Bagian Biokimia
Fakultas Kedokteran Unhas
Topik Pembahasan
• Pendahuluan
• Gugus Fungsi Biomolekul
• Penyusun Biomolekul (Makromolekul)
– Building blocks karbohidrat
– Building blocks lipid
– Building blocks asam nukleat
– Building blocks protein
• Tingkatan Struktur Protein
• Isolasi Biomolekul
Pendahuluan
Komposisi Kimia Sel
Pendahuluan
Pembentukan senyawa/biomolekul melalui pembentukan ikatan kovalen
dan berbagai interaksi lemah (nonkovalen) antaratom/unsur
Pendahuluan
Pendahuluan
Biomolekul: molekul kehidupan yang
utamanya ada pada sel hidup
kemampuan pembentukan ikatan kovalen
dari C, H, O, dan N (P, S) karbohidrat,
lipid, asam nukleat, dan protein
C H O N S P
• Komposisi
– Basa nitrogen
– Ribosa/deoksiribosa
– Phosphate
Building blocks asam nukleat
Nucleotides, DNA, and RNA
Building Blocks Protein
Asam amino: monomer penyusun protein
• R Polar Bermuatan:
– Residu di permukaan eksterior
– Tersolvasi oleh H2O (muatan yang
berlawanan mudah terpisah tetapan
dielektrik tinggi)
– interior jembatan garam
• R Polar Netral:
– Gugus fungsi (–OH, –SH, NH, CO)
membentuk ikatan hidrogen dengan air
– Terekspose ke pelarut
– Interior ikatan hidrogen dengan
gugus polar lainnya
• Hidrofobik (apolar):
– Hidrokarbon (aromatik dan alifatik)
tidak dapat membentuk ikatan hidrogen
dengan air.
– Aromatik ring-ring interaction
– Berada dalam interior protein (tidak
terekspose dengan pelarut)
Sifat-sifat Asam amino
• Jumlah asam amino banyak: 20 jenis asam amino
pembentuk struktur protein, ada asam amino tidak
ditemukan dalam protein, ada asam amino yang
dimodifikasi setelah membentuk protein (O-
fosfoserin, 4-hidroksiprolin, d-hidroksilisin, tiroksin,
asam g-karboksiglutamat)
• Asam L-amino adalah molekul pembentuk struktur
protein; dikelompokkan berdasar rantai samping
(alifatik/siklik, aromatik, hidroksil/sulfur, basa, asam
dan amidanya)
• Dalam pangan, asam amino diklasifikasikan sebagai
asam amino esensial (tidak dapat disintesis dalam
tubuh; F, H, I, K, L, M, R, T, W, dan V) dan asam
amino non esensial.
Tingkatan Struktur Protein