PHOTONIC BIOMEDIS

RESUME

OPTICAL BIOSENSOR

IKA NOVITASARI
NRP. 2411.100.005

JURUSAN TEKNIK FISIKA

FAKULTAS TEKNOLOGI INDUSTRI
INSTITUT TEKNOLOGI SEPULUH
NOPEMBER
SURABAYA
2014

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005

OPTICAL BIOSENSOR

Perkembangan terbaru teknologi optic kali ini adalah berperan sebagai sensor untuk
mendiagnosa, mendeteksi maupun melakukan pengontrolan terhadap segala hal yang
berhubungan dengan reaksi biologi (spesies) maupun reaksi kimia dibeberapa objek penelitian
dan pengukuran.
1. Devinisi Optical Biosensor
Biosensor merupakan divais yang dapat mendeteksi adanya reaksi kimia maupun spesies
biologi yang kemudian menciptakan respon kimia maupun fisika yang dapat dikonfersi
kedalam sinyal yang dapat dibaca oleh tranduser. Aplikasi biosensor ini banyak ditemukan
didalam clinical diagnostics, drug development, enviromental monitoring, dan kontrol
kualitas makanan.

Gambar 1. Schema biosensing

Dari devinisi diatas, maka diketahui bahwa optical biosensor merupakan biosensor yang
menggunakan media berbasis optik didalamnya dimana sensor ini dapat merubah respon fisik
maupun kimia dari proses bioreognition kealam bentuk fasa, amplitudo, polarisasi, atau
frekuensi dengan inputan berupa cahaya.
Adapun keuntungan menggunakan optical biosensor dibandingkan dengan sensor lain
adalah sebagai berikut.
a. Lebih selektif dan spesifikasi
b. Mempunyai sensor remote
c. Terisolasi dari adanya interferensi elegtromagnetik
d. Lebih cepat, pengukuran dilakukan real-time
e. Mempunyai sistem deteksi multi (multiparameters detection)
f. Compact Design
g. Meminimalkan gangguan pada pengukuran struktur dalam jaringan (in vivo),
h. Informasi reaksi kimia ada analisa lebih detail.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 1

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
2. Komponen Utama Optical Biosensor
Adapun komponen utama dari optical biosensor adalah sumber cahaya, medium untuk
mentransmisi optic ( ex: fiber optic), elemen biologi yang diteliti (ex: enzim, microba), optical
probes pada tranduksi (ex: fluoresense marker), dan sistem pendeteksi optik.

Light
Source

Medium Transmisi

Elemen
biologi

Optical Probes
(Tranduction)

Optical
Detection

Gambar 2. Komponen Utama Optical Biosensor

3. Prinsip Optical Biosensor

Adapun prinsip dari Optical Biosensor terfokus pada Biorecognition dan Optical Tranducer.
A. Biorecognition
Biorecognition merupakan elemen biologi yang meliputi enzim, sistem kekebalan tubuh
(antibodi), lektin, neuroreseptor, DNA/RNA, sel biologi, dan mikroorganisme yang
teranalisis recognize. Elemen biologi ini sering berhenti ketika meningkatkan konsentrasi
lokal pada elemen sensor optik dan terdeteksi hingga kemunculannya.
B. Optical Tranduser
Adapun cakupan manifestasi yang digunakan didalam biosensor pada Optical Tranduser
diantaranya meliputi :

Gambar 3. Manifestasi biosensor pada Optical Tranduser

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 2

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
C. Fluorescence Sensing
Pada sensor fluorense terdiri dari 2 macam sensor, diantaranta yaitu sensor terarah
(Direct Sensing) dan sensor tidak terarah (Indirect Sensing).
Sensor Terarah (Direct Sensing)

