1. a.

Sumber Karbon
Tumbuhan-tumbuhan dan beberapa bakteri mampu mengunakan
energi fotosintetik untuk mereduksi karbondioksida pada penggunaan air.
Organisme ini termasuk kelompok autotrof, makhluk hidup yang tidak
membutuhkan nutrient organik untuk pertumbuhannya. Autotrof lain
adalah khemolitotrof, organisme yang menggunakan substrat anorganik
seperti hidrogen atau thiosulfat sebagai reduktan dan karbondioksida
sebagai sumber karbon. Heterotrof membutuhkan karbon organik untuk
pertumbuhannya, dan karbon organik tersebut harus dalam bentuk yang
dapat diasimilasi. Contohnya, naphthalene.
b. Sumber Nitrogen
Nitrogen merupakan komponen utama protein dan asam nukleat,
yaitu sebesar lebih kurang 10 persen dari berat kering sel bakteri. Sumber
nitrogen yang paling lazim untuk mikroorganisme adalah garam-garam
ammonium. Beberapa prokariot mampu mereduksi nitrogen molekul
(N2 atau dinitrogen). Mikroorganisme lain memerlukan asam-asam amino
sebagai sumber nitrogen, jadi yang mengandung nitrogen organik. Tidak
semua mikroorganisme mampu mereduksi sulfat, beberapa diantaranya
memerukan H2S atau sistein sebagai sumber S.
c. Sumber Belerang
Belerang adalah komponen dari banyak substansi organik sel.
Belerang membentuk bagian struktur beberapa koenzim dan ditemukan
dalam rantai samping cisteinil dan merionil protein. Belerang dalam
bentuk asalnya tidak dapat digunakan oleh tumbuhan atau hewan.
Namun, beberapa bakteri autotropik dapat mengoksidasinya menjadi
sulfat (SO42-).
d. Sumber Phospor
Fosfat (PO43-) dibutuhkan sebagai komponen ATP, asam nukleat dan
sejumlah koenzim seperti NAD, NADP dan flavin. Selain itu, banyak
metabolit, lipid (fosfolipid, lipid A), komponen dinding sel (teichoic acid),
beberapa polisakarida kapsul dan beberapa protein adalah bergugus
fosfat. Fosfat selalu diasimilasi sebagai fosfat anorganik bebas (Pi).
e. Sumber Mineral
Sejumlah besar mineral dibutuhkan untuk fungsi enzim. Ion
magnesium (Mg2+) dan ion ferrum (Fe 2+) juga ditemukan pada turunan
porfirin yaitu: magnesium dalam molekul klorofil, dan besi sebagai bagian
dari koenzim sitokrom dan peroksidase. Mg 2+ dan K+ keduanya sangat
penting untuk fungsi dan kesatuan ribosom. Ca2+ dibutuhkan sebagai
komponen dinding sel gram positif, meskipun ion tersebut bebas untuk

bakteri gram negatif. Banyak

Na+ untuk pertumbuhannya.

dari

organisme

laut

membutuhkan

f. Sumber Oksigen
Untuk sel, oksigen tersedia dalam bentuk air. Selanjutnya oksigen
juga terdapat dalam CO2 dan dalam bentuk senyawa organik. Selain itu
masih banyak organisme yang tergantung dari oksigen molekul (O 2 atau
dioksigen). Oksigen yang berasal dari molekul oksigen hanya akan
diinkorporasi ke dalam substansi sel kalau sebagai sumber karbon
digunakan metana atau hidrokarbon aromatic yang berantai panjang.
Mikroorganisme anaerob fakultatif tumbuh dengan adanya O 2 udara, jadi
bersifat aerotoleran; tetapi organisme ini tidak dapat memanfaatkan O 2,
tetapi memperoleh energi semata-mata dari peragian. Jenis bakteri
anaerob fakultatif lain (Enterobacteriaceae) dan banyak ragi dapat beralih
dari peroleh energi dengan respirasi (dengan adanya O 2) ke peragian
(tanpa O2).

