SARS-COV-2
Betacoronavirus
Dapat menginfeksi manusia dan hewan mammalia seperti kelelawar, sapi, unta
dan rodensia.
HKU1, HCoV-OC43, SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2.
Deltacoronavirus
Ditemukan pada unggas dan babi, contohnya: spesies Bulbul CoV-HKU11.
Gammacoronavirus
Ditemukan pada unggas dan babi, contohnya: spesies Beluga whale CoV-SW1.
Sejumlah 25% virus penyebab common cold pada manusia disebabkan oleh
Coronavirus, diantaranya adalah strain HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-HKU1
dan HCoV-OC43
SARS COV2
• Pertama kali ditemukan di Wuhan, provinsi Hubei China pada akhir tahun
2019
• Penyebab awal penularan virus ini ke manusia belum diketahui secara
pasti, namun diduga terjadi di pasar hewan di Wuhan
• COVID 19 adalah penyakit yang disebabkan oleh Coronavirus 2019, virus
yang menyebabkan penyakit COVID19 disebut SARS CoV 2
• Pada tanggal 30 Januari 2020, WHO mendeklarasi COVID-19 sebagai
PHEIC (Public Health Emergency of International Concern) dan pada
tanggal 11 Maret 2020 status tersebut meningkat menjadi pandemi
SARS COV2
• Belum diketahui inang perantara yang pertama kali menularkan virus ini pada manusia.
• Beberapa penelitian menunjukkan dugaan hewan perantara penularan SARS-CoV-2 dari kelelawar ke
manusia melalui hewan ular atau terenggiling
GENOM SARS COV2
* Memerlukan virus aktif sehingga harus dilakukan di fasilitas lab BSL3, staff terlatih dan terampil dan waktu
relatif lama
DETEKSI MOLEKULER
• mendeteksi materi genetik atau asam nukleat virus.
• Metode : nucleic acid amplification tests (NAAT) misal PCR, TCM,
Isothermal
Kelebihan NAAT
• Sensitif dan spesifik
• Waktu pengerjaan relatif cepat
• Dapat mendeteksi virus sejak awal masa infeksi/inkubasi
Kelemahan NAAT
• Perlu tahapan persiapan sampel
• Kualitas spesimen sangat krusial
• Memerlukan fasilitas laboratorium minimal BSL-2
• Memerlukan staf yang sudah terlatih
DETEKSI ANTIGEN
• mendeteksi keberadaan protein virus (antigen) dalam sampel saluran pernapasan
seseorang.
• Biasanya dalam bentuk RDT Ag (Rapid Diagnostik Test Antigen) prinsip
Lateralflow Immunokromatografi (umumnya bentuk kaset).
• Waktu pendeteksian cepat 10 – 30 menit
• Tujuan pemeriksaan
• Waktu
• Logistik
Thank you
Terimakasih