PENGAPLIKASIAN SEQUENCE DNA

1. Zera Fatma Syahada (2240017035)

1. BUKA “ GOOGLE”
2. Buka https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
3. Tentukan, dan ambil jurnal yang akan
digunakan
4. Dan tentukan jurnal dengan gen yang sama
dengan tahun yang berbeda
5. Klik “FASTA”
PENGGUNAAN APLIKASI CLUSTAL OMEGA
1. Buka
http://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:https://
www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/
2. Blok bagian DNA yang akan digunakan
3. Masukkan DNA yang akan digunakan kedalam
sequence,begitu juga DNA yang kedua
4. Klik submit
5. Setelah itu,muncul sequence yang sudah
dimasukkan
PENGGUAAN APLIKASI MEGA
1. KLIK “ SEND TO”
2. KLIK “ File “ kemudian “Create File”
3. Buka hasil download yang sudah di create
file
4. Klik bagian ini
5. Masukkan sequence yang kedua
6. Klik “sequence 1” lalu klik “shift”
kemudian klik “ sequence ke 2 dan ke 3 “
7. Klik “Aligment”
8. Klik “ Align by ClustaW”
9. Klik “ OK “
10. Klik “Data”, lalu klik “Export Aligment”
kemudian “MEGA Format”
11. Klik “save” dan simpan data
LANGKAH MEMBUAT POHON PHYLOGENY
12. Klik menu utama. Kemudian klik
“PHYLOGENY” kemudian klik baris pertama
13. Masukkan data yang sudah tersimpan
14. Klik data yang digunakan, kemudian
“open”
15. Lalu klik kedua bagian tersebut
16. Klik atau masukkan datayang sudah
disimpan
17. Klik “OK”
18. Akan muncul pohon phylogeny
19. Klik “file” lalu klik “save”
18. Simpan data