kaitannya dengan model enzim.
mempercepat reaksi
4. Mengidentifikasi contoh jenis-jenis enzim di kehidupan sehari-hari.
5. Mempelajari prinsip kerja enzim dan faktor-faktor yang mempengaruhinya.

7 Menjelaskan mengenai struktur dan 1. Menjelaskan struktur dan fungsi DNA serta RNA.
fungsi asam nukleat (DNA & RNA) 2. Menjelaskan DNA kromosomal dan ekstrakromosomal.
3. Menyebutkan jenis-jenis RNA beserta fungsinya.
4. Membedakan Gen, DNA dan kromosom

8 UTS (UJIAN TENGAH SEMESTER)

 Materi Perkuliahan 14 Topik
11 dari 14
9 Menjelaskan mengenai vitamin
dan mineral serta manfaatnya
bagi tubuh makhluk hidup.
10 Menjelaskan metabolisme
karbohidrat
11 Menjelaskan metabolisme lipid
12 Menjelaskan secara singkat
jalur oksidasi asam amino,
produksi urea dan biosintesis
asam amino.
1. Menjelaskan pengertian vitamin dan mineral.
2. Menyebutkan jenis, sifat vitamin dan peranannya bagi makhluk
hidup.
3. Menyebutkan jenis dan peran mineral bagi tubuh makhluk hidup
1. Menjelaskan reaksi katabolisme karbohidrat dan
glukoneogenesis.
2. Menyebutkan hasil dari reaksi katabolisme karbohidrat dan
glukoneogenesis.
3. Menyebutkan lokasi berlangsungnya proses katabolisme
karbohidrat dan glukoneogenesis
1. Mempelajari β-oksidasi asam lemak dan produk pemecahan yang
dihasilkan.
2. Menjelaskan biosintesis asam lemak dan kolesterol dalam tubuh.
3. Menyebutkan lokasi berlangsungnya proses β-oksidasi asam
lemak dan biosintesis asam lemak dan kolesterol.
1. Menjelaskan secara singkat oksidasi asam amino.
2. Menjelaskan tahapan produksi urea.
3. Menjelaskan salah satu biosintesis asam amino.
 Materi Perkuliahan 14 Topik
14 dari 14
13 Menguraikan proses replikasi
DNA dan transkripsi RNA
14 Menguraikan proses sintesis
protein
15 Menjelaskan pengertian
metabolisme sekunder dan
kaitannya dengan metabolisme
primer, menyebutkan contoh-
contoh metabolit sekunder dan
fungsinya.
16
1. Menjelaskan secara singkat proses replikasi leading strand dan
lagging strand
2. Menjelaskan secara singkat proses transkripsi RNA.
3. Menyebutkan tempat terjadinya replikasi DNA dan proses
transkripsi RNA.
4. Pengantar amplifikasi DNA secara in vitro dengan metode
Polymerase Chain Reaction
1. Menjelaskan pengertian translasi atau sintesis protein.
2. Menjelaskan proses inisiasi, elongasi dan terminasi translasi atau
sintesis protein.
1. Menjelaskan pengertian metabolisme sekunder.
2. Menunjukkan hubungan metabolisme primer dan metabolisme
sekunder.
3. Menyebutkan contoh-contoh metabolit sekunder dan fungsinya
pada tumbuhan, hewan dan mikrobia.
UAS (UJIAN AKHIR SEMESTER)
NICE TO MEET YOU MYSTUDENT!
Thank you for coming today!

“BIOKIMIA”
How do you think about Biokimia?
Bio + Kimia or Biologi + Kimia = Biokimia
 Apa itu Biokimia?

