RIBOSOM

(Organela yang aktif dalam proses metabolisme sel)

Hery Purnobasuki

TERMINOLOGI
1900 Garnier memperkenalkan ergatoplasma (bendabenda yang berkaitan dengan kegiatan sel)

1924

Fuelgen dan Rosenbeck menemukan pewarnaan khusus thd kromatin

Benda-benda yang yang tidak sama dengan butir kromatin yang mengandung DNA (Feulgen negative), inti yang mengandung DNA bereaksi Feulgen positive dengan warna ungu Dengan ME terdeteksi bahan-bahan halus dari nukleoproptein granula PALADE ribosom

SEJARAH
1930 1940 1950 1960 1970 1980 Pertama kali dipelajari Isolasi awal Penelitian Pemisahan dan penyusunan Topografi morfologi Penelitian lanjut

Pernyataan ribosom dipelajari sebelum diteliti kebenarannya (1930) yang menyatakan bahwa ribosom terletak di sitoplasma

Bukti pengamatan scr tidak langsung di sitoplasma, pada proses spermatogenesis ditemukan RNA (seluler) Metode pewarnaan, dibedakan RNA dan DNA

Spektrofometric dengan daya absorbansinya dibedakan RNA dan DNA RNA di sitoplasma (hewan maupun tumbuhan), DNA di inti

Sel kaya RNA ketika aktif mesintesis protein

Ada korelasi positif antara jumlah protein dengan RNA dalam sel

SUSUNAN RIBOSOM DALAM SITOPLASMA

Ribosom terdapat bebas dalam sitoplasma atau menempel pada gelembung-gelembung yang berdinding membran Ribosom yang bebas berguna untuk sintesa protein yang digunakan untuk: Bahan sel itu sendiri saat sel membelah
Disimpan di sitoplasma (spt. Pada pembentukan hemoglobin dalam eritoblas) Ribosom yang terdapat terikat terutama pada organela yang bersifat membran

PENELITIAN TENTANG RIBOSOM

Albert Caude
Embrio ayam dan mamalia, fraksinya mengandung partikel mikrosom, partikel ribonukleo protein

Bit dan buah-buahan, RE mengandung ribosom, tapi dengan TEM tampak ribosom merupakan partikel individu
1950 Diketahui ribosom ada yang bebas dan melekat pada membran G.E. Palade dan P. Siekevits

partikel ribosom: 20 nm 30 nm

1950

Ultrasentrifugal analisis

Endapan ribosom mempunyai tempat 40S 76S; mengandung 50% RNA dan 50% protein P. Zamecnik (1950) Radioaktif asam amino ada di protein ribosom Massachusetts Institute of Technelogy (1958) Partikel ribonucleoprotein disebut Ribosom 1960 Electrophoresis dan kromatografi

Ribosom terdiri 3-4 macam RNA dan protein

Berdasarkan koefisien sedimentasi dikenal tiga tipe ribosom: Tipe ribosom Koefisien sedimentasi

Sel prokariot Sel eukariot (sitosol) Sel eukariot (organel) kloroplast mitokondria

70S 80S
70S 55S 80S

Semua ribosom berdisosiasi menjadi dua subunit (besar dan kecil)

Fungsi ribosom prokariot analog dengan ribosom eukariot

RIBOSOM PROKARIOT
Subunit kecil (30S)
Subunit besar (50S)

rRNA (16S)
rRNA (23S) rRNA (5S)

21 protein

Monomer (70S)

32 protein

Ketiga rRNA disintesis oleh gen-gen yang erat berikatan , ditranskripsi oleh RNA polimerase dengan urutan:

16S

23S

5S

Operon rRNA juga mengandung gen untuk beberapa tRNA

Operon : sekelompok gen dan tempat-tempat pengenal pada kromosom (DNA) yang berpartisipasi pada pengaturan transkripsi

Protein ribosom ditambahkan / berkombinasi dengan rRNA pada berbagai tahapan perakitan sub unit: Beberapa protein ditambahkan selama transkripsi Protein lain ditambahkan setelah transkrip primer lepas dan selama pemrosesan Protein lain lagi ditambahkan setelah rRNA matang

Protein-protein tertentu berikatan dengan rRNA hanya sementara, tidak terdapat dalam subunit-subunit yang sempurna dirakit

BENTUK FISIK RIBOSOM PROKARIOT

Subunit 70S Ribosom lengkap / utuh Keutuhan partikel bergantung pada konsentrasi ion Mg2+

