Setiap tubuh tumbuhan tersusun atas sel, pernyataan tersebut dikemukakan oleh…
a. Felix Dujrain
b. Schleiden
c. Theodore Schwan
d. Max Schultze
e. Johannes Purkinje
jawab : b.Schleiden
Untuk no 2,3,&4
2. Dari pernyataan teori sel di atas yang merupakan pendapat Johannes Purkinje adalah no…
a. 1
b. 2
c. 3
d.4
e.5
jawab : d. 4
3. Dari pernyataan teori sel di atas yang merupakan pendapat Rudlof Virchow adalah no…
a. 1
b. 2
c. 3
d.4
e.5
jawab : a. 1
4. 3. Dari pernyataan teori sel di atas yang merupakan pendapat Henri Dutrochet adalah no…
a. 1
b. 2
c. 3
d.4
e.5
jawab : b. 2
5. Gagasan awal tentang sel muncul pada abad ke XVII ketika seorang ahli memeriksa gabus di
bawah kaca pembesar, ahli tersebut adalah…
a. Henri Dutrochet
b. Rudlof Virchow
c. Robert Hooke
d. Johannes Purkinje
e. Felix Dujrain
Jawab : c. Robert Hooke
a. Lisosom
b. Retikulum Endoplasma
c. Sitoplasma
d. Nukleus
e. Mitokondria
Jawab : e. Mitokondria
7. Dinding primer pada sel tumbuhan secara kimia disusun oleh zat…
a. Kromoplas
b. asam amino
c. Selulosa
d. Glukosa
e. protein
Jawab : c. Selulosa
8. Organel sel yang berperan dalam sintesis dan transport berbagai macam subtansi zat kimia
adalah…
a.Protein
b. Asam amino
c. Sitosol
d. Retikulum Endoplasma
e. Mitokondria
a. lisosom
b. Nukleus
c. Retikulum Endoplasma
d. Sentriol
e, Vakuola
Jawab : b. Nukleus
a. O,C, dan H
b. O, C, dan Fe
c. O,C, dan Ge
d. O, C, dan Mg
e.O, C, dan Ag
Jawab : a. O,C,dan H
a. Nukleus
b. Lisosom
c. Mitokondria
d. Vakuola
e. Retikulum Endoplasma
Jawab : b. Lisosom
a. Regulasi
b. Konjugasi
c. Rekontruksi
d. Revolusi
e. Respirasi
Jawab : e. Respirasi
13. Leukopas yang berfungsi untuk membentuk dan menyimpan lemak adalah…
a. Amiloplas
b. Kloroplas
c. nukleoplasma
d. Elaioplas
e. Plastida
Jawab : d. Elaioplas
a. Membran plasma
b. Nukleoplasma
c. Retikulum Endoplasma
d. lisosom
e. Plastida
a. Respirasi
b. Reproduksi
c. Pembelahan Nukleus
d. Sintesis lemak
e. Sintesis Protein
a. Dinding sel
b. vakuola
c. Nukleus
d. Sitoplasma
e. Nukleoplasma
a. Ribosom
b. nukleus
c. Kloroplas
d. Plastida
e. membran plasma
Jawab : a. Ribosom
20. Organel terbanyak yang terdapat dalam sitoplasma sel tumbuhan adalah…
a. golgi kompleks
b. kloroplas
c. peroksisom
d. retikulum endoplasma
e. ribosom
Jawab : b. Kloroplas
a. badan golgi
b. Retikulum endoplasma
c. lisosom
d. Nukleus
e. Ribosom
Jawab : d. Nukleus
22. Bagian protoplasma yang berfungsi dalam memelihara stabilitas suhu adalah…
a. gula
b. air
c. lemak
d. karbohidrat
e. protein
Jawab : c. lemak
23. Apabila sel dimasukan kedalam suatu larutan yang hipertonis akan terjadi peristiwa plasmolisis,
yaitu…
d. mengecilnya ribosom
e. membelahnya sel
24. Di dalam protoplasma terdapat ion buffer, yaitu suatu ion yang berfungsi mengatur…
a. kesetimbangan pH
b. ekskresi
c. Respirasi
d. Reproduksi
e. Regulasi
Jawab : a. Kestimbangan pH
25. Bagian sel hewan monoseluler yang digunakan sebagai alat ekskresi adalah…
a. sitoplasma
b. membrane plasma
c. sentriol
d. vakuola kontraktil
e. ribosom
26. Masuknya garam-garam mineral dan air dari tanah ke dalam sel-sel akar merupakan suatu contoh
proses…
a. imbisisi
b. osmosis
c. difusi
d. adsorpsi
e. plasmolisis
Jawab : b. osmosis
1. Sentriol
2. Mikrotubuli
3. Ribosom
4. Lisosom
5. Fibril
6. Retikulum endoplasma
27. Dari pernyataan diatas organel yang tidak aktif dalam metabolism sel adalah…
a. 1,2,3
b. 1,3,2
c. 1,2,5
d. 3,4,5
e. 2,3,6
Jawab : b. 1,2,5
28. Dari pernyataan diatas organel yang aktif dalam metabolism sel adalah…
a. 1,2,3
b. 1,3,6
c. 1,2,5
d. 3,4,6
e. 2,3,5
Jawab : d.3,4,6
a. Henri Dutrochet
b. Rudlof Virchow
c. Christian De Duve
d. Robert Hooke
e. Johannes Purkinje
e. inti sel
e. inti sel
32. Perubahan bentuk energy yang berasal dari bahan makanan menjadi bentuk energy untuk
sintesis,transport aktif dll, adalah….
a. transformasi heterotrof
b. transformasi energy
c. transformasi udara
d. transformasi lisosom
e. transformasi karbohidrat
c. respirasi sel
d. sintesis protein
e. ikut serta dalam proses filtrasi bahan yang masuk dan keluar
Jawab : e. ikut serta dalam proses filtrasi bahan yang masuk dan keluar
a. kuning
b. merah
c. orange
d. biru
e. coklat
Jawab : a kuning
a. kuning
b. merah
c. orange
d. biru
e. coklat
Jawab : e. coklat
36. klorofil a akan menampilkan warna…
a. hijau kuning
b. hijau biru
c. hijau hijau
d. hijau merah
e. hijau coklat
b. menghancurkan amilum
d. menyimpan protein
a. lisosom
b. sentriol
c. reticulum endoplasma
d. mitokondria
e. DNA
Jawab : a . lisosom
a. mitokondria
b. badan golgi
c. ribosom
d. lisosom
e. reticulum endoplasma
40. Protoplasma adalah subtansi dasar kehidupan, berdasarkan pengertian itu maka komponen
penyusun protoplasma adalah …
b. menghancurkan amilum
c. sintesis lemak
a. kuning
b. merah
c. orange
d. biru
e. coklat
Jawab : b. merah
a. hijau kuning
b. hijau biru
c. hijau hijau
d. hijau merah
e. hijau coklat
a. hijau kuning
b. hijau biru
c. hijau hijau
d. hijau merah
e. hijau coklat
a. lipid
b. protein
c. karbohidrat
d. glikolipid
e. lipoprotein
Jawab : e. lipoprotein
47. Membran sel pada sel hewan mempunyai fungsi sebagai berikut, kecuali…
e. sebagai reseptor
a. membrane plasma
b. sentriol
c. nukleolus
d. ribosom
e. DNA
Jawab : c. nucleolus
a. matriks
b. dinding sel
c. nukleus
d. sitoplasma
e. membrane plasma
a. vakuola
b. sentriol
c. sitoplasma
d. lisosom
e. nukleoplasma
Jawab : a. vakuola
Like this:
Like
Lanjutan….
a. eksositosis
b. fagositosos
c. autolisis
d. endositosis
e. plasmolisis
Jawab : c. autolysis
a. protoplasma
b. sitosol
c. nukleus
d. nukleoplasma
e. sitoplasma
Jawab : b. sitosol
53. Transpor glukosa kedalam sel dapat berlangsung walaupun melawan…
a. arus
b. gradien konsentrasi
c. gravitasi
d. medan magnet
e. kesetimbangan
a. transport aktif
b. penghancuran sel
c. pembelahan sel
d. gerakan sel
e. difusi
a. ganggang
b. alga
c. bakteri
d. jamur
e. virus
Jawab : c. bakteri
a. penyerapan
b. transport aktif
c. endositosis
d. difusi
e. osmosis
Jawab : e. osmosis
a. katalase
b. lisozim
c. zimogen
d. lipase
e. asam amino
Jawab : a. katalase
58. Cadangan makanan pada sel hewan umumya disimpan dalam bentuk…
b. protein
59. Bagian membran sel yang berperan dalam transport aktif adalah…
a. lipid
b. protein
c. air
d. asam amino
e. lemak
Jawab : b.protein
a. transport aktif
b. osmosis
c. difusi
d. transport pasif
e. imbibisi
Jawab : c. difusi
Perhatikan Gambar !