Definisi:
Webster’s dictionary: Bios = Yunani, artinya “hidup” “Kimia mahluk hidup; Kimia yang
terjadi dan menjadi ciri kehidupan.”
Biokimia adalah kimia dari bahan-bahan dan proses-proses yang terjadi dalam tubuh
mahluk hidup; sebagai upaya untuk memahami proses kehidupan dari sisi kimia.
Pemahaman bentuk dan fungsi biologis dari sudut pandang kimia
Bertujuan untuk memahami interaksi molekul-molekul tak hidup yang menghasilkan
fenomena kompleks dan efisien yang menjadi ciri-ciri kehidupan serta menjelaskan
keseragaman kimia dari kehidupan yang beragam.
 Hal-hal yang dipelajari
Struktur kimia dan bentuk tiga dimensi molekul biologi
Interaksi antar biomolekul
Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel
Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel
Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan pengkoordinasian aktifitasnya
Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi
informasi genetika
 Sejarah Biokimia
Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk hidup.
Unsur kimia utama penyusun
mahluk hidup adalah bahan minor
penyusun kerak bumi (kandungan
utama 47% O, 28% Si, 7.9% Al, 4.5%
Fe, dan 3.5% Ca).

Enam unsur utama penyusun sel

hidup adalah: C, H, N, O, P, dan S.

99% penyusun sel adalah H, O, N, dan C

Unsur Elektron bebas Jumlah Fraksi
H 1 2/3
O 2 1/4
N 3 1/70
C 4 1/10
Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup memiliki berat atom yang rendah; H, O,
N dan C adalah unsur dengan berat atom relatif paling kecil yang masing-masing
mampu membentuk ikatan tunggal, rangkap, rangkap 3 dan rangkap 4.

Unsur dengan berat atom paling ringan

membentuk ikatan paling kuat
 Sejarah Biokimia
Kemudian, identifikasi tipe molekul yang ditemukan dalam mahluk hidup

Asam Amino

Nukleotida

Karbohidrat

Lipida
 Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya

Kimia Organik yang mempelajari sifat-sifat biomolekul.

Biofisika, yang memanfaatkan teknik-teknik fisika untuk
mempelajari struktur biomolekul.
Nutrisi, yang memanfaatkan pengetahuan tentang
metabolisme untuk menjelaskan kebutuhan makanan bagi
mahluk hidup mempertahankan kehidupan normalnya.
Kesehatan, yang mencari pemahaman tentang keadaan
sakit dari sudut pandang molekular.
 Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya
Mikrobiologi, yang menunjukkan bahwa organisme sel
tunggal dan virus cocok untuk digunakan sebagai sarana
mempelajari jalur-jalur metabolisme dan mekanisme
pengendaliannya.
Fisiologi, yang mempelajari proses kehidupan pada
tingkat jaringan dan organisme.
Biologi sel, yang mempelajari pembagian kerja biokimia
dalam sel.
Genetika, yang mempelajari mekanisme penyusunan
identitas biokimia sel.
 REFERENSI BIOKIMIA

1Harold, H., Craine, L.E., and Hart D.J. 2003. Kimia Organik (Terjemahan). Erlangga: Jakarta.
2Murray, R.K., Bender, D.A., Botham, K.M., Kennelly, P.J., Rodwell, V.W., and Weil, P.A. 2012.

Biokimia Harper (Terjemahan). Edisi 29. Penerbit Buku Kedokteran EGC: Jakarta.
3Nelson, D.L. dan Cox, M.M. 2008. Lehninger Principles of Biochemistry. Fifth Ed. W.H.

Freeman and Company: New York.

4Poedjiadi, A., dan F.M. Titin Supriyanti. 1994. Dasar-Dasar Biokimia. UI-Press: Jakarta.
5Sinaga, E. 2012. Biokimia Dasar. PT. ISFI Penerbitan: Jakarta.
6Voet, D., Voet, J.G., and Pratt, C.W. 2013. Principles of Biochemistry (International Student

Version). John Wiley & Sons, Inc.:

Singapore.
7Michal, G., and Schomburg, D. 2012. Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and

Molecular Biology. Second Ed. John Wiley

and Sons: Canada.
8Nirwana, R.R. 2015. Unity of Science Dalam Biokimia Biomolekul. CV. Karya Abadi Jaya:

Semarang.
That’s all. Thank you!  Any Questions?