Biokim 1
Biokim 1
KARBOHIDRAT
1.1. Komponen penyusun utama : Unsur C, H, O
Pentosa Heksosa
Lisosa Glukosa Sukrosa/sakarosa A. Pati :
Idosa D. Gum
Gulosa E. Glikogen
Altrosa F. Selulosa
Alosa G. Kitin
Konfigurasi aldoheksosa
CHO
H OH
CH 2O H
D-glisera ldehida
CHO CHO
H OH HO H
H OH H OH
CH2 OH CH 2O H
D-eritrosa D-treosa
H OH H OH HO H HO H
H OH H OH H OH H OH
Lisosa hemiasetal
lilosa
O OH
HC HC
CH 2OH H
O
HC OH HC O OH H
OH H OH
HO CH HO CH
H OH
HC OH HC
silosa
CH2 OH CH 2OH
Silosa hemiasetal
silosa
O OH
HC HC
HO CH HO CH O CH2 OH H
O
HO
HC OH HC H OH
OH OH H
HC OH HC
Arabinosa
CH 2O H CH2 OH
Arabinosa hemiasetal
arabinosa
OH
O
HC HC
CH2 OH H
HC OH HC OH O
O
HC OH HC OH
H OH
HC OH HC OH OH
CH 2O H CH 2O H Ribosa
h emia seta l
ribosa ribosa
MONOSAKARIDA
H OH H H OH H OH
OH
OH OH H H OH H H
OH
Ribosa Arabinosa Xilosa Lixosa
CH 2 OH CH 2 OH
CH 2 OH CH 2 OH
O H OH O H
O H H O H H
H
H H H OH
OH H OH OH
OH OH H OH
OH OH OH OH
OH OH OH H
H OH H H
CH 2 OH CH 2 OH CH 2 OH
CH 2 OH
H O H O H O H
H OH O H OH
H H H OH OH OH
OH H
OH OH OH OH
OH H OH H
OH OH OH H H H
H OH
alf a-(D)-Alosa alf a-(L)-Altrosa alf a-(D)-Galaktosa alf a-(L)_talosa
HOH2 C
DISAKARIDA O H
OH H H
H
HO H
OH H
OH
H OH beta galaktosa H OH
OH H
H O HO O H
HOH2 C H OH
HOH 2C
H O OH
H O H
H CH 2OH
HO H
LAKTOSA
OH
OH 1,4-beta galaktosa
H OH alf a glukosa
CH2 OH
CH2 OH
CH2OH CH2OH
H O H
H O H
H OH
OH
OH H
OH
O O
H OH
CH 2OH H OH O
OH
O
H O
HO H
H
OH OH
H
OH
OH O OH
CH 2OH OH
OH
H O
H OH
CH2 OH OH
CH2 OH
H O H
OH H
OH
H OH
OH H
O OH
H OH
H
H O H
CH2 OH
Selebiosa
1,4-beta-
HC=O
CH2 OH H OH
alfa glukosa
H O H
HO H
H
OH H
HO H
OH OH
H OH H OH
CH2 OH
CH 2OH
OH O OH
CH2 OH
H
OH H O
H H
H H H
OH H
H OH
beta galaktosa OH
CH2 OH H OH
laktosa
O O
OH 1,4-beta galaktosa
H
OH H
H H
H OH
Polisakarida CH 2 OH
O
OH CH 2OH CH 2OH
OH O O O
OH OH OH
CH 2 OH CH 2 CH 2 OH OH O O
CH 2 OH CH 2 OH CH2OH CH 2 OH
O O O O O OH OH
O O
OH OH OH CH 2OH H 2C
OH OH OH OH
O O O O O O
O O O O
OH OH OH OH OH OH
OH OH OH
OH O O
OH OH
O O O O O CH 2OH H2 C
OH OH OH OH OH O O
OH OH OH OH
OH O O
OH OH
Amilosa
1,4-alfa-glukosa
Inulin
1,6-alfa-glukosa (Mr =
5000
CH 2OH
O
OH
OH O
OH
Glikogen
1,4-alfa-glukosa, cabang-1,6-alfa lebih banyak daripada amilopektin
Histidin His NH 2
Aspartat Asp
O O
H2N CH C OH
H 2N CHC OH
CH 2
CH 2
N C O
NH
OH
Isoleusin Ile Asparagin Asn
O O
H 2N CH C OH
H 2N CH C OH
CH CH 3
CH2
CH 2
C O
CH 3
NH2
Leusina Leu Cysteina Cys
O
O
H2N CH C OH
CH2 H 2N CH C OH
CH CH 3 CH2
CH3 SH
Nutrisi/ Kode Struktur Nutrisi/ Kode
asam singkat asam singkat Struktur
amino an amino non an
esensial esensial
Lisina Lis O
Glutamat Glu
O
H2 N CHC OH
CH2 H 2N CHC O H
CH 2
CH2
CH2 CH 2
CH2 C O
NH2 OH
Phenilalanina Phe O
Glisina Gli
H 2N CHC OH O
CH2
H 2N CH C OH
H
Treonina Thr O Tyrosina Tyr O
H2 N CH C OH
H 2N CH C OH CH 2
CH OH
CH 3
OH
Nutrisi/ Kode Struktur Nutrisi/ Kode
asam singkata asam singkata Struktur
amino n amino non n
esensial esensial
Triptophan Trp Prolina Pro
O O
H 2N CHC OH C OH
CH 2
HN
HN
Valina Val Serina Ser
O O
H 2N CH C OH H 2N CH C OH
CH CH 3 CH 2
CH 3 OH
2.4. Struktur
Protein
1. Primer
2. Sekunder
3. Tersier
4. Kuarterner
Struktur primer, tersusun satu unit asam amino dengan asam amino
lainnya.