Tipe

Fototrof
Fotoautotrof
Fotoheterotr
of
Kemotrof
Kemoautotro
f
Kemoheterot
rof
2.

Sumber
Energi
untuk
Pertumbuh
an

Sumber
Karbon
Untuk
Pertumbuh
an

Contoh genus

Cahaya
Cahaya

CO2
Senyawa
organik

Chromatium
Rhodopseumdom
onas

Oksidasi
senyawa
organik
Oksidasi
senyawa
organik

CO2
Senyawa
organik

Thiobacillus
Esherichia

Mikroorganisme merupakan jasad hidup yang mempunyai ukuran

sangat kecil. Setiap sel tunggal mikroorganisme memiliki kemampuan
untuk melangsungkan aktivitas kehidupan antara lain dapat mengalami
pertumbuhan, menghasilkan energi dan bereproduksi dengan sendirinya.
Mikroorganisme memiliki fleksibilitas metabolisme yang tinggi karena
mikroorganisme ini harus mempunyai kemampuan menyesuaikan diri
yang besar sehingga apabila ada interaksi yang tinggi dengan lingkungan
menyebabkan terjadinya konversi zat yang tinggi pula. Akan tetapi,

karena ukurannya yang kecil, maka tidak ada tempat untuk menyimpan
enzim-enzim yang telah dihasilkan. Dengan demikian enzim yang ridak
diperlukan tidak akaan disimpan dalam bentuk persediaan. Enzim-enzim
tertentu yang diperlukan untuk pengolahan bahan makanan akan
diproduksi bila makanan tersebut sudah ada (Kusnadi, 2003).
Mikroorganisme ini juga tidak memerlukan tempat yang besar, mudah
ditumbuhkan dalam media buatan, dan tingkat pembiakannya relatif
cepat. Oleh karena aktivitasnya tersebut, maka setiap mikroorganisme
memiliki peranan dalam kehidupan, baik yang merugikan maupun yang
menguntungkan (Darkuni, 2001).
Pembiakan mikroorganisme dalam laboratorium memerlukan medium
yang berisi zat hara serta lingkungan pertumbuhan yang sesuai dengan
mikroorganisme. Zat hara digunakan oleh mikroorganisme untuk
pertumbuhan, sintesis sel, keperluan energi dalam metabolisme dan
pergerakan. Lazimnya, medium biakan berisi air, sumber energi, zat hara
sebagai seumber karbon, nitrogen, sulfur, fosfat, oksigen, hidrogen serta
unsur-unsur sekelumit (trace element). Dalam bahan dasar medium dapat
pula ditambahkan faktor-faktor tumbuhan berupa asam amino, vitamin
dan nuleotida. Medium biakan yang digunakan untuk menumbuhkan
mikroorganisme dalam bentuk padat, semi padat dan cair (Syabatini A.,
2007).
Metode agar pada cawan merupakan metode yang paling sering
dipakai. Metode ini telah lama digunakan dalam penetapan
mikroorganisme yang terdapat dalam tanah yang terbawa erosi, air, air
selokan, hasil pertanian dan makanan. Prinsip penetapan jumlah
mikroorganisme dalam bahan tersebut adalah sama. Perbedaannya
adalah dalam pengambilan dan penanganan contoh, pemilihan media dan
lama inkubasi serta kondisi inkubasi. Suatau hal yang perlu diperhatikan
adalah bahwa agar harus mengandung seminimum mungkin senyawa
yang mempunyai energi segera tersedia seperti gula dan protein.
Alasannya adalah agar mikroorganisme yang tumbuhnya cepat tidak
mendominasi
pertumbuhan
pada
agar-cawan
dan
mnghambat
petumbuhan mikroorganisme yang tumbuhnya lambat walaupun jumlah
spesies nya banyak (Waluyo, 2005).
Media biakan merupakan suatu zat yang digunakan untuk
menumbuhkan jasad renik di laboratorium. Jadi media biakkan adalah
memberikan tempat dan kondisi yang mendukung pertumbuhan dari
mikroorganisme
yang
ditumbuhkan.
Sebelum
menumbuhkan
mikroorganisme dengan baik, langkah pertama harus dapat dipahami
kebutuhan dasar mikroorganisme lalu mencoba memformdasikan suatu
medium yang member hasil terbaik misalnya media biakan Nutrient Agar
(NA) yang digunakan pada penumbuhan bakteri (Muhiddin, 2007).