Pada sensor jenis ini memanfaatkan pengaruh langsung pada properti fluorense
terhadap elemen biorecognition (elektronik energi Transfer, EET) dimana properti
fluoresense mempunyai spesifikasi reaksi enzim-dikatalisasi.
Sensor Tidak Terarah (Indirect Sensing)
merupakan jenis sensor yang dipengaruhi oleh faktor eksternal dimana sensor ini
menanggapi analisa pada biorecognisi akibat dari adanya erubahan pada properti
fluorense.
D. Fluorescence Energy Transfer Sensors (FRET Sensors)
Fluorescence Energy Transfer Sensors (FRET Sensors) mempunyai kelompok pemberi
(donor) dan kelompok penerima (acceptor) dengan dilakukan transfer energi electronic
yang dihasilkan dari biorecognitif, dimana bioreognitif dapat menyebabkan efisiensi
didalam transfer energi elektronik (EET) dari kelompok donor menuju kelompok
acceptor yang sangat fluorense.

Gambar 4. Sensor Fluoresense pada FRET biosensor

Sedangkan jika dilakukan transfer energi melalui transfer photoindiksi pada

elektron ( Photoinduced Electron Transfer, PET) adalah sebagai berikut.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 3

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005

Gambar 5. Sensor Fluoresense pada PET biosensor

HOMO (Highest Occupied Molecular Orbital): energi level donor lebih besar
daripada acceptor.

E. Molecular Beacons
Molecular Beacons didasarkan pada skema transfer energi elektronik (EET) yaitu
menunjukkan hubungan antara unit fluoresense (FI) dan Fluoresense Quencher (Q).
Molecular Beacon mendeteksi dan dapat berinteraksi dengan kelas DNA dan RNA.

Gambar 6. Prinsip Kerja Molecular Beacons

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 4

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
F. Biosensor Geometri Optik

Gambar 7. Ruang Lingkup Optical Geometry of Biosensor

4. Fiber Optic Biosensor

Fiber optic merupakan divais pentransmisi cahaya dari satu tempat ketempat yang lain
tanpa menimbulkan loss yang berlebih jika dibandingkan dengan kabel tembaga biasa. Selain
mempunyai fungsi sebagai divais pentransmisi, fiber optik juga dapat digunakan sebagai
sensor optik.

Gambar 8. Macam-macam layer sensor didalam fiber optic sebagai sensor

Penggunaan fiber optik sebagai sensor dapat dimodifikasi geometrisnya tergantung

pada aplikasi sensor yang akan digunakan. (seperti single core fiber, dual core fiber, Yjunction fiber, dan fiber bundles).

Gambar 9. a) single core fiber,b)dual core fiber dan c)fiber bundles.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 5

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
Salah satu aplikasi penggunaan fiber optic dibidang biosensor adalah sangat sesuai
diaplikasikan untuk biosensor pada endoscopi (in vivo biosensing), karena mempunyai
ukuran yang relatif kecil, sehingga mudah dimasukkan kedalam organ tubuh dn mudah
diarahkan juga.

Gambar 10. in vivo biosensing dengan bantuan spectroscopy untuk imaging.

Pada perkembangan terbaru mengenai fiber optik sebagai biosensor didunia medis
adalah untuk mendteksi adanya kanker sejak dini (awal ertumbuhan kanker), mengontrol
serta mengurangi kanker dengan menembakkan cahaya pada rentang optical window (6501000 Hz) kedalam jaringan yang terkena kanker. Maka berkas cahaya tersebut akan diserap
pada sel kanker dan didapatkan informasi mengenai karakteristik sel kanker tersebut melalui
DOS (iDiffuse Optical Spectroscopy).

Gambar 11. Lintasan foton didalam jaringan

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 6

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
5. Planar Waveguide Biosensors

Gambar 12. Planar Waveguide

Planar Waveguid merupakan media yang mempropagasi pandu gelombang optik yang
dibatasi didalam comparable dimension pada panjang gelombang cahaya. Adapun
keuntungan utama menggunakan sensor ini adalah akan membentuk pola geometri ketika
mendeteksi simultan multichanel dengan banyak analisis.
Terdapat tiga teknik penting dalam penggabungan cahaya (coupling) planar waveguide,
diantaranya adalah :

Menggunakan coupling prisma,

Menggunakan grating coupling,
End-fire coupling.

