1

PRAKTIKAL 6
MENGUKUR DIVERSITI GENETIK

Tujuan : Untuk mengkaji dan mengukur diversiti genetik

TUGASAN

Anda bertugas untuk sebuah agensi pemuIiharaan dan
berdepan dengan satu krisis : sebuah kawasan dengan
enam jenis tanah Iembap ang berbeza, ang diketahui
hana tanah bagi dua jenis orkid Iiar ang sedang
dibangunkan menjadi kawasan perindustrian.
Organisasi anda hana mampu membeIi dan menjaga
empat tanah sahaja. Mana satukah antara keenam-
enam tanah ang harus dijaga? Dua daripadana iaIah
tanah Iembap, tiga Iagi adaIah paa bersama dengan popuIasi Pterostylis
isozymus. Tiga jenis paa ang Iain merupakan satu-satuna popuIasi ang
paIing berkait rapat tetapi spesis ang jauh Pterostylis polyzymous tinggaI. Anda
menghantar sampeI daun ke sebuah koIej untuk anaIisa genetik, dan menerima
data seperti di bawah, iaitu di daIam bentuk geI protein eIektroforesis untuk satu
Iokus aIIozme ang poIimorfik bagi kedua-dua spesis. Lokus tersebut
mempunai dua aIIeI, 'Cepat' dan 'PerIahan' kerana mereka bergerak pada kadar
ang berbeza merentasi geI tersebut, di mana aIIeIe ang cepat berada di bawah
aIIeIe ang perIahan.









Langkah 1

Untuk mengukur bagaimana variasi genetik tersebar di antara populasi, frekuensi allele
perlu dikenalpasti di dalam setiap populasi. Lokus alozyme mempunyai dua bentuk.
dentiti bagi setiap allele di dalam setiap individu ditunjukkan melalui banding pattern
yang ada di dalam gel. Sebagai contoh, individu pertama di baris pertama di dalam gel
pertama adalah heterozygous, di mana dua allele tersebut adalah berbeza dan diwakili
oleh simbol (+) bagi kedua-dua cepat dan perlahan. Sebaliknya, individu di baris kedua
ialah homozygous, yang mempunyai satu band mewakili dua allele perlahan.

O Tentukan frekuensi allele di dalam setiap populasi bagi allele cepat (p) dan allele
perlahan (q) dengan mengira bilangan allele bagi individu di dalam setiap
populasi (homozygote mempunyai dua allele yang sama, oleh itu anda perlu
mengira + dua kali ganda, dan jumlah bagi allele bagi 15 individu tersebut ialah
x 15 = 30. Bahagikan jumlah tersebut dengan jumlah allele yang hadir dai dalam
populasi tersebut (sentiasa sama dengan dua kali ganda bilangan individu).















3

!terostylis isozymus, Populasi 1 (individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)
1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 13 14 15 Jum
Slow 3
ast 7

!terostylis isozymus, Populasi (individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)
1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 13 14 15 Jum
Slow




1
ast

18

!terostylis isozymus, Populasi 3 (individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)
1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 13 14 15 Jum
Slow 4
ast

6

!terostylis polyzymus, Populasi 1 (individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)
1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 13 14 15 Jum
Slow



1
ast

18

!terostylis polyzymus, Populasi (individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)
1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 13 14 15 Jum
Slow






14
ast




16

!terostylis polyzymus, Populasi 3 (individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)
1 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 13 14 15 Jum
Slow



8
ast






4

Langkah
Anda perlu mengukur perbezaan genetik diantara populasi tersebut. Biasanya right's
ixation Index or
st
digunakan, dari julat 0 yang mewakili tiada perbezaan antara
populasi tersebut, meningkat, menandakan kenaikan perbezaan. Untuk menentukan

st
, heterozygousity perlu dikira bagi setiap spesis (H
s
), dengan menggandakan pq
bagi setiap satu populasi dan mengira nilai purata bagi ketiga-tiga populasi untuk
setiap spesis.


Frekuensi allele bagi !terostylis isozymus,

AIIeIe cepat,
p
AIIeIe perIahan,
q
2 x p x q
PopuIasi 1 7/30 = 3/30 =
PopuIasi 2
18/30 1/30
PopuIasi 3
6/30 4/30

Purata

s)


Frekuensi allele bagi !terostylis polyzymus,

AIIeIe cepat,
p
AIIeIe perIahan,
q
2 x p x q
PopuIasi 1 18/30 1/30
PopuIasi 2
16/30 14/30
PopuIasi 3
/30 8/30

Purata

s)

5

Langkah 3
Kira heterozygosity jika ketiga-tiga populasi meneruskan pembiakan, (H
t
).
Lakukan kiraan dengan mencari purata bagi p dan q ke atas ketiga-tiga populasi
bagi setiap spesis, digandakan dengan x purata p x purata q. Jangkaan
frekuensi heterozygote di dalam populasi ini dikatakan mempunyai kawasan
pembiakan yang besar dengan tiadanya perbezaan genetik pada tahap populasi
biasa.