ATAU
Evolusi (dalam kajian biologi) berarti perubahan pada sifat-sifat
terwariskan suatu populasi organisme dari satu generasi ke generasi
berikutnya. Perubahan-perubahan ini disebabkan oleh kombinasi tiga
proses utama: variasi, reproduksi, dan seleksi. Sifat-sifat yang menjadi
dasar evolusi ini dibawa oleh gen yang diwariskan kepada keturunan
suatu makhluk hidup dan menjadi bervariasi dalam suatu populasi. Ketika
organisme bereproduksi, keturunannya akan mempunyai sifat-sifat yang
baru.
Sifat
baru
dapat
diperoleh
dari
perubahan
gen
akibat mutasiataupun transfer gen antar populasi dan antar spesies. Pada
spesies yang bereproduksi secara seksual, kombinasi gen yang baru juga
dihasilkan oleh rekombinasi genetika, yang dapat meningkatkan variasi
antara
organisme.
Evolusi
terjadi
ketika
perbedaan-perbedaan
terwariskan ini menjadi lebih umum atau langka dalam suatu populasi.
3.

Letak

Bentuk

Gula
Fungsi

Kadarnya

DNA (Deoxyribo Nukleat RNA (Ribo Nukleat Acid)

Acid)
Dalam inti sel, nukleus, Dalam inti sel, nukleus,
mitokondria,
plastid, sitoplasma dan ribosom.
kloroplas, sentriol.
Polinukleotida ganda yang Polinukleotida tunggal dan
terpilin panjang
pendek
Deoksiribosa
Ribosa

mengontrol sifat
sintesis protein
yang menurun
- Pembawa informasi
genetic

sintesis protein

sintesis RNA
Tidak dipengaruhi sintesis Berubah-ubah
tergantung
protein.
aktivitas sintesis protein
Letak basa nitrogen
Macam ARN :
dari kedua pita ADN
ARN duta
saling
berhadapan
ARN ribosom
dengan pasangan yang
ARN transfer
tetap
yaitu
Adenin
selalu
berpasangan
dengan Timin, Cytosin
dengan Guanin. Kedua
pita itu diikatkan oleh

Gula
pentosa
Basa
Nitrogen

ikatan hidrogen.
Deoxiribosa

Ribose

Purin: Adenin dan Guanin Purin: adenine dan Guanin

Pirimidin:
Timin
dan Pirimidin: Urasil dan Citosin/
Sitosin/ Citosin
Sitosin

4. a. mRNA
RNA
duta (messenger-RNA, mRNA)
adalah RNA yang
sintesisnya
diarahkan oleh gen pada berkas DNA sebagai pembawa pesan. Dengan
kata lain, mRNA adalah RNA yang merupakan hasil transkripsi DNA dan
menjadi perantara pembawa urutan protein dalam proses translasi.
Molekul mRNA
kemudian
berinteraksi
dengan
perangkat
pensintesis protein dalam sel untuk
memproduksi polipeptida. mRNA
memiliki
tugas
utama
menjadi
"pembawa
pesan"
kode
dari DNA kepada rRNA untuk "dibaca" dan selanjutnya diterjemahkan
(translasi) menjadi urutan protein.
Bentuknya
berupa
rantai basa tunggal
lurus
dengan
kerangka fosfat dan gula ribosa.
Molekul
ini
dihasilkan
dari
proses transkripsi di
dalam inti
sel oleh enzim RNApolimerase. Pada eukariota setelah transkripsi dapat terjadi proses
pascatranskripsi,
seperti splicing dan
penambahan poli-A.
Setelah
"matang", mRNA berpindah tempat menuju sitoplasma dan akan
ditangkap oleh rRNA untuk dibaca.

