(P Danar) Materi Biokimia - Metabolisme Protein-Katabolisme (D-III THP) (Compatibility Mode)

METABOLISME
PROTEIN
(KATABOLISME)
BIOKIMIA
Program D-III Teknologi Hasil Pertanian
Universitas Sebelas Maret (UNS) Surakarta
Dosen:
Danar Praseptiangga, S.TP., M.Sc., Ph.D.
Fungsi Protein dalam sel hidup

Pembangun/pertumbuhan dan pemberi tenaga
Pengatur proses dalam tubuh
Memperbaiki sel yang rusak
Komunikasi antar sel (cell signaling)
Pembawa/transpor (misal: oksigen dibawa oleh
hemoglobin dalam darah)
Media kontraksi jaringan (otot)
Zat cadangan (pada susu dan biji-bijian)
Zat pelindung (antibodi)
Biokatalisator (enzim)
Hormon
Toksin (defense)
Biokimia- Dr. Danar Praseptiangga
Protein
Asam amino : sumber utama glukosa melalui jalur
glukoneogenesis
Glukoneogenesis dan glikogenolisis penting untuk
memback-up sumber glukosa pada saat puasa
Asam amino dalam tubuh terutama digunakan untuk
sintesis protein. Jika asupan glukosa rendah, asam
amino dapat diubah menjadi glukosa melalui jalur
glukoneogenesis (pembentukan glukosa baru dari
prekursor non karbohidrat)
Proporsi protein sebagai sumber energi dalam diet yang
dianjurkan adalah sebesar ~15%
Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga
STRUKTUR ASAM AMINO

Non-ionized form
H
Amino
group
H2N
C
R
O
C
Carboxyl
group
OH
Side chain
POLYPEPTIDE CHAIN
N-terminus
H
C-terminus
H H
O H H
O H
O H H
O H
C N
C
H
C
CH3
N C
CH2
CH2
OH
C OH
O H H
O H H
H H
N C
C N C
C N
C N C
CH2
CH
H3C
CH3
C
CH2
SH
O
OH
CH2
OH
PETA KONSEP
Karbohidrat, Lemak, Protein
Proses Metabolisme:
Anabolisme
Katabolisme
Energi
Reaksi enzimatik,
Reaksi Reduksi- Oksidasi
Proses sintesis sel dan enzim,

memelihara steady state sel,
penyerapan unsur hara, ekskresi
senyawa, pergerakan sel
LINTASAN METABOLISME PROTEIN

DIET PROTEIN
Protein jaringan
ASAM AMINO
DERIVAT NITROGEN
(non protein
TRANSAMINASI
KARBOHIDRAT/
GLUKOSA
NITROGEN AMINO
DALAM GLUTAMAT
BENDA KETON
ASETIL-KOA
DEAMINASI
SIKLUS ASAM
SITRAT
NH3
UREA/UREUM
JALUR BERSAMA METABOLISME
TRANSPORT
ELEKTRON
10
Makanan
(protein)
ESENSIAL
Asam Amino
ASAM KETO
SEL TUBUH
SIKLUS ASAM SITRAT
HATI
UREA
11
Protein dalam
makanan
pencernaan
Asam Amino
absorbsi
A. A dalam darah
A.A. dl HATI
(ektrasel)
A.A. Dalam darah
PROTEIN
A. A. ektra sel
Senyawa N lain
A. A. intra sel
PROTEI
N
A. A. dl Hati
(intra sel)
A. Keto
Sik. A. Sitrat
A. Keto
Asam lemak
NH3
S
urea
12
SUMBER ASAM AMINO

Asam amino yang beredar dalam darah dapat berasal
dari : - katabolisme protein makanan

- sintesis dalam tubuh
Protein makanan
Protein yang berasal dari makanan mengandung 20
macam/jenis asam amino yang penting secara biologis
Dalam lambung:
Enzim Pepsin dan Renin dalam suasana asam (pH 1);
terjadi denaturasi protein
13
Dalam sel-sel mukosa usus halus :

