Pengantar
Kehidupan ini digerakkan oleh energi. Semua aktivitas organisme yaitu : bakteri yang berenang,
kucing yang mendengkur, dan ketika Anda memikirkan kalimat ini pun memakai energi.
Dalam bab ini, kita membahas proses yang dipakai oleh semua sel untuk memperoleh energi kimia
dari molekul organik dan untuk mengubah energi menjadi ATP. Kemudian, dalam bab 8, kita akan
meneliti fotosintesis, yang menggunakan energi cahaya menjadi energi kimia. Pertama - tama kami
mempertimbangkan konversi energi kimia menjadi ATP karena semua organisme, baik tanaman yang
berfotosintesis maupun ulat yang memberi makan pada tanaman, yang digambarkan dalam foto,
mampu
menndapatkan
energi
dari
ikatan kimia.
protista dan
prokariota
adalah
energi
dari
senyawa organik mereka baru memiliki kapasitas tambahan untuk menggunakan energi dari sinar
matahari untuk mensintesis senyawa tersebut. Proses di mana energi dihasilkan dinamakan respirasiselular oksidasi senyawa organik untuk mengekstrak energi dari ikatan kimia.
Sel mengoksidasi senyawa organik untuk mendorong metabolism
Sebagian besar makanan mengandung berbagai macam karbohidrat, protein, dan lemak, semuanya
kaya ikatan kimia sarat-energi. Karbohidrat dan lemak, seperti yang Anda ingat dari bab 3, memiliki
banyak ikatan karbonhidrogen (C H), serta ikatan karbon-oksigen (C O).
Tugas mengesktrak energi dari campuran organik kompleks dalam sebagian besar makanan
ditangani secara bertahap. Pertama, enzim memecah molekul besar menjadi lebih kecil, yang disebut
proses pencernaan (bab 48). Kemudian, enzim lain memecah molekul tersebut sedikit demi sedikit
pada suatu waktu, menghasilkan energy dari C H dan ikatan kimia lainnya pada setiap tahap.
Reaksi memecah molekul-molekul
tersebut
berbagi
ciri
umum,
energi berkaitan dengan reaksi redoks, dan untuk memahami prosesnya kita harus mengikuti
nasib elektron yang hilang dari molekul makanan.
Reaksi-reaksi tersebut bukanlah transfer elektron sederhana, namun juga merupakan dehidrogenasi.
Artinya, elektron yang hilang disertai dengan proton, sehingga yang benar-benar hilang adalah atom
hidrogen, dan bukan hanya elektron.
Respirasi selular adalah oksidasi glukosa lengkap
Dalam bab 6, Anda mengetahui bahwa atom yang kehilangan elektron dikatakan teroksidasi, dan
atom yang menerima elektron dikatakan tereduksi. Reaksi Oksidasi sering digabungkan dengan reaksi
reduksi dalam sistem kehidupan, dan reaksi berpasangan ini disebut reaksi redoks. Sel memanfaatkan
fasilitas-enzim reaksi redoks untuk mengambil energi dari sumber makanan dan mengubahnya
menjadi ATP.
Reaksi redoks
Reaksi Oksidasi-reduksi memainkan peran kunci dalam aliran energi melalui sistem biologis karena
elektron yang melewati dari satu atom ke atom yang lain membawa energi bersamanya. Jumlah energi
elektron yang dimiliki tergantung pada posisi orbit, atau tingkat energi, sekitar inti atom.
Ketika elektron ini berangkat dari satu atom dan bergerak ke atom yang lain dalam reaksi redoks,
energi elektron ditransfer didalamnya.
Gambar 7.1 menunjukkan bagaimana enzim mengkatalisis reaksi redoks yang melibatkan molekul
substrat yang kaya energi, dengan bantuan suatu kofaktor, yaitu nicotinamide adenosine dinucleotide
(NAD+). Dalam reaksi ini, NAD+ menerima sepasang elektron dari substrat, bersama dengan sebuah
proton, membentuk NADH (proses ini dijelaskan secara rinci selanjutnya). Produk yang teroksidasi
dilepaskan dari tempat enzim aktif, sebagaimana NADH.
Kaya-energi
molekul
Hasil
enzim
1.Enzim yang
memakai NAD+
2.Dalam reaksi
oksidasi-reduksi,
3.NADH
berdifusi dan
sebagai kofaktor
untuk reaksi
oksidasi,
mengikat NAD+
dan substrat
2 elektron dan
kemudian
sebuah proton
dapat
ditransfer pada
menyumbang
+
NAD ,
electron pada
membentuk
molekul lain.
NADH. Proton
yang kedua
disumbangkan
dalam
pemecahannya.
Gb 7.1 Reaksi oksidasi-reduksi sering mengikutsertakan kofaktor
Sel memakai kofaktor kimia yaitu nicotinamide adenosine dinucleotide (NAD +)
untuk membawa banyak reaksi oksidasi-reduksi. Dua electron dan sebuah proton
ditransfer
ke
NAD+
dengan
proton
yang
lain
disumbangkan
dalam
yang
dikatakan teroksidasi.
NAD +
Glukosa
oksigen
karbon air
dioksida
Perubahan energi bebas dalam reaksi ini adalah -686 kkal / mol (atau -2870 kJ / mol) dalam kondisi
standar (yaitu, pada
suhu
kamar, tekanan
yang ada
di
dalam sel, energi yang dilepaskan bisa setinggi -720 kkal / mol (-3012 kJ / mol) glukosa. Ini berarti
bahwa dalam kondisi selular yang sebenarnya, lebih banyak energi yang dilepaskan dari pada dalam
kondisi standar.
Jumlah energi yang sama dilepaskan baik glukosa dikatabolisasi ataupun dibakar, tetapi jika dibakar,
sebagian besar energi dilepaskan sebagai panas. Sel mendapat energi yang berguna dari katabolisme
glukosa dengan menggunakan sebagian energi untuk mendorong produksi ATP.