Gambar 13 Aplikasi pada biomoleules menggunakan flow cels.

Gambar 14 Aplikasi array biosensor

Gambar diatas merupakan salah satu wujud aplikasi Planar waveguide sebagai
biosensor dan masih banyak lagi aplikasi lain yang menggunakan cahaya planar (cahaya
yang mempunyai jarak sumbernya cukup jauh).

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 7

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
6. Evanescent Wave Biosensors
Evanescent wave sebagai sensor dapat berinteraksi pada rentang panjang gelombang
elektromagnetik dan dapat menembus daerah sekitar yang mempunyai nilai indeks bias
rendah serta mengalami rapidly decaying pada daerah amplitudo elektrik, dengan
konstantan perambatan k adalah imajiner. Skema sensor ditunjukan sebagai berikut :

Gambar 15. Skema Evanescent Wave Sensing.

Sebuah sensor fluoresense menggunakan monomode planar waveguide untuk mengeksitasi

bersama pada area evanescent yang digunakan untuk mendeteksi fluoresense seperti yang
ditunjukkan pada gambar berikut.

Gambar 16. Sensor fluoresense menggunakan monomode planar waveguide.

7. Interferometric Biosensors
Interferometer sebagai sensor ini menggunakan informasi pada perubahan fasa (
yang dideteksi oleh elemen biorecognisi yang beroperasi pada permukaan waveguide
channel. Perubahan fasa ini akan terdteksi oleh interferometer dengan menciptakan adanya
interferensi antara dua beam.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 8

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005

Gambar 17. Interferometry Mac-Zender

Berdasarkan teori, rumus matematis intensitas outputan interferometer adalah sebagai

berikut.

Dimana :

cos

................... 1
....................2

: Intensitas Keluaran Interferometer

: faktor Modulasi

: perubahan fasa

: Intensitas masukan interferometer

: panjang Interaksi

8. Surface Plasmon Resonance Biosensor

Surface Plasmon Resonance Biosensor menggunakan prinsip propagasi pada permukaan
plasmon ketika cahaya dirambatkan pada sudut tertentu (sudut kritis) disepanjang
antarmuka logam dengan media dielektrik.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 9

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005

Gambar 18. Surface Plasmon Resonance Biosensor

Pada gambar diatas menunjukkan Surface Plasmon Resonance memanfaatkan CCD

atau fotodioda array dan hasilya ditampilkan didalma sensogram dimana menunjukkan
adanya pergeseran SPR dari 1 ke 2 setelah mengalami reaksi. Serta diperoleh informasi
resonansi sinyal pada kopling yang bergesar sudut sebagai fungsi waktu.
Adapun keuntungan menggunakan Surface Plasmon Resonance Biosensor diantaranya
adalah sebagai berikut.

Tidak memperlukan pelabelan pada penanda fluoresence, sehingga memungkinkan

untuk menganalisis berbagai sistem biomolekuler,

kuantitatif,

Realtime monitoring, sehingga memberikan informasi dengan efek cepat dan

Bahan yang dibutuhkan dalam analisis cukup dalam sample kecil.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 10

NAMA : IKA NOVITASARI

NRP : 2411.100.005
9. Divais Optical Biosensors Lainnya
Adapun perkembangan divais optical biosensor lainnya yang telah berkembang diantaranya
adalah :

Photonic Cristals Sensors

Hybrid Tranduction Biosensors,

Optical Sensors Array dan hubungannya dengan sumber cahaya,

Time Domain Sensing

Surface Enhanced Raman Sensors

Dan Divais Optical Biosensor lainnya.

REFERENSI
Prasad, Paras. 2003.Introduction to Biophotonics : Canada
Lauren, Joel Hailey. 2009. Optical Biosensor, Departement of Electrical and Computer
Engineering, Colorado State University : Colorado.

PHOTONICS BIOMEDIS
Page 11