- Tripsin dan kimotripsin
- Aminopeptidase dan karboksipeptidase
Asam amino-asam amino yang terbentuk, secara aktif
ditransport ke dalam darah porta dan kemudian ke selsel tubuh untuk homeostasis
Asam amino yang terus menerus beredar dalam darah
2-6 mmol/L
Pengeluaran asam amino terutama melalui hati, sedikit
melalui ginjal dan otot
14
Sintesis dalam tubuh :

Asam amino hasil pencernaan makanan tidak terdapat
dalam perbandingan seperti yang diperlukan oleh tubuh,

oleh karena itu perlu disintesis dalam tubuh, terutama
asam amino non-esensial
Asam amino esensial adalah asam amino yang tidak
dapat disintesis dalam jumlah yang cukup yaitu :

fenilalanin, valin, triptofan, treonin, isoleusin, metionin,
histidin, arginin, leusin, dan lisin (Pvt Tim Hall)
15
Asam amino dalam darah

Jumlah asam amino dalam darah tergantung jumlah yang
diterima dan jumlah yang digunakan

Proses absorbsi asam amino dalam dinding usus adalah
proses transport aktif
Kondisi puasa. Konsentrasi asam amino dalam darah 3.55 mg/ 100 ml darah. Setelah ada asupan makanan
menjasi 5-10 mg/ 100 ml darah. Turun kembali setelah 6
jam
16
TRANSPORT DAN METABOLISME KARBOHIDRAT DAN

PROTEIN (GLUKOSA DAN ASAM AMINO)
17
Transport Glukosa + AA
* KH dan protein (glukosa + AA) larut dalam air/plasma,
sehingga dari usus halus langsung ke vena porta hati
* Dalam hati
Oksidasi menjadi CO2 + H2O

Glukosa
AA
Glikogen
18
AA :
Oksidasi menjadi CO2 + H2O + E

Deaminasi
Urea
NH3
Ginjal
Glukosa (glukoneogenesis)
Protein : Biosintesis protein
Plasma protein
Urea
Urine
19
* Dalam darah
Glukosa
Darah
Eritrosit
Laktat
Glukosa
Otot
Laktat
(hati)
Glikogen
Jaringan-jaringan lain :
Oksidasi
AA
Darah
CO2 + H2O + E
Otot : - Transaminasi
AA lain
hati
darah
- Biosintesis protein otot
20
KATABOLISME PROTEIN
Katabolisme atau penguraian protein merupakan satu
dalam pertukaran protein tubuh yang terjadi secara

kontinu dalam semua bentuk kehidupan
Dewasa normal : 1-2 % protein tubuh diganti/hari
Protein diuraikan menjadi asam amino
As.Amino :- 75-80 % sintesis protein baru
- 20-25 % amina membentuk ureum
karbon jadi KH dan Lemak
21
Amino acids used for synthesizing proteins are
obtained by degrading other proteins

Proteins destined for degradation are labeled with
ubiquitin
Polyubiquinated proteins are degraded by
proteosomes
Amino acids are also a source of nitrogen for other
biomolecules
22
Excess amino acids cannot be stored

Surplus amino acids are used for fuel
Carbon skeleton is converted to
AcetylCoA
AcetoacetylCoA
Pyruvate
Citric acid cycle intermediate
The amino group nitrogen is converted to urea and
excreted
Glucose, fatty acids and ketone bodies can be formed from
amino acids
23
Reaksi Metabolisme Asam Amino

Meliputi reaksi pelepasan gugus asam amino
Perubahan kerangka karbon
1. Transaminasi
Proses katabolisme asam amino yang berupa
pemindahan/interkonversi dari gugus amino suatu asam
amino ke senyawa lain (keto. asam piruvat, ketoglutarat,
atau oksaloasetat) atau di antara sepasang asam amino
dan sepasang asam keto
Sebagian besar asam amino (kecuali : lisin,treonin,prolin dan hidroksi
prolin)
Perlu enzim transaminase
Koenzim piridoksamin fosfat via basa Schiff
24
Enzim-enzim utama reaksi transaminasi