Gb 7.2 Bagaimana cara kerja
transport electron. Diagram
disamping menunjukkan
bagaimana ATP dihasilkan
ketika electron berpindah dari
satu tingkat energy ke tingkat
energi lain. Daripada
melepaskan satu ledakan
energi, electron jatuh dari
tingkat energi yang rendah ke
yang lebih rendah lagi dalam
setiap tahapnya, melepaskan
energi yang tersimpan dengan
setiap jatuhnya sebagaimana
electron jatuh ke yang
terbawah (sebagian besar
elektronegatif) penerima
electron, O2.
dapat
membawa elektron,
dan beberapa
pembawa
electron
dapat
satu pembawa
elektron
yang
ditunjukkan pada sebelah kiri gambar 7.3, molekul NAD+ terdiri dari dua nukleotida yang terikat
bersama. Kedua nukleotida yang membentuk NAD+, nicotinamide monofosfat (NMP) dan adenin
monofosfat (AMP), bergabung head-to-head/kepala-dan-kepala dengan gugus fosfat mereka. Kedua
nukleotida melayani fungsi yang berbeda pada molekul NAD+: AMP bertindak sebagai
inti, menyediakan bentuk yang dikenal oleh banyak enzim, NMP adalah bagian aktif dari molekul,
karena siap direduksi, maka mudah menerima elektron.
molekul organik,
termasuk
Pada hewan,
pengurangan kekuatan dari akumulasi NADH dialihkan untuk memasok prekursor asam lemak
dengan elektron energi tinggi, mengurangi lemak mereka untuk membentuk dan menyimpan energi
dari elektron.
Metabolisme mendapat energi secara bertahap
Hal ini umumnya benar bahwa semakin besar pelepasan energi dalam setiap tahap, semakin banyak
energi yang dilepaskan sebagai panas, dan semakin sedikit energi yang tersedia untuk disalurkan ke
jalur yang lebih berguna. Dalam pembakaran bensin, jumlah energi yang sama dilepaskan, baik
seluruh bensin di tangki meledak sekaligus, ataupun terbakar dalam serangkaian ledakan yang sangat
kecil di dalam silinder. Dengan melepaskan sedikit energi dalam bensin pada satu waktu, efisiensi
pendapatan energi lebih besar, dan lebih banyak energi dapat digunakan untuk mendorong piston dan
memindahkan mobil.
Prinsip yang sama berlaku dengan oksidasi glukosa di dalam sel. Jika semua elektron ditransfer
ke oksigen dalam satu langkah eksplosif, melepaskan semua energi bebas sekaligus, sel akan
mendapat kembali energi yang sangat sedikit dalam bentuk yang berguna. Sebagai gantinya, selsel membakar bahan bakarnya seperti mobil, sedikit demi sedikit pada suatu waktu.
Elektron dalam ikatan C H dari glukosa melepas bertahap serangkaian reaksi katalisasi-enzim
secara bersamaan disebut sebagai glikolisis dan siklus Krebs. Elektron dilepaskan dengan
mentransfernya ke NAD+, seperti yang dijelaskan sebelumnya, atau ke pembawa elektron lain.
Energi yang dilepaskan oleh semua reaksi oksidasi diatas juga tidak semuanya dilepaskan
sekaligus (lihat gambar 7.2). Elektron yang dilewatkan melalui kumpulan pembawa elektron
disebut rantai transpor elektron, yang terletak pada membran dalam mitokondria. Gerakan elektron
melalu rantai tersebut menghasilkan energi potensial dalam bentuk gradien elektrokimia. Kami
meneliti proses ini dengan lebih rinci nanti dalam bab ini.
ATP paling berperan dalam metabolisme
Bab sebelumnya memperkenalkan ATP sebagai beredarnya energy sel. Sel menggunakan ATP sebagai
tenaga untuk menggerakkan sebagian besar aktivitas yang membutuhkan kerja salah satu aktivitas
yang paling jelas adalah bergerak. Serat yang paling kecil sekali dalam sel otot saling tarikmenarik satu sama lain saat otot berkontraksi. Mitokondria dapat bergerak satu meter atau lebih di
sepanjang sel saraf yang sempit yang membentang mulai dari tulang belakang sampai kaki Anda.
Kromosom ditarik terpisah oleh mikrotubulus selama pembelahan sel. Semua gerakan-gerakan ini
memerlukan pengeluaran energi dengan hidrolisis ATP. Sel juga menggunakan ATP untuk
menggerakkan reaksi endergonik yang barangkali sebaliknya tidak terjadi secara spontan (Bab 6).
Bagaimana ATP mendorong reaksi endergonik? Enzim yang mengkatalisis reaksi tertentu memiliki
dua tempat yang terikat pada permukaannya: satu untuk reaktan dan satu lagi untuk ATP. Tempat ATP
membagi molekul ATP, membebaskan lebih dari 7 kkal (G = -7,3 kkal/ mol) energi kimia. Energi
ini mendorong reaktan pada tempat yang kedua "menanjak" mencapai energi aktivasi dan mendorong
reaksi endergonik. Jadi reaksi endergonik digabungkan agar hidrolisis ATP menjadi baik.
Banyaknya langkah yang dimiliki oleh respirasi selular sebagai tujuan utama mereka memproduksi
ATP. Sintesis ATP merupakan reaksi endergoniknya sendiri, yang mengharuskan sel untuk melakukan
reaksi eksergonik untuk mendorong sintesis ini. Rincian reaksi tersebut disajikan pada bagian berikut
dari bab ini.
1. Dalam fosforilasi tingkat-substrat, ATP dibentuk dengan mentransfer gugus fosfat langsung ke
ADP
dari antara
fosfatbearing, atau
substrat
(gambar 7.4).
Selama glikolisis,
pemecahan awal glukosa (dibahas nanti), ikatan kimia dari glukosa bergeser seputar reaksi yang
menyediakan energi yang dibutuhkan untuk membentuk ATP oleh fosforilasi tingkat-substrat.
ke ADP, energi
dalam ikatannya
disimpan
danenzim
ATP dibentuk.
2. Dalam fosforilasi
oksidatif,
AT disintesis
oleh
sintase ATP, menggunakan energi dari
gradien proton (H+) . Gradien ini dibentuk oleh elektron berenergi tinggi dari oksidasi glukosa
mewariskan rantai transpor elektron (dijelaskan kemudian). Elektron ini, dengan habisnya energi
mereka, kemudian disumbangkan untuk oksigen, sehingga istilahnya fosforilasi oksidatif. Sintase
ATP menggunakan energy dari gradien proton untuk mengkatalisis reaksi:
ADP + Pi ATP
Eukariota dan prokariota aerob menghasilkan sebagian besar ATPnya dengan cara ini.
