ENZIM
ENZIM
1
REFERENSI
2
PENDAHULUAN
MAKANAN DICERNA DIMETABOLISME
dalam saluran dalam sel
pencernaan
METABOLISME :
KATABOLISME
MOLEKUL YG LEBIH BESAR MOLEKUL YG LEBIH KECIL
GLUKOSA CO2 + H2O + ENERGI
ANABOLISME = SINTESIS
MOLEKUL YG LEBIH KECIL MOLEKUL YG LEBIH BESAR
GLUKOSA GLIKOGEN
ENZIM
REAKSI KIMIA
3
REAKSI KIMIA biasa dalam laboratorium
Mempercepat reaksi
-
PERLU PEMANASAN
PERLU KATALISATOR
4
Organisme
Perlu Katalisator
ENZIM
Biokatalisator
5
Organisme sel molekul
enzim
Endoplasmik retikulum
ribosom
cytoskeleton
inti mitochondrion
Golgi app.
sitosol lisosom
peroxisom
Sel eukariot 6
LETAK ENZIM dalam SEL
BBerkaitan dengan FUNGSI ORGANEL SEL yang bersangkutan
- ENZIM MITOKONDRIAL :
Reaksi pengadaan energi, reaksi oksidasi yang menghasilkan energi
- ENZIM RIBOSOMAL :
Reaksi biosintesis protein
ENZIM INTI :
Berkaitan dengan perangkat genetika
ENZIM LISOSIM :
7
I. BIOKIMIA mempelajari :
SUSUNAN KIMIAWI DALAM ORGANISME
PROSES2 KIMIA
virus, bakteri, tumbuhan, hewan, manusia
ENZIM :
PROTEIN BIOKATALISATOR
ALUR METABOLIK
E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7
A B C D E F G P
A = substrat awal
P = produk akhir
B,C,D,E,F,G = senyawa2 antara (intermediates)
E1 searah
E. regulator
8
LETAK ENZIM DALAM SEL
BERKAITAN DGN FUNGSI ORGANEL Ybs.
E. MITOKONDRIAL REAKSI PENGADAAN ENERGI
Reaksi oksidasi Energi
Rantai respirasi dalam mitokondria
E. RIBOSOMAL SINTESIS PROTEIN
KATALISATOR mempercepat reaksi
IKUT SERTA DALAM REAKSI KIMIA & MEMPERCEPAT REAKSI
KIMIA, TETAPI PD. AKHIR REAKSI AKAN DIDAPAT KEMBALI
SEPERTI SEMULA
DIBUTUHKAN DLM. JUMLAH KECIL
CELAH AKTIF
E
+ S
+
P
KOMPLEKS [ES] E
9
KATALISATOR INORGANIK ENZIM
1. H+, OH-, Pt 1. PROTEIN biokatalisator
2. E. aktivasi 2. E aktivasi
3. - 3. BEREAKSI SPESIFIK
4. - 4. TIDAK TAHAN PANAS
10
kead. transisi
Ea''
kead. awal G = Perubahan
E. bebas
kead. akhir
Perjalanan
reaksi
11
keadaan awal pd suhu tertentu
Reaksi kimia : A P
Lab kimia : dipanasi
di + katalisator
Sistem biologis : - suhu konstan
- + Enzim
A+B C+D
ΔG = 0 seimbang
ΔG < 0 Rx ke kanan bersifat eksergonik
ΔG > 0 Rx ke kanan bersifat endergonik
KESIMPULAN :
13
KLASIFIKASI & TATANAMA ENZIM
NAMA ENZIM
DULU SEDERHANA
Mis: EMULSIN, PTYALIN
‘S’ + ASE
Mis: UREASE, LIPASE
JENIS REAKSI + ASE
Mis: TRANSFERASE, DEHIDROGENASE
‘S’ + JENIS REAKSI + ASE
Mis: MALAT DEHIDROGENASE
‘S’ Jenis reaksi
TATANAMA ENZIM IUBMB:
1. REAKSI & ENZIMNYA DIBAGI DALAM 6 KELAS UTAMA
2. NAMA ENZIM T.D. 2 BAGIAN:
Bgn. 1 NAMA SUBSTRAT
Bgn. 2 JENIS REAKSI + ASE
