ALKALOID: INDOL

STREPTOMYCES
SP.CT37
Kelompok 5
 Anggota
Nabillah Yusna (11170162000001)
Ulfah Nur Sarifah (11170162000014)
Nira Nidaul Zannah (11170162000010)
Madroup (11170162000020)
Erica Anna Pratiwi (11170162000027)
Aulia Nisa Amanda (11170162000032)

Semangat belajar daring guys

01
PENDAHULUUAN
 Latar Belakang

Alkaloid indol merupakan Microbial natural products Streptomyces merupakan

golongan yang paling (NPs) mencakup beberapa sebuah sumber daya alam
beragam dan rumit , struktur molekul yang yang memberikan
mengandung obat penting bernilai tinggi seperti kontribusi hingga 75%
seperti reserpina dan antibiotik, antikanker dan sebagai antibiotik untuk
vinkristina. obat antioksidan. penggunaan klinis.
 Latar Belakang
Empat senyawa diisolasi dari ekstrak
Streptomyces sp.CT37 menggunakan uji
bioassay dengan isolasi Molecular
Networking (MN). Struktur lengkapnya
diperoleh dari high-resolution electrospray
ionization mass spectrometry serta data
NMR 1D dan 2D
Isolasi yang ditargetkan tersebut
menghasilkan empat senyawa,
yaitu: legonimida 1, 1H-indol-3-
karbaldehida 2,
aktinopolimorfol B 3, dan (2R,
3R) -1-fenilbutana-2,3-diol 4.
 Rumusan dan Tujuan

Rumusan Masalah Tujuan

1. Bagaimana latar belakang
Streptomyces sp. CT.37?
2. Apa saja senyawa metabolit sekunder
yang dihasilkan dari Streptomyces sp.
CT.37?
3. Apa uji bioaktivitas yang dilakukan
pada penelitian ini?
4. Apa alkaloid yang terkandung pada
Streptomyces sp. CT.37?
1. Mengetahui latar belakang Streptomyces sp.
CT.37
2. Mengetahui senyawa metabolit sekunder
yang dihasilkan dari Streptomyces sp. CT.37
beserta strukturnya
3. Mengetahui proses uji bioaktivitas yang
dilakukan pada isolasi Streptomyces sp.
CT.37
4. Mengetahui indol alkaloid yang terkandung
pada Streptomyces sp. CT.37.
 Metode Penelitian
Penelitian ini berdasarkan metode
uji bioassay menggunakan High-
Resolution Electrospray Ionization
Mass Spectrometry (HR-ESIMS)
dan High Pressure Liquid
Chromatography (HPLC).
Molecular Networking (MN) database.
Database MN adalah server berbasis
web yang sangat berguna untuk
dereplikasi struktur produk alami
dengan membandingkan kedua
spektrum HR-ESIMS (MS / MS)
eksperimental dengan data dari
database. Metode ini berguna untuk
melihat efektivitas dereplikasi pada
suatu metabolit.
02
Pembahasan
Taksonomi Streptomyces sp.
● Kingdom : Bacteria
● Filum : Actinobacteria
● Kelas : Actinobacteria
● Ordo : Actinomycetales
● Famili : Streptomycetaceae
● Genus : Streptomyces
● karakteristik: :Karateristik
Streptomyces yang lain
adalah koloni mereka yang
keras, berbulu dan
tidak/jarang
berpigmen
Latar Belakang Tumbuhan Streptomyces sp.

Streptomyces merupakan bakteri yang dapat menghasilkan spora

yang habitatnya berada di dalam tanah. Bakteri ini nonmotil dan
berfilamen. Selain dapat ditemukan pada tanah, bakteri ini juga
dapat ditemukan pada tumbuhan yang membusuk (Madigan,
2006).
Senyawa Metabolit Sekunder
1. Legonimida
Senyawa 1 diisolasi sebagai
padatan amorf kuning pucat.
Gambar diatas menunjukkan
struktur kimia dari isolasi
senyawa tersebut. Spektrum
HR-ESIMS menunjukkan
puncak pada m / z 293,1280 [M
+ H]+ sesuai dengan rumus
molekul C18H16N2O2 memiliki
12 derajat ketidakjenuhan.
 1. Legonimida
Spektrum 1H-NMR menunjukkan
adanya dua proton NH (δH 7,37,
10,96), dua metilen sp3 (δH 3,35,
3,46), sembilan metin aromatik (δH
7,54, 7,34, 7,31, 7,28, 7,28, 7,21,
7,21, 7,06, dan 7,02), dan satu
metina sp2 (δH 7.18).
Analisis 13C-NMR dan spektra
HSQC (heteronuclear single
quantum coherence)
mengungkapkan keberadaan enam
karbon kuartener, termasuk dua
karbonil (δC 173.1, 172.3) dan
empat gugus aromatik (δC 136.6,
136.5, 127.3, dan 109.2).
 1. Legonimida
Analisis dari spektrum 2D-NMR
mengungkapkan adanya 4 substruktur
(A-D): A. 3H-indol tersubtitusi, B.
Gugus asetil, C. Subunit asetamida, D.
satu cincin aromatik monosubstitusi.
Kelompok fenil monosubstitusi dan
cincin di bagian indol terdiri dari dua
sistem spin terpisah,
Analisis 13C-NMR dan spektra
HSQC (heteronuclear single
quantum coherence)
mengungkapkan keberadaan enam
karbon kuartener, termasuk dua
karbonil (δC 173.1, 172.3) dan
empat gugus aromatik (δC 136.6,
136.5, 127.3, dan 109.2).
 1. Legonimida