Pada sebagian besar organisme, dua
proses
tersebut
dikombinasikan.
lengkap
elektron
oksidasi.
dipakai
transport
yang
energik
melepaskan
melalui
reaksi
dalam
yang
rangkaian
melewati
elektrin terakhir dalam respirasi aerob adalah oksigen, dan gradient proton yang dihasilkan
memberikan energi pada sintasis enzim ATP untuk fosforilasi ADP ke ATP (Gb. 7.5). Detil dari proses
kompleks ini akan dijelaskan lebih lanjut dalam bab ini.
Review 7.1
Sel mendapat energi dari oksidasi lengkap glukosa. Dalam reaksi redoks tersebut, proton dan juga
elektron ditransfer, dan karena itu menjadi reaksi dehidrogenasi. Elektron membawa bantuan secara
bertahap, secara bertahap melepaskan energi dari oksidasi, daripada pembakaran cepat. Hasilnya
adalah sintesis ATP, sumber energi portabel. Sintesis ATP dapat terjadi dalam dua mekanisme yaitu ;
fosforilasi tingkat substrate dan fosforilasi oksidatif.
Kenapa sel tidak langsung saja menghubungkan oksidasi glukosa ke fungsi selular yang
membutuhkan energi?
molekul
3-karbon
dari
babak
menjadi piruvat
dalam proses
Langkah C: Oksidas Dua elektron (dan satu proton) ditransfer dari G3P ke NAD+, membentuk
NADH.
Suatu
moleku
Pi
juga
bisphosphoglycerate. Gabungan fosfat kemudian akan ditransfer ke ADP oleh fosforilasi tingkat
substrat untuk memberikan hasil bersih ATP.
Langkah D: ATP generasi Empat reaksi BPG menjadi piruvat. Proses ini menghasilkan dua molekul
ATP per G3P (lihat gambar 7.4 dan 7.7) yang diproduksi di Langkah B.
mengekstrak
energi
tetap
berada
dalam
dua
molekul
keluar
mengakumulasi
NADH
untuk mendorong
dan
menghabiskan
aktivitasnya. Dengan
gugus
molekul
demikian, bagaimanapun,
NAD +. Sebuah
sel
tidak
mengandung sejumlah besar NAD+, dan ketika glikolisis berjalan, NADH harus didaur ulang menjadi
NAD+. Beberapa
diambil dari
G3P dan direduksi. Dua proses dapat melaksanakan tugas penting tersebut (gambar7.8):
1. Respirasi aerobik. Oksigen adalah akseptor electron yang sangat baik. Melalui serangkaian
transfer elektron, electron yang diambil dari G3P dapat disumbangkan ke oksigen, membentuk
air.
disebut sebagai
terdapat
metabolism
aerobik.
besar organisme,
bahkan
mereka
reaksi
yang
disebut siklus Krebs. Jalur fermentasi, sebaliknya, menggunakan reduksi semua atau sebagian dari
pipruvat
untuk
Berikutnya
kami
meneliti respirasi aerobik ; fermentasi akan dijelaskan secara rinci pada bagian selanjutnya.
Review 7.2
Glikolisis membagi 6 karbon molekul glukosa menjadi 2 3-karbon molekul piruvat. Proses ini
memakai dua molekul ATP dalam reaksi priming/utama dan pada akhirnya menghasilkan 4 molekul
ATP per glukosa sebagai hasil bersih dua ATP. Reaksi oksidasi glikolisis membutuhkan NAD + dan
menghasilkan NADH. Ketika oksigen melimpah, NAD + diperbarui dalam rangkaian transport electron
menggunakan O2 sebagai akseptor. Ketika tidak terdapat oksigen, NAD + diperbarui dalam reaksi
fermentasi menggunakan molekul organik sebagai reseptor electron.
7.3 Oksidasi Piruvat dalam memproduksi Asetil-KoA
1. Jelaskan bagaimana oksidasi piruvate bergabung glikolisis dengan siklus krebs.
Dengan adanya oksigen, oksidasi glukosa yang dimulai di glikolisis berlangsung dimana
glikolisis lepas-dengan piruvat. Pada organisme eukariotik, ekstraksi energi tambahan dari piruvat
berlangsung
secara
eksklusif
di
dalam mitokondria.
Pada
dua
menghasilkan
senyawa
karbon
NADH. Selanjutnya,
dan
dua
senyawa
karbon
dioksidasi
menjadi CO2
2-karbon,
yang disebut gugus asetil, kemudian melekat pada koenzim A; keseluruhan molekul tersebut disebutKoA. Sepasang
electron
dan
satu
proton
yang
terhubung
ditransfer
dalam
pemecahannya.
Reaksi ini melibatkan tiga tahap intermediate, dan dikatalisis dalam mitokondria oleh multienzim
kompleks. Seperti dalam bab 6, sebuah multienzim kompleks mengatur serangkaian langkah
enzimatik sehingga intermediet kimia tidak menyebar jauh atau mengalami reaksi lainnya. Dalam
kompleks, komponen polipeptida melewati substrat dari enzim satu ke enzim berikutnya, tanpa
melepaskannya. Dehidrogenase Piruvat, enzim kompleks yang menghilangkan CO2 dari piruvat,
adalah salah satu enzim terbesar yang dikenal, yang berisi 60 subunit! Reaksi dapat diringkas sebagai
berikut:
Pyruvate + NAD+ + CoA acetyl-CoA + NADH + CO2 + H+
Molekul NADH yang
dimasukkan ke dalam siklus Krebs, dengan KoA yang didaur ulang untuk oksidasi piruvat lain.
Siklus Krebs kemudian menyelesaikan oksidasi karbon asli dari glukosa.
Review 7.3
Piruvat teroksidasi dalam mitokondria untuk menghasilkan asetil-KoA dan CO2. Asetil-KoA adalah
molekul yang menghubungkan glikolisis dan reaksi siklus Krebs.
Pada tahap ketiga ini, gugus asetil dari piruvat dioksidasi dalam serangkaian Sembilan reaksi yang
disebut siklus Krebs. Reaksi ini terjadi dalam matriks mitokondria.