Alanin transaminase
Glutamat transaminase
Aspartate transaminase
2. Deaminasi oksidatif
Asam glutamat dapat mengalami deaminasi oksidatif
mengunakan glutamat dehidrogenase menghasilkan ion
NH4+
NADP NAD sebagai akseptor elektron
25
Katabolisme asam amino

Pemecahan asam amino baik berasal dari diet atau dari
biosintesis dimulai dengan melepaskan gugus alfa-amino

dari molekulnya melalui 2 reaksi utama :
1.
Transaminasi asam keto
2. Deaminasi Oksidatif ion amonium
26
Note:
Semua jaringan tubuh menghasilkan ion amonium
Ion amonium sangat beracun bagi sistem saraf pusat (SSP) dan
harus dihilangkan
Otak mengubah amonium menjadi glutamin
Glutamin mempunyai peranan membawa amonium ke hati dan
diubah menjadi urea
(urea/ureum sedikit beracun pada SSP)
Bila fungsi hati gagal Keracunan amoniak
penglihatan kabur
tremor
bicara tidak jelas
akhirnya koma (koma hepatikum)
meninggal
27
The first step in catabolism of most amino acids is transamination

CO2+H N-C-H
3
amino acid
C=O
R
-keto
acid
CO2C=O
CH2
CH2
-ketoglutarate
CO2-
CO2-
CO2+H N C H
3
CH2
CH2
CO2-
glutamate
The main function of transamination is to funnel amino groups

into a small number of amino acids, particularly Glu & Asp.
Some amino transferases (transaminases) are specific for
-ketoglutarate and Glu; others use oxaloacetate and Asp.
28
Transamination
Generally these enzyme funnel amino groups to
ketoglutarate.
Aspartate transaminase
Alanine transaminase
29
H
R1 C COO
Transaminases
(aminotransferas
es) catalyze the
reversible
reaction at right
R2
NH3
C COO
O
Transaminase
H
R1 C COO
R2
C COO
NH3
There are multiple transaminase enzymes which vary in
substrate specificity.
Some show preference for particular amino acids or classes
of amino acids as amino group donors, and/or for particular

a-keto acid acceptors.
30
COO
COO
COO
CH2
COO
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
HC
NH3+
COO
COO
COO
HC
NH3+
COO
aspartate -ketoglutarate oxaloacetate glutamate
Aminotransferase (Transaminase)
Example of a Transaminase reaction:
Aspartate donates its amino group, becoming the -
keto acid oxaloacetate.

-Ketoglutarate
accepts the amino group, becoming the

amino acid glutamate.
31
CH3
HC
COO
COO
CH2
CH2
CH2
NH3+
COO
alanine
CH3
O
COO
-ketoglutarate
CH2
O
COO
pyruvate
HC
NH3+
COO
glutamate
In another example, alanine becomes pyruvate as the
amino group is transferred to -ketoglutarate
32
Transaminases equilibrate amino groups among
available -keto acids

This permits synthesis of non-essential amino acids,
using amino groups from other amino acids & carbon

skeletons synthesized in a cell
Thus a balance of different amino acids is
maintained, as proteins of varied amino acid contents

are synthesized.
Although the amino N of one amino acid can be used
to synthesize another amino acid, N must be

