Diatur dalam peraturan Menteri Keuangan Republik Indonesia no. 20/PMK.03/2008
tentang jangka waktu pendaftaran dan pelaporan kegiatan usaha, tata cara pendaftaran dan penghapusan NPWP serta pengukuan dan pencabutan NPPKP dan peraturan Direktur Jenderal Pajak Nomor PER -62/PJ/2010 tentang Tata cara pendaftaran NPWP dan /atau pengukuhan kena pajak perubahan data dan pemindahan wajib pajak dan/atau pengusaha kena pajak. 1. Diajukan permohonan penghapusan NPWP dan/atau ahli warisnya apabila wajib pajak sudah tidak memenuhi persyaratan subjektif dan /atau objektif sesuai dengan ketentuan peraturan perundangan-undangan perpajakan kepada Direktur Jenderal Pajak yang wilayah kerjanya meliputi tempat tinggal pengusaha kena pajak dan tempat usaha kegiatan dilakukan 2. wajib pajak badan dilikuidasi karena penghentian atau penggabungan usaha 3. wajib pajak BUT menghentikan kegiatan usahanya di Indonesia 4. dianggap perlu oleh Direktur Jenderal Pajak untuk menghapus NPWP dari wajib pajak yang sudah tidak memenuhi persyaratan subjektif dan/atau objektif sesuai dengan ketentuan peraturan perpajakan 5. Direktur Jenderal Pajak setelah melakukan pemeriksaan harus memberikan keputusan atas permohonan penghapusan NPWP dalam jangka waktu 6 bulan untuk wajib pajak orang pribadi atau 12 bulan untuk wajib pajak badan, sejak tanggal permohonan dterima secara lengkap