61. Fungsi bagian no 9 adalah…
a. difusi
b. respirasi sel
c. osmosis
d. pembakaran
e. ekskresi
b. sintesis lemak
c. sekresi
d. sintesis protein
e. ekskresi
a. sintesis protein
b. sintesis lemak
c. proteksi
d. respirasi sel
e. pembelahan sel
c. respirasi sel
d. sintesis protein
a. proteksi
b. sintesis lemak
c. sekresi
d. sintesis protein
e. ekskresi
a. sitosol
b. sentriol
c. membran plasma
d.badan golgi
e. mitokondria
Jawab : b. sentriol
a. sitosol
b. sentriol
c. inti sel
d.badan golgi
e. mitokondria
a. sitosol
b. sentriol
c. inti sel
d.badan golgi
e. flagelum
Jawab : e. flagelum
a. sitosol
b. sentriol
c. membran plasma
d.badan golgi
e. mitokondria
a. sitosol
b. sentriol
c. membran plasma
a. 8
b. 9
c. 1
d. 2
e. 13
Jawab : a. 9
71. yang berfungsi untuk mengatur seluruh kegiatan tubuh ialah bagian no…
a. 8
b. 9
c. 1
d. 2
e. 13
Jawab : c. 1
72. Organel yang berfungsi untuk pembelahan sel ialah bagian no…
a. 8
b. 9
c. 1
d. 2
e. 13
Jawab : e.13
73. Organel yang berfungsi senagai sintesis lemak ialah bagian no…
a. 8
b. 9
c. 1
d. 2
e. 13
Jawab : a. 8
74. Organel yang berfungsi untuk sintesis protein ialah bagian no…
a. 6
b. 9
c. 7
d. 4
e. 3
Jawab : e. 3
75. Organel yang berperan untuk membentuk lisosom ialah bagian no…
a. 6
b. 9
c. 7
d. 4
e. 3
Jawab : a. 6
76. Organel bulat kecil terdapat melekat di RE, dalam organel lain, dan tresebar di sitoplasma. Fungsi
organel tersebut adalah…
a. respirasi
b. sintesis lemak
c. proteksi
d. sintesis protein
e. sekresi
a. lisosom
b. flagellum
c. mitokondria
d. vakuola
e. badan golgi
Jawab : c mitokondria
78. Bentuk sel hewan relative berubah karena sel hewan tidak mempunyai…
a. membrane sel
b. lisosom
c. plastida
d. flagellum
e. dinding sel
79. Dalam tubuh manusia terdapat sel yang tidak mempunyai nucleus yaitu…
a. leukosit
b. eritrosit
c. neuron
d. trombosit
e. sel otot
Jawab : b eritrosit
80. Vakuola sel tumbuhan hidup kadang-kadang mengandung enzim hidrolitik sehingga dapat
berperan seperti..
a. sentriol
b. dinding sel
c. lisosom
d. sel otot
e. tulang
Jawab : c. lisosom
1. Dinding sel
2. Flagellum
3.Membrane sel
4. Inti sel
5. Plastida
6.Vakuola kontraktil
7.Klorofil
8. Lisosom
9. Ribosom
81. Dari pernyataan di atas yang ada pada sel hewan dan sel tumbuhan ialah…
a. 2 dan 6
b. 1 dan 5
c. 3 dan 5
d. 4 dan 1
e. 4 dan 9
Jawab : e. 4 dan 9
82. pernyataan di atas yang ada pada sel hewan saja ialah…
a. 2 dan 6
b. 1 dan 5
c. 3 dan 5
d. 4 dan 1
e. 4 dan 9
Jawab : a. 2 dan 6
83. . Dari pernyataan di atas yang ada pada sel tumbuhan saja ialah…
a. 2 dan 6
b. 1 dan 5
c. 3 dan 5
d. 4 dan 1
e. 4 dan 9
Jawab : b. 1 dan 5
84. DNA merupakan materi pembawa sifat menurun dapat ditemukan di bagian sel berikut kecuali…
a. nucleus
b. kloroplas
c. mitokondria
d. membran sel
e. sentriol
85. Organel sel ribosom dapat di temukan di bagian sel berikut, kecuali…
a. nucleus
b. kloroplas
c. mitokondria
e. sentriol
Jawab : a nucleus
c. hewan spons
d. cacing
87. pigmen dalam bentuk larutan dan zat lain dlam bentu emulasi disimpan dalam…
a. plastid
b. plastisida
c. sentriol
d. darah
e. kromoplas
Jawab : e . Kromoplas
a. Gerak Brown
b. Gerak dipercepat
c. GLBB
d. Gravitasi
a. RNA
b. DNA
c. ARN
d. asam
e. basa
Jawab : c. ARN
c. pecahnya sel
Jawab : e. lepasnya selaput plasma atau membran sel dari dinding sel
d. reproduksi sel
d. reproduksi sel
93. “Spermatazoa dan ovum merupakan unsure histologis, yang merupakan asal dari makhluk hidup
baru” teori tersebut di ungkapkan oleh…
a. Fleming
b. Albert Kolliker
c. Waldeyer
d. Overton
e. Hertwing
a. Fleming
b. Albert Kolliker
c. Waldeyer
d. Overton
e. Hertwing
Jawab : d. Overton
c. pencampuran zat
d. difusi
e. osmosis
c. pencampuran zat
d. difusi
e. osmosis
a. nukleoplasma
b. karioteka
c. membrane plasma
d. sitosol
e. kromatin
Jawab : e. kromatin
a. nukleoplasma
b. kompleks golgi
c. mitokondria
d. ribosom
e. lisosom
Jawab : a. nukleoplasma
99. Kalau kita mengamati sel-sel gabus tutup botol di bawah mikroskop dengan pembesaran 10 x 10
maka akan tampak…
c. sel sel dengan dinding yang telah menebal dan isinya kosong
d. hanya cairan
e. tidak terlihat
Jawab : c. sel sel dengan dinding yang telah menebal dan isinya kosong
a. hijau
b. kuning
c. ungu
d. biru
e. merah
Jawab : b. kuning
Like this:
Like
Be the first to like this.
This entry wa
Lisosom adalah organel pencerna pada sel hewan dan di temukan disemua sel eukariotik. Lisosom berasal
dari kata lyso = pencernaan dan soma = tubuh. Diamater lisosom kira-kira 25-50nm - 1μm. Lisosom memiliki
keanekaragaman morfologi. Berbentuk agak bulat dan dikelilingi oleh membran tunggal bilayer yang digunakan
untuk mencerna makromolekul. Yang khas dari lisosom adalah terdiri atas sekitar 50 enzim hidrolitik yang berbeda
yang dihasilkan di dalam RE kasar. Enzim ini disebut dengan lisozom. Enzim-enzim ini dapat menghidrolisis semua
bentuk makromolekul antara lain polisakarida, lipid, fosfolipid, asam nukleat, dan protein. Enzim hidrolisis tersebut
bekerja optimum pada pH asam (sekitar 4,6). Kondisi asam ini dihasilkan dari pompa proton di membran
organel. Lisosom dapat mempertahankan kondisi asam ini dengan cara membran lisosom memompa ion hidrogen
dengan menghunakan bantuan ATP dari sitosol ke dalam lumen lisosom. Proses masuknya ion hidrogen ini karena
membran lisosom mengandung protein integral yang kandungan glikosilatnya tinggi dan terdapat garis pelindung
dari karbohidrat yang mampu melindungi membran dari kerusakan.
Enzim Substrat
Phosphatase :
Acid phosphatase Phosphomonoesterus
Nucleases :
Proteases :
Cathepsin Protein
Collagenase Collagen
GAG-hydrolizing enzymes :
Polysaccharidases dan
Oligosaccharidases:
Glycogen
α-glucosidase
Fucosyloligosaccharides
Fucosidase
Mannosyloligossacharides
α-manosidase
Sialyloligosaccharides
Sialidase
Sphingolipid hydrolyzing
enzymes :
Ceramide
Ceramidase
Glucosylceramide
Glucocerebosidase
GM2ganglioside
β-Hexosaminidase
Galactosylsulfatide
Arylsulfatase
Lipid hidrolysing enzimes :
Phospholipase Phospholipids
Lisosom berfungsi untuk merusak/menghancurkan materi yang masuk ke dari luar sel, menghancurkan
patogen mencerna makanan, daur ulang organel yang rusak, dan berperan dalam perkembangan embrio pada hewan.
Beberapa organisme uniseluler mencerna partikel makanan yang kemudian dibongkar secara enzimatis di dalam
lisosom, dan nutrisi hasil pencernaan akan dilepaskan ke dalam sitosol. Pada sel fagositik mamalia, seperti makrofag
dan neutrofil, berfungsi untuk mencerna mikroorganisme berbahaya. Pencernaan bakteri atau mikroorganisme
tersebut diaktifkan pada pH rendah dari lisosom dan kemudian dicerna secara enzimatik.
Lisosom juga mempunyai peran dalam pergantian organel, yang mengatur perusakan serta penempatan
organel sel itu sendiri, disebut autofagi. Selama proses ini berlangsung, sebuah organel seperti mitokondria akan
diselubungi oleh membran ganda yang merupakan derivat dari sisterna RE. membran RE kemudian bergabung
degan lisosom untuk membentuk autofagolisosom.
Ketika proses autofagolisosom selesai, organel yang dicerna dikeluarkan sebagairesidual body. Berdasarkan
tipe dari sel yang bersangkutan, isi dari residual body dikeluarkan dari dalam sel secara eksositosis atau disimpan di
dalam sitoplasma disebut lipofuscin granulLipofuscin granule akan meningkat jumlahnya seiring penambahan umur
sel.