Integritasnya tergantung konsentrasi ion Mg2+ > 2 mM Bila konsentrasi sangat tinggi menjadi partikel 100S Bila konsentrasi < 2 mM berubah menjadi subunit 30S dan 50S

Keutuhan partikel bergantung pada konsentrasi Mg2+

Transformasi partikel berhubungan dengan peristiwa metabolisme dalam sel

Dalam keadaan tidak aktif akan berasosiasi menjadi subunit 30S dan 50S

Subunit 50S dan 30S

Bentuk irregular Subunit 50S berbentuk bola dengan 3 tonjolan

Subunit 30S berbentuk seperti batang, berbelah menjadi dua

A couple more nifty pictures

50S (left) and 30S. This time you can see them from different angles, through different style of picture

Koefisien sedimentasi Perbedaan ribosom didasarkan: Jumlah dan macam RNA Jumlah protein
Eukariot Monomer koefisien sedimentasi RNA protein Sub Unit Kecil koefisien sedimentasi RNA yang ada protein Sub Unit Besar koefisien RNA protein 80S 4 70 40S 18S 30 60.5S 58S 60S Prokariot 70S 3 55 30S 16S 21 50S 68S 275

Ribosom mempunyai 2 tempat berikatan:

1. P-site

(tempat P, tempat berikatan peptil-tRNA), tempat tRNA berhubungan dengan ujung rantai polipeptida yang sedang tumbuh

2. A-site

(tempat A, tempat berikatan aminoasiltRNA), tempat tRNA yang akan datang (baru) yang membawa satu asam amino

Antara subunit terdapat suatu terusan tempat menembus RNA selama translasi

EUCARYOTIC RIBOSOME
Isolasi lebih susah daripada ribosom pada prokariotik Ukuran lebih besar Suka bergabung dengan sel bakteri Sedimen monomer 80S Sedimen subunit 40S dan 60S Rat liver: KS small subunit 36,9S BM small subunit 1,44.106 Dalton KS large subunit 56,3S BM large subunit 2,9.106 Dalton Tanaman BM : 3,9.106 Dalton Hewan BM : 4,6.106 Dalton

MITOKONDRIAL DAN CHLOROPLAST RIBOSOME

Ribosom pada kloroplast = prokariotik
Ribosom pada mitokondria tidak sama Sedimen ribosome chloroplast : 70S dan dapat terurai : 30S (29S - 41S) dan 50S (46S 54S) Sedimen Ribosom Mitokondria Monomer Animal Ascomycetes Ciliate protozoan Higher plant 55S 60S 70S 75S 80S 77S 80S Small subunit 30S 35S 30S 40S 55S 40S Large subunit 40S 45S 50S 55S 60S

Sintesis dan Pemrosesan rRNA Eukariot

Pada eukariot sintesis rRNA (sitosol) berlangsung di nukleolus (anak inti)

Tiga peristiwa yang merupakan ciri nukleolus:

1. Transkripsi gen-gen yang mengkode rRNA (rDNA) 2. Pemrosesan molekul pra rRNA 3. Perakitan subunit-subunit pra ribosom

RNA RIBOSOME
1. RNAs pada ribosom prokariotik Subunit (large) 50S Subunit (small) 30S 5s; 23S 16S

2. RNAs pada ribosom eukariotik

Subunit (large) 60S Subunit (small) 40S 5s; 5,8S; 28S 18S

3. RNAs pada kloroplas

Subunit (large) Subunit (small) 4,5s; 5S; 23S 16S

1. RNAs pada mitokondria Subunit (large) 5s (tumb); 16-19S (hwn); 21-26S (lain) 12S 13S (hewan) 14S - 18S (lain)

Subunit (small)

Ribosom tikus

Ribosom babi
Ribosom manusia (plasma sel)

SINTESIS PROTEIN (TRANSLASI)

1. Aktivasi (pengatifan) asam amino
2. Pembentukan kompleks inisiasi antara mRNA dengan subunit ribosom 3. Inisiasi rantai polipeptida 4. Pemanjangan rantai polipeptida

5. Terminasi rantai dan pembebasan rantai polipeptida yang lengkap

6. Disosiasi kompleks mRNA dan ribosom

Translation - Proteins are made from the message on the RNA

Tahap translasi protein

POLIRIBOSOM (POLISOM)
Butir-butir ribosom yang tersusun berderet-deret dihubungkan oleh benang-benang halus substansi sel
Jumlah ribosom dalam poliribosom dapat memberikan informasi tentang ukuran molekul protein yang disintesis di tempat tersebut
Dalam eritroblas berkaitan dengan pembentukan hemoglobin

Topografi polisom pada membran organel

THE END