14
KLASIFIKASI & TATANAMA ENZIM
Mis:
1.1.1.1 Alkohol : NAD Oksidoreduktase
= alkohol dehidrogenase
3. INFORMASI TAMBAHAN DALAM ( )
Mis:
1.1.1.37 L-MALAT : NAD OKSIDOREDUKTASE
(decarboxylating)
L-MALAT + NAD+ PIRUVAT + CO2 + NADH + H+
1.1.1.37 L-MALAT : NAD OKSIDOREDUKTASE
Mg++
-D-GLUKOSA+ATP -DGLUKOSA-6-P +ADP
Heksokinase
Glukokinase
HIDROLASE :
1. MENGKATALISIS PEMBELAHAN HIDROLITIK
Contoh : Enzim - Amilase
- Lipase
- Karboksi peptidase A
17
KELAS-KELAS ENZIM MENURUT IUBMB
PIRUVAT ASETALDEHID
18
KELAS-KELAS ENZIM MENURUT IUBMB
5. ISOMERASE :
MENGKATALISIS PENYUSUNAN KEMBALI INTRAMOLEKULER
All Trans – retinin 11 – cis – retinin
6. LIGASE :
MENGGABUNGKAN 2 MOLEKUL, DISERTAI PEMUTUSAN IKATAN
PIROFOSFAT PD. ATP ATAU SENYAWA SEJENIS
Mis :
~ PIRUVAT KARBOKSILASE :
O O
|| ||
– OOC – C – CH + CO – OOC – C – CH – COO –
3 2 2
19
MEKANISME KERJA ENZIM
20
R - C - COOH R - C - COO
I I
NH3+ NH3+
_
R - C - COO
I
NH2
21
LIGAND
MOLEKUL KECIL YG BISA TERIKAT PADA MOLEKUL
BESAR
E
S=SUBSTRAT
I=INHIBITOR
E
A=AKTIVATOR
A E=ENZIM
E
S
I LIGAND
I A
22
STRUKTUR PROTEIN
H O H O H O H O
| || | || | || |
||
+
H3 N – C – C – N – C–C–N–C–C–––N– C–C
|
| | | | | | | O–
R1 H R2 H R3 H R
ujung
ujung karboksil bebas
amino bebas IKATAN PEPTIDA
» H
|
R – C – COOH • ASAM AMINO DALAM LARUTAN SELALU BERMUATAN
| • PROTEIN JUGA SELALU BERMUATAN
NH2
asam amino
» +
H3N COO–
aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6
H H H
| | +OH– |
R – C – COOH R – C – COO– R – C – COO–
| +H+ | |
NH3+ NH3+ NH2
pH < iep iep pH>iep
muatan=0 pKa COOH < NH3+
24
STRUKTUR SEKUNDER :
H H O R
| | || |
–N–C–C– C–C–N–
| || | |
CH2 O H H
| : :
S ikatan : : ikatan
disulfida : : Hidrogen
|
: :
S
H H O
|
| | ||
CH2 –N–C–C
| |
–N–C–C– R
* Helix
| | ||
H H 2O
* Lain : * LIPIT = - PLEATED
* KUMPARAN ACAK = RANDOM COIL
Cys Cys
– SH – SH 25
STRUKTUR TERSIER :
celah
aktif
26
STRUKTUR KUARTERNER :
DIMER
subunit
OLIGOMER
POLIMER
27
STRUKTUR KUARTERNER :
28
RANTAI POLIPEPTIDA
gen rantai
Hb : 22 susunan a.a rantai
LDH : M4
H4
ISOZIM
M3H MENGKATALISIS REAKSI
M2H2 YG SAMA
MH3
29
DENATURASI
IKATAN PEPTIDA tidak rusak
IKATAN DISULFIDA
30
KERUSAKAN DAPAT DISEBABKAN :
SUHU TINGGI
31
CARA KERJA ENZIM
celah aktif = celah katalitik
= celah pengikat substrat
~
E
+ S
E
+
P
Kompleks
E : ENZIM E-S
S : SUBSTRAT
P : PRODUK
~ UKURAN MOLEKUL E : BESAR
UKURAN MOLEKUL S : KECIL
~ DALAM SISTEM BIOLOGIS :
KADAR E << KADAR SUBSTRAT
33
~ GUGUS REAKTIF ASAM AMINO GUGUS YG. PUNYA POTENSI UNTUK
BEREAKSI, TDP. PD. RANTAI ‘R’.