Struktur 1 selanjutnya dikuatkan oleh korelasi Gugus bebas dari imida dapat mengadopsi tiga
HMBC dari NH-10 sampai C-4 dan C- konformasi: cis-trans, trans-trans dan cis-cis. Tidak
12; dengan demikian, gugus imida ada korelasi HMBC dari NH-10 ke C-8, sedangkan
mengapit bagian 3H-indol tersubstitusi korelasi diamati dari NH-10 sampai C-12
dan cincin benzena yang monosubstitusi. menunjukkan bahwa motif imida kemungkinan
adalah konformer cis-trans. Pengamatan ini sesuai
dengan teori bahwa produk alami yang mengandung
imida konformasi cis-trans adalah yang paling
stabil.
2. 1H-indol-3-karbaldehida

Senyawa 2 diidentifikasi
sebagai 1H-indol-3-
karbaldehida yang
sebelumnya diisolasi dari
tanaman, spons laut, dan
beberapa spesies
Streptomyces.
3. 3-hidroksi-4-(1H-indol-3-yl) butan-2-one
(Actinopolymorphol B)

Senyawa 3 dicatat sebagai

Actinopolymorphol B dari
Actinopolymorpha rutilus.
4. (2R, 3R)-1-fenilbutana-2,3-diol

Senyawa 4 adalah 1-
fenilbutane-2,3-diol yang
ditemukan di beberapa
tanaman. Tiga isomer dari
senyawa 4 sebelumnya
diisolasi dari actinomycete
Williamsia sp.
 Bioaktifitas

A. Sebagai Anti Biotik

Produk alami mikroba (NP) mencakup beberapa struktur kimia yang merupakan
harta karun molekul bernilai tinggi, seperti antibiotik, antikanker, dan obat-obatan
antioksidan (Ngo, 2013). Streptomyces merupakan sumber daya utama untuk
penemuan produk alami yang berkontribusi hingga 75% dari antibiotik yang
digunakan secara klinis saat ini (Mohana, 2018).
 B. Eksperimental
1. Prosedur
Eksperimental Umum
Data HR-ESIMS diperoleh dalam
mode ESI positif dengan rentang
massa 100-2000 m / z ( resolusi
maksimum 30.000) pada sistem
Thermo Scientifc MS (LTQ XL /
LTQ Orbitrap Discovery,
Waldbronn, Jerman).
2. Pengambilan Dan
Identifikasi Bahan
Biologis
Bakteri tanah Streptomyces sp.
CT37 diisolasi dari sampel rhizosfer
yang dikumpulkan di dekat akar
Caesalpinoideae pohon
(Tamarindus Indica, Afrika) yang
tumbuh di Kebun Raya Universitas
Ghana, Legon
 B. Eksperimental
3. Budidaya Skala
Smale Streptomyces sp. 4. Uji Difusi Disk (Disc
CT37 Diffusion Assay)
Kultur skala kecil (50 mL)
Streptomyces sp. CT37 dibuat
dengan menginokulasi satu koloni Uji difusi disk dilakukan untuk
bakteri dalam delapan detik media mengikuti disk Kirby-Bauer sebagai
kultur cair yang salah (ISP2, ISP3, uji kerentanan penggunaan
ISP4, ISP5, ISP6, ISP7, Bennett
yang dimodifikasi, dan kasein pati)
dan diinkubasi pada 28⁰ C dan 180
rpm selama 7.
 B. Eksperimental
5. Fermentasi Skala
Besar Streptomyces sp. 6. Jaringan Molekuler
CT37 Berbasis Fitur
Kultur benih Streptomyces sp. CT37
Data MS / MS dari fraksi S1-S6
(50 mL) disiapkan dengan
diubah dari file .RAW menjadi
mengikuti prosedur inokulasi yang
.mzXML menggunakan software
sama seperti budidaya skala kecil.
Proteo Wizard MS convert (Kessner,
Kultur benih kemudian digunakan
2008).
untuk menginokulasi (1: 100)
masing-masing berisi 250 mL kaldu
ISP2.
 B. Eksperimental
7. Isolasi HPLC
Senyawa yang diinginkan
diidentifikasi dalam fraksi S2, maka
fraksinasi selanjutnya dilakukan
pada fraksi ini menggunakan
Kromatografi Cair Tekanan Tinggi
(HPLC, Agilent Technologies 1260
infinity, Waldbronn, Jerman).
6. Konsentrasi
Hambatan Minimum
Konsentrasi hambat minimum
(MIC) sebesar 1 - 4 melawan C.
albicans ATCC 10.231 ditentukan
menggunakan uji pengenceran
kaldu konvensional sesuai dengan
standar yang direkomendasikan oleh
Komite Nasional untuk Standar
Laboratorium Klinis (NCCLS)
(Carpenter, 2018)
THAN Do you have any questions?

KS! CREDITS: This presentation template was created by

Ayo sia
Slidesgo, yang icons
including maubynanya, jangan
Flaticon, malu&
infographics
malu.Kami
images siap
by Freepik and menjawab,
illustrations by hehe
Stories