obtained in the diet as amino acids (proteins)
33
Deamination
Glutamate dehydrogenase
34
Glutamate
Dehydrogenase
catalyzes a
major reaction
that effects
net removal of
N from the
amino acid pool.
H2
OOC C
glutamate
H2
C
NH3+
C
H
H2O
COO
NAD(P)+
NAD(P)H
O
H2 H2
OOC C C
-ketoglutarate
COO + NH4+
Glutamate Dehydrogenase
It is one of the few enzymes that can use NAD+ or NADP+ as
electron acceptor
Oxidation at the a-carbon is followed by hydrolysis, releasing NH4+
35
Amino acid
-keto acid
-ketoglutarate
NADH + NH4
glutamate
Transaminase
NAD + H2O
Glutamate
Dehydrogenase
Summarized above:
The role of transaminases in funneling amino N to
glutamate, which is deaminated via Glutamate
Dehydrogenase, producing NH4+.
36
Deamination
In most terrestrial vertebrates the ammonium ion is
converted to urea
37
Pyridoxal Phosphate
Pyridoxal phosphate forms a
Schiff-base intermediates in
aminotransferase reactions
38
Pyridoxyl Phosphate
Pyridoxyl phosphate can under go acid/base
tautomerization
39
Pyridoxyl Phosphate
The aldehyde forms a Schiffbase with an amino
group on the enzyme

This Schiff-bases can be exchanged for one with the amino
group of an amino acid
40
Pyridoxyl Phosphate
Transamination mechanism:
The second half of the reaction reverses these steps with a
different keto acid.
41
Pyridoxyl Phosphate
Pyridoxyl phosphate is a very versatile cofactor
used to make bonds to C susceptible to cleavage
42
Serine and Threonine

The hydroxy amino acids, serine
and threonine, can be directly

deaminated
43
+
H2O NH4
H2O
HO
CH2
H
C
COO
NH3+
serine
H2C
COO
H3C
COO
NH3+
aminoacrylate
pyruvate
Serine Dehydratase
Some other pathways for deamination of amino acids:
1. Serine Dehydratase catalyzes:
serine pyruvate + NH4+
2. Peroxisomal L- and D-amino acid oxidases catalyze:
amino acid + FAD + H2O
a-keto acid + NH4+ + FADH2
FADH2 + O2 FAD + H2O2
Catalase catalyzes: 2 H2O2 2 H2O + O2
44
Transporting Nitrogen to Liver

Urea is produced in the Liver
The alanine cycle (reminiscent of the Cori
cycle/ Lactic acid cycle) is used to transport nitrogen
to the liver
45
The amino groups of glutamic acid and glutamine

can be released as ammonia in liver mitochondria
cellular
protein
ingested
protein
CO2+
amino H3N C H
acids
R
-ketoglutarate
CO2-
transaminases
C=O -keto
R
CO2+H N C H
3
CH2
CH2 Glu
CO2C=O
CH2
CH2
CO2-
glutamate
dehydrogenase
NADH or
NADPH + H+
CO2NAD+ or
NADP+
But ammonia is toxic,

particularly to neural tissue.
Organisms must get rid of it.
NH4+
NH4+
acids
CO2+H N C H
3
CH2
H2O
CH2
CONH2
Gln from
muscle &
other tissue
46
Pembentukan Asetil Koenzim A

Merupakan senyawa penghubung antara metabolisme asam
amino dengan siklus asam sitrat(merubah menjadi energi)

1. Jalur asam piruvat
2. Jalur asam asetoasetat
47
AMINO ACID DEGRADATION INTERMEDIATES

Glucogenic
Ala
Cys
Gly
Ketogenic
* Both Glucogenic and Ketogenic

Purely Ketogenic
CO2
Ile*
Leu
Lys
Thr*
Ser
Thr*
Trp*
Pyruvate
Glucose
Acetyl-CoA
Acetoacetate
Asn
Asp
Citrate
Oxaloacetate
Asp
Phe*
Tyr*
Fumarate
Leu
Lys
Phe*
Citric
Acid
Cycle
Trp*
Tyr*
Isocitrate
CO2
Ile*
Met
Val
Succinyl-CoA
-ketoglutarate
CO2
Arg
Glu
Gln
His
Pro
48
METABOLISME PROTEIN / ASAM AMINO
1
6
4
3
49
JALUR BIOKIMIA PRODUKSI ENERGI
50
Amino acids
Most mammals convert aminoacid nitrogen to urea for excretion
The carbon chains are

broken down to molecules
that feed into the TCA cycle.
NH4+
Some animals
excrete NH4+ or
uric acid.
most terrestrial
vertebrates
fish & other aquatic

vertebrates
birds & reptiles
O
O
H2N-C-NH2
NH4+
ammonium ion
HN
urea
uric acid O
H
N
O
N
H
N
H
51
Oksidasi Asam Amino