H
SH R – C – COO– OH
| R | R
|
CH2 CH2
NH3+ |
|
H3+N – C – COO– H3+N – C – COO–
| |
H H
Cysteine (Cys) C Serin (Ser) S
SISTEIN
S
~
E
35
MOLEKUL ENZIM BESAR ,
SUBSTRAT UMUMNYA KECIL
36
MEKANISME KATALISIS ENZIM
+ E
+
S
MOLEKUL MOLEKUL P
BESAR KECIL Kompleks ES
37
TEORI KUNCI & ANAK KUNCI FISHER
38
KOFAKTOR
ENZIM :
SEDERHANA PROTEIN SAJA
YG. LEBIH KOMPLEKS PROTEIN + KOFAKTOR
KOFAKTOR :
LOGAM
SENYAWA ORGANIK NON PROTEIN YG. SPESIFIK (KOENZIM)
IKATAN ENZIM – KOFAKTOR :
ADA YG. KUAT (KOVALEN)
ADA YG. LEMAH
ENZIM YG. PERLU KOFAKTOR HARUS MENGIKAT
KOFAKTORNYA TERLEBIH DAHULU SEBELUM
MELAKUKAN PROSES KATALISIS.
Mg++
Ex. : GLUKOSA + ATP Heksokinase GLUKOSA–6P + ADP
39
KOFAKTOR LOGAM
40
KOENZIM
41
• LEMAH : KO-SUBSTRAT
PIRUVAT + NADH + H+ LAKTAT + NAD+
Laktat Dehidrogenase
S Ko-substrat
Pd GLIKOLISIS :
Gliseraldehid 3-P 1,3-Bisfosfogliserat
S + NAD+ P + NADH + H+
+ Pi
KE R.R. (O2)
Bila O2 / anaerob :
42
FUNGSI KOENZIM
PERANTARA PEMBAWA GUGUS, ATOM TERTENTU ATAU
ELEKTRON
R.R
CONTOH:
S NAD+ FAD
• NAD+
• NADP+ KoQ
• FMN ATOM H
• FAD Sistem sitokrom
• KoQ
½ O2
• ELEKTRON : HEME
• GUGUS LAIN : ATP FOSFAT
PIRIDOKSAL FOSFAT –NH2
VITAMIN B TERMASUK KOENZIM
• TPP THIAMIN
• NAD NIASIN
• NADP NIASIN
• FAD RIBOFLAVIN
• KoA ASAM PANTOTENAT
43
PROENZIM=ZYMOGEN
ENZIM YG. DISEKRESI DALAM BENTUK YG. BELUM AKTIF
TUJUAN :
MELINDUNGI ORGAN TUBUH
MENYEDIAKAN BAHAN SETENGAH JADI
CONTOH : PEPSINOGEN
UNTUK MENGAKTIFKAN DIGUNAKAN ENZIM PROTEOLITIK ATAU
H+
PEPSINOGEN PEPSIN
H+ / PEPSIN
H+ / Enzim proteolitik
PEPSINOGEN
PEPSIN
44
ISOZIM
MENGKATALISIS REAKSI YG. SAMA
CONTOH : LAKTAT DEHIDROGENASE (LDH)
N B B
Hati C C
5 4 3 2 1
5 4 3 2 1
I5: M4 I1=H4 A – Infark miokard
B–N LDH
Elektroforesis C – penyakit hati
Selulosa asetat
pH 8,6
46
KINETIKA ENZIM
SIFAT ENZIM
(PROTEIN)
47
PENGUKURAN AKTIVITAS ENZIM
48
IUBMB :
1 IU ENZIM
JUMLAH ENZIM YANG MENGKATALISIS
PEMBENTUKAN 1 MIKROMOL
PRODUK PERMENIT PADA KONDISI TERTENTU
DINYATAKAN DALAM :
- JUMLAH SUBSTRAT YANG DIUBAH ATAU
- JUMLAH PRODUK YANG TERBENTUK PERSATUAN WAKTU
49
KURVA PERJALANAN SUATU REAKSI ENZIMATIK
S
atau
P
0 t
50
KURVA PERJALANAN REAKSI ENZIMATIK
GRAFIK BERBELOK DENGAN BERTAMBAHNYA WAKTU
OLEH KARENA :
51
KECEPATAN SESAAT
KECEPATAN SESAAT PADA SUATU TITIK MERUPAKAN TANJAKAN (SLOPE)
YAITU :
TANGENS DARIPADA GARIS SINGGUNG
TERHADAP GRAFIK PADA TITIK TERSEBUT
KECEPATAN SESAAT A B C