Jangkaan heterozygosity (H
t
) bagi Pterostylis iso:ymus

AIIeIe cepat,
p
AIIeIe perIahan,
q
PopuIasi 1 7/30 3/30
PopuIasi 2
18/30 1/30
PopuIasi 3
6/30 4/30
Purata
frekuensi
aIIeIe



Jangkaan heterozygosity (H
t
) bagi Pterostylis poly:ymus

AIIeIe cepat,
p
AIIeIe perIahan,
q
PopuIasi 1 18/30 3/30
PopuIasi 2
16/30 14/30
PopuIasi 3
/30 8/30
Purata
frekuensi
aIIeIe



6

Langkah 4
Anda perlu mengira jumlah local, dengan variasi populasi. Frekuensi sisihan bagi
heterozygotes di dalam populasi yang berasingan, (H
s
) perlu dicari jika mereka
adalah dari populasi besar yang sama, (H
t
), sertakan indeks jumlah variasi
genetik yang ditemui di dalam satu populasi local. Oleh itu,
st
= (H
t
- H
s
) / H
t
, di
mana nilai
st
< 0.1 menunjukkan nilai divergen yang besar di dalam populasi
(iaitu populasi yang berbeza dari segi genetik antara satu sama lain). Nilai
antaranya menunjukkan beberapa divergen genetik.

RUMUSAN

O !terostylis isozymus


st
= (H
t
- H
s
) / H
t



O !terostylis polyzymus


st
= (H
t
- H
s
) / H
t















7

PERBINCANGAN

1. Adakah popuIasi bagi setiap spesies adaIah berbeza antara satu sama
Iain? Adakah sesuatu spesies mempunai Iebih diversiti antara popuIasi
daripada ang Iain? Yang mana satu?

Populasi bagi setiap spesies adalah berbeza antara satu sama lain.
Berdasarkan data yang telah dikumpul, terdapat spesies yang mempunyai
diversiti antara populasi yang lebih daripada yang lain. Untuk memiliki
diversiti genetik yang tinggi di dalam sesebuah variasi populasi,
st
yang
dikumpul mestilah melebihi 0.1 di mana ia menunjukkan divergen yang besar
antara populasi.

2. Bagaimanakah anda peruntukkan dana ang terhad bagi pemeroIehan
tanah Iembap? JeIaskan dengan wajar keputusan anda di daIam
konteks memeIihara jumIah genetik diversiti ang maksimum ang
menggambarkan kedua-dua spesies.

Saya akan memilih genetik yang menunjukkan diversiti genetik yang tinggi
antara populasi. Dana tersebut akan digunakan untuk memulihara tanah
lembap yang mempunyai diversiti genetik yang tinggi untuk medapatkan
populasi yang lebih baik.

3. Apakah pertimbangan seIain genetik ang akan mempengaruhi piIihan
anda?

Selain daripada faktor genetik, saya akan melihat kepada spesies yang
terancam dan yang terdedah kepada masalah sukar untuk hidup di dalam
habitat sedia ada.

8

. Diberi bahawa kedua-dua aIIeIe pada Iokus ang dikaji ditemui bagi
setiap spesies. Mengapakah Iebih daripada satu popuIasi akan wujud
bagi setiap spesis ang diIindungi?

Biasanya, bagi setiap satu populasi spesis, mereka akan dilindungi apabila
diversiti genetik di dalam populasi itu berbeza antara satu sama lain, dan
mungkin terdapat variasi antaranya. Populasi dengan variasi genetik yang
tinggi menunjukkan bahawa semakin tinggi peluang populasi tersebut untuk
hidup.

5. MeIaIui pembacaan oIeh EIdridge 1998) ang bertajuk 'TroubIe in
Paradise', bagaimanakah saintis memaksimakan diversiti genetik bagi
pengenaIan semuIa popuIasi? Mengapakah mereka tidak memiIih hana
sejenis haiwan dari puIau tersebut?

Berdasarkan pembacaan yang telah dibuat, saintis memaksimakan diversity
genetik bagi re-introduce population, dengan memilih haiwan daripada pulau
yang berbeza.