Degradasi asam amino dimulai dengan pelepasan gugus amino
menghasilkan kerangka C diubah menjadi senyawa antara

metabolisme utama tubuh
Metabolisme asam amino pada umumnya terjadi di hati

Kelebihan di luar liver dibawa ke hati diekskresikan
Ammonia digunakan kembali untuk proses biosintesis
diekskresi secara langsung atau diubah dulu menjadi asam urat /
urea
Vertebrata terestrial urea
ureotelic
Burung dan reptil asam urat

Binatang di air ammonia
uricotelic
ammonotelic
52
Proses Pengeluaran
Berdasarkan zat yang dibuang
Defekasi: pengeluaran zat sisa hasil pencernaan (feses)
Ekskresi: pengeluaran zat sisa hasil metabolisme (CO2,
keringat dan urine)

Sekresi: pengeluaran getah yang masih berguna bagi tubuh
(enzim dan hormon)
53
Sistem Ekskresi
Sistem pengeluaran zat-zat sisa metabolisme yang
tidak berguna bagi tubuh dari dalam tubuh
Menghembuskan gas CO2 ketika kita bernafas
Berkeringat
Buang air kecil (urine)
54
Alat-alat Ekskresi
Alat-alat ekskresi pada manusia meliputi:
- Ginjal
- Hati
- Kulit
- Paru-paru
55
Ginjal (ren)
Manusia memiliki sepasang
ginjal yang terletak di

depan sebelah kiri dan
kanan tulang belakang
bagian pinggang
56
Struktur Ginjal
glomerulus
Pembuluh kapiler
korteks
Arteri ginjal
Medula/
Sumsum ginjal
Vena ginjal
ureter
Saluran pembawa
Hasil penyaringan
57
Fungsi Ginjal
Menyaring darah dan menghasilkan urine
Membuang zat-zat yang membahayakan tubuh (urea, asam
urat)
Membuang zat-zat yang berlebihan dalam tubuh (kadar
gula)
Mempertahankan tekanan osmosis cairan ekstraseluler
Mempertahankan keseimbangan asam dan basa
58
Pembentukan Urine
Filtrasi darah di dalam glomerulus
menghasilkan filtrat glomerulus

(urine primer)
Urine primer di reabsorsi di
dalam tubulus konturtus proksimal
untuk menyerap zat-zat yang
masih berguna. Dihasilkan filtrat
tubulus (urine sekunder)
Konturtus
Urine sekunder diaugmentasi
didalam tubulus konturtus distal
menghasilkan urine
Urine mengandung air,
urea,amonia, garam mineral, zat
warna empedu, vitamin, obatobatan dan hormon
glomerulus
Pembuluh kapiler
Arteri ginjal
Vena ginjal
ureter
Saluran pembawa
Hasil penyaringan
59
Hati (hepar)
Kelenjar terbesar dalam tubuh
manusia (~2 kg) yang terletak

di rongga perut sabelah kanan
di bawah diafragma
60
Struktur Hati
61
Fungsi Hati
Menghasilkan empedu (bilus) yang mengandung zat
sisa dari perombakan eritosit di dalam limpa

Menyimpan gula dalam bentuk glikogen
Mengatur kadar gula darah
Tempat pembentukan urea dari amonia
Menawarkan racun
Membentuk vitamin A dari provitamin A
Tempat pembentukan fibrinogen protrombin
62
Proses di dalam Hati

Sel darah merah yang sudah tua (histiosita) dipecah
didalam hati
Hb
hati
Fe
Globin
Hemin
Sumsum tulang
Metabolisme
protein
bilirubin
Pembentukan Hb baru
urobilin
sterkobilin
urine
USUS
feses
63
Kulit (integumen)
Lapisan terluar tubuh
manusia dan merupakan

pelindung bagian dalam
tubuh
64
Fungsi Kulit
Mengeluarkan keringat
Melindungi bagian dalam tubuh dari gesekan, kuman,
penyinaran, panas dan zat kimia

Mengatur suhu tubuh
Menerima rangsangan dari luar
Mengurangi kehilangan air
65
Hasil samping metabolisme yang paling toksik : buangan yang
mengandung nitrogen dari perombakan protein dan asam nukleat
Nitrogen dikeluarkan ketika makromolekul tersebut dirombak dan
diuraikan untuk mendapatkan energi, atau ketika makromolekul diubah

menjadi karbohidrat atau lemak
Produk buangan bernitrogen : amonia

Mengekskresikan amonia secara langsung merupakan cara efisien untuk
membuang limbah itu karena sama sekali tidak ada energi yang
dikeluarkan
Hewan yang terlebih dahulu mengubah amonia menjadi senyawa seperti
urea atau asam urat, yang kurang toksik namun memerlukan energi
dalam bentuk ATP untuk menghasilkannya
66
Ammonia diubah menjadi Urea dengan SIKLUS UREA

(UREA CYCLE)
67
O
NH 3
Urea Cycle
CH 2
NH 3
NH
citrulline
CH 2
Pi
CH 2
AT P
AMP + PP i
H2O
COO
C
NH 2
urea
CH 2
COO
ornithine
H2N
COO
NH 3 +
HC
Urea Cycle
COO
NH 2
CH 2
CH 2
HC
OPO 3 2
carbamoyl
phosphate
CH 2
Enzymes in
mitochondria:
1. Ornithine
Transcarbamylase
Enzymes in
cytosol:
2. ArgininoSuccinate
Synthase
3. Argininosuccinase
4. Arginase
H2N
H2N
NH 2
NH
arginine
COO
HC
CH 2
HC
CH
NH 3 +
COO
COO
HC
H
N
COO
CH 2
NH 2
aspartate
CH 2
CH 2
HC
COO
fumarate
NH 2 +
NH
CH 2
CH 2
argininosuccinate
CH 2
HC
NH 3 +
COO
68
cytosol
mitochondrial matrix
carbamoyl phosphate
Pi
ornithine
citrulline
ornithine
urea
arginine
citrulline
aspartate
argininosuccinate
fumarate
For each cycle, citrulline must leave the mitochondria, and ornithine must
enter the mitochondrial matrix

An ornithine/citrulline transporter in the inner mitochondrial membrane
facilitates transmembrane fluxes of citrulline & ornithine
69
cytosol
mitochondrial matrix
carbamoyl phosphate
Pi
ornithine
citrulline
ornithine
urea
arginine
citrulline
aspartate
argininosuccinate
fumarate
A complete Krebs Cycle functions only within mitochondria
But cytosolic isozymes of some Krebs Cycle enzymes are involved in
regenerating aspartate from fumarate

70
COO
COO
COO
CH2
COO
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
HC
NH3+
COO
COO
COO
HC
NH3+
COO
aspartate -ketoglutarate oxaloacetate glutamate
Fumarate is converted to oxaloacetate via Krebs Cycle enzymes Fumarase
& Malate Dehydrogenase

Oxaloacetate is converted to aspartate via transamination (e.g., from
glutamate)
Aspartate then reenters Urea Cycle, carrying an amino group derived from
another amino acid
71
THE UREA CYCLE
72
THE UREA CYCLE

PPi langsung di hidrolisis shg urea cycle 4
phosphat
Fumarat menghubungkan dengan TCA cycle
Fumarat malate OAA
OAA mempunyai beberapa alternatif jalur
Transaminasi menjadi aspartate
Diubah menjadi glukosa dengan glukoneogenesis
pathway
Berkondensasi dgn acetyl coA citrate
Diubah menjadi pyruvate
73
THE UREA CYCLE
74
Formation of Carbamoyl Phosphate

Carbamoyl synthetase
Free NH4 reacts with HCO3 to form carbamoyl phosophate
Reaction is driven by the hydrolysis of two molecules of ATP
75
Formation of Citrulline
Ornithine transcarbamoylase
Citrulline is formed from transfer of the carbamoyl group to
the -amino group of ornithine
76
Formation of Arginosuccinate
Condensation of citrulline with aspartate to form
arginosuccinate
Two equivalent of ATP are required
77
Formation of Arginine and Fumarate

Arginosuccinase
Cleaves arginosuccinate to form arginine and fumarate
78
Formation of Urea
Arginase
The arginine is hydrolyzed to produce the urea and to reform
the ornithine
The ornithine reenters the mitochondrial matrix
79
Sintesa urea jalur utama untuk pelepasan Ammonia

Kelima tahapan reaksi diatas terjadi dalam suatu
siklus urea dan kemudian urea dikeluarkan dari tubuh

melalui ginjal
Kegagalan ginjal akan menimbulkan suatu keadaan yang
disebut dengan Uremia
mual, muntah, koma (koma uremik) dan dapat
menimbulkan kematian
terapi dengan alat hemodialisa
80
81
Linked to Citric Acid Cycle

The urea cycle is linked to the citric acid cycle:
Krebs Bi-cycle!!
82
Carbon Atoms
The carbon atoms of degraded amino acids emerge as major
metabolic intermediates
Degradation of the 20 amino acids funnel into 7 metabolic
intermediates
AcetylCoA
AcetoacetylCoA
Ketogenic
Pyruvate
-Ketoglutarate
SuccinylCoA
Fumarate
Oxaoloacetate
Glucogenic
83
Carbon Atoms
Ketogenic
Glucogenic
Both
leucine
lysine
serine
threonine
aspartic acid
glutamic acid
asparagine
glutamine
glycine
alanine
valine
proline
histidine
arginine
methionine
cysteine
isoleucine
phenylalanine
tryptophan
tyrosine
84
Carbon Atoms
85
Pyruvate Entry Point
86
Oxaloacetate Entry Point

Aspartate
Transamination to oxaloacetate
Asparagine
+
Hydrolysis to Aspartate + NH
4
Transmination to oxaloacetate
87
Ketoglutarate Entry Point

Five carbon amino acids
88

Histidine
89

Proline and Arginine
90
SuccinylCoA Entry Point

Methionine, Valine & Isoleucine
91
SuccinylCoA Entry Point

Methionine
Forms S-Adenosylmethionine
92
Branched-chained Amino Acids
93
Aromatic Amino Acids

Phenylalanine
94

Tetrahydrobiopterin - electron carrier
95

Phenylalanine & Tyrosine
96

Tryptophan
97
Strategi degradasi asam amino mengubah kerangka C
nya menjadi senyawa intermediete dari metabolisme

primer diubah menjadi glukosa atau dioksidasi oleh
TCA
Asam amino berasal dari senyawa intermediet
glikolisis, siklus asam sitrat, dan pentose phosphate
pathway
Nitrogen masuk ke dalam metabolisme melalui Glutamat
dan Glutamin
Kemampuan organisme untuk mensintesis asam amino
berbeda-beda
Bakteri dan tumbuhan pada umumnya mampu
mensintesis seluruh asam amino
Mammals hanya separuh dari total asam amino
98
Notes
Bakteri, ragi (yeast) dan kapang (molds) memerlukan senyawa
nitrogen dalam bentuk asam amino, serta asam nukleat purin dan
pirimidin
Mikroba lainnya dapat menggunakan ammonia atau nitrat untuk
mensintesis senyawa nitrogen organik. Beberapa bakteri
memfiksasi N2 menjadi ammonia
Asimilasi ammonia
L-Glutamat + NH4+ + ATP L-glutamine + ADP + Pi
Selanjutnya glutamate synthase mentrasfer satu gugus amino
dari glutamine ke molekul -ketoglutarat sehingga terbentuk
dua molekul L-glutamat
-ketoglutarat + L-glutamine + NADPH2 + H+ L-Glutamat +
NADP+
99
Siklus Nitrogen
Nitrogen adalah elemen yang esensial untuk biomolekul seperti AA,
nukleotida
Seluruh organisme mampu mengubah ammonia (NH3) menjadi
substansi atau senyawa organik yang mengandung N
Reduksi N2 NH3 hanya dapat dilakukan oleh mikroorganisme
baik bebas atau yang memerlukan simbiosis dengan tumbuhan
proses ini disebut fiksasi nitrogen secara biologis
Reduksi NO3- NH3 : banyak ditemukan pada mikroorganisme
dan tumbuhan
Di biosfer harus selalu dipelihara keseimbangan antara N
inorganik dan N organik
Konversi nitrogen inorganik nitrogen organik : fiksasi nitrogen
dan reduksi nitrogen
Nitrogen organik nitrogen inorganik : katabolisme, dan
denitrifikasi
Nitrosomonas mengoksidasi ammonia nitrit
Nitrobacter mengoksidasi nitrit menjadi nitrat
100

(P Danar) Materi Biokimia - Metabolisme Protein-Katabolisme (D-III THP) (Compatibility Mode)

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Judul Asli

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

(P Danar) Materi Biokimia - Metabolisme Protein-Katabolisme (D-III THP) (Compatibility Mode)

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

METABOLISME

Fungsi Protein dalam sel hidup

Biokimia- Dr. Danar Praseptiangga

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

STRUKTUR ASAM AMINO

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Proses sintesis sel dan enzim,

LINTASAN METABOLISME PROTEIN

JALUR BERSAMA METABOLISME

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

SIKLUS ASAM SITRAT

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

A.A. Dalam darah

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

SUMBER ASAM AMINO

dari : - katabolisme protein makanan

Biokimia- Dr. Danar Praseptiangga

Dalam sel-sel mukosa usus halus :

Biokimia- Dr. Danar Praseptiangga

Sintesis dalam tubuh :

dalam perbandingan seperti yang diperlukan oleh tubuh,

dapat disintesis dalam jumlah yang cukup yaitu :

Biokimia- Dr. Danar Praseptiangga

Asam amino dalam darah

diterima dan jumlah yang digunakan

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

TRANSPORT DAN METABOLISME KARBOHIDRAT DAN

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Oksidasi menjadi CO2 + H2O

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Oksidasi menjadi CO2 + H2O + E

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

dalam pertukaran protein tubuh yang terjadi secara

Amino acids used for synthesizing proteins are

obtained by degrading other proteins

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Excess amino acids cannot be stored

Reaksi Metabolisme Asam Amino

Enzim-enzim utama reaksi transaminasi

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Katabolisme asam amino

biosintesis dimulai dengan melepaskan gugus alfa-amino

Biokimia- Dr. Danar Praseptiangga

The first step in catabolism of most amino acids is transamination

The main function of transamination is to funnel amino groups

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

There are multiple transaminase enzymes which vary in

of amino acids as amino group donors, and/or for particular

aspartate -ketoglutarate oxaloacetate glutamate

keto acid oxaloacetate.

accepts the amino group, becoming the

amino group is transferred to -ketoglutarate

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Transaminases equilibrate amino groups among

available -keto acids

using amino groups from other amino acids & carbon

maintained, as proteins of varied amino acid contents

to synthesize another amino acid, N must be

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga

Biokimia - Dr. Danar Praseptiangga