Struktur Kuarterner, tersusun dari primer, sekunder dan tersier yang hanya
melibatkan satu rantai polipeptida.
Contoh
H 2N H2
C
C HH 22N
O C
CH
Gln
C HO
O C
O CH 2
HO CH2 NH 2
CH
H 2 NH Glu
C HO C
CH O
Glu H N
2 Tyr C
O
H2 C
CH O CHHN
2
C CH
H2 C Tyr
C HO HO C
HO O C H2 O
NH H2 NH C
CH C
H2 C C O O C O CH 2
CH CH2HN
Glu
C CH Glu
Tyr HO NH O C
CH O
O O
Glu H 2H
C
2C C
O O H
C
HO O H H
O
O O O O O
H O H H H H
H 2N CH C N CH C N CHC N CH C N CH C N CHC N CH C
CH 2 CH 2 CH 2 CH2 CH 2 CH 2
CH 3 CH 2
CH 2 C O CH2 N SH
NH C O NH
Ala OH
C NH
OH
Cys
NH 2
Asp Phe His
Arg Glu
1.5. Denaturasi Protein
Val O Gly
Lys
O
HN C
H 2 H 2 H2 H2 H H2
H3C CH CH CH C C C C N C C N
O
NH CH2 OH
H 3C C O CH2
O H O H
HO P OH H H
HO H
OH H OH H
O O O
O
HO H OH
(CH 2) 14 -CH2 CH OH H OH
2 CH2 OH
H 2C O C CH 2OH glikogen
H O H O H
H H O H
as. palmitat O H H H
H2 OH H OH H OH H
HOC O C (CH 2)14 C O O O O
H HO H OH
H OH CH 2OH
H 2C O C
H O H
(CH 2) 14 -CH2 O H
O OH H
OH O
HO P OH CHOH
OH H
OH
O C NH 2 H O H
O H
CH CH3 OH H
H2 O
HN C C CH 2-CH 2-CH 2-CH 2 -NH C C N CH 2
H H OH
H O O
Val O H H
O Lys HO H
Gly
OH
H OH
BAB 3
LEMAK
3.2. Fungsi
1. Asam lemak jenuh, yaitu asam lemak yang memiliki ikatan tunggal atara
karbon yang satu dengan karbon lainnya.
2. Asam lemak tidak jenuh, yaitu asam lemak yang memiliki ikatan rangkap dua
atau rangkap tiga dan juga ikatan tunggal.
Beberapa contoh:
Asam Lemak Jenuh Asam Lemak tidak Jenuh
As. miristat/as. tetradekanoat As. Palmitooleat/as. cis-9
CH3(CH2)12COOH heksadekanoat,
CH3(CH2)5CH=CH (CH2)7COOH
As. Palmitat/asheksadekanoat As. Oleat/as. cis-9-Oktadekanoat
CH3(CH2)14COOH CH3(CH2)7CH=CH (CH2)7COOH
As. stearat/as.oktadekanoat As. linoleat/as.cis,cis-9,12-
CH3(CH2)16COOH oktadekadienoat
CH3(CH2)4CH=CHCH2CH=CHCH2-
(CH2)7COOH
BAB 4
ENZIM
4.1. Fungsi
1. Konsentrasi enzim
2. Konsentrasi subtrat/bahan makanan
3. Suhu
4. pH (optimal pH 5-9)
4.4. Kalsifikasi enzim
3. Hidrolase, untuk kat. Pemutusan ikatan atom C-dgn atom lain, dengan adanya air
(mis. Esterase, peptidase, amylase, fosfatase, pepsin, tripsin, kimotripsin, urease)
4. Liase, untuk kat. Pemutusan ikatan atom C-C, C-S, C-N (mis. Dekarboksilase,
aldolase, sitrat liase, dehidratase)
5. Isomerase, untuk kat. Geometric dan redoks tertentu. (epirase, rasemase, mutase
6. Ligase, Utk kat. pembentukan iktn C-O, C-S, C-N & C-atom lain
4.5. Regulasi aktivitas enzim
Contoh :
Amoxicillin, pensilin utk Steptomisyn,
menghambat kerja enzim utk menghambat aktivitas
sint. Dinding sel bakteri ribosom bakteri dg cara
CH3 mengikat sint. Protein
CH3
S H 2N C NH
CH3
NH2 O HO NH
H NH
H
O
O
HO C C N N COOH H 2N C N O C
H
H HO OH O
OH
H
amoxicicillin O H 3C N O
CH 2OH
HO
OH
Streptomisin
Lovastatin, HO O O
O O CH 3
HN
H 3C CH2
O H 2C O N
H O
CH3 HOH2 C
H 3C
H H
ZIDOVUDIN
N3
H 3C H HO H
Sumber bahan alam Manfaat Kelompok
senyawa
dominan/bhn aktif