Bab II.

Isi
II.1 Bakteri yang terdapat di Kawah Putih
Bakteri yang terdapat di Kawah Putih adalah :

A. Termofilik Asidofil
Bakteri termofilik asidofil merupakan mikroorganisme yang dapat
tumbuh pada temperatur tinggi dan
pH rendah. Bakteri ini memiliki
sebaran yang luas. Akan tetapi
bakteri yang sudah teridentifikasi
jumlahnya masih terbatas.
bakteri diisolasi dan
dikulturkan dalam medium A dan
medium B. Molekul DNA
kromosom sampel bakteri
diekstraksi dan dimurnikan
selanjutnya diamplifikasi
dengan metode PCR
(Polymerase Chain Reaction).
Varian amplikon fragmen gen
16S rRNA dipisahkan dengan SSCP (Single-Strand Conformation
Polymorphism), kemudian ditentukan urutan nukleotidanya dengan
sekuensing. Pada tahap akhir, dilakukan komparasi dengan data base
GenBank. Sampel bakteri merupakan Gram-negatif berbentuk kokus yang
dapat tumbuh optimum pada temperatur 65 C (AD3) dan 70 C (BD3).
Sedangkan sampel BD3 mempunyai pola smear. Analisis data sekuensing
spesies spesifik sampel AD3 menunjukkan adanya homologi sebesar 98 %
dengan Pseudomonas fluorecens strain Pfl dan perbedaan urutan sebesar
2 % disebabkan oleh adanya substitusi di lima tempat yaitu pada posisi
basa 1071, 1074, 1076, 1357, 1358 dan insersi pada 1125.

B. Thermus Aquaticus
Karakteristik :
a. Nama Thermus aquaticus
berasal dari bahasa latin, aqua,
yang berarti air.
b. Terinhibisi oleh tryptone dan
yeast extrast dengan
konsentrasi 1%
c. Membentuk microbial mat
d. Koloni kuning, gram negatif,
non-motil, berbentuk batang
e. Sensitif pada actinomycin D

f.

Utilitas : sumber enzim DNA Taq , Taq I restriction enzyme,

RNA polymerase, aldolase.

C. Sulfolabus

Sulfolobus spesies tumbuh di mata air gunung berapi dengan

pertumbuhan optimal terjadi pada pH 2-3 dan suhu
dari 75-80 C, membuat mereka acidophiles dan
thermophiles dan masing-masing. Sulfolobus selsel berbentuk tidak teratur flagellar Spesies
Sulfolobus umumnya dinamai lokasi dari
yang mereka pertama kali diisolasi, misalnya
solfataricus Sulfolobus pertama kali diisolasi di
Solfatara (gunung berapi) . spesies lainnya
dapat ditemukan di seluruh dunia dalam bidang
panas bumi atau aktivitas gunung berapi seperti
formasi geologi disebut mud pot yang juga dikenal sebagai
solfatare (jamak dari solfatara).