b. rRNA
rRNA (ribosome-Ribonucleic
Acid)
atau Asam
Ribonukleat
ribosomal adalah
molekul
utama
penyusun ribosom.
rRNA
dan protein secara bersama membangun subunit-subunit ribosom yang
terdiri dari subunit kecil dan subunit besar untuk kemudian bergabung
membentuk
ribosom
fungsional
ketika
dua
subunit
terikat
pada mRNA saat translasi. Pada prokaryot, subunit kecil mempunyai

koefisien sedimentasi sebesar 30S (unit Svedberg) sedangkan subunit

besar berukuran 50S, akan tetapi saat bergabung koefisien
sedimentasinya adalah 70S (terdiri dari RNA 16S, 5S dan
23S). Pada eukaryot subunit kecil berukuran 40S sedangkan subunit besar
berukuran 60S, akan tetapi sebagai suatu kesatuan, ribosom eukaryot
memiliki koefisien sedimentasi sebesar 80S (terdiri dari 18S, 5S, 5,8S, dan
28S).
rRNA merupakan salah satu tipe dari kelompok RNA. RNA ini merupakan
RNA terbanyak yang dikandung oleh suatu sel, yaitu sekitar 83% dari RNA
yang terdapat dalam suatu sel (menyusun ribosom). Ribosom terdapat di
dalam sel dalam jumlah yang cukup banyak, yaitu sekitar 200.000
ribosom yang menyusun sekitar 25% berat kering total selnya). Dan
sekitar 60% dari berat suatu ribosom adalah rRNA. Besarnya jumlah rRNA
dalam sel juga dipengaruhi strukturnya yang stabil dan ukurannya yang
besar.

c. tRNA
Transfer RNA (transfer-Ribonucleic acid) atau asam ribonukleat transfer
adalah
molekul
yang
menginterpretasikan
pesan genetik berupa
serangkaian kodon di sepanjang molekul mRNA dengan cara mentransfer
asam-asam aminoke ribosom dalam proses translasi. Dengan kata lain,
tRNA merupakan molekul pembawa asam-asam amino yang akan
disambungkan menjadi rantai polipeptida. Hal ini karena kemampuan
tRNA dalam membentuk kompleks dengan asam-asam amino. Asam
amino yang dibawa tRNA spesifik, oleh karena itu ada sekitar 20 macam
tRNA yang masing-masing membawa asam amino yang spesifik karena di
alam ada sekitar 20 asam amino yang menyusun protein. Asam amino
yang dibawa oleh tRNA sesuai dengan antikodon yang merupakan
komplemen dari kodon mRNA dan akan berpasangan secara antiparalel
saat translasi. Saat translasi, dua molekul tRNA akan menempel pada
ribosom untuk satu molekul mRNA, dan dua asam amino yang dibawa
oleh kedua tRNA tersebut akan dirangkaikan menjadi polipeptida. Inilah
prinsip sintesis rantai polipeptida. tRNA ialah salah satu dari molekulmolekul RNA selain mRNA dan rRNA yang dimiliki oleh semua organisme
selular dan berperan dalam ekspresi gen . tRNA dan rRNA adalah molekul
RNA yang bukan genom (bukan molekul yang diterjemahkan). Struktur

primer tRNA merupakan rantai nukleotida linear dengan ukuran panjang

73 sampai 93 nukleotida dengan berat molekul total antara 25 sampai 30
kilo dalton. Pada molekul tRNA terdapat jenis-jenis basa yang tidak umum
atau
termodifikasi.
Misalnya pseudourasil dan
dihidrourasil
yang
merupakan modifikasi dari basa urasil.