KECEPATAN SESAAT TITIK A KECEPATAN AWAL
S C
atau tg
P B
A t
52
KECEPATAN RATA-RATA KECEPATAN AWAL
V RATA-RATA = S
t
V0 = tg = b
a
S
t
53
PENGARUH KADAR ENZIM PADA KECEPATAN
REAKSI ENZIMATIK
GAMBAR KANAN
GRAFIK HUBUNGAN V RATA-RATA PADA t0 , t1 , t2 dengan jumlah enzim
GAMBAR KIRI
KURVA PERJALANAN REAKSI ENZIMATIK YANG BERBEDA DALAM JUMLAH ENZIM
KETERANGAN :
I 1 UNIT
II 2 UNIT
III 3 UNIT
54
- KECEPATAN RATA-RATA TIDAK BERBANDING
LURUS DENGAN KADAR ENZIM
55
PENGARUH KADAR SUBSTRAT PADA REAKSI
ENZIMATIK
S C
atau tg
P B
A t
56
GRAFIK HUBUNGAN (S) DENGAN (V)
BERBENTUK HIPERBOLA
DI TITIK A B ENZIM BELUM JENUH DENGAN
SUBSTRAT
DI TITIK C ENZIM SUDAH JENUH DENGAN
SUBSTRAT
PENINGKATAN KADAR SUBSTRAT TIDAK
MENAIKKAN HARGA V
57
PERSAMAAN MICHAELIS MENTEN
58
BILA [S] Km , MAKA V BERBANDING LURUS
DENGAN (S)
BILA [S] = Km , SEHINGGA V = 1/2 VMAX
BILA [S] Km , MAKA V = VMAX
59
HARGA Km
MENUNJUKKAN AFFINITAS (DAYA IKAT) ENZIM
TERHADAP SUBSTRAT
APABILA SUATU ENZIM BEKERJA TERHADAP LEBIH
DARI 1 MACAM SUBSTRAT HARGA Km UNTUK
MASING-MASING SUBSTRAT BERBEDA, CONTOH :
ENZIM HEKSOKINASE
60
ENZIM HEKSOKINASE :
SUBSTRAT Km (mM)
Glukosa 0,15
Fruktosa 1,15
ARTINYA HEKSOKINASE MEMPUNYAI AFFINITAS
TERHADAP GLUKOSA LEBIH BESAR DARIPADA
TERHADAP FRUKTOSA
61
PENGARUH PH PADA REAKSI ENZIMATIK
+ H+ + OH-
R-C-COOH R-C-COO- R-C-COO
PHPH PH PHPH
ISOELEKTRIK ISOELEKTRIK ISOELEKTRIK
62
- PH TERLALU TINGGI RENDAH DENATURASI
- PH PENGARUHI MUATAN ENZIM SUBSTRAT
- PH PENGARUHI KONFORMASI ENZIM
63
KURVA BERBENTUK GENTA (BELL-SHAPED CURVE)
KARENA :
64
65
PENGARUH SUHU PADA STABILITAS DAN
AKTIVITAS ENZIM
66
ENZIM MERUPAKAN MOLEKUL PROTEIN KOMPLEKS
JIKA MENGABSORPSI ENERGI TERLALU BANYAK
DENATURASI
67
-SUHU OPTIMUM 50 derajat Celsius PADA KURVA TERSE
-SUHU OPTIMUM TERGANTUNG WAKTU
PENENTUAN
-ENZIM STABIL PADA SUHU RENDAH (DINGIN)
LABIL SUHU TINGGI (PANAS) 68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
PENGUKURAN KADAR ENZIM DLM. PLASMA
UNTUK MEMBANTU DIAGNOSIS
MIS. :
N : PERGANTIAN SEL (SEL MATI
ENZ.2 PROSES PEMBEKUAN DIGANTI SEL BARU)
DARAH
DIFFUSI PASIF
LIPOPROTEIN LIPASE
: SEL MATI
KADAR : RADANG
GANGGUAN PROSES SINTESIS DI Ca
HATI TRAUMA
/ (-) : KELAINAN GENETIK PENYAKIT GENETIK
DEFISIENSI F VIII : HEMOFILIA (CONTOH: DMD)
CREATIN KINASE
85
CACAT ENZIMATIK GENETIK
PERAWATAN KHUSUS
DIET KHUSUS mis : FENIL KETONURIA
TERAPI GEN ? MASIH TAHAP PENELITIAN 86