Bagi makhluk hidup tingkat tinggi seperti kita kebutuhan oksigen adalah mutlak namun tidak demikian dengan

mikroorganisme kehadiran oksigen dilingkungannya dapat menguntungkan atau bahkan menghambat pertumbuhan mikroorganisme. Kemampuan mikroorganisme untuk tumbuh dalam suasana yangmengandung oksigen tersebut tergantung pada oksidase sitokrom. Berdasarkan kebutuhan akan oksigen, maka mikroorganisme dikelompokkan menjadi empat kelompok, yaitu: 1. Aerob adalah kelompok yang hany tumbuh dalam suasan yang mengandung oksigen, contohnya Psudomonas, Bacillus, Nitrobacter, Sarcina, dan lain-lain. Mereka membutuhkan oksigen sebagai penangkap hydrogen. 2. Anaerob Fakultatif adalah kelompok mikrooranisme yang dapat dengan ataupun tanpa keberadaan oksigen, dilingkungan kaya oksigen akan metabolismenya bersifat aerob namun ketika oksigen terbatas atau habis maka akan berlih ke metabolismenya akan beralih ke fermentasi. Contohnya Vibrio, Escherichia coli, Salmonella, Shigella, Staphylococcus. 3. Mikroaerofili adalah kelompok mikroorganisme yang bersifat aerob, mutlak membutuhkan oksigen tetapi dalam jumlah yang lebih sedikit dari pada yang terdapat di udara bebas. Kelompok tidak bisa tumbuh tanpa oksigen namun di udara yang kaya oksigen justru pertumbuhannya terhambat. Contohnya Helicobacter pylori. 4. Anaerob obligat adalah kelompok yang mutlak hanya berkembang biak dalam suasan tanpa oksigen, Contohnya Clostridium. Mereka membtuhkan zat lain sebagai penangkap hydrogen ada jalur repirasinya. Oksigen akan bersifat toksik pada kelompok ini karena proses reduksi oleh enzim-enzimdi dalam sel menjadi hydrogen peroksida, bahkan dapatmenjadi lebih beracun yaitu radikal superoksida. Mikroorganisme kelompok ini tidak mampu memproduksi enzim katalase maupun proksidase sehingga hydrogen peroksida yang dihasilkan dari metabolisme aerobik justru meracuni diri sendiri. Hidrogen peroksida sangat beracun karena merusak DNA mikroba. Selain kebutuhan akan oksigen beberapa mikroorganisme ada juga membutuhkan kehadiran gas selain oksigen untuk menyokong pertumbuhannya. Kelompok Neisseria gonorrhoeae dan Brucella abortus pertumbuhannya sangat dirangsang dengan kehadiran karbon dioksida.