REGULASI EKSPRESI GEN

Ekspresi Gen

Perbedaan sel pada organisme eukaryot mengandung DNA yg sama Perbedaan sel pada organisme eukaryot menghasilkan protein yang berbeda Sel dapat merubah ekspesi gennya karena respon terhadap signal eksternal

Differensiasi Sel

DNA microarray

Analisis ekspresi gen

Figure 8-73 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Regulasi Jalur Sintesa Protein

Pengendalian kapan dan seberapa sering gen itu ditranskripsi (transcriptional control) Pengendalian bagaimana RNA primer ditranskripsi (splicing atau pemrosesan lebih lanjut) (RNA-processing control) Seleksi terhadap mRNA nukleus yang akan ditransport ke sitoplasma (RNA transport control) Seleksi terhadap mRNA sitoplasma yang akan ditranslasi oleh ribosom (translational control) Destabilisasi mRNA sitoplasma tertentu secara selektif (mRNA degradation control) Pengaktifan, Peng-in-aktifasi, lokalisasi molekul protein setelah sintesa (protein activity control)

B. Regulasi ekspresi gen prokariot

Regulasi ekspresi gen dilakukan pada proses transkripsi

Regulasi Proses Transkripsi

regulasi transkripsi dilakukan oleh protein represor dan aktivator Transkripsi akan OFF jika protein represor yang terikat pada sekuen operator DNA yang overlapping dengan sekuen DNA promotor Transkripsi akan ON jika aktivator berikatan dengan RNA polimerase

Operon

Beberapa gen di transkripsi dari satu promoter menjadi satu mRNA yang panjang Operon lac, Operon trp

Operon lac

Contains 3 genes coding for E. coli proteins that permit the bacteria to use the sugar lactose

Galactoside permease which transports lactose into the cells b-galactosidase cuts the lactose into galactose and glucose Galactoside transacetylase whose function is unclear

Operon lac

Genes are grouped: lacZ = b-galactosidase lacY = galactoside permease lacA = galactoside transacetylase All 3 genes are transcribed together producing 1 mRNA, a polycistronic message that starts from a single promoter

Operon lac

11

1.Regulasi Ekspresi Operon

Lac

Ada 2 regulasi
Regulasi Negatif : Operon dapat diaktifkan oleh produk ekspresi gen regulator Regulasi Positif : Operon dapat diaktifkan oleh produk ekspresi gen regulator

7-12

Operon lac: represor

Kontrol negatif: bila represor terikat DNA (operator), tidak terjadi transkripsi Tidak ada laktosa represor terikat operator tidak terjadi transkripsi Ada laktosa laktosa terikat represor represor tidak dapat terikat operator transkripsi

Operon lac: represor

Operon lac: aktivator

Kontrol positif: bila aktivator terikat DNA, baru terjadi transkripsi Tidak ada glukosa ATP menjadi cAMP cAMP terikat CAP (catabolite activator protein) CAP terikat DNA transkripsi Ada glukosa CAP tidak dapat terikat DNA tidak terjadi transkripsi

Operon lac: aktivator

Figure 7-39 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Operon trp

Figure 7-35 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

2. Operon trp

Figure 7-34 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

3. Biosintesis Purin
Bagian non-coding mRNA terikat metabolit

Menghambat ekspresi gen pada terminasi atau inisiasi translasi

Figure 7-93a Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Figure 7-93b Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

B. Regulasi ekspresi gen eukariot

Regulasi ekspresi gen eukariot jauh lebih komplek dibandingkan prokariot
Regulasi ekspresi gen eukariot Tahap transkripsi Tahap pemrosesan pre-mRNA Tahap translasi

Regulasi tahap transkripsi

Pada eukaryot regulasi transkripsi melibatkan interaksi transcription factors (TF), dgn TATA Box (upstream promoter) menginduksi kompleks RNA-Polymerase (I,II dan III) transkripsi. Eukaryot juga lebih banyak menggunakan enhancer yang mengendalikan gen-gen bahkan yang berjarak sampai ribuan nukleotida. Satu gen dapat diregulasi oleh banyak sisi regulator, masing-masing terikat faktor-faktor transkripsi berbeda Aktifasi gen dapat dilakukan oleh hormon

Mekanisme Enhancer

Satu gen diregulasi oleh banyak regulator

Aktivasi gen oleh hormon

AD = domain aktivasi DBD = domain pengikat DNA LBD = domain pengikat ligan

Response element glukokortikoid (GRE): 5-AGAACAnnnTGTTCT-3

27

Regulasi yg berbeda dapat menghasilkan tipe sel yang berbeda