ABSTRAK

Rosid, M. F. 2017. Studi Struktur Keadaan Transisi dan Energi Aktivasi Abstraksi
Hidrogen pada Toluena dengan Radikal Nitrat Menggunakan Metode
DFT dan MP2. Skripsi, Jurusan Kimia, FMIPA, Universitas Negeri
Malang. Pembimbing: (I) Dr. Yahmin, S.Pd., M.Si., (II) Drs. Ida Bagus
Suryadharma, M.S.

Kata Kunci: Toluena, Radikal Nitrat, Struktur Keadaan Transisi, Energi

Aktivasi, DFT, MP2

Toluena merupakan salah satu hidrokarbon aromatik yang memiliki peran

penting dalam pembentukan VOC (Volatile Organic Compounds) dan memiliki
reaktivitas tinggi dalam pembentukan SOA (Seconder Organic Aerosol)
diatmosfer. Di lapisan atmosfer, salah satu proses penghilang toluena adalah
reaksinya pada wujud gas dengan radikal NO3 pada malam hari. Reaksi tersebut
menyebabkan terbentuknya polusi di udara. Berbagai upaya telah dilakukan untuk
mengurangi dampak tersebut. Salah satunya meneliti reaksi-reaksi yang terjadi
pada toluena, terutama reaksi oksidasi pada toluena. Pada studi ini struktur
keadaan transisi dan energi aktivasi abstraksi hidrogen pada toluena dengan
radikal nitrat diteliti menggunakan metode kimia komputasi.
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur keadaan transisi, energi
aktivasi dan produk utama pada temperatur kamar reaksi abstraksi hidrogen pada
toluena dengan radikal NO3 menggunakan metode DFT. Tahapan kerja dalam
penelitian teoritis ini terdiri enam tahap, yaitu (1) menggambar struktur reaktan
dan produk, (2) optimasi geometri dan perhitungan frekuensi vibrasi reaktan, (3)
optimasi geometri dan perhitungan frekuensi vibrasi produk, (4) pencarian
struktur keadaan transisi dan perhitungan frekuensi vibrasinya, (5) perhitungan
energi keadaan transisi, (6) perhitungan Intrinsic Coordinate Reaction (IRC).
Perhitungan optimasi geometri dan frekuensi dilakukan dengan menggunakan
metode DFT B3LYP. Perhitungan energi keadaan transisi dilakukan dengan
metode MP2 (second-order Møller-Plesset perturbation theory). Himpunan basis
yang digunakan untuk perhitungan optimasi, frekuensi vibrasi, dan energi adalah
6-311G(d,p).
Hasil penelitian menunjukkan bahwa reaksi abstraksi hidrogen pada
toluena dengan radikal nitrat menghasilkan enam macam struktur keadaan
transisi, yakni: (1) abtraksi hidrogen pada rantai samping (TS-S, Ea = 0,509
kkal/mol), (2) abstraksi hidrogen cincin posisi orto (TS-Oa, Ea = 12,302
kkal/mol), (3) abstraksi hidrogen cincin posisi orto (TS-Ob, Ea = 12,017
kkal/mol), (4) abstraksi hidrogen cincin posisi meta (TS-Ma, Ea = 12,278
kkal/mol), (5) abstraksi hidrogen cincin posisi meta (TS-Mb, Ea = 12,363
kkal/mol), (6) abstraksi hidrogen cincin posisi para (TS-P, Ea = 12.746 kkal/mol).
Keadaan transisi TS-S merupakan yang paling stabil sehingga produk utama
reaksi abstraksi hidrogen toluena dengan radikal nitrat adalah radikal benzil.

i
 ABSTRACT

Rosid, M. F. 2017. Study of Transition State Structure and Activation Energy

Hydrogen Abstraction Toluene with Nitrate Radical using DFT and MP2
Method. Undergraduate, Department of Chemistry. Mathematics and
Science Faculty. State University of Malang. Lecturer: (I) Dr. Yahmin,
S.Pd.,M.Si., (II) Drs. Ida BagusSuryadharma, M.S.

Keyword: Toluene, Radical nitrate, Transition State Structure, Activation Energy,