Biosintesis Lisosom
Enzim lisosom adalah suatu proses yang diproduksi oleh ribosom dan kemudian masuk ke RE. Dari RE,
enzim dimasukan ke dalam membran, kemudian di keluarkan ke sitoplasma menjadi lisosom. Selain itu, ada pula
enzim yang dimasukan terlebih dahulu ke Golgi, Oleh golgi, enzim ini dibungkus membran, kemudian dilepaskan di
dalam sitoplasma. Jadi, proses pembentukan lisosom ada dua macam pertama dibentuk secara langsung oleh RE,
dan kedua oleh Golgi.
Fungsi Lisosom
1. Mencerna materi yang diambil secara fagositosis. Misalnya pada sel-sel leukosit dan sel-sel makrofag.
2. Autofagi adalah proses penyingkiran struktur yang tidak digunakan lagi. Misalnya organel- organel yang tidak digunakan.
3. Autolisis adalah penghancuran diri sel dengan cara membebaskan semuaenzim dalam lisosom. Misalnya berudu yang
menghancurkan ekornya.
4. Eksositosis adalah pembebasan enzim keluar sel. Misalnya pada proses perubahan tulang rawan menjadi tulang keras.
Endositosis
Endositosis dapat dibedakan ke dalam 2 kategori : Bulk-phases endocytosis (dikenal juga sebagai
pinositosis) dan Receptor-mediated endocytosis.
a. Bulk-phases endocytosis adalah pengambilan cairan dari bagian ekstraselular untuk dibawa ke bagian
dalam sel. Bulk-phases endosistosis juga dapat digunakan untuk memindahkan bagian dari membran
plasma ke organel lain yang membutuhkan dan mengembalikan kembali bagian tersebut ke membran
plasma.
b. Receptor-mediated endocytosis adalah pengambilan makromolekul (ligand) yang spesifik dari bagian
luar. Makromolekul ini akan terikat pada reseptor yang terletak pada bagian luar membran plasma.
Molekul yang diambil menuju sel dengan cara endositosis berjalan melewati endocytic pathway. Ada dua
tipe reseptor yang berperan dalam endositosis. Reseptor tersebut terletak pada bagian luar membran plasma.
Reseptor pertama adalah “Houskeeping receptors”, yang bertanggung jawab dalam pengambilan materi yang akan
digunakan oleh sel. Reseptor yang kedua adalah “Signaling receptors”, yang bertanggung jawab dalam pengikatan
ligan di bagian ekstraseluler yang membawa pesan untuk mengubah aktivitas di dalam sel. Molekul yang ditangkap
oleh reseptor di membran plasma ditransportasikan ke endosom. Endosom berperan sebagai pusat pendistribusian
selama endositosis berlangsung. Cairan yang terdapat di dalam endosom di jaga keasamannya dengan adanya sebuah
H+-ATPase di membran endosom. Endosom dapat dibagi menjadi dua, yaitu early endosom yang terletak di daerah
sekitar dalam sel, dan yang kedua adalah late endosom yang tereletak lebih dekat ke bagian nukleus. Early endosom
dan late endosom dapat dibedakan dari berat jenisnya, pH dan komposisi protein.
Mekanisme endositosis :
Gambar Endositosis
Dari gambar tersebut kita dapat melihat pergerakan materi dari bagian ekstraseluler menuju ke
bagian late endosom. Pada plasma membran terdapat dua jenis reseptor yaitu houskeeping receptor
dan signaling receptor. Houskeeping reseptor adalah tipe reseptor yang akan kembali lagi ke plasma
membran apabila ligannya telah ditransfer ke dalam late endosom. Sedangkan signaling reseptor adalah
tipe reseptor yang ditransfer ke dalam late endosom bersama ligannya. Late endosom juga menerima
enzim lisosom yang baru saja disintesis dari bagian trans Golgi network. Enzim ini dibawa oleh manosa-
6-fospat (M6P). M6P akan kembali lagi ke TGN apabila enzim lisosom telah dimasukkan ke dalam late
endosom. Materi yang sudah ada di dalam late endosom akan dicerna oleh enzim lisosom.
Autofagi
Autofagi adalah suatu cara pendegradasian terhadap organel sel yang sudah tidak dapat berfungsi
dengan baik yang dilakukan oleh lisosom tanpa kehilangan bahan kimia penyusunnya yang digunakan
lagi oleh sel. Sebagai contoh dalam sel hati, mitokondria rata-rata berumur 10 hari. Mitokondria yang
telah berumur 10 hari dan tidak berfungsi dilingkupi oleh sebuah organel yang berasal dari membran
retikulum endoplasma membentuk autofagosom. Kemudian autofagosom bergabung dengan lisosom
agar mitokondria dapat dihancurkan oleh enzim hidrolitik.
Fagositosis
Gambar Fagositosis
Fagositosis dilakukan oleh beberapa tipe sel yang telah mengalami spesialisasi untuk
mendegradasi partikel besar ( diameter > 0,5 μm) atau mikroorganisme dari lingkungan. Kebanyakan
protista seperti amoeba dan siliata memenuhi kebutuhan makanan mereka dengan cara menangkap
partikel makanan atau organisme yang lebih kecil. Partikel makanan yang ditangkap dimasukkan ke
dalam organel yang disebut vakuola atau fagosom. Vakuola atau fagosom ini berasal dari sebagian kecil
(cubitan ke arah dalam) membran plasma. Fagosom akan bergabung dengan lisosom, sehingga pertikel
makanan yang ditangkap dicerna di dalam fagolisosom.
DAFTAR PUSTAKA
Karp, Gerald. 2004. Cell and Moleculer Biology. USA : Von Hoffmann press.
Murray, RK, Dk Granner, PA Mayes, VM Rodwell. 2003. Harper’s Illustrated Biochemistry. 26th edition.
Amerika utara : The McGraw-Hill Company .
Nelson, DL dan MM Cox. 2005. Principles of Biochemistry. 4th edition. W.H. Freeman and Company.
Suryani, Yoni. 2004. Bilogi Sel dan Molekuler. Yogyakarta : FMIPA UNY.
Lisosom
Lisosom merupakan vesikel membrane berkantung yang mengandung enzim-enzim hidrolitik yang
bekerja pada kondisi asam.lisosom terbentuk dari pertunasan vesikel badan golgi. Lisosom berfungsi
untuk mencerna makromolekuler secara intra seluler dan merusak sel-sel asing
Lisosom memiliki berbagai macam enzim seperti nuclease, protease, lipase, fosfatase yang berfungsi
untuk menghodrolisis materi asing .
Peroksisom
Bentuknya seperti lisosom berisi enzim oksidatif dan katelase. Katalase mengkatalisis perombakan
hydrogen peroksida (H2O2). Hydrogen peroksida merupakan produk metabolisme sel yang berpotensi
membahayakan sel. Peroksisom ini ada pada sel hewan (hati dan ginjal) ataupan tumbuhan (berbagai
tipe sel).
Sel adalah blok-blok pembangun (building bloks) hidup bagi tubuh. Seperti tubuh keseluruhan yang
tertata dengan rapi, demikian juga bagian dalam sel. Sel yang menyusun tubuh manusia berukuran sangat
kecil sehingga tidak dapat dilihat dengan mata telanjang.
1. 1. Membrane sel
Suatu struktur membranosa yang sangat tipis yang membungkus setiap sel, memisahkan isi sel dari
sekitarnya.
Fungsi membrane sel
membran plasma bersifat selektif permeabel artinya ada zat-zat tertentu yang dapat melewati
membrane dan ada pula yang tidak. Molekul-molekul tersebut berguna untuk mempertahankan
kehidupan sel
reseptor rangsangan dari luar sel, rangsangan itu berupa zat-zat kimia seperti
1. Membran berupa struktur yang membatasi sel, terdiri atas lipid yang mengandung gugus polar dan
2. Gugus polar mengarah ke bagian luar dari bilayer, sedangkan gugus hidrofob (rantai asam lemak)
berada di bagian tengah dari lipid bilayer.
Davson & Danielli (1954)
Membran merupakan struktur lipid bilayer yang disisipi dengan protein globular yang melintasi membran
dan terdapat pula protein di permukaan luar dan dalam membran.
Dalam konsep mozaik cair, matriks membrane terdiri atas dua lapisan lipida protein globular yang tidak
berkesinambungan dan saling menyesuaikan menurut susunan yang teratur atau tidak teratur. Gugusan
polarnya terletak pada permukaan membrane yang kontak dengan cairan intra atau ekstraseluler,
sedangkan gugusan nonpolarnya menghadap ke arah dalam. Pori-pori yang tampak pada sumbu utama
protein globuler tebalnya ± 85 A.
Model “mozaik cair” konsisten tentang aksistensi dari chanel ion khusus dan reseptor-reseptor di dalam
dan di sepanjang membrane-membran permukaan.
Semua membrane plasma terutama terdiri dari lipid (lemak) dan protein ditambah sedikit karbohidrat.
Lipid membrane plasma yang terbanyak adalah fosfolipid dengan sejumlah kecil kolesterol.
Fosfolipid. Memiliki ujung kepala polar (bermuatan listrik) yang mengandung sebuah gugus fosfat
bermuatan negative dan dua ekor asam lemak nonpolar (netral). Ujung polar bersifat hidrofilik (“menyukai
air”) karena dapat berinteraksi dengan molekul air yang juga polar. Ujung nonpolar bersifat hidrofobik
(“takut air”) dan tidak akan bercampur dengan air. Rangkaian molekul dua-sisi semacam ini kemudian
menyusun diri membentuk lapis-ganda (lipid bilayer).
CIS dan CES. Zat-zat larut air tidak dapat larut dan menembus lapisan ganda lemak.
3. Menentukan sifat cair (fluiditas) membran.
Yang berperan menimbulkan sifat cair serta stabilitas membrane adalahkolesterol. Dengan berada di
antara molekul-molekul fosfolipid, molekul kolesterol mencegah rantai-rantai asam lemak menyatu dan
Kristal, suatu proses yang akan secara drastic menurunkan tingkat kecairan (fluiditas) membrane. Sifat
cair tersebut memungkinkan membrane fleksibel sehingga sel dapat mengubah bentuknya.
Protein-protein membran. Protein membran melekat atau terselip di antara lipid lapis-ganda. Sebagian
dari protein ini, memiliki bagian polar dikedua ujungnya yang berkaitan dengan bagian sentral nonpolar,
dengan menjulur ke seluruh ketebalan membran. Protein lain hanya menempel dipermukaan luar dan
dalam. Protein-protein ini tertambat oleh interaksi dengan suatu protein yang menembus membran atau
oleh perlekatan ke lipid lapis-ganda.
1. A. Protein Integral membentuk mayoritas protein membran. Molekul ini menembus dan tertanam
1. Protein transmembran menyebar keseluruh lapisan ganda dan membentuk saluran (pori-
menembus lipid-lapis ganda. Keberadaan protein-protein tersebut memungkinkan zat-zat larut air
yang cukup kecil memasuki saluran, misalnya ion, melewati membran tanpa harus berkontak
langsung dengan interior lemak yang hidrofobik. Saluran-saluran ini sangat selektif. Diameternya
lebih besar dari 0,8 nm, saluran tersebut juga dapat secara selektif menarik atau menolak ion-ion
tertentu. Sebagai contoh, Saluran Natrium (Na+) dan Saluran Kalium (K+) masing-masing hanya
Protein lain berfungsi sebagai molekul pembawa (carrier molecule) yang menyangkut zat-zat yang
tidak mampu menembus membran dengan sendirinya. Dengan demikian, saluran dan molekul
pembawa, keduanya penting dalam transportasi zat-zat antara CES dan CIS. Setiap pembawa hanya
dapat mengengkut molekul tertentu atau molekul-molekul yang berhubungan erat. Jenis-jenis
pembawa yang bervariasi pada sel-sel yang berbeda secara selektif diangkut melalui membran sel
tersebut. Sebagai contoh, kelenjar tiroid memerlukan yodium untuk sintesis hormone tiroid.
Dengan demikian, membran plasma kelenjar tiroid memiliki molekul pembawa yang khas untuk
yodium, sebagai unsure yang esensial ini dapat diangkut dari darah ke dalam kelenjar tiroid, suatu
Banyak protein di permukaan luar berfungsi sebagai tempat reseptor(receptor site) yang mengenali
dan berikatan dengan molekul-molekul spesifik di lingkungan sekitar sel. Pengikatan ini
mencetuskan serangkaian kejadian di membran dan di dalam sel yang mengubah aktivitas sel
tertentu. Dengan cara ini, zat-zat perantara kimiawi di dalam darah, misalnya hormone, hanya
mampu mempengaruhi sel-sel spesifik yang memiliki reseptor untuk zat tersebut dan tidak
menimbulkan efek pada sel-sel lain, walaupun setiap sel terpajan oleh zat perantara yang sama
melalui penyebarannya yang luas di dalam darah. Sebagai contoh, kelenjar hipofisis anterior
mengeluarkan TSH ke dalam darah. TSH hanya dapat melekat pada permukaan sel kelenjar tiroid
Kelompok protein lain berfungsi sebagai enzim yang terikat ke membran yang mengontrol reaksi-
reaksi kimia tertentu di permukaan dalam atau luar sel. Sel-sel memperlihatkan kekhususan pada
jenis enzim yang terbenam di dalam membran plasmanya. Sebagai contoh, lapisan luar membran
plasma sel-sel otot rangka mengandung suatu enzim yang dapat menghancurkan zat perantara
Sebagian protein tersusun dalam suatu jalinan filamentosa di permukaan bagian dalam membran
membran ini tampak secara struktural berperan yang penting dalam mempertahankan bentuk sel
serta mungkin ikut serta dalam perubahan-perubahan di permukaan yang terjadi saat sel bergerak.
Protein lain berfungsi sebagai molekul adhesi sel (cell adhesion molecule, CAM). Molekul-molekul
ini menonjol ke luar dari permukaan membran dan membentuk lengkung-lengkung atau anggota
badan (apendiks) lain yang digunakan oleh sel untuk saling berpegangan dan untuk melekat ke
serat-serat jaringan ikat yang menjalin antara sel-sel. Dengan demikian, molekul-molekul inii
Protein lain, khususnya bersama dengan karbohidrat, penting untuk kemampuan sel mengenali
“diri” (self, yaitu sel dari jenis yang sama) dan dalam interaksi sel ke sel.
1. B. Protein perifer, terikat longgar pada permukaan membran dan dapat dengan mudah terlepas dari
membran tersebut. Fungsinya, tidak begitu diketahui seperti fungsi protein integral. Protein ini
kemungkinan terlibat dalam struktur pendukung dan perubahan bentuk membran saat pembelahan
atau pergerakan sel.
Karbohidrat Membran. Berkaitan dengan molekul lipid atau protein. Glikolipid dan glikoprotein yang
dihasilkan dapat memberikan sisi pengenal permukaan untuk interaksi antar sel, seperti mempertahankan
sel-sel darah merah agar tetap terpisah atau memungkinkan penggabungan sel-sel yang sama untuk
membentuk sebuah jaringan. Karbohidrat membran berperan dalam pengenalan sel, kemampuan sel
untuk membedakan sel yang satu dengan sel lainnya.
1. 2. Nucleus (inti)
Struktur :
DNA dan protein khusus yang dibungkus oleh sebuah membran berlapis ganda.
Fungsi :
menyediakan kode-kode untuk mensintesis protein structural dan enzimatik yang menentukan sifat
spesifik sel,
untuk replikasi sel
3. Sitoplasma
Bagian interior sel yang tidak ditempati oleh nucleus. Sitoplasma mengandung sejumlah struktur
tersendiri, yang sangat terorganisasi. Komponen dalam sitoplasma meliputi :
mengambil energy dari zat-zat gizi dalam makanan dan mengubahnya menjadi suatu bentuk yang dapat
digunakan untuk menjalankan aktivitas sel.
Struktur
Tampak seperti batang atau filament yang bergerak dengan konstan dalam sebuah sel hidup.
Terdiri dari membran terluar halus dan membran terdalam yang mempunyai lipatan yang disebut
Krista.
Ruang antar Krista dipenuhi matriks, yang berisi protein, DNA, RNA, dan ribosom
Fungsinya :
Pembangkit tenaga sel karena fungsi terpentingnya adalah memproduksi energy dalam bentuk ATP
Energy yang dihasilkan dari penguraian nutrient seperti glukosa, asam amino, dan asam lemak.
Enzim yang dibutuhkan untuk melepas energy secara kimia, terlokalisasi dalam matriks
mitokondria dan partikel kecil pada krista.
Ribosom
Struktur
Granula kecil berwarna hitam (diameter 25 nm), yang tersusun dari RNA ribosomal dan hamper 80
jenis protein
Ribosom ditemukan sebagai granula individual atau dalam kelompok disebut poliribosom
Bisa bebas dalam sitoplasma (ribosom bebas) atau melekat pada membran reticulum endoplasma.
Fungsi
Struktur
Jaringan membranosa yang luas dan kontinu, terdiri dari tubulus berisi cairan dan kantung gepeng,
Fungsi
RE merupakan tempat utama sintesis produk sel dan juga berperan dalam transport dan
penyimpanannya.
RE kasar menonjol dalam sel, terlibat dalam sintesis dan pelepasan berbagai protein baru ke dalam
lumen RE. Dinding membranosa juga mengandung enzim-enzim yang penting untuk sintesis
RE halus banyak ditemukan di sel-sel yang mengkhususkan diri dalam metabolism lipid, misalnya
pada sel hati RE halus, mengandung enzim yang berperan dalam detoksifikasi berbagai bahan
berbahaya yang diproduksi di dalam tubuh sebagai hasil metabolism atau bahan-bahan yang
masuk ke dalam tubuh dari luar dalam bentuk obat atau senyawa asing.
Pada sel otot, dikenal sebagai reticulum sarkoplasma yang menyimpan kalsium dan berperan
penting dalam proses kontraksi otot.
Kompleks golgi berhubungan erat dengan RE. terdiri dari kantung gepeng, sedikit melengkung, dan
bagian lapisan tengah tetapi tepinya mengembang. Jumlah lapisan Golgi bervariasi, bergantung pada jenis
sel. Sebagian sel hanya memiliki satu tumpukan, sedangkan sel-sel yang mengkhususkan diri
mengsekresikan protein memiliki ratusan tumpukan.
Sebagian besar molekul yang baru disintesis yang baru saja menonjol dari RE halus masuk ke tumpukan
Golgi. Sewaktu sebuah vesikel transportasi yang mengangkut kargo yang baru disintesis mencapai
tumpukan Golgi, membran vesikel tersebut akan menyatu dengan membran kantung yang berada paling
dekat dengan pusat sel. Membran vesikel membuka dan menjadi bagian dari membran Golgi, sedangkan
isi vesikel dibebaskan ke bagian dalam kantung.
Bahan-bahan mentah yang baru disintesis ini bergerak bergerak dari RE melalui pembentukan vesikel
menelusuri lapisan-lapisan tumpukan Golgi, tempat berlangsungnya dua fungsi yang saling berkaitan :
1. Pengolahan bahan mentah menjadi produk akhir. Di dalam kompleks Golgi, protein “kasar” dari RE
dimodifikasi menjadi bentuk akhirnya, sebagian besar melalui penyesuaian-penyesuaian pada gula
yang melekat ke protein. Jalur-jalur biokimiawi yang dilalui oleh protein selama proses
perjalanannya menelusuri kompleks Golgi adalah jalur yang terperinci, kompleks, telah diprogram
2. Menyortir dan mengarahkan produk akhir ke tujuan sebenarnya. Kompleks Golgi bertanggung
jawab untuk menyortir dan memisahkan berbagai jenis produk sesuai dengan fungsi dan tujuannya
yaitu molekul-molekul yang diarahkan untuk disekresikan ke bagian luar, molekul-molekul yang
akan menjadi bagian dari membran plasma, dan molekul-molekul yang akan bergabung ke dalam
organel lain.
Cara yang digunakan oleh kompleks Golgi untuk mengarahkan lalu lintas molekul ini bersifat kompleks
dan masih belum sepenuhnya dipahami. Walaupun demikian, telah diketahui bahwa produk-produk yang
diarahkan untuk transportasi intrasel dikemas secara berbeda dari produk-produk yang akan dikeluarkan
dari sel. Produk-produk yang ditujukan ke bagian intrasel lainnya dikemas dalam vesikel
berselubung, sedangkan yang akan disekresikan dikemas dalam vesikel sekretonik.
1. Bahan ekstrasel yang akan dihancurkan oleh enzim-enzim lisosom dibawa ke bagian dalam sel
2. Sebagian kecil sel, terutama sel darah putih, melakukan bentuk khusus endositosis yang
disebut fagositosis.
3. Enzim-enzim hidrolitik umumnya menguraikan bahan yang ditelan menjadi produk-produk seperti
asam amino, glukosa, dan asam lemak yang dapat digunakan oleh sel. Produk-produk berukuran
kecil ini siap menembus membran lisosom untuk masuk ke dalam sitoplasma untuk digunakan
kemudian.
4. Biasanya bahan-bahan yang tidak tercerna yang tertinggal di dalam badan residual akhirnya
5. Lisosom juga dapat bergabung dengan organel-organel yang sudah tua atau rusak untuk
6. Lisosom akan pecah dan melepaskan enzim-enzim destruktifnya ke dalam sitosol, sehingga sel
7. Pada keadaan tertentu, lisosom menyebabkan penghancuran diri sel sel sehat secara sengaja.
9. Mekanisme yang mengontrol aktivitas lisosom dalam keadaan-keadaan tersebut belum diketahui.
10. Peroksisom (menyimpan enzim oksidatif yang mendetoksifikasi berbagai zat sisa)
merupakan kantung yang mengandung enzim-enzim. Namun tidak seperti lisosom, yang mengandung
enzim-enzim hidrolitik, peroksisom menyimpan beberapa enzim oksidatif kuat dan mengandung
sebagian besar katalase sel. Enzim oksidatif, seperti yang disyaratkan namanya, menggunakan oksigen
(o2), dalam hal ini untuk mempreteli hydrogen pada molekul-molekul tertentu. Reaksi seperti ini penting
untuk mendetoksifikasi berbagai zat sisa yang dihasilkan di dalam sel atau senyawa asing yangmasuk ke
dalam sel. Misalnya etanol yang terdapat dalam minuman beralkohol. Produk utama yang dihasilkan di
peroksisom adalah hydrogen peroksida (H2O2), yang dibentuk dari oksigen molekuler dan atom hydrogen
yang berasal dari zat-zat sisa.
Hydrogen peroksida, suatu oksigen kuat, memiliki potensi merusak apabila dibiarkan tertimbun atau
keluar dari bungkus peroksisomnya. Walaupun demikian, peroksisom juga mengandung banyak katalase,
suatu enzim antioksidan yang menguraikan H2O2 yang poten menjadi H2O dan O2 yang tidak berbahaya.
Reaksi yang terakhir ini merupakan mekanisme pengaman yang penting untuk menghancurkan peroksida
yang dapat mematikan di tempat pembentuknya, sehingga mencegah kemungkinan lolosnya senyawa itu
ke dalam sitosol.
TRANSPORT MOLEKUL MELALUI MEMBRAN
Prinsip dasar : pemeliharaan kehidupan sel bergantung pada kesinambungan gerakan materi ke dalam
dan keluar sel. Nutrisi harus masuk, sampah harus keluar, dan ion-ion harus digerakkan ke dua arah
tersebut. Pergerakan menembus membran plasma terjadi melalui mekanisme transport aktif dan transport
pasif.
1. Pasif = difusi
DIFUSI,
Persyaratan yang harus dimiliki oleh suatu senyawa non elektrolit agar dapat berdifusi secara pasif
melalui membrane:
1. Konsentrasi senyawa pada satu sisi lebih besar dari sisi lain
2. Membran harus permiabel terhadap substansi tersebut
Senyawa tersebut dapat melewati membrane
Ukuran partikel
Molekul ion bergerak lebih cepat dari pada ion-ion terlarut atau senyawa polar
Membran sel memiliki ion chanel terbuka atau tertutup melaui 2 cara :
1. Voltage-gated channels, tergantung pada perbedaan muatan ion pada kedua sisi membrane,
2. Ligan-gated channels, terjadi perubhan konformasi molekul dengan adanya molekul yang terikat
pada channel ini, contoh : asetilkolin
Difusi terfasilitasi
Senyawa berikatan dulu dengan protein carrier atau protein integral membrane.
TRANSPORT AKTIF
Membutuhkan energy
Uniport, pergerakan ion tunggal dalam satu arah, misalnyaprotein pengikat kalsium terdapat dalam
membrane plasma dan RE pada sel-sel yang aktif mentransport ion Ca2+ dari daerah konsentrasi tinggi
baik dari dalam maupun luar RE
Symport, pergerakan 2 jenis ion dalam arah yang sama. Misalnya, pengambilan asam amino dari usus
halus dari sel-sel yang membatasinya memerlukan pengikatan ion Na+ dan asam amino secara bersamaan
ke protein transporter yang sama.
Antiports, pergerakan dua ion pada arah yang berlawanan. Satu ke luar dan yang lain ke dalam sel.
Misalnya, banyak sel yang memiliki pompa Na-K yang menggerakkan Na+ ke luar sel dan K+ke dalam sel.
Symport dan antiport dikenal sebaggai transporter berpasangan, karena kedua tipe ini menggerakkan ion
pada saat yang bersamaan
Transport aktif primer memerlukan partisipasi langsung molekul ATP yang kaya energi.
Pada transport aktif primer energi digunakan untuk memindahkan ion melawan gradient konsentrasi.
Untuk setiap molekul ATP yang digunakan, dua ion K+ dipompa ke dalam sel dan tiga ion Na+ dipompa
ke luar sel.
Transport aktif sekunder tidak menggunakan ATP secara langsung, energi disediakan oleh gradien
konsentrasi ionyang dihasilkan dari transport aktif primer
Pada transport aktif sekunder, konsentrasi Na+ yang dimantapkan oleh transport aktif primer
menggerakkan transport aktif sekunder dari glukosa, Perpindahan glukosa melintasi membran melawan
gradient konsentrasi dibantu oleh protein simport untuk pergerakan ion Na+ ke dalam sel.
Transport makromolekul
Perpindahan makromolekul dari dalam/ke luar sel dapat terjadi dengan cara :
Eksositosis
Konstitutif : suatu materi ditransport dalam vesikula sekretori dan dikeluarkan ke tempat tujuannya
dengan bantuan peptide sinyal yang terdapat pada protein yang ditranspor
Regulatif : materi disekresikan dan disimpan dalam suatu vesikula dan baru dikeluarkan jika ada
rangsangan
Endositosis
Pinositosis _perpindahan cairan, senyawa terlarut atau makromolekul tersuspensi dari luar ke dalam sel
Fagositosis :
JARINGAN
1. I. Pendahuluan. Jaringan adalah kelompok sel yang serupa secara structural (begitupula dengan
produk yang dihasilkan) yang mengalami spesialisasi untuk menjalankan suatu fungsi tertentu. Ada
empat jenis jaringan dasar yang ditemukan pada tubuh manusia: epitelium, jaringan ikat, jaringan
otot, jaringan saraf,. Semua struktur tubuh tersusun dari beragam jumlah jaringan ini; sebagian
besar organ utama tersusun dari penggabungan keempat jenis jaringan ini.
1. 1. Epithelium penutup dan pelapis adalah lapisan sel yang menutupi bagian internal dan
eksternal dari permukaan tubuh dan organ serta melapisi rongga tubuh dan organ berongga
3. 2. Epithelium glandular berasal dari epithelium yang melapisi atau menutupi sel-sel
2. b. Kelenjar endokrin adalah kelenjar yang tidak memiliki duktus keluar; kelenjar
ini kehilangan hubungan dengan permukaan tubuh dan menjadi massa padat
3. B. Karakteristik umum
1. 1. Struktur
saluran pencernaan.
3. Transport cairan, mucus, nutrient, atau zat partikulat lain.
epithelium glandular.
III. Jaringan ikat. Menyangga tubuh dan organ tubuh serta menyatukan jaringan-jaringan. Susunan utama
jaringan ini terdiri dari substansi tak hidup intraseluler yang dihasilkan oleh sel-sel jaringan ikat tertentu.
1. Klasifikasi
1. Jaringan ikat embrionik, ditemukan pada embrio dan janin yang sedang tumbuh. Jaringan ini
2. Jaringan ikat yang biasa, antara lain jaringan ikat renggang (areolar, fibrosarapat, dan
adiposa).
3. Jaringan ikat yang mengalami spesialisasi, meliputi jaringan ikat penunjang, kartilago tulang,
4. Fungsi
2. Jaringan ikat mengikat berbagai jaringan agar tetap menyatu dan menyediakan materi
perbaikan jaringan.
3. Substansi dasar dari jaringan ikat yang renggang memberikan jalur untuk pembuluh
darah dan saraf, nutrient, gas, dan sisa metabolisme ditranspor dari kapiler ke sel (dan
4. Substasi dasar merupakan suatu barier terhadap penyebaran bakteri yang berbahaya
dan juga tempat berlangsungnya perang melawan bakteri.
IV. Jaringan otot, adalah “daging” tubuh dan tersusun dari banyak dinding organ berongga dan pebuluh-
pembuluh tubuh. Sel-sel jaringan otot, yang dinamakan serabut, sangat terspesialisasi untuk
kontraktilitas.
1. Karakteristik umum
3. Sitoplasma disebut sarkoplasma, membran sel disebut sarkolema, dan RE halus disebut
reticulum sarkoplasma.
4. Serabut otot dapat membesar, kecuali untuk kemampuan terbatas sel otot polos pada lokasi
5. Klasifikasi
2. Secara structural, otot diklasifikasikan menjadi otot lurik dan otot polos.
3. Berdasarkan struktur dan fungsinya, dibagi menjadi otot polos, otot rang, dan otot
jantung.
1. V. Jaringan saraf sebagai jaringan komonikasi, jaringan saraf mengalami spesialisasi untuk
1. Struktur. Jaringan saraf terdiri dari dua jenis sel neuron dan neuroglia.
2. Difisi-difisi. Secara anatomis, jaringan saraf terdiri dari system saraf pusat (otak dan medulla
spinalis) dan system saraf perifer (serabut saraf) dan kelompok sel saraf yang disebut
ganglia.
Daftar Pustaka
Widjaja NMR. Transport membran. http//: www.fkh .unair.ac.id/materi/materi kuliah 2010/bahan ajar
fisiologi veteriner/kelas regular/transport membran 2008.pdf.
Anonym. 2009. Struktur dan fungsi membran sel. http//:www. Sith . itb . ac . id/…/
strukturdanfungsimembransel-februari09.pdf>
Sherwood. L. 2001. Fisiologi manusia dari sel ke system. Edisi 2. EGC, Jakarta
Pada amoeba dan banyak protista lain makan dengan jalan menelan organisme atau partikel makanan lain
yang lebih kecil, suatu proses yang disebut fagositosis(berasal dari bahasa Yunani, phagein yang berarti
“memakan” dan kytos yang berarti wadah. Wadah disini yang dimaksud adalah sel). Sebagian sel manusia
juga melakukan fagositosis, diantaranya adalah makrofage, sel membantu mempertahankan tubuh dengan
merusak bakteri dan penyerang lainnya.
Perusakan sel terprogram oleh enzim lisosomnya sendiri penting dalam perkembangan organisme. Misal,
pada waktu kecebong berubah menjadi katak, ekornya diserap secara bertahap. Sel-sel ekor yang kaya
akan lisosom mati dan hasil penghancuran digunakan di dalam pertumbuhan sel-sel baru yang berkembang.
Pada perkembangan tangan embrio manusia yang semula berselaput hingga lisosom mencerna jaringan
diantara jari-jari tangan tersebut sehingga terbentuk jari yang terpisah seperti yang kita punyai sekarang.
Berbagai kelainan turunan yang disebut sebagai penyakit penyimpangan lisosom (lysosomal storage
disease) mempengaruhi metabolism lisosom. Seseorang yang ditimpa penyakit penyimpangan ini
kekurangan salah satu enzim hidrilitik aktif yang secara normal ada dalam lisosom. Lisosom melahap
substat yang tidak tercerna yang mulai mengganggu fungsi seluler lainnya. Pada penyakit Pompe misalnya,
hati dirusak oleh akumulasi glikogenakibat ketiadaan enzil lisosomyang dibutuhkan untuk memecah
polisakarida. Pada penyakit Tay-Sachs, enzim pencerna lipid hilang atau inaktif, dan otak dirusak oleh
akumulasi lipid dalam sel. Untunglah penyakit penyimpangan ini jarang ada pada populasi umum. Pada
masa mendatang mungkin kita dapat mengobati penyakit penyimpangan ini dengan menyuntikkan enzim
yang hilang bersama dengan molekul adaptor yang menargetkan enzim-enzim untuk penelanan oleh sel dan
penggabungan dengan lisosom. Mungkin Anda yang menemukan caranya?!!!
Pembentukan lisosom
Enzim lisosom adalah suatu protein yang diproduksi oleh ribosom dan kemudian masuk ke dalam RE. Dari
RE enzim dimasukkan ke dalam membran kemudian dikeluarkan ke sitoplasma menjadi lisosom. Selain ini
ada juga enzim yang dimasukkan terlebih dahulu ke dalam golgi. Oleh golgi, enzim itu dibungkus membran
kemudian dilepaskan di dalam sitoplasma. Jadi proses pembentukan lisosom ada dua macam, pertama
dibentuk langsung oleh RE dan kedua oleh golgi.
Lisosom umumnya berdiameter 1,5 m, walaupun kadang-kadang ditemukan lisosom berdiameter
0,05 m. Lisosom terdapat hampir pada semua sel eukariotik, terutama sel-sel yang bersifat fagositik
seperti leukosit. Lisosom berisi enzim-enzim hidrolitik seperti protease, lipase,nuklease, fosfatase,
dan enzim pencerna yang lain. Perhatikan Gambar
Enzim lisosom adalah suatu protein yang diproduksi oleh ribosom dan kemudian masuk ke RE. Dari
RE, enzim dimasukkan ke dalam membran kemudian dikeluarkan oleh sitoplasma menjadi lisosom.
Selain itu, ada pula enzim yang dimasukkan terlebih dahulu ke Golgi. Enzim itu dibungkus membran
kemudian dilepaskan dalam sitoplasma oleh Golgi.
Jadi, proses pembentukan lisosom dapat dilakukan secara langsung oleh RE atau oleh Golgi.
Proses pencernaan oleh lisosom berlangsung misalnya saat sel menelan bakteri secara fagositosis.
Bakteri itu dimasukkan ke dalam vakuola. Vakuola yang berisi bakteri segera dihampiri lisosom.
Membran lisosom dan membran vakuola bersinggungan dan bersatu. Enzim lisosom masuk ke
dalam vakuola dan mencerna bakteri. Substansi hasil pencernaan lisosom disimpan dalam vesikel
kemudian ditranspor ke membran plasma dan dikeluarkan dari sel.
Fungsi Lisosom
Secara rinci fungsi lisosom adalah sebagai berikut :
2) Autofagi yaitu menghancurkan struktur yang tidak dikehendaki, misalnya organel lain yang sudah
tidak berfungsi
3) Eksositosis yaitu pembebasan enzim keluar sel, misalnya pada pergantian tulang rawan pada
perkembangan tulang keras
4) Autolisis yaitu penghancuran diri sel dengan membebaskan isi lisosom ke dalam sel, misalnya
terjadi pada saat berudu menginjak dewasa dengan menyerap kembali ekornya
Lisosom
Oleh Mustahib, S.Pd.Si. June 17, 2007
Lisosom berasal dari kata lyso = pencernaan dan soma = tubuh. Lisosom merupakan kantong yang
berbentuk agak bulat dikelilingi membran tunggal yang digunakan sel untuk mencerna
makromolekul. Lisosom berisi enzim yang dapat memecahkan (mencerna) polisakarida, lipid, fosfolipid,
asam nukleat, dan protein. Enzim itu dinamakan lisozim. Lisosom berperan dalam pencernaan intra sel,
misalnya pada protozoa atau sel darah putih, juga dalam autofagus.
Pada amoeba dan banyak protista lain makan dengan jalan menelan organisme atau partikel makanan lain
s “memakan” dan kytos yang berarti wadah. Wadah disini yang dimaksud adalah sel). Sebagian sel manusia
juga melakukan fagositosis, diantaranya adalah makrofage, sel membantu mempertahankan tubuh dengan
merusak bakteri dan penyerang lainnya.
Perusakan sel terprogram oleh enzim lisosomnya sendiri penting dalam perkembangan organisme. Misal,
pada waktu kecebong berubah menjadi katak, ekornya diserap secara bertahap. Sel-sel ekor yang kaya
akan lisosom mati dan hasil penghancuran digunakan di dalam pertumbuhan sel-sel baru yang
berkembang. Pada perkembangan tangan embrio manusia yang semula berselaput hingga lisosom
mencerna jaringan diantara jari-jari tangan tersebut sehingga terbentuk jari yang terpisah seperti yang kita
punyai sekarang.
Berbagai kelainan turunan yang disebut sebagai penyakit penyimpangan lisosom (lysosomal storage
disease) mempengaruhi metabolism lisosom. Seseorang yang ditimpa penyakit penyimpangan ini
kekurangan salah satu enzim hidrilitik aktif yang secara normal ada dalam lisosom. Lisosom melahap
substat yang tidak tercerna yang mulai mengganggu fungsi seluler lainnya. Pada penyakit Pompe misalnya,
hati dirusak oleh akumulasi glikogenakibat ketiadaan enzil lisosomyang dibutuhkan untuk memecah
polisakarida. Pada penyakit Tay-Sachs, enzim pencerna lipid hilang atau inaktif, dan otak dirusak oleh
akumulasi lipid dalam sel. Untunglah penyakit penyimpangan ini jarang ada pada populasi umum. Pada
masa mendatang mungkin kita dapat mengobati penyakit penyimpangan ini dengan menyuntikkan enzim
yang hilang bersama dengan molekul adaptor yang menargetkan enzim-enzim untuk penelanan oleh sel
dan penggabungan dengan lisosom. Mungkin Anda yang menemukan caranya?!!!
Pembentukan lisosom
Enzim lisosom adalah suatu protein yang diproduksi oleh ribosom dan kemudian masuk ke dalam RE. Dari
RE enzim dimasukkan ke dalam membran kemudian dikeluarkan ke sitoplasma menjadi lisosom. Selain ini
ada juga enzim yang dimasukkan terlebih dahulu ke dalam golgi. Oleh golgi, enzim itu dibungkus membran
kemudian dilepaskan di dalam sitoplasma. Jadi proses pembentukan lisosom ada dua macam, pertama
dibentuk langsung oleh RE dan kedua oleh golgi.
Gbr. Lisosom, tampak pada sel
Lisosom mengandung kumpulan enzim hidrolitik untuk menguraikan berbagai substansi di dalam sel. Lisosom
berbentuk sebagai saku bulat (sferis) terbungkus oleh satu lapisan membran mengandung enzim hidrolitik. Lisosom
terdapat pada hampir semua sel. Enzim lisosom disintesis dalam retikulum endoplasma kasar, kemudian
dipindahkan ke dalam badan golgi. Lisosom sangat penting bagi kesehatan sel karena membentuk fungsi sel dengan
peremajaan sel dan mencerna sel-sel tua. Dalam mencerna makanan atau substrat yang masuk, lisosom bekerja
sama dengan sitoplasma.
Menurut Wikipedia, Lisosom adalah organel sel berupa kantong terikat membran yang berisi enzim hidrolitik yang
berguna untuk mengontrol pencernaan intraseluler pada berbagai keadaan. Lisosom ditemukan pada tahun 1950
oleh Christian de Duve dan ditemukan pada semua sel eukariotik. Di dalamnya, organel ini memiliki 40 jenis enzim
hidrolitik asam seperti protease, nuklease, glikosidase, lipase, fosfolipase, fosfatase, ataupun sulfatase. Semua
enzim tersebut aktif pada pH 5. Fungsi utama lisosom adalah endositosis, fagositosis, dan autofagi.
Pada tumbuhan organel ini lebih dikenal sebagai vakuola, yang selain untuk mencerna, mempunyai fungsi
menyimpan senyawa organik yang dihasilkan tanaman.
Lysosomal storage diseases adalah penyakit keturunan yang memengaruhi metabolisme lisosom, terjadi karena
mutasi di gen struktural sehingga kekurangan salah satu enzim hidrolitik aktif yang secara normal ada dalam lisosom.
Substrat yang tidak tercerna akan menumpuk dan mengganggu fungsi seluler lainnya. Penyakit ini sangat jarang
ditemukan, yaitu sekitar 1 dari 7700 kelahiran manusia. Salah satu contohnya adalah penyakit Pompe.
Sumber: http://id.shvoong.com/exact-sciences/biology/2184520-lisosom/#ixzz28sK9c700
Fungsi Lisosom
Secara rinci fungsi lisosom adalah sebagai berikut :1)
Melakukan pencernaan intrasel2) Autofagi yaitu
menghancurkan struktur yang tidak dikehendaki, misalnya
organel lain yangsudah tidak berfungsi3) Eksositosis yaitu
pembebasan enzim keluar sel, misalnya pada pergantian tulang
rawan pada perkembangan tulang keras4) Autolisis yaitu
penghancuran diri sel dengan membebaskan isi lisosom ke
dalam sel, misalnyaterjadi pada saat berudu menginjak dewasa
dengan menyerap kembali ekornya5) Menghancurkan senyawa
karsinogenik Dari uraian di atas dapat diketahui bahwa lisosom
mempunyai peranan penting dalam sel.Bagaimana jika lisosom
mengalami kegagalan fungsi? Kegagalan dalam proses
pencernaan olehlisosom dapat menyebabkan penyakit silikosis
dan rematik
Lisosom
Walaupun banyak sel yang berbeda satu sama lainnya, tetapi umumnya seluruh sel mempunyai sifar-sifat dasar yang
mirip satu sama lain, misalnya :
* oksigen akan terikat pada karbohidrat, lemak atau protein pada setiap sel untuk melepaskan energi
* mekanisme umum merubah makanan menjadi energi
* setiap sel melepaskan hasil akhir reaksinya ke cairan disekitarnya
* hampir semua sel mempunyai kemampuan mengadakan reproduksi dan jika sel tertentu mengalami kerusakan
maka sel sejenis yang lain akan beregenerasi
Secara umum sel-sel yang menyusun tubuh manusia mempunyai struktur dasar yang terdiri dari membran sel,
protoplasma dan inti sel (nukleus).
Ketiganya mempunyai komposisi kimia yang terdiri dari air, elektrolit, protein, lemak dan karbohidrat.
a. Air
Medium cairan utama dari sel adalah air, yang terdapat dalam konsentrasi 70-85%. Banyak bahan-bahan kimia sel
larut dalam air, sedang yang lain terdapat dalam bentuk suspensi atau membranous
b. Elektrolit
Elektrolit terpenting dari sel adalah Kalium, Magnesium, Fosfat, Bikarbonat, Natrium, Klorida dan Kalsium. Elekrolit
menyediakan bahan inorganis untuk reaksi selluler dan terlibat dalam mekanisme kontrol sel
c. Protein
Memegang peranan penting pada hampir semua proses fisiologis dan dapat diringkaskan sebagai
berikut :
1. Proses enzimatik
2. Proses transport dan penyimpanan
3. Proses pergerakan
4. Fungsi mekanik
5. Proses imunologis
6. Pencetus dan penghantar impuls pada sel saraf
7. Mengatur proses pertumbuhan dan regenerasi
d. Lemak
Asam lemak yang merupakan komponen membran sel adalah rantai hidrokarbon yang panjang, sedang asam lemak
yang tersimpan dalam sel adalah triasilgliserol, merupakan molekul yang sangat hidrofobik. Karena molekul
triasilgliserol ini tidak larut dalam air/larutan garam maka akan membentuk lipid droplet dalam sel lemak (sel
adiposa) yang merupakan sumber energi. Molekul lemak yang menyusun membran sel mempunyai gugus hidroksil (
fosfolipid dan kolesterol) sehingga dapat berikatan dengan air, sedangkan gugus yang lainnya hidrofobik (tidak
terikat air) sehingga disebut amfifatik.
e. Karbohidrat
Suatu karbohidrat tersusun atas atom C,H, dan O. Karbohidrat yang mempunyai 5 atom C disebut pentosa, 6 atom C
disebut hexosa adalah karbohidrat-karbohidrat yang penting untuk fungsi sel.
Karbohidrat yang tersusun atas banyak unit disebut polisakarida. Polisakarida berperan sebagai sumber energi
cadangan dan sebagai komponen yang menyusun permukaan luar membran sel. Karbohidrat yang berikatan dengan
protein (glikoprotein) dan yang berikatan dengan lemak (glikolipid) merupakan struktur penting dari membran sel.
Selain itu glikolipid dan glikoprotein menyusun struktur antigen golongan darah yang dapat menimbulkan reaksi
imunologis.
Di dalam sitoplasma inilah tersebar berbagai bahan, yaitu globulus lemak netral, granula-granula glikogen, ribosome,
granula sekretoris, dan lima macam organel terpenting yaitu retikulum endoplasma, aparatus Golgi, mitokhondria,
lisosom dan peroksisom.
DNA yang terdapat pada kromosom merupakan struktur double stranded (double helix) yang terdiri dari : 1) gugus
posfat 2) gugus pentose (gula) yaitu deoksiribosa dan 3) basa nitrogen yaitu purine : adenine dan guanine;
pirimidine : sitosine dan thymine. Gugus posfat dan pentose membentuk struktur fisik DNA, sedangkan 4 basa yang
berbeda ini membawa informasi genetik. Pada DNA, adenin selalu berikatan dengan thymine dan guanin selalu
terikat dengan sitosine.
Karena DNA berlokasi pada inti sel sedang hampir semua aktifitas sel terjadi pada sitoplasma, maka dibentuklah RNA
yang dapat berdifusi menuju sitoplasma untuk mengatur sintesa protein yang spesifik. Proses pembentukan RNA
diatur oleh DNA melalui proses transkripsi.
Terdapat 3 jenis RNA yang dibentuk oleh DNA, dimana tiap jenis RNA mempunyai fungsi yang berbeda, yaitu :
1. Messenger RNA (mRNA), berfungsi membawa kode genetik ke sitoplasma untuk mengatur sintesa protein.
2. Transfer RNA (tRNA) untuk transport asam amino menuju ribosom untuk digunakan menyusun molekul protein
3. Ribosomal RNA (rRNA) untuk membentuk ribosom bersama dengan 75 protein lainnya.
Bila molekul mRNA kontak dengan ribosom, maka akan dibentuklah molekul protein disepanjang ribosom. Proses
pembentukan protein ini disebut translasi. Jadi pada ribosom terjadi proses kimia penyusunan asam amino untuk
membentuk protein.
PicOfPlantCell01
Dan ini adalah gambar sel hewan:
animalcellsfigure02
Protein merupakan senyawa biokimia yang tersusun dari satu atau lebih polipeptida dan memiliki
bentukglobular atau fibrous. Polipeptida sendiri merupakan suatu polimer dari asam amino yang
terbentuk dari ikatan peptida. Sebagian besar asam amino penyusun protein adalah L-α-asam amino.
Untuk mempermudah dalam memahami struktur protein, kita bagi pembahasan sesuai tingkatan, mulai
dari ukuran paling kecil. Secara tingkatan, struktur protein dibagi menjadi empat, yakni primer, sekunder,
tersier, dan kuartener.
Asam Amino
Asam amino merupakan asam organik yang memiliki gugus amina, hal ini dapat terlihat jelas dari
namanya, asam (berarti memiliki gugus COOH) dan amino (berarti memiliki gugus amina, NH 2). Secara
umum, struktur asam amino terdiri dari satu gugus karboksilat, satu buah atom Cα, satu buah gugus
amina, dan satu buah gugus -R. Karena memiliki atom Cα, maka asam amino memiliki dua buah isomer,
yakni isomer L dan isomer D. Dalam senyawa protein, sangat jarang sekali ditemukan adanya asam
amino dengan konfigurasi D, kebanyakan adalah L.
Gugus -R pada asam amino seharusnya bisa apa saja, namun pada asam amino penyusun protein,
hanya terdapat 20 jenis gugus -R yang banyak ditemukan. Karena terdapat 20 variasi gugus -R, maka
jenis asam amino yang banyak ditemukan sebagai penyusun protein ada 20, sesuai dengan gugus -R. 20
jenis asam amino itu sendiri dapat dikelompokkan sesuai dengan sifat dan struktur gugus -R.
Pengelompokkan tersebut dapat dilihat pada gambar di bawah ini.
Asam amino pembentuk protein, link: http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a9/Amino_Acids.svg/2000px-
Amino_Acids.svg.png
Sekarang kita sudah mengetahui struktur 20 asam amino pembentuk protein, lalu bagaimana asam
amino tersebut berikatan?
Ikatan Peptida
Dalam menyusun protein, asam amino pembentuk protein membentuk ikatan peptida dengan asam
amino lainnya. Ikatan peptida adalah ikatan yang terbentuk antara atom C karboksilat asam amino
dengan atom N amina dari asam amino lainnya. Pada prosesnya, reaksi ini melepaskan sebuah molekul
H2O.
Reaksi pembentukan ikatan peptida
Hasil reaksi diatas adalah dipeptida, karena terbentuk dari dua asam amino. Bagaimanapun dipeptida
masih memiliki gugus karboksilat dan amina, sehingga reaksi pembentukan ikatan peptida masih dapat
terus terjadi. Dipeptida dapat bereaksi dengan asam amino atau dipeptida lainnya membentuk
oligopeptida. Oligopeptida pun masih bisa terus bereaksi dengan asam amino atau oligopeptida lainnya,
pada akhirnya terbentuklah protein. Lepasnya gugus -OH asam karboksilat dan -H amin pada proses
pembentukan ikatan peptida menyebabkan struktur asam amino pada oligopeptida atau protein tidak lagi
lengkap sebagai asam amino. Oleh karena itu, kata paling tepat untuk menyebutkannya adalah "residu
asam amino".
Glisina atau asam aminoetanoat adalah asam amino alami paling sederhana. Asam amino ini bagi
manusia bukan merupakan asam amino esensial karena tubuh manusia dapat mencukupi
kebutuhannya. Tubuh manusia memproduksi glisina dalam jumlah mencukupi. Glisina berperan
dalam sistem saraf sebagai inhibitor neurotransmiter pada sistem saraf pusat (CNS).
Alanin (Ala) atau asam 2-aminopropanoat merupakan salah satu asam amino bukan esensial. Bentuk
yang umum di alam adalah L-alanin (S-alanin) meskipun terdapat pula bentuk D-alanin (R-alanin) pada
dinding sel bakteri dan sejumlah antibiotika. Alanina dapat berperan dalam pengenalan substrat atau
spesifisitas, khususnya dalam interaksi dengan atom nonreaktif seperti karbon. Dalam proses
pembentukan glukosa dari protein, alanina berperan dalam daur alanina.
Valina adalah salah satu dari 20 asam amino penyusun protein yang dikode oleh DNA. Dalam ilmu gizi,
valina termasuk kelompok asam amino esensial. Sifat valina dalam air adalah hidrofobik (‘takut air’)
karena ia tidak bermuatan. Pada penyakit anemia “bulan sabit” (sel-sel eritrosit tidak berbentuk seperti
pil tetapi seperti bulan sabit, sickle-cell anaemia), valina menggantikan posisi asam glutamat, asam
amino lain yang hidrofilik(‘suka air’), pada hemoglobin.
Leusina merupakan asam amino yang paling umum dijumpai pada protein. Ia mutlak diperlukan dalam
perkembangan anak-anak dan dalam kesetimbangan nitrogen bagi orang dewasa. Ada dugaan bahwa
leusina berperan dalam menjaga perombakan dan pembentukan protein otot. Leusina tergolong asam
amino esensial bagi manusia.
Isoleusina adalah satu dari asam amino penyusun protein yang dikode oleh DNA. Rumus kimianya sama
dengan leusinhidrofobik (tidak larut dalam air) dan esensial bagi manusia.
merupakan asam amino penyusun protein yang umum ditemukan pada protein hewan. Protein mamalia
hanya memiliki L-serin. Serina bukan merupakan asam amino esensial bagi manusia. Serina penting
bagi metabolisme karena terlibat dalam biosintesissenyawa-
senyawa purin dan pirimidin, sistein, triptofan (pada bakteria), dan sejumlah besar metabolit lain.
Sebagai penyusun enzim, serina sering memainkan peran penting dalam fungsi katalisator enzim. Ia
diketahui berada pada bagian aktif kimotripsin, tripsin, dan banyak enzim lainnya. Sebagai
penyusun protein non-enzim, rantai sampingnya dapat mengalami glikolisasi yang dapat menjelaskan
gangguan akibat diabetes.
7. Treonina (Asam2S,3R-2-amino-3-hidroksibutanoat)
(C4H9NO3)
Bagi manusia, treonina bersifat esensial. Tubuh manusia tidak memiliki enzim pembentuk treonina
namun manusia memerlukannya, sehingga treonina esensial (secara gizi) bagi manusia.
Kehadiran enzim treonina-kinase dapat menyebabkan fosforilasi pada treonina,
menghasilkan fosfotreonina, senyawa antara penting pada biosintesis metabolitsekunder.
Asam aspartat bersifat asam, dan dapat digolongkan sebagan asam karboksilat. Bagimamalia aspartat
tidaklah esensial. Fungsinya diketahui sebagai pembangkit neurotransmisi di otak dan saraf otot. Diduga,
aspartat berperan dalam daya tahan terhadap kepenatan. Senyawa ini juga merupakan produk dari daur
urea dan terlibat dalam glukoneogenesis.
Asam glutamat dapat diproduksi sