Mekanisme yang tepat dari tindakan diet ketogenik masih belum sepenuhnya jelas.

Namun, studi
praklinis telah menyarankan mekanisme yang mungkin berikut sebagai perubahan dalam fungsi
mitokondria, efek tubuh keton dan asam lemak, dan stabilisasi glukosa. Tubuh keton mudah melewati
sawar darah otak, dan hanya sumber energi ke otak selama kelaparan.

Pergantian glukosa oleh keton di otak menghasilkan penurunan glikolisis dan peningkatan siklus krebs
untuk produksi energi. Badan keton menyebabkan sintesis asam am-aminobutyric (GABA), neuronal
membran hyperpolarization, penurunan pelepasan glutamat, meningkatkan norepinefrin dan
adenosin, aktivitas neuroprotektif dan antioksidan, menurunkan faktor pertumbuhan seperti insulin
1 (IGF-1) dan target mamalia rapamycin ( mTOR), dan meningkatkan sirtuins dan adenosine
monophosphate-activated protein kinase (AMPK) di otak.

GABA disintesis selama siklus krebs ketika glutamat diubah menjadi GABA oleh enzim glutamat
dekarboksilase. Penelitian telah menunjukkan bahwa betahydroxybutyrate (ketone body)
menghambat ekspresi GABA-transaminase sehingga meningkatkan GABA di otak. Tubuh keton
mengatur aktivitas enzim ini sehingga meningkatkan tingkat GABA di otak. Peningkatan tingkat GABA
menghasilkan stimulasi reseptor klorida dan ATP saluran kalium sensitif yang mengarah ke
hyperpolarisasi membran neuronal dan penghambatan saluran natrium dan kalsium yang
menyebabkan penurunan rangsangan. Penelitian telah menunjukkan ketone bodies (acetoacetate
lebih dari betahydroxybutyrate) mempengaruhi saluran VGLUT pada vesikel glutamat presinaptik
(melalui saluran klorida), sehingga menyebabkan penurunan pelepasan neurotransmiter glutamat
eksitatorik.

Badan keton juga menyebabkan perubahan tingkat amina biogenik seperti peningkatan nor-epinefrin
dan adenosin, dan penurunan dopamin dan serotonin. Peningkatan adenosine menyebabkan aktivasi
reseptor adenosin A1 yang mengakibatkan penurunan rangsangan otak. Badan keton memiliki peran
neuroprotektif dengan menyebabkan biogenesis mitokondria. Ini juga memiliki peran antioksidan
dengan meningkatkan protein uncoupling dalam rantai transpor elektron mitokondria sehingga
mengurangi spesies oksigen reaktif dan meningkatkan tingkat mitokondria mengurangi tingkat
glutathione sehingga melindungi tingkat mitokondria dari stres oksidatif. Peningkatan sirtuins
menyebabkan peningkatan jumlah dan ukuran mitokondria, dan juga menyebabkan penurunan
insulin seperti growth factor1. Peningkatan AMPK secara langsung berkaitan dengan produksi ATP.
Badan keton dengan menghambat jalur mTOR memiliki tindakan antikonvulsan. Sejak ketone bodies
metabolizing enzyme (yaitu, transporter asam monocarboxylic) ditemukan lebih banyak pada bayi dan
anak-anak, yang kemudian menurun dengan bertambahnya usia dan orang dewasa. Oleh karena itu
KD lebih efektif selama bayi dan masa kanak-kanak daripada di masa dewasa (2)