DFT, MP2

Toluene is one of aromatic hydrocarbon that has important role in

formation of VOC (Volatile Organic Compounds) and has high reactivity in
formation of SOA (Seconder Organic Aerosol) in atmosphere. In the atmosphere,
one process of Toluene`s remover is its reaction on gas state with radical NO3 in
the night. That kind of reaction then create pollution in the air. Earlier studies has
tried to decrease impact of the reaction, one of them is by research toluene`s
reaction particularly the oxidation. In this case, transitionstate structure and
activation energy of hydrogen abstraction in toluene with nitrate radical was
observed using computation chemistry method.
This research was aimed to know the transition state structure, activation
energy, and primary product in the room reaction of hydrogen abstraction in
toluene with radical NO3 using DFT method. There were six step in this research,
(1) draw the structure of reactants and product, (2) optimization of geometry and
calculation of its reactants vibration frequency, (3) optimization of geometry and
calculation of product vibration frequency, (4) research the transition state
structure and calculation of its vibration frequency, (5) energy calculation of
transition state, and (6) calculation of Intrinsic Coordinate Reaction (IRC). The
energy calculation of transition state was done with MP2 (second-order moller-
plessset perturbation theory) method. The base set used for optimization
calculation, vibration frequency, and energy is 6-311G(d,p).
The result shows that hydrogen abstraction reaction in toluene with nitrate
radical was then produce six kind of transition state structure, (1) hydrogen
abstraction of side chain (TS-S, Ea = 0,509 Kcal/mol), (2) hydrogen abstraction of
ortho position ring TS-Oa, Ea = 12,302 Kcal/mol), (3) hydrogen abstraction of
ortho position ring (TS-Ob, Ea = 12,017 Kcal/mol, (4) hydrogen abstraction of
meta position ring (TS-Mb, Ea = 12,363 Kcal/mol), (5) hydrogen abstraction of
meta position ring(TS-Mb, Ea = 12,363 Kcal/mol), and (6) hydrogen abstraction
of para position ring (TS-P, Ea =12,746 Kcal/mol). Transition state of TS-S is the
most stable one, so that the first product of hydrogen abstraction reaciton of
toluene with nitrate radical is benzyl radical.

ii
 KATA PENGANTAR

Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT karena berkat

limpahan rahmat dan hidayah-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi yang

berjudul “Studi Struktur Keadaan Transisi dan Energi Aktivasi Abstraksi

Hidrogen pada Toluena dengan Radikal Nitrat Menggunakan Metode

DFTdan MP2”. Penulis mengucapkan terima kasih ditujukan kepada semua

pihak yang telah membantu baik secara langsung maupun tidak langsung dalam

menyelesaikan penelitian dan penulisan skripsi ini, yaitu:

1. Abi, umi (alm), dan segenap keluarga atas segala dukungan, semangat dan

doa kepada penulis selama proses penulisan skripsi ini.

2. Dr. Yahmin, S.Pd., M.Si., selaku pembimbing I yang dengan sabar

mengarahkan, membimbing, memotivasi, dan memberikan masukan selama

penelitian dan penyusunan skripsi.

3. Drs.Ida Bagus Suryadharma, M.S., selaku pembimbing II yang telah

memberikan bimbingan, motivasi, arahan, saran, dan koreksi dalam

penyusunan skripsi ini.

4. Drs. Ridwan Joharmawan, M.Si., selaku dosen penguji utama yang telah

memberikan masukan demi kesempurnaan skripsi.

5. Dr. Aman Santoso, M.Si. dan Dr. Suharti, S.Pd, M.Si. selaku ketua dan

sekertaris jurusan kimia FMIPA UM yang telah memberikan izin dalam

pelaksanaan penelitian dan ujian skripsi.

6. Para dosen Jurusan Kimia yang telah memberikan ilmu yang bermanfaat

selama proses perkuliahan.

iii
7. Laboran dan staf jurusan kimia yang telah membantu selama proses

penelitian.

8. Teman-teman bidang kimia komputasi Alfinda P. R, Anisa, Moch. Khozin A,

Catra, Memed, dan Suto yang selalu membantu dalam memberikan saran,

motivasi, dan dorongan demi terselesainya skripsi ini.

9. Sahabat-sahabat Offering G, H dan I angkatan 2012 yang telah ikut memberi

semangat, masukan, dan motivasi.

10. Teman-teman organisasi kemahasiswaan baik Himpunan Mahasiswa Jurusan

Kimia, Chemistry Islamic Study, Ikatan Mahasiswa Pamekasan Madura,

UKM-Al-Qur’an Study Club, Badan Eksekutif Mahasiswa Universitas,

Pergerakan Mahasiswa Islam Indonesia yang selalu meningkatkan semangat

selama menempuh perkuliahan.

11. Noval, S.Pdi, dan Siti Magfuroh, S.E selaku saudara penulis yang selalu

memberikan ssuport dan motivasi untuk menyelesaikan skripsi ini.

Selain itu, penulis ingin menyampaikan minta maaf jika selama proses

menimba ilmu di Universitas Negeri Malang ada yang kurang berkenan baik

ucapan dan tindakan yang sengaja maupun tidak disengaja.

Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih banyak kekurangan. Oleh

karena itu, penulis mengharapkan saran dan kritik demi kesempurnaan skripsi ini.

Semoga skripsi ini bermanfaat bagi pembaca.

Malang, 15 Mei 2017

Muhamad Fathor Rosid

iv
 DAFTAR ISI

ABSTRAK .................................................................................................... i
KATA PENGANTAR .................................................................................. ii
DAFTAR ISI ................................................................................................. v
DAFTAR TABEL ......................................................................................... vii
DAFTAR GAMBAR .................................................................................... viii
DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................. ix

BAB I PENDAHULUAN
A. Latar Belakang ......................................................................... 1
B. Rumusan Masalah .................................................................... 4
C. Tujuan Masalah ........................................................................ 5
D. Kegunaan Penelitian ................................................................ 5
E. Ruang Lingkup dan Pembatasan Penelitian ............................. 6
F. Definisi Operasional ................................................................ 6

BAB II KAJIAN PUSTAKA

A. Kimia Komputasi ..................................................................... 8
1. Density Functional Theory (DFT) ....................................... 9
2. Perhitungan Energi Metode MP2 ........................................ 10
B. Mekanisme Reaksi Radikal...................................................... 11
C. Keadaan Transisi dan Energi Aktivasi ..................................... 13

BAB III METODE PENELITIAN

A. Rancangan Penelitian ............................................................... 15
B. Waktu dan Tempat Penelitian .................................................. 16
C. Peralatan Penelitian .................................................................. 16
1. Perangkat Lunak .................................................................. 16
2. Perangkat Keras ................................................................... 16
D. Prosedur Kerja ......................................................................... 17
1. Menggambar Struktur Reaktan dan Produk ........................ 17
2. Optimasi Geometri dan Perhitungan Frekuensi Vibrasi
Reaktan ................................................................................ 17
3. Optimasi Geometri dan Perhitungan Frekuensi Vibrasi
Produk.................................................................................. 17
4. Pencarian Struktur Keadaan Transisi dan Perhitungan
Frekuensi Vibrasinya ........................................................... 18
Perhitungan Energi Keadaan Transisi ................................. 19
Perhitungan dengan Intrinsic Reaction Coordinate (IRC) .. 19
E. Metode Analisis Data ............................................................... 20

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN

A. Menggambar Struktur Reaktan dan Produk ............................. 21
B. Optimasi Geometri dan Perhitungan Frekuensi Vibrasi
Reaktan .................................................................................... 23

v
 C. Optimasi Geometri dan Perhitungan Frekuensi Vibrasi
Produk. ..................................................................................... 27
D. Pencarian Struktur Keadaan Transisi dan perhitungan
frekuensi Vibrasinya ............................................................... 30
1. Abstraksi Hidrogen Rantai Samping ................................... 30
2. Abstraksi Hidrogen Cincin Aromatik .................................. 32
E. Energi Keadaan Transisi .......................................................... 35
F. Energi Aktivasi ........................................................................ 36

BAB V PENUTUP
A. Kesimpulan .............................................................................. 42
B. Saran ........................................................................................ 42

DAFTAR RUJUKAN ................................................................................. 44

LAMPIRAN-LAMPIRAN ......................................................................... 46
RIWAYAT HIDUP ..................................................................................... 52

vi
 DAFTAR TABEL

Tabel Halaman

4.1 Panjang Ikatan C-C pada Molekul Toluena .............................. 24

4.2 Interpretasi Gugus Fungsi pada Molekul Toluena .................... 26

4.3 Energi Molekul Toluena dan Radikal Nitrat ............................. 27

4.4 Energi Keadaan Transisi Metode DFT dan MP2 ...................... 35

4.5 Data Energi Aktivasi Metode DFT dan MP2 ............................ 36

vii
 DAFTAR GAMBAR

Gambar Halaman
1.1 Struktur senyawa toluena .......................................................... 1

2.1 Reaksi Radikal Nitrat dengan Toluena ...................................... 11

2.2 Stabilisasi Resonansi Radikal Hasil Reaksi Radikal NO3 dengan

Toluena (a) Abstraksi Hidrogen Pada Rantai Samping, (b) Abstraksi
Hidrogen Cincin Posisi Orto, (c) Abstraksi Hidrogen Cincin Posisi
Meta, dan (d) Abstraksi Hidrogen Cincin Posisi Para. .............. 12

2.3 Diagram Energi Potensial Versus Koordinat Reaksi................. 13

4.1 Reaksi Toluena dengan Radikal Nitrat Mengahasilkan Abstraksi

Hidrogen pada Toluena ............................................................. 21

4.2 Stuktur Toluena Teroptimasi ..................................................... 23

4.3 Spektrum IR Molekul Toluena Hasil Perhitungan dan

Eksperimen ................................................................................ 25

4.4 Stuktur Radikal Nitrat Teroptimasi ........................................... 26

4.5 Stuktur Produk Radikal Toluena Teroptimasi .......................... ` 29

4.6 Stuktur Transisi Posisi Rantai Samping Teroptimasi ................ 31

4.7 Stuktur Transisi Posisi Orto, Meta, dan Para Teroptimasi ........ 34

4.8 Kurva Energi Potensial Reaksi Abstraksi Hidrogen pada Toluena

dengan Radikal Nitrat ................................................................ 39

viii
 DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran Halaman

1. Diagram Alir Penelitian .......................................................... 46

2. Perhitungan Energi dalam Satuan Kkal/mol ........................... 48

3. Perhitungan Energi Aktivasi dalam Satuan Kkal/mol ............. 51

ix