Dalam siklus ini, gugus 2-karbon asetil dari asetil-KoA bergabung dengan 4-molekul karbon yang
disebut oksaloasetat. Menghasilkan Molekul 6-karbon, sitrat, kemudian melalui beberapa urutan
langkah
reaksi
oksidasi
elektron, pada
saat
dimana dua
molekul CO2
molekul CO2, dan lebih banyak elektron yang ditransfer ke pembawa elektron.
elektron untuk
kembali
sitrat
dan
yang
telah
disederhanakan dalam gambar 7.11, mereduksi sitrat ke 5-karbon intermediet dan kemudian ke 4karbon suksinat. Selama reaksi ini, menghasilkan dua NADH dan satu ATP.
Segmen C: Regenerasi
oksaloasetat Suksinat
mengalami tiga
reaksi tambahan,
juga
disederhanakan dalam gambar, untuk menjadi oksaloasetat. Selama reaksi ini, satu NADH dihasilkan,
di
samping
itu,
kofaktor lain,
memasuki awal siklus, dan menghasilkan dua molekul CO2, satu ATP, dan empat pasang electron.
Reaksi 1: Kondensasi Sitrat terbentu dari acetyl-KoA dan oksaloasetat. Reaksi kondensasi ini tidak
dapat
diubah,
terhambat
ketika
konsentrasi ATP sel tinggi dan terdorong pada saat rendah. Hasilnya adalah bahwa ketika se
memiliki jumlah ATP yang cukup, siklus Krebs berhenti, dan asetil-KoA disalurkan ke sintesis lemak.
Reaksi 2 dan 3: Isomerisasi Sebelum
sitrat harus direposisi. Penyusunan ini dilakukan dalam dua langkah: Pertama, molekul air akan
dihapus dari satu karbon, kemudian air ditambahkan ke karbon yang berbeda. Akibatnya, gugus
H dan gugus OH posisinya berubah. Produk ini merupakan isomer sitrat yang disebut isositrat.
Penyusunan ini memudahkan reaksi selanjutnya.
Reaksi 4: Oksidasi Pertama Pada langkah pertama menghasilkan energi dari siklus, isocitrate
mengalami reaksi dekarboksilasi oksidatif. Pertama, isocitrate teroksidasi, menghasilkan sepasang
elektron
yang
mereduksi
molekul
NAD+
menjadi NADH. Kemudian yang teroksidasi intermediet adalah dekarboksilasi, gugus karboksil pusat
terpisah membentuk CO2, menghasilkan sebuah molekul 5-karbon disebut -ketoglutarate.
Reaksi 5: Oksidasi Kedua Berikutnya, -ketoglutarate di dekarboksilasi oleh multienzim kompleks
yang mirip dengan piruvat dehidrogenase. Gugus suksinil bergabung dengan koenzim A setelah
pemindahan CO2, yang membentuk suksinil-KoA. Dalam prosesnya, dua elektron diekstrak, dan
elektron tersebut mereduksi molekul lain NAD + menjadi NADH.
Reaksi 6: Fosforilasi Tingkat-Substrat Hubungan antara gugus suksinil 4-karbon dan KoA
merupakan ikatan energi tinggi. Dalam reaksi gabungan yang serupa dengan yang terjadi di glikolisis,
ikatan tersebut dibelah, dan energi yang dilepaskan mendorong fosforilasi guanosin difosfat (GDP),
membentuk guanosin trifosfat (GTP). GTP dapat mentransfer fosfat menjadi ADP dan mengubahnya
menjadi ATP. Molekul 4-karbon yang tersisa tetap disebut suksinat.
Reaksi 7: Oksidasi Ketiga Berikutnya, suksinat dioksidasi menjadi fumarat oleh enzim yang terletak
di dalam membran mitokondria.Perubahan energi bebas dalam reaksi ini tidaklah cukup besar untuk
mereduksi NAD+. Sebaliknya, FAD adalah akseptor elektron. Tidak seperti NAD+, FAD tidak bebas
menyebar dalam mitokondria, melainkan terkait erat dengan enzim dalam membran mitokondria
bagian dalam. Bentuk tereduksi, FADH2, hanya dapat memberikan elektron pada rantai transpor
elektron dalam membran.
Reaksi 8 dan 9: Regenerasi oksaloasetat Dalam dua reaksi akhir siklus, molekul air ditambahkan ke
fumarat, membentuk malat.Malat kemudian dioksidasi, menghasilkan sebuah molekul 4-karbon dari
oksaloasetat dan dua elektron yang mereduksi molekul NAD + menjadi NADH. Oksaloasetat, molekul
yang memulai siklus, kini bebas bergabung dengan gugus asetil 2-karbon lain dari asetil-KoA dan
memulai siklus lagi.
Glukosa menjadi CO2 dan potensi energi.
Dalam proses respirasi aerobik, glukosa sepenuhnya dikonsumsi.Molekul 6-karbon glukosa dibelah
menjadi sepasang molekul 3-karbon piruvat selama glikolisis. Salah satu karbon dari masingmasing piruvat ini kemudian hilang sebagai CO2 dalam konversi piruvat ke asetil-KoA. Dua karbon
lainnya dari acetyl-KoA hilang sebagai CO2 selama oksidasi siklus Krebs.
Semua yang tersisa
enam CO2
molekul adalah energi, beberapa diantaranya disimpan dalam empat molekul ATP dan dalam bentuk
reduksi dari 12 pembawa elektron. Sepuluh dari pembawa electron tersebut adalah molekul NADH,
sedangkan dua lainnyaFADH2
Mengikuti elektron dalam reaksi mengungkapkan arah transfer
Ketika Anda memeriksa perubahan muatan listrik dalam reaksi yang mengoksidasi glukosa, strategi
yang
baik
untuk
menjaga
agar
transfernya
jelas
adalah
dengan
selalu
mengikuti
elektron. Misalnya, dalam glikolisis, enzim mengekstrak dua hidrogenyaitu, dua elektron dan dua
protondari glukosa dan mentransfer kedua elektron dan salah
+
satu
proton ke
ke dalam larutan
positif
untuk
sekitarnya.
dan satu
membentuk
serangkaian
pembawa
elektron, sebagian
besar
protein,
tertanam
elektron
bergerak
hydrogen
lebih
dan
sedikit
membentuk
menuju
ke
gradien energi.
Seluruh
elektron
pada
bawah
membahas
akan
Apa yang terjadi pada elektron yang dilepaskan dari glukosa pada poin ini?
yang
terbentuk
saat
selama
NAD
respirasi
aerob
dan
FAD
masing-masing berisi
direduksi. Molekul-
molekul NADH membawa elektron mereka ke membran mitokondria bagian dalam, di mana mereka
mentransfer elektron ke serangkaian membrane protein secara kolektif dan disebut rantai transpor
elektron (ETC).
Rantai transpor elektron menghasilkan gradien proton
Yang pertama dari protein menerima elektron merupakan kompleks, membran-yang tertanam enzim
disebut NADH dehidrogenase. Pembawa yang disebut ubiquinone kemudian melewatkan elektron ke
protein-sitokrom
kompleks
yang
disebut bc1
kompleks.
proton
Setiap
melewati
ini
menggunakan
empat
elektron
untuk mereduksi
molekul oksigen. Setiap oksigen kemudian bergabung dengan dua proton untuk membentuk air:
O2 + 4 H+ + 4 e- 2 H2O
Berbeda
dengan
NADH,
dimana
yang
memberikan
kontribusi elektronnya
untuk
dehidrogenase NADH , FADH2, yang terletak di membran mitokondria bagian dalam, menjadikan
elektronnya makananan ubiquinone, yang juga dalam membran. Elektron dari FADH2 karena itu
"skip/melewati" langkah pertama dalam rantai transpor elektron.
Banyaknya ketersediaan dari akseptor elektron yang kuat, oksigen, yang memungkinkan terjadinya
respirasi oksidatif. Seperti
yang
akan
elektron
digunakan dalam respirasi aerobik serupa dengan (dan mungkin telah berevolusi dari) rantai yang
digunakan dalam fotosintesis.
Bentuk gradien sebagaimana elektron bergerak melalui pembawa elektron
Respirasi terjadi dalam mitokondria ada di hampir semua
internal, atau matriks, dari
Krebs. Seperti
mitokondria
NAD . Sebagaimana
eukariotik.
mengandung enzim
yang
disebutkan
sel
elektron
yang
diperoleh
ketika elektron
dengan respirasi
mereka
Kompartemen
lepaskan
ditransfer
ke
oksidatif dilewatkan
smengangkut
proton
keluar
protein,
membran. Elektron
saat
Aliran
elektron yang
yang menyebabkannya
yang
disumbangkan
rantai. Dengan
cara
ini
suatu gradien proton terbentuk antara ruang dalam membrane dan matriks.
Kemiosmosis memanfaatkan gradien elektrokimia untuk memproduksi ATP
Karena
matriks
mitokondrial
adalah
negative
dibandingkan
dengan
ruang
kembali matriks. Tingginya konsentrasi luar proton juga cenderung mendorong proton kembali
kedalam
oleh difusi,
saja
proses
ini terjadisangat lambat. Sebagian besar proton yang masuk kembali ke matriks bukan melalui sintase
ATP, sebuah
enzim
yang
menggunakan
energi dari
gradient
untuk
mengkatalisis
sintesis ATP dari ADP dan Pi. Karena pembentukan kimia ATP digerakkan oleh kekuatan difusi mirip
dengan osmosis, proses ini
baru terbentuk diangkut oleh
disebut
sebagai
fasilitas
kemiosmosis
difusi
ke banyak
ATP
yang
dalam menggandakan transport elektron dan sintesis ATP merupakan hal yang controversial pada saat
diajukan. Selama bertahun-tahun, bukti eksperimen diakumulasi untuk mendukung hipotesis ini
(gambar 7.13)
Energi
yang
respirasi
selular
akhirnya
mendorong
memberikan
pompa
energi
yang
melakukan
sintesis
ATP (gambar 7.15). Secara struktural, enzim memiliki bagian membran-yang terikat dan tangkai
sempit yang menghubungkan bagian membran tersebut dengan bagian katalitik knoblike/seperti
kenop.
membran-yang
terikat
kompleks, dan F1 kompleks yang terdiri dari tangkai dan kenop, atau daerah kepala.
Kompleks
F0
mana
proton
bergerak melintasi membran sampai kepada gradient konsentrasinya. Pada saat melakukannya,
gerakan
mereka
kompleks
dan tangkai
relative
memutar
kenop.Energi mekanik rotasi ini digunakan untuk mengubah konformasi dari daerah katalitik
dalam F1 kompleks.
Dengan
demikian,
berputar
yang
sangat
kecil,
rotasi
yang digerakkan langsung oleh gradien proton. Aliran proton seperti air dalam system hidroelektrik
tumbuhan. Seperti aliran air yang didorong oleh gaya berat/gravity yang menyebabkan turbine
berputar dan membangkitkan arus listrik, gradient proton menghasilkan energi yang mendorong rotasi
generator sintase ATP.
Review 7.5.
Rantai transpor elektron menerima elektron dari NADH dan FADH, dan melewatkannya sampai pada
rantai ke oksigen. Protein melengkapi rantai transport elektron, pada bagian dalam mitokondria,
memakai energy dari transfer elektron untuk memompa proton melewati membran, membentuk
gradient elektrokimia. Sintase enim ATP menggunakan gradient ini untuk mendorong reaksi
endergonik dari fosforilasi ADP ke ATP.
Bagaimana mungkin menusuk lubang kecil pada bagian luar membran mempengaruhi sintesis
ATP?
1. Menghitung banyaknya jumlah molekul ATP yang dihasilkan oleh respirasi aerob
Berapa banyak energy metabolic daam bentuk ATP yang didapat sel dari pemecahan glukosa secara
aerob? Mengetahui langkah-langkah yang terjadi dalam proses tersebut, kita dapat mengetahui hasil
teoritis ATP dan membandingkannya dengan hasil sebenarnya.
Hasil teoritis eukariota adalah 36 molekul ATP per molekul glukosa
Model kemiosmotik menunjukkan bahwa satu molekul ATP dihasilkan untuk setiap pompa proton
Sebanyak 10 molekul NADH yang
(1 x 2),dan 6 lainnya dari siklus Krebs (3 x 2). Dan juga, dua FADH2 dihasilkan (1 x 2). Akhirnya, dua
ATP yang dihasilkan langsung oleh glikolisis dan dua ATP lainnya dari siklus Krebs (1 x 2). Hal
ini memberikan total 10
akurat
untuk
dalam mitokondria
dengan
transport aktif, yang menghabiskan satu ATP per NADH yang diangkut. Hal ini mengurangi perkiraan
hasil untuk eukariota sampai 36 ATP.
Hasil sebenarnya untuk eukariota adalah 30 molekul ATP per molekul glukosa
Jumlah ATP sebenarnya yang dihasilkan dalam sel eukariotik selama respirasi aerobic sedikit lebih
rendah dari 36, karena dua alasan. Pertama, membran mitokondria bagian dalam agak "bocor" untuk
proton, yang memungkinkan beberapa dari mereka masuk kembali ke matriks tanpa melalui sintase
ATP.
Kedua, mitokondria
sering menggunakan
gradient
proton yang
dihasilkan oleh
kemiosmosis untuk tujuan selain sintesis ATP (seperti mengangkut piruvat ke matriks).
Akibatnya, nilai
ATP
sebenarnya
yang
diukur yang
dihasilkan
lebih mendekati 2,5 untuk setiap NADH, dan 1,5 untuk setiap FADH2. Dengan koreksi ini, hasil
pendapatan
keseluruhan
glukosa
dalam
sel eukariotik
dihitung
sebagai
berikut: 4 ATP dari fosforilasi tingkat- substrat + 25 ATP dari NADH (2,5 x 10) + 3 ATP dari FADH2
(1,5 x 2) 2 ATP untuk pengangkutan NADH glikolitik = 30 molekul ATP.
Kami sebutkan sebelumnya bahwa katabolisme glukosa oleh respirasi aerobik, berbeda dengan
katabolisme glikolisis sendiri, yang menghasilkan energi yang besar. Respirasi aerobic dalam sel
eukariotik mendapat sekitar (7,3 x 30) / 686 = 32% dari energi yang tersedia dalam glukosa. (Sebagai
perbandingan, mobil mengkonversi hanya sekitar 25% dari energi pada bensin menjadi energi yang
berguna.)
Semakin
tinggi hasil
respirasi
aerobik merupakan
salah satu
factor
perkembangan evolusi heterotrof. Karena mekanisme untuk memproduksi ATP berevolusi, organisme
nonphotosintetik bisa lebih berhasil berdasarkan metabolisme mereka pada penggunaan eksklusif
molekul yang berasal dari organisme lain. Selama beberapa organisme menangkap energi dengan
fotosintesis, organisme yang lain bisa ada semata-mata dengan diberi makan oleh mereka.
Review 7.6
Bagian elektron
Passage elektron yang menuruni rantai transport elektron menghasilkan kira-kira 3 ATP per NADH
(dua ATP per FADH2). Proses tersebut ditambah ATP dibangkitkan dengan fosforilasi tingkat-substrat
dapat menghasilkan menghasilkan maksimum 38 ATP untuk seluruh oksidasi lengkap glukosa. Tetapi
NADH yang ditimbulkan dalam sitoplasma menghasilkan hanya dua ATP/NADH karena transportasi
NADH ke mitokondria memakai ATP. Karena itu secara teoritis totalnya adalah 36 ATP per glukosa
dalam eukariot.
Mengapa hasil yang diharapkan belum tentu sama dengan hasil sebenarnya dalam sel?
Titik kontrol lain dalam siklus Krebs adalah sintetase sitrat enzim, yang mengkatalisis reaksi pertama,
konversi oksaloasetat dan asetil-KoA menjadi sitrat. Tingginya kadar ATP menghambat sintetase sitrat
(dan juga fosfofruktokinase, dehidrogenase piruvat, dan dua enzim siklus Krebs lainnya),
memperlambat keseluruhan jalur katabolik.
Review 7.7
Respirasi dikontrol oleh tingkat ATP dalam sel dan tingkat kunci intermediet dalam proses. Titik
control glikolisis dalah enzim fosfofruktokinase, yang dihambat oleh ATp atau sitrat (atau keduanya).
Control utama dalam oksidasi piruvat adalah dehidrogenasi enzim piruvat, dihambat oleh NADH.
bahkan tanpa
anaerobik,
menerima
dengan
elektron,
beberapa
organisme
menggunakan molekul
anorganik
sebagai akseptor
elektron
terakhir
(Gambar
7.18).
Energi bebas yang dilepaskan dengan menggunakan molekul-molekul lain sebagai akseptor elektron
terakhir
tidak
begitu
besar
seperti dengan
menggunakan
oksigen
karena mereka memiliki afinitas/daya tarik-menarik yang lebih rendah untuk elektron. ATP yang
dihasilkan sedikit, namun prosesnya masih respirasi dan tidak fermentasi.
Methanogen menggunakan karbon dioksida
Di antara heterotrophs yang menjalankan respirasi anaerob adalah Archaea seperti thermophiles dan
methanogen.
Methanogen
menggunakan
karbon
akseptor elektron, mereduksi CO2 ke CH4 (metana). Hidrogen yang berasal dari molekul organik
dihasilkan oleh organisme lain.Methanogen ditemukan di lingkungan yang
tanah dan sistem pencernaan ternak besar seperti sapi.
Bakteri Belerang menggunakan sulfat
beragam,
termasuk
Bukti kedua
batuan
sekitar 2,7 BYA, dikenal sebagai pembentukan besi Woman River. Bahan organik dalam batuan
diperkaya cahaya isotop belerang,
32
yang diketahui menghasilkan pengayaan tersebut, tetapi ada reduksi belerang biologis, dalam suatu
proses yang masih dilakukan pada saat ini oleh prokariota primitif tertentu.
Dalam respirasi sulfat, prokariota mendapat energi dari reduksi sulfat anorganik (SO4) ke hidrogen
sulfida (H2S). Atom hidrogen diperoleh dari
dihasilkan
oleh
organisme lain. Sehingga Prokariota ini serupa dengan methanogen, tapi mereka menggunakan SO4
sebagai perantara pengoksidasi (yaitu, penerima elektron) pada tempat CO2.
Pada
awalnya
pengurang sulfat
mengatur
yang
tahapan
kita
evolusi
fotosintesis, menciptakan
bicarakan
awal fotosintesis yang memperoleh hidrogen dari H2S menggunakan energi sinar matahari.
Proses fermentasi menggunakan senyawa organik sebagaia kseptor electron
Dengan tidak adanya oksigen, sel-sel yang tidak dapat memanfaatkan penerima elektron alternatif
untuk respirasi harus bergantung secara eksklusif pada glikolisis untuk menghasilkan ATP. Dengan
kondisi
tersebut, elektron
yang
dihasilkan oleh
glikolisis
disumbangkan untuk molekul organik dalam proses yang disebut fermentasi. Proses ini mendaur
ulang NAD+, penerima elektron yang memungkinkan glikolisis untuk berjalan.
Bakteri melakukan lebih dari selusin jenis reaksi fermentasi, sering menggunakan piruvat atau turunan
dari piruvat untuk menerima elektron dari NADH. Molekul organik selain piruvat dan turunannya
dapat digunakan juga; poin penting adalah bahwa proses tersebut memulihkan NAD+ :
molecule organic +NADH melekul organic yang tereduksi +NAD+
Seringkali senyawa organic yang berkurang adalah asam organic seperti asam asetat, asam butirat,
asam propionat, atau asam-laktat atau alkohol.
Fermentasi Etanol
Sel eukariotik hanya mampu melakukan beberapa jenis fermentasi. Dalam satu jenis, yang terjadi
dalam ragi, molekul yang menerima elektron dari NADH berasal dari piruvat, hasil-akhir glikolisis.
gugus
terminal CO2
dari
piruvat
melalui
dekarboksilasi,
menghasilkan molekul 2-karbon yang disebut asetaldehida. Pelepasan CO2 menyebabkan roti yang
dibuat dengan ragi mengembang; roti
Asetaldehida ini
dibuat
NADH,
tidak
mengembang.
menghasilkan
NAD+
fermentasi ini
menarik
merupakan sumber
etanol pada anggur dan bir. Etanol merupakan produk sampingan dari fermentasi yang sebenarnya
adalah racun
bagi
ragi,
yang
mendekati
konsentrasi
difermentasi
secara
mengandung
sel-sel
hewan
meregenerasi NAD+
misalnya, menggunakan enzim laktat dehydrogenasi untuk mentransfer elektron dari NADH kembali
ke piruvat yang dihasilkan oleh glikolisis. Reaksi ini mengubah piruvat menjadi asam laktat dan
meregenerasi
NAD+
dari
itu
menutup
lingkaran
metabolisme, memungkinkan glikolisis untuk terus berlanjut selama masih ada glukosa.
Peredaran
darah melepaskan
dengan
Dalam jenis ekosistem yang bagaimana Kamu harap dapat menemukan respirasi anaerob?
ini kita
organisme memperolehnya
dari mencerna karbohidrat atau dari fotosintesis. Molekul organik selain glukosa, khususnya protein
dan lemak, juga merupakan sumber penting energi (gambar 7.20).
kemudian dilepaskan
dari
setiap asam
yang
disebut
deaminasi. Serangkaian reaksi mengubah rantai karbon yang tetap menjadi molekul yang memasuki
glikolisis atau siklus Krebs. Sebagai contoh, alanin diubah menjadi piruvat, glutamate menjadi ketoglutarate (gambar 7.21), dan aspartate menjadi oksaloasetat. Reaksi glikolisis dan siklus Krebs
kemudian
mengekstrak
elektron energi
tinggi
dari molekul-molekul
dan
mendorongnya
ikatan
CH
kaya
energi.
Asam
lemak dioksidasi dalam matriks mitokondria. Enzim melepaskan gugus 2-karbon asetil dari akhir
setiap asam
untuk
asetil
membentuk
asetil-
KoA. Proses ini dikenal sebagai oksidasi . Proses ini tergantung pada oksigen, yang menjelaskan
mengapa olahraga erobik membakar lemak, tapi olahraga bukan erobik tidak membakar lemak.
Berapa banyak ATP yang
dihasilkan oleh
katabolisme
bandingkan 6-
karbon asam lemak hipotetis dengan 6-karbon molekul glukosa , yang menghasilkan sekitar 30
molekul ATP dalam sel eukariotik. Dua putaran oksidasi akan mengubah asam lemak menjadi
tiga molekul asetil-KoA. Setiap putaran membutuhkan
untuk
memancing
prosesnya, tetapi juga menghasilkan satu molekul NADH dan satu FADH2. Molekul tersebut bersamasama menghasilkan empat molekul ATP
(dengan
asumsi 2,5 ATPs per NADH, dan 1,5 ATPs per FADH2).
Oksidasi setiap asetil KoA dalam siklus Krebs akhirnya menghasilkan 10 molekul ATP tambahan.
Secara
6-karbon
sekitar:
8 (dari dua putaran oksidasi ) 2 (untuk priming dua putaran) + 30 (dari oksidasi tiga asetilKoAs) = 36 molekul ATP. Oleh
asam
lemak
menghasilkan
fakta
ini mengapa
kali
lemak
kilo
kalori
merupakan
energi yang
disimpan bukan sebagai karbohidrat, seperti pada tumbuhan, tubuh hewan haruslah bertambah besar.
Sejumlah kecil kunci intermediet terhubung dengan jalur metabolik
Jalur Oksidasi molekul makanan berhubungan dalam sejumlah kecil kunci intermediet, seperti
piruvat dan asetil-KoA, menghubungkan pemecahan dari titik awal yang berbeda. Kunci intermediet
ini memungkinkan interkonversi dari
berbagai
jenis molekul,
seperti
gula
dan
proses
pembuatan
glukosa baru,
demikian
menggunakan
banyak
dari
semuanya
glikolisis
kecuali
berjalan maju
atau mundur, tergantung pada konsentrasi dari intermediet-dengan hanya tiga langkah kunci memiliki
enzim yang berbeda untuk arah maju dan mundur.
Asetil-KoA memiliki banyak peran
Banyak proses metabolisme berbeda yang menghasilkan asetil-KoA. Tidak hanya oksidasi piruvat
memproduksinya,
tetapi
mengkatabolize
energi untuk
ini menjelaskan
mengapa
banyak hewan
mereka mengkonsumsi
tingkat rendah, jalur oksidatif
dirangsang, dan arus asetil-KoA mengalir menjadi energi yang menghasilkan metabolisme oksidatif.
Mempelajari rangkuman hasil 7.9
protein dapat dipecah ke dalam unsure amino acid mereka, yang kemudian di deaminasi dan dapat
memasuki metabolism pada glycolsys atau langkah-langkah yang berbeda dari siklus Kreb.
Lemak adalah dapat dipecah menjadi unit asetil-KoA oleh b-oksidasi dan dimasukkan ke
dalam siklus Krebs. Banyak Jalur metabolik utama dapat digunakan secara terbalik, pada
pembentukan (anabolisme) juga atau mematahkan (katabolisme) makromolekul biologi utama. Kunci
menengah, seperti pruvaa dn acetyl-Coa, berhubungan dengan prses ini.
7.11 Evolusi Metabolisme
1. Jelaskan satu kemungkinan hipotesis pada evolusi metabolisme.
Kami berbicara tentang respirasi selular sebagai rangkaian berkesinambungan dari tahap-tahap. tetapi
penting untuk dicatat bahwa tahap ini berkembang dari waktu ke waktu, dan metabolisme telah
berubah banyak pada saat itu. Kedua proses anabolik dan proses katabolik berkembang bersama satu
sama lain. Kita tidak tahu rincian dari evolusi biokimia, atau urutan penampilan dari prosesproses. Oleh karena itu garis waktu berikut ini didasarkan pada bukti geokimia yang tersedia dan
mewakili hipotesis daripada garis waktu yang ketat.
Anaerobik
Memungkinkan
Penangkapan
Energi
Cahaya
peristiwa utama ketiga dalam evolusi fotosintesis metabolisme anaerobic adalah fotsintesis
anoxygenis. Pada awal sejarah kehidupan, sebuah cara yang berbeda untuk menghasilkan ATP yang
berevolusi pada beberapa organisme. Alih-alih memperoleh energi untuk sintesis ATP oleh ikatan
kimia reshuffle, seperti dalam glikolisis, organisme ini mengembangkan kemampuan untuk
menggunakan cahaya yang memompa proton keluar dari sel mereka, dan menggunakan gradien
proton yang menghasilkan daya produksi ATP melalui kemiosmosis.
Fotosintesis berkembang dalam ketiadaan oksigen dan bekerja dengan baik tanpa itu. H2S terlarut,
hadir dalam lautan bumi awal di bawah suasana yang bebas dari gas oksigen, dipersiapkan sebagai
sumber atom hidrogen untuk membangun molekul organik. Belerang bebas dihasilkan sebagai produk
sampingan dari reaksi ini.
Fotosintesis Pembentuk Oksigen Menggunakan Sumber Hidrogen Yang Berbeda
Penggantian H2O untuk H2S dalam fotosintesis adalah peristiwa besar keempat dalam sejarah
metabolisme. Fotosintesis pembentuk Oksigen mempekerjakan H2O daripada H2S sebagai sumber
atom hidrogen dan elektron yang terkait.Karena ini menyimpan elektron dari oksigen yang berkurang
bukan dari belerang yang berkurang, ini menghasilkan gas oksigen daripada belerang bebas.
Lebih dari 2 BYA, sel-sel kecil yang mampu membawa fotosintesis pembentuk oksigen, seperti
cyanobacteria, menjadi bentuk kehidupan dominan di Bumi. Gas Oksigen mulai menumpuk di
atmosfer. Ini adalah awal dari sebuah transisi besar yang mengubah kondisi permanen di
Bumi. atmosfer kita sekarang adalah 20,9% oksigen, setiap molekul berasal dari reaksi fotosintesis
pembentuk oksigen.
Pembetulan Nitrogen menyediakan nitrogen organik baru
Nitrogen tersedia dari bahan organik mati, dan dari reaksi kimia yang dihasilkan molekul-molekul
organik asli. Agar kehidupan berkembang sumber nitrogen baru diperlukan. fiksasi Nitrogen
merupakan langkah utama dalam evolusi kelima metabolisme. Protein dan asam nukleat tidak dapat
disintesis dari hasil fotosintesis karena kedua molekul tersebut secara bilologis kekurangan
nitrogen. Mendapat atom nitrogen dari gas N2, sebuah proses yang disebut fiksasi nitrogen,
membutuhkan pemecahan tiga ikatan NN.
Reaksi penting tersebut berkembang dalam atmosfer kaya hidrogen pada awal Bumi, di mana tidak
ada oksigen. Oksigen bertindak sebagai racun pada fiksasi nitrogen, yang hari ini hanya terjadi pada
lingkungan bebas oksigen atau dalam kompartemen bebas oksigen dalam prokariota tertentu.
Respirasi aerobik memanfaatkan oksigen
Respirasi adalah kejadian keenam dan terakhir dalam sejarah metabolisme. Respirasi aerobik
menggunakan jenis pompa proton yang sama sebagaimana fotosintesis dan diduga telah berevolusi
sebagai modifikasi dari mesin fotosintesis dasar.
Ahli biologi berpikir bahwa kemampuan untuk melakukan fotosintesis tanpa H 2S pertama kali
berevolusi pada bakteri nonsulfur ungu, yang memperoleh hidrogen dari senyawa organik sebagai
gantinya. Hal itu mungkin tak terelakkan bahwa di antara keturunan dari bakteri fotosintetik respiring,
beberapa akhirnya akan lakukan tanpa fotosintesis sepenuhnya, hidup dari hanya pada energi dan
elektron yang berasal dari pemecahan molekul organik.Mitokondria di semua sel eukariotik dianggap
keturunan dari bakteri ini.
Proses kompleks metabolisme aerobik dikembangkan dari waktu ke waktu secara geologi, sebagai
seleksi alam yang disukai organisme dengan metode yang lebih efisien untuk memperoleh energi dari
molekul organik. Proses fotosintesis, seperti yang kamu lihat di bagian penutup, juga telah
dikembangkan dari waktu ke waktu, dan munculnya fotosintesis mengubah kehidupan di bumi
selamanya. Bab berikutnya membahas fotosintesis secara rinci.
Review 7.10
TOnggak utama dalam evolusi metabolisme termasuk jalur evolusi untuk mengekstrak energi dari
senyawa organik, jalur fotosintesis, dan jalur fiksasi nitrogen. Fotosintesis dimulai sebagai proses
tanpa oksigen yang kemudian berkembang menghasilkan oksigen, sehingga memungkinkan evolusi
dari metabolisme aerob.
Bukti apa yang bias kamu ambil dalam hipotesis evolusi metabolisme?