LAPORAN HASIL PRAKTIKUM

KIMIA MEDISINAL

PREDIKSI TOKSISITAS DAN SIFAT

FARMAKOKINETIKA OBAT
TUJUAN DAN TEORI
TEORI
■ Program pkCSM oline adalah salah
satu program komputer online yang
TUJUAN digunakan untuk mempredksi sifat
■ Mampu memprediksi sifat farmakokinetika dan toksisitas dari
farmakokinetika dan toksisitas obat senyawa atau obat melalui pendekatan
dengan menggunakan program graph-based signatures berdasarkan
pkCSM online prediksi regresi dan model klasifikasi,
serta sudah banyak jurnal internasional
bereputasi yang menggunakan prediksi
online tersebut.
■ Keuntungan dari penggunaan program
in silico yaitu mampu mengurangi risiko
kegagalan serta membutuhkan waktu
yang lebih pendek untuk penemuan
obat jika dibandingkan dengan cara
tradisional.
 CARA KERJA
Gambar struktur 2D senywa Ubah gambar struktur
Simpan dalm bentuk
yang akan diprediksikan 2D menjadi 3D dengan Buka internet, ketik Klik
SD file,
dengan program ChemDraw program ChemDraw pkCSM predict
beri nama
16.0 16.0

Klik browse, cari Pindah tanda • dari Ketik online

Keluar struktur dalam Klik translate ,
file SD yang sudah Display on screen ke SMILES
bentuk SMILE klik here !
diberi nama, OPEN SMILE txt file Translator

Blok struktur , klik Buka program Paste pada kotak Klik ADMET, keluar data
kanan, copy pkCSM, predict kosong ADMET
HASIL
Sifat Farmakokinetik N-Benzoyl-N’-(4- Isoliquiritigenin
dan Toksisitas fluorophenyl)thiourea
Data dari jurnal Hasil Praktikum
Caco-2Permeability 1,366 (Log Pappp in 10−6 cm/s) 0,955 (Log Papp in 10−6 1,031 (Log Papp in 10−6
cm/s) cm/s)
Intestinal Absorption 89,798 % 91,096 % 88,395 %
(Human)
Volume Distribusi SS -0,176 (Log L/kg) 0,485 (Log L/kg) -0,208 (Log L/kg)
(Human)
Blood Brain Barrier 0,359 (Log BB) -0,717 (Log BB) -0,723 (Log BB)
Permeabillity
CYP2D6 Inhibitors TIDAK TIDAK TIDAK
CYP3A4 Inhibitors YA TIDAK YA
Renal OCT2 Substrate TIDAK TIDAK TIDAK
Total Clearance -0,431 (Log ml/min/kg) 0,087 (Log mg/kg/hari) 0,121 (Log ml/min/kg)
Rat LD50 2,092 1,048 2,035 (mol/kg
Ames Toxicity TIDAK TIDAK TIDAK
Hepatotoxicity TIDAK TIDAK TIDAK
PEMBAHASAN

 Pada praktikum kali ini dilakukan pencarian data ADMET suatu obat atau senyawa
menggunakan program pkCSM online.
 Senyawa yang akan dicari data ADMET nya yaitu
 a. N-Benzoyl-N’-(4-fluorophenyl) thiourea
 b. Senyawa dari hasil penulusan jurnal oleh masing-masing mahasiswa
(Isoliquiritigenin)
 Kategori beberapa data ADMET menurut Pires, D.E.V :
 Caco-2 permeability > 0,9 (high)
 Intestinal absorption < 30% (poorly absorbed)
 VDss (human) < 0,71 L/kg ( log VDss < -015 ) (low)
VDss (human) > 2,81 L/kg ( log VDss >0,45 ) (high)
 BBB permeability
Log BB > 0,3 (readly cross the blodd brain barrier)
Log BB < -1 (poorly distributed to the brain)
Hasil data ADMET pada N-Benzoyl-N’-(4-fluorophenyl) thiourea :
Caco-2 permeability tinggi
 Intestinal absorption baik
VDss (human) rendah
BBB permeability baik
 Tidak menghambat kerja pada sitokrom CYP2D6 dan menghambat kerja sitokrom CYP3A4
 Tidak bersifat toksik terhadap Hepar dan Ames

Hasil data ADMET pada senyawa Isoliquiritigenin :

Caco-2 permeability tinggi
 Intestinal absorption baik
VDss (human) rendah, namun data dari peneliti nilai VDss tinggi
BBB permeability sedang
 Tidak menghambat kerja pada sitokrom CYP2D6
 Menghambat kerja pada siktokrom CYP3A4, namun pada data dari peneliti berbeda
 Tidak bersifat toksik terhadap Hepar dan Ames
 Hasil LD50 berbeda signifikan
Perbedaan data ADMET senyawa Isoliquiritigenin dari hasil peneliti dan praktikan dapat dikarenakan oleh :
• Program yang digunakan berbeda, peneliti menggunakan ChemDraw versi 12 sedangkan praktikan versi 15
• Peneliti menggunakan program PubChem untuk mengunduh kode SMILE dari senyawa Isoliquiritigenin
sedangkan praktikan menggunakan program online SMILE translator untuk mendapatkan kode SMILE
Isoliquiritigenin.

KESIMPULAN

• Program pkCSM online terbukti mampu memprediksi sifat farmakokinetik dan toksisitas obat
secara cepat dan mudah
• Perbedaan hasil data ADMET peneliti dengan praktikan dikarenakan adanya perbedaan data
SMILES yang digunakan serta program yang digunakan.
 DAFTAR PUSTAKA
Tutorial Program ChemDraw dan Chem3D
Pires, D.E.V., Blundell, T.L., and Ascher, D.B., 2015. “pkCSM Predicting Small-Molecule Pharmacokinetic and Toxicity
Properties Using Graph-Based Signatures”. Journal of Medicinal Chemistry, 58, PP. 4066-4072
Hariz, F. 2019. “Uji Sitotoksik, Toksisitas, dan Prediksi Sifat Fisika Kimia Senyawa Isoliquiritigenin dan Oxyresveratrol
terhadap Reseptor B-Cell Lymphoma 2(4AQ3) dan Vaskular Endhohelial Growth Factor Receptor-2 (2RL5)
Sebgai Terapi Aknker Serviks secara In Silico”. Malang : UIN Maulana Malik Ibrahim.
Hardjono, S., Siswandono, S., & Andayani, R. (2018). Evaluation of N-benzoylthiourea derivatives as popssible
analgesic agents by predicting their hysicochemical and pharmacokinetic properties, toxicity, and analgesic activity.
Indonesian Journal of Biotechnology, 22(2), 76. https://doi.org/10.22146/ijbiotech.27171