Virus & Bakteri

Chapter 14
Biology 11
DR. HARUN RASYID, MP

What are Viruses

Virus adalah partikel non seluler yang
terbuat dari materi genetik dan
protein yang dapat menginvasi sel
hidup

 Virus ukurannya sangat kecil dan dapat melalui saringan (filter) bakteri.
Ukuran virus umumnya 0,01-0,1 . Virus tidak dapat diendapkan dengan
sentrifugasi biasa. Untuk melihat virus diperlukan mikroskop elektron.
Sifat-sifat virus yang penting antara lain:
1. Virus hanya mempunyai 1 macam asam nuklein (RNA atau DNA)
2. Untuk reproduksinya hanya memerlukan asam nuklein saja.
3. Virus tidak dapat tumbuh atau membelah diri seperti mikrobia
lainnya

Virus memiliki sifat-sifat khas dan tidak merupakan jasad yang dapat
berdiri sendiri.
Virus memperbanyak diri dalam sel jasad inang (parasit obligat) dan
menyebabkan sel-sel itu mati.
Sel inang adalah sel manusia, hewan, tumbuhan, atau pada jasad renik
yang lain.
Sel jasad yang ditumpangi virus dan mati itu akan mempengaruhi sel-sel
sehat yang ada didekatnya, dan karenanya dapat mengganggu seluruh
kompleks sel (bercak-bercak daun, bercak-bercak nekrotik dan
sebagainya.

BAKTERIOPHAGE (VIRUS YANG MENYERANG BAKTERI)

Virus pada bakteri coli (T-phage) terdiri atas dua bagian, yaitu
bagian kepala yang berbentuk heksagonal dan bagian
ekornya.
Bentuk demikian itu hanya dapat dilihat pada pengamatan
dengan mikroskop elektron.
Bagian kepala terdiri atas bagian utama yang bagian pusatnya
terdiri atas DNA; sedang bagian luarnya merupakan selubung
protein yang berfungsi sebagai pelindung.
Bagian ekornya berupa tubus yang mempunyai sumbat, selain
itu dilengkapi pula dengan serabut ekor.
Bakteri yang terserang bakteriofag akan lisis.

T4 Bacteriophage

BAKTERIOPHAGE (VIRUS YANG MENYERANG BAKTERI)

Untuk mendapatkan gambaran tentang siklus hidup bakteriofag,
perlu ditinjau tingkatan-tingkatan yang terjadi pada waktu phage
menyerang bakteri:
a. Pada permulaannya phage melekat dengan bagian ekornya
pada bagian tertentu dari sel (fase adsorpsi phage pada sel) .
b. DNA phage dimasukkan ke dalam sel melalui tubus ekornya,
DNA phage merusak DNA bakteri sehingga proses di dalam sel
dikendalikan oleh DNA phage, kemudian akan terbentuk protein
(selubung) phage dan DNA phage yang baru (fase perkembangan
phage).
c. Fase yang terakhir ialah keluarnya partikel-partikel virus
(bekteriophage) dari sel. Sel bakteri mengalami lisis (bakteriolisis/
fase pembebasan phage).

Herpes Virus

Escherichia Coli
Bacterium

E. coli is a bacterium. That is a crude cell, it is not a

virus because viruses are protein containers with DNA
cores or RNA cores.

E. Coli and the

Bacteriophage

What it looks like in

real life

The Structure Of a Virus

Viruses are composed
of a core of nucleic
acid
The Nucleic acid core
is surrounded by a
protein coat called a
capsid
The Nucleic core is
either made up of
DNA or RNA but
never both

Cycle of Lytic and Lysogenic

VIRUS TUMBUHAN
Virus tumbuhan pada umumnya masuk ke dalam sel melalui
luka, jadi tidak dapat menerobos secara aktif.
Di alam virus tumbuhan disebarkan dengan pertolongan
hewan serangga vektor atau dengan cara lain, misalnya
tanaman Cuscuta dengan haustorianya juga memindahkan
virus melalui sistem jaringan angkutannya (buluh-buluh
pengangkutan).
Banyak jenis virus yang memperbanyak diri terlebih dahulu di
dalam tractus digestivus hewan-hewan vektornya.
Setelah
masa inkubasi
tertentu
dapat
menyebabkan infeksi pada tumbuh-tumbuhan lagi. Virus
semacam itu dikenal sebagai virus yang persisten.
Virus tumbuhan yang telah banyak dipelajari adalah TMV
(Tobacco Mozaic)
Virus = Virus Mozaik Tembakau). Bahan genetik virus ini ialah
RNA.

Plant Viruses

Tobacco Mosaic Virus (TMV) causes

mottling symptoms
Rose mosaic virus
Spots on fruit
Wheat stunt virus

BENTUK VIRUS

Suatu virion terdiri atas bahan genetik (RNA atau DNA) yang
diselubungi oleh selubung protein.
Selubung protein ini disebut kapsid.
Asam nuklein yang diselubungi kapsid disebut nukleokapsid.
Nukleokapsid dapat telanjang misalnya pada TMV (Tobacco
Mozaik
Virus yang menyebabkan penyakit bercak daun),
Adenovirus dan virus kutil (Warzervirus); atau diselubungi
oleh suatu membran pembungkus misalnya pada virus
influenza, virus herpes.

BENTUK VIRUS
Kapsid terdiri atas bagian-bagian yang disebut kapsomer
(misalnya pada TMV dapat terdiri atas hanya satu rantaian
polipeptida, juga dapat terdiri atas protein monomer-protein
monomer yang identik yang masing-masing terdiri atas
rantaian polipeptida).
Pada dasarnya kapsid terdiri atas banyak satuan-satuan dasar
yang identik. Pada umumnya kapsid tersusun simetris.
Pada TMV (suatu virus yang berbentuk batang) kapsomernya
tersusun dalam bentuk anak tangga uliran spiral.
Bentuk dasar virus adalah yang bulat, silindris, kubus,
polihedral, seperti huruf T, dan lain-lain.

Virus structure

Viruses: Just a protein coat

for protection (capsid) and a
nucleic acid (RNA or DNA) for
information on how to make
more copies of the same virus
Cannot replicate/reproduce on
its own! Needs a host

Virus is a cellular parasite

Uses cell machinery of a

host cell to replicate and
to produce more viruses
They come in
many varieties,
sizes & shapes

Viruses cause diseases

Viruses cause numerous diseases in Plants,

animals, bacteria & fungi
Examples of human viruses:
Herpes virus
Hepatitis virus
Rabies
Ebola emerging epidemics
Influenza (flu) respiratory infection (fever,
headache, chills, cough, stuffy nose, sore
throat) caused by a variety of viruses. Flu
season: Nov. March.
Passed on by sneezing, coughing air, hand-tomouth, etc.
Vaccine helps prevent outbreaks.

Human Viruses

Human Immunodeficiency Virus (HIV)

causes AIDS.
Transmitted through
sexual contact,
sharing infected needles,
blood transfusions,
mother to baby.
Severe Acute Respiratory Syndrome
(SARS) brand new deadly virus, started
in China, causes atypical pneumonia.
Spreads quickly.

Retrovirus

Change DNA
into RNA.
Example of a
Retrovirus is
HIV

A typical, "minimal"
retrovirus consists of:
an outer envelope which
was derived from the
plasma membrane of its
host
many copies of an
envelope protein
embedded in the lipid
bilayer of its envelope
a capsid; a protein shell
containing
two molecules of RNA
and
molecules of the
enzyme reverse
transcriptase

Bacteria Cell

Bakteri merupakan mikrobia prokariotik uniselular,

termasuk klas Schizomycetes, berkembang biak secara
aseksual dengan pembelahan sel. Bakteri tidak
berklorofil kecuali beberapa yang bersifat fotosintetik.
Cara hidup bakteri ada yang dapat hidup bebas,
parasitik, saprofitik, patogen pada manusia, hewan dan
tumbuhan. Habitatnya tersebar luas di alam, dalam
tanah, atmosfer (sampai + 10 km diatas bumi), di
dalam lumpur, dan di laut.
Bakteri mempunyai bentuk dasar bulat, batang, dan
lengkung. Bentuk bakteri juga dapat dipengaruhi oleh
umur dan syarat pertumbuhan tertentu.
Bakteri dapat mengalami involusi, yaitu perubahan
bentuk yang disebabkan faktor makanan, suhu, dan
lingkungan yang kurang menguntungkan bagi bakteri.
Selain itu dapat mengalami pleomorfi, yaitu bentuk
yang bermacam-macam dan teratur walaupun
ditumbuhkan pada syarat pertumbuhan yang sesuai.
Umumnya bakteri berukuran 0,5-10 .

Berdasarkan klasifikasi artifisial yang dimuat dalam buku

Bergeys manual of determinative bacteriology tahun
1974, bakteri diklasifikasikan berdasarkan deskripsi sifat
morfologi dan fisiologi.
Dalam buku ini juga terdapat kunci determinasi untuk
mengklasifikasikan isolat bakteri yang baru ditemukan.
Menurut Bergeys manual, bakteri dibagi menjadi 1
kelompok (grup), dengan Cyanobacteria pada grup 20.
Pembagian ini berdasarkan bentuk, sifat gram, kebutuhan
oksigen, dan apabila tidak dapat dibedakan menurut
ketiganya maka dimasukkan ke dalam kelompok khusus.

Prokaryotes

Cells that do not have a

nucleus
Exist almost every where on
earth
Grow in numbers so great you
can see them with the unaided
eye
Are placed in either the
Eubacteria or the
Archebacteria Kingdoms
Make up the smaller of the two
kingdoms

Eubacteria
Make up the larger of
the two prokaryote
kingdoms
Generally are
surrounded by a cell
wall composed of
complex
carbohydrates

Cyanobacteria

Photosynthetic
bacterium
Bluish-greenish color
Contain membranes
that carry out the
process of
photosynthesis
Do not contain the
same type of
chloroplasts as
plants do
This bluish-greenish
algae can be found
nearly everywhere
on earth.
Can survive in
extremely hot
environments and
even extremely cold
environment

Archaebacteria
Lack important
carbohydrate found
in cell walls
Have different lipids
in their cell
membrane
Different types of
ribosomes
Very different gene
sequences
Archaebacteria can
live in extremely
harsh environments
They do not require
oxygen and can live
in extremely salty
environments as well
as extremely hot
environments.

Identifying Prokaryotes
Cell Shape
Cell Wall
Movement

Bacterium Shapes

Cocci~ Sphere shaped

bacteria
Bacillus~ Rod shaped bacteria
Spirrillium ~ Spiral shaped
bacteria
Flagella~ Leg-like structures
that help to propel the
bacterium.

Gram + and Gram Bacterium

Cell Walls

Cellular Walls

Chemical nature of a cell wall can be

determined by Gram Staining
By finding out what color the cell produces
when it is gram stained you can figure out
the type of carbohydrates in the cell wall

Movement
Flagella ~ Tail like structure the
whips around to propel the
bacterium
Cillia ~ Miniature flagella surround
the cell that help to swim
Non motile ~ Sticky cillia like
structures that keep the bacterium
from moving

Flagella

Bacteria and their

energy

Autotrophs
Chemotrophs
Heterotrophs

Autotrophs

Make their own

energy
Using Solar energy
Eg. Cyanobacteria

Chemotrophs

Make own Energy

Using Chemical
energy
Eg. Archaebacteria

Heterotrophs

Obtain food
By eating
Eg. E-coli

Bacteria Respiration

Obligate Anaerobes
Facultative
Anaerobes

Obligate Aerobes

Live without
Oxygen
Can live with or
without oxygen
Cannot live without
oxygen.

Bacteria Reproduction

Binary Fission
Conjugation
Spore Formation

Cellular organism copies its genetic information then splits into

two identical daughter cells

Conjugation

A type of Bacteria Sex

Two organism swap
genetic information,
that contains the
information such as a
resistance to penicillin

Spore Formation: Endospore

A type of dormant cell
Exhibit no signs of life
Highly resistant to
environmental stresses such
as:
-High temperatures
-Irradiation
-Strong acids
-Disinfectants
Endospores are formed by
vegetative cells in response to
environmental signals that
indicate a limiting factor for
vegetative growth, such as
exhaustion of an essential
nutrient.

Symbiosis

Close relationship
between to species
in which at least
one species
benefits from the
other
Live together for
LIFE

Parasitism

Bacteria exploit the

host cell, injuring
them
Eg. Mychobacterium
tuberculosis

Mutualism

Symbiosis in which two

of the species live
together in such a way
that both benefit from
the relationship
Eg. E-coli

Nitrogen Fixations
Process by which nitrogen in the
atmosphere is converted into a form that
can be used by living things

THE END