Tumbuhan lamun terdiri dari akar rhizome dan daun .

Rhizome merupakan
batang yang terpendam dan merayap secara mendatar dan berbuku-buku. Pada buku-
buku tersebut tumbuh batang pendek yang tegak ke atas, berdaun dan berbunga. Pada
buku tumbuh pula akar (Nontji,1993). Lamun memiliki daun-daun tipis yang
memanjang seperti pita yang mempunyai saluran-saluran air (Nybakken, 1992). Bentuk
daun seperti ini dapat memaksimalkan difusi gas dan nutrien antara daun dan air, juga
memaksimalkan proses fotosintesis di permukaan daun (Philips dan Menez, 1988).
Secara lengkap klasifikasi beberapa jenis lamun yang terdapat di perairan pantai
Indonesia (Phillips dan Menez,1988) adalah sebagai berikut :

Divisi : Anthophyta
Kelas : Angiospermae
Subkelas : Monocotyledonae
Ordo : Helobiae
Famili : Hydrocharitaceae
Genus : Enhalus
Species : Enhalus acoroides
Genus : Halophila
Species : Halophila decipiens
Halophila ovalis
Halophila minor
Halophila spinulosa
Genus : Thalasia
Species : Thalasia hemprichii
Famili : Cymodoceaceae
Genus : Cymodocea
Species : Cymodocea rotundata
Cymodocea serrulata
Genus : Halodule
Species : Halodule pinifolia
Halodule uninervis
Genus : Syringodium
Species : Syringodium isoetifolium
Genus : Thalassodendron
Species : Thalassodendron ciliatum

Daun menyerap hara langsung dari periran sekitarnya, mempunyai rongga untuk
mengapung agar dapat berdiri tegak di air, tapi tidak banyak mengandung serat seperti
tumbuhan rumput di darat (Hutomo,1997). Sebagian besar lamun berumah dua,artinya
dalam satu tumbuhan hanya ada jantan saja atau betina saja. Sistem pembiakannya
ber Lamum di dunia terdiri atas 2 suku, 12 marga dan 50 jenis. Di Indonesia hanya
dijumpai 12 jenis yang termasuk dalam tujuh marga.