Tugas-1: Reference Searching and Managing: Levansukrase

- copy seluruh teks di halaman soal ini ke halaman kosong di lembar jawaban, kemudian
file diberi nama: Tugas-1_nama mhs_NIM.doc
- carilah referensi/jurnal yang berkaitan dengan artikel ilmiah di bawah ini
- lampirkan file jurnal yang diperoleh pada saat mengumpulkan tugas ini
- otomatisasi referensi (sitasi dan daftar pustaka) dengan program Mendeley
- kirimkan tugas ke: asyari@live.undip.ac.id maks Sabtu, 30-9-2017 jam 10.00 WIB.

Struktur dan sisi aktif levansukrase

Salah satu struktur molekul levansukrase yang telah dikristalisasi yaitu dari bakteri Bacillus
subtilis (Meng and Ftterer 2003). Berikut ini struktur tersier levansukrase dari bakteri Bacillus
subtilis pada Gambar II.2.

Gambar II.1 Struktur tersier levansukrase dari Bacillus subtilis

Sumber: (Meng and Ftterer 2003)(pdb :1PT2)

Sisi katalitik levansukrase terdiri dari satu atau lebih bagian pengikatan substrat. Umumnya
mekanisme katalitik levansukrase dilakukan oleh 3 residu asam amino penting yang disebut triad
katalitik. Triad katalitik levansukrase terdiri atas dua residu aspartat dan satu residu glutamat
dengan posisi residu yang berbeda bergantung pada sumber mikroorganismenya. Triad katalitik
levansukrase dari Bacillus subtilis terdiri atas Asp86, Asp247, dan Glu340. (Meng and Ftterer
2008). Residu Asp86 berperan sebagai nukleofil yang menyerang bagian tengah glukopiranosil
dari sukrosa membentuk kompleks enzim-fruktosil dan membalikkan ikatan glikosidik dari
sukrosa pada keadaan intermediet, dimana bisa melalui transfruktosilasi atau hidrolisis
bergantung pada konsentrasi substrat. (Dedonder 1945). Residu Asp247 diketahui sebagai
penstabil keadaan transisi dikarenakan dapat membentuk ikatan hidrogen dengan hidroksil dari
C3 dan C4 unit fruktosil. Residu Glu340 bertindak sebagai katalis asam atau basa (Meng and
Ftterer 2003). Pada Gambar II.3 ditunjukkan triad katalitik levansukrase dari Bacillus subtilis.

Gambar II.2 Triad katalitik levansukrase dari Bacillus subtilis (Meng and Ftterer 2003)

Triad katalitik levansukrase dari Bacillus megaterium terdiri atas Asp95, Asp257, dan Glu 352
(Strube et al. 2011). Sedangkan triad katalitik levansukrase dari Gluconacetobacter
diazotrophicus terdiri atas Asp135, Asp309, dan Glu401 (Martnez-Fleites et al. 2005).

Mekanisme reaksi levansukrase

Enzim levansukrase (EC 2.4.1.10) termasuk pada kelompok enzim fruktosil transferase.
(Homann et al. 2007) (Tian, Khodadadi, and Karboune 2014). Levansukrase dapat mengkatalis
empat jenis reaksi tergantung pada akseptor yang terlibat yaitu, pertukaran (akseptor
monosakarida), hidrolisis (akseptor air), transfruktosilasi (akseptor sukrosa atau
fruktooligosakarida), dan polimerisasi (akseptor levan) (Martnez-Fleites et al. 2005).
Mekanisme reaksi levansukrase ditunjukkan pada Gambar II.4
 Gambar II.3 Mekanisme reaksi levansukrase (Martnez-Fleites et al. 2005)

Pada dasarnya tahapan awal proses katalitik levansukrase adalah pembentukan intermediet
fruktosil-enzim yang umumnya terjadi pada berbagai levansukrase. Selanjutnya terjadi
pemindahan unit fruktosil dari intermediet fruktosil-enzim pada akseptor sukrosa. Kemudian
diteruskan dengan reaksi polimerisasi melalui pemindahan unit fruktosil pada berbagai akseptor
fruktooligosakarida membentuk polimer levan. (Tian, Karboune, and Hill 2014). Akan tetapi,
efisiensi pemindahan unit fruktosil pada akseptor fruktooligosakarida berbeda untuk berbagai
levansukrase. Perbedaan efisiensi katalitik enzim levansukrase mengindikasikan akan kebutuhan
yang berbeda terhadap produk katalisis dari setiap mikroorganisme bergantung pada lingkungan
ekologinya (Song and Jacques 1999). Selain itu, konsentrasi sukrosa, temperatur reaksi, serta
konsentrasi enzim akan memberi pengaruh pada produk akhir reaksi. Levansukrase pada
Bacillus subtilis dan Gluconacetobacter diazotrophicus diketahui hanya memperlihatkan
aktivitas hidrolitik ketika konsentrasi sukrosa rendah ( < 50 mM ) pada lingkungannya
(Hernandez et al. 1995).
 DAFTAR PUSTAKA

Dedonder, By Raymond. 1945. Ducible and Exocellular , and in Aerobacter Levanicum , Where
It Is Con- Glucostat Special S Solutions. Synthesis 450(1943): 500505.
Hernandez, L et al. 1995. Isolation and Enzymic Properties of Levansucrase Secreted by
Acetobacter Diazotrophicus SRT4, a Bacterium Associated with Sugar Cane. The
Biochemical journal 309 ( Pt 1: 11318.
Homann, Arne et al. 2007. Insights into Polymer versus Oligosaccharide Synthesis:
Mutagenesis and Mechanistic Studies of a Novel Levansucrase from Bacillus
Megaterium. The Biochemical journal 407(2): 18998.
Martnez-Fleites, Carlos et al. 2005. Crystal Structure of Levansucrase from the Gram-Negative
Bacterium Gluconacetobacter Diazotrophicus. Biochemical Journal 390(1): 1927.
Meng, Guoyu, and Klaus Ftterer. 2003. Structural Framework of Fructosyl Transfer in Bacillus
Subtilis Levansucrase. Nature structural biology 10(11): 93541.
Meng, Guoyu, and Klaus Ftterer. 2008. Donor Substrate Recognition in the Raffinose-Bound
E342A Mutant of Fructosyltransferase Bacillus Subtilis Levansucrase. BMC structural
biology 8(1): 16.
Song, D D, and N A Jacques. 1999. Purification and Enzymic Properties of the
Fructosyltransferase of Streptococcus Salivarius ATCC 25975. Biochem J 341 ( Pt
2(1999): 28591.
Strube, Christian P. et al. 2011. Polysaccharide Synthesis of the Levansucrase SacB from
Bacillus Megaterium Is Controlled by Distinct Surface Motifs. Journal of Biological
Chemistry 286(20): 17593600.
Tian, Feng, Salwa Karboune, and Andrea Hill. 2014. Synthesis of Fructooligosaccharides and
Oligolevans by the Combined Use of Levansucrase and Endo-Inulinase in One-Step Bi-
Enzymatic System. Innovative Food Science and Emerging Technologies 22: 23038.
Tian, Feng, Maryam Khodadadi, and Salwa Karboune. 2014. Optimization of
Levansucrase/endo-Inulinase Bi-Enzymatic System for the Production of
Fructooligosaccharides and Oligolevans from Sucrose. Journal of Molecular Catalysis
B: Enzymatic 109: 8593.