Tanggal Peristiwa Pengeboman 2000 (4) Bom Kedubes Filipina Jakarta 1 Agustus 2000Bom meledak dari sebuah mobil

il yang diparkir di depan rumah Duta Besar Filipina, Menteng, Jakarta Pusat. Korban : 2 orang tewas dan 21 orang terluka. Bom Kedubes Malaysia, Jakarta 27 Agustus 2000Granat meledak di kompleks Kedutaan Besar Malaysia di Kuningan, Jakarta. Tidak ada korban jiwa. Bom Gedung Bursa Efek Jakarta -13 September 2000Ledakan mengguncang lantai parkir P2 Gedung Bursa Efek Jakarta. Korban : 10 orang tewas, 90 orang terluka. 104 mobil rusak berat, 57 rusak ringan. Bom malam Natal 2000 24 Desember 2000Serangkaian bom meledak pada malam Natal di Jakarta, Bekasi, Sukabumi, Mataram, Pematangsiantar, Medan, Batam, dan Pekanbaru. Korban : 16 orang tewas dan 96 terluka serta mengakibatkan 37 mobil rusak. 2001 (5) Bom Gereja Jakarta- 22 Juli 2001Bom meledak di Gereja Santa Anna dan Gereja Huria Kristen Batak Protestan (HKBP) di Kawasan Kalimalang, Jakarta Timur. Korban : 5 orang tewas Bom Gereja Semarang 2001- 31 Juli 2001 Bom yang meledak di Gereja Bethel Tabernakel Kristus Alfa Omega, Jl.Gajah Mada 114-118, Semarang.Bom Plaza Atrium Senen Jakarta 23 September 2001Bom meledak di kawasan Plaza Atrium, Senen, Jakarta. Korban : 6 orang terluka. Bom Restoran KFC Makassar 12 Oktober 2001Ledakan bom mengakibatkan kaca, langit-langit, dan neon sign KFC pecah. Tidak ada korban jiwa. Bom sekolah Australia, Jakarta 6 November 2001Bom rakitan meledak di halaman Australian International School (AIS), Pejaten, Jakarta. 2002 (3) Bom malam Tahun Baru 2002 1 Januari 2002Granat manggis meledak di depan rumah makan ayam Bulungan, Jakarta. Korban : 1 orang tewas dan 1 orang terluka.Di Palu, Sulawesi Tengah, terjadi empat ledakan bom di berbagai gereja. Tidak ada korban jiwa. Bom Bali 2002 12 Oktober 2002Paddys Pub dan Sari Club (SC) di Jalan Legian, Kuta, Bali diguncang bom. Dua bom meledak dalam waktu yang hampir bersamaan yaitu pukul 23.05 Wita. Korban : 202 orang tewas dan 300 orang terluka. Mayoritas korban adalalah warga negara Australia. Pada pukul 23.15 Wita, bom meledak di Renon, berdekatan dengan kantor Konsulat Amerika Serikat. Namun tak ada korban jiwa dalam peristiwa itu.Saat bersamaan, di Manado, Sulawesi Utara, bom rakitan juga meledak di kantor Konjen Filipina, tidak ada korban jiwa. Bom Restoran McDonalds Makassar 5 Desember 2002Bom rakitan yang dibungkus wadah pelat baja meledak di restoran McDonalds Makassar. Korban : 3 orang tewas dan 11 orang terluka

.2003 (3) Bom Kompleks Mabes Polri Jakarta 3 Februari 2003Bom rakitan meledak di lobi Wisma Bhayangkari, Mabes Polri Jakarta. Tidak ada korban jiwa. Bom Bandara Cengkareng Jakarta 27 April 2003Bom meledak dii area publik di terminal 2F, bandar udara internasional Soekarno-Hatta, Cengkareng, Jakarta. Korban : 10 orang terluka (2 orang luka berat) Bom JW Marriott 5 Agustus 2003Bom menghancurkan sebagian hotel JW Marriott. Korban : 11 orang tewas dan 152 orang terluka.

2004 (3) Bom Palopo 10 Januari 2004Bom caf di Palopo Sulawesi. Korban : 4 orang tewas Bom Kedubes Australia 9 September 2004Ledakan besar terjadi di depan Kedutaan Besar Australia. Korban : 6 orang tewas dan ratusan orang terluka Bom Gereja Palu 12 Desember 2004Ledakan bom di Gereja Immanuel, Palu, Sulawesi Tengah. Tidak ada korban jiwa.

2005 (5) Bom Ambon 21 Maret 2005Dua Bom meledak di Ambon. Tidak ada korban jiwa. Bom Tentena Poso- 28 Mei 2005Bom meledak di Tentena, Poso, Sulawesi Tengah. Korban : 22 orang tewas .Bom Pamulang Tangerang 8 Juni 2005 Bom meledak di halaman rumah Ahli Dewan Pemutus Kebijakan Majelis Mujahidin Indonesia Abu Jibril alias M Iqbal di Pamulang Barat. Tidak ada korban jiwa. Bom Bali 2005 1 Oktober 2005 Bom kembali meledak di R.AJAs Bar dan Restaurant, Kuta Square, daerah Pantai Kuta dan di Nyoman Caf Jimbaran. Korban : 22 orang tewas dan 102 orang terlukaBom Palu 2005- 31 Desember 2005 Bom meledak di sebuah pasar di Palu, Sulawesi Tengah. Korban : 8 orang tewas dan 45 orang terluka

2006 (4) Bom Poso 2006 -10 Maret 2006Ledakan bom di rumah penjaga Kompleks Pura Agung Setana Narayana di Desa Toini, Poso. Tidak ada korban jiwa. Bom Poso 2006 -22 Maret 2006Sekitar pukul 19.00 WITA, bom meledak di pos kamling di Dusun Landangan, Desa Toini, Kecamatan Poso Pesisir. Tidak ada korban jiwa. Bom Gereja Poso 2006 1 Juli 2006Bom meledak di Gereja Kristen Sulawesi Tengah (GKST) Eklesia Jalan Pulau Seram, Poso, Sabtu (1/7), sekitar pukul 22.15 Wita yang cukup keras hingga terdengar dalam radius tiga kilometer. Tidak ada korban jiwa

Bom Stadion Poso 3 Agustus 2006Sekitar pukul 20.00 WITA, bom kembali meledak di Stadion Kasintuwu yang terletak tepat di samping Rumah Sakit Umum Poso. Tidak ada korban jiwa

2009 (1)

Bom Jakarta 2009- 17 Juli 2009Bom Jakarta 2009, 17 Juli 2009, dua ledakan dahsyat terjadi di Hotel JW Marriott dan Ritz-Carlton, Jakarta. Ledakan terjadi hampir bersamaan, sekitar pukul 7.45 WIB. Korban : 12 orang tewas dan puluhan orang terluka