Pemodelan embriogenesis somatik melibatkan auksin, NO, Hb dan kematian sel
terprogram Pada tahap ini, bukti eksperimental terhadap embriogenesis somatik menunjukkan ketidakmungkinan untuk menggambarkan proses salah satu mekanisme tunggal atau, setidaknya, menggambarkan, mendefinisikan tahap yang konsisten di spesies. Auksin dan transportasi auksin merupakan komponen penting dari embriogenesis somatik pada Arabidopsis, dengan kematian sel terprogram memiliki peran yang kurang jelas. Dalam sistem lain, auksin, transportasi auksin dan kematian sel terprogram memiliki peran yang signifikan pada prosesnya. NO juga dapat bertindak sebagai faktor sinyal pada mediasi auksin, selain fungsinya dalam kematian sel terprogram. Keterlibatan NO di dua tempat dapat menjelaskan efeknya pada embriogenesis somatik. Di laboratorium, Arabidopsis dan jagung, dan tanaman lain menunjukkan bahwa tanaman Hbs juga berfungsi mengganggu proses mediasi NO. Dari segi gen hemoglobin, dilakukan pemeriksaan daerah promotor Hb pada berbagai spesies. Elemen di daerah promotor kelas 1 dan kelas 2 Hbs dari Arabidopsis, jagung dan beras secara skematis disajikan dalam Gambar 1. Lima homolog HB1 telah diidentifikasi untuk spesies ini dengan daerah promotor putatif. Auksin, sitokinin dan asam absisat semua efektor dikenal sebagai embryogenesis somatik dan elemen promotor relatif terhadap tiga hormon yang ada dalam Hb. Sitokinin, elemen respon sitokinin dan elemen promotor asam absisat dapat diidentifikasi di kedua kelas Hbs pada semua spesies. Selain itu, ada banyak elemen responsif cahaya di setiap daerah promoter. Pemeriksaan elemen respon auksin memberikan beberapa perbedaan yang menarik di antara spesies. Kurangnya unsur promotor auksin di salah satu dari dua gen Arabidopsis merupakan keadaan yang sangat penting. Variasi adanya elemen respon auksin untuk Hbs monokotil merupakan indikator signifikan bahwa hemoglobin memiliki fungsi sel tertentu, respon dengan cara yang berbeda untuk sel dan gangguan lingkungan. Daerah promotor dari Hbs dari Arabidopsis, jagung dan beras. HB1 dan HB2 menunjuk Kelas 1 dan Kelas 2 hemoglobin dari Arabidopsis. Hb1-1 dan Hb1-2 menunjukkan Kelas 1 homolog gen hemoglobin pada jagung dan beras. Daerah promotor gen mengandung elemen yang merespon gangguan lingkungan atau hormon tertentu jika sel selain berwarna putih. Arabidopsis thaliana (At); Zea mays (Zm); Oryza sativa (Os); MEJA (metil jasmonat); GA (asam giberelat); CK / ARR1, sitokinin / sitokinin elemen respon; ABA (asam absisat). Reseptor metil jasmonat pada jagung dan Arabidopsis mungkin memiliki hubungan karena adanya efek dari asam jasmonat pada ekspresi MYC2. Stres anaerobik dan PCD sangat erat kaitannya. Elemen terkait kekurangan oksigen dapat ditemukan di daerah promotor semua gen pengecualian pada Hbs Arabidopsis. Arabidopsis juga tidak memiliki promotor yang mengontrol respon suhu rendah yang ada dalam spesies lain. Pengamatan ini jelas memerlukan verifikasi eksperimental dan kurangnya elemen promotor tidak menghilangkan kemungkinan adanya rute tidak langsung yang mencapai peningkatan dari hemoglobin tertentu. Perlakuan jaringan kalus Arabidopsis dengan 2,4-D, misalnya, menghasilkan peningkatan yang signifikan dalam ekspresi HB2. Namun, saat diidentifikasi tidak ada unsur promotor untuk auksin pada gen Arabidopsis. Ekstrapolasi hasil pada Arabidopsis ke spesies lain perlu dilakukan dengan hati-hati. Penjelasan lebih rinci dan perbandingan daerah promotor Hbs dari jagung disajikan pada Gambar 2. Daerah promotor Hb 1-2 kekurangan respon auksin, seperti daerah promotor HB2 pada Arabidopsis. Penekanan ekspresi HB2 memiliki efek dalam meningkatkan pembentukan embrio somatik pada Arabidopsis. Selain itu, juga memiliki bukti bahwa penekanan Hb 1-2 terlibat dalam kematian sel terprogram yang spesifik dalam jaringan jagung. Adanya hipotesis tentang bagaimana tanaman Hbs dapat mempengaruhi embriogenesis somatik dan kematian sel terprogram melalui modulasi NO disajikan pada Gambar 3. Kompetensi embriogenik dicapai dengan menginkubasi jaringan kalus dalam auksin, biasanya dengan 2,4-D, selama periode induksi. NO dalam sel diinduksi, mencegah sintesis jasmonat, memungkinkan sintesis MYC2, mencegah biosintesis IAA dalam jaringan. Pada saat yang sama, Hb menghilangkan NO dalam sel suspensor, mencegah peristiwa inisiasi rantai yang mengakibatkan PCD. Pembentukan blok MYC2 ini untuk mengatasi penghambatan IAA biosintesis, mengurangi kebutuhan auksin eksternal yang mencapai kompetensi embriogenik. Demikian pula, penghapusan Hb dari sel-sel suspensor meningkatkan NO seluler, inisiasi PCD, menghancurkan suspensor dan memudahkan embrio berkembang dari sel-sel yang kompeten.
15 tahun pertama penelitian berurusan dengan latar belakang Hbs, reaksi
metabolisme dan peran fungsional. Dengan penekanan pada tingkat sel, ada kesempatan untuk memperluas pengetahuan tentang bagaimana molekul-molekul ini berfungsi dalam pengembangan, diferensiasi, amputasi dan respons terhadap stres biotik dan abiotik. Kematian sel / tingkat kelangsungan hidup mungkin dikendalikan oleh Hbs yang menjadi faktor regulasi selama reproduksi tanaman yang mempengaruhi embrio dan produksi benih dan akhirnya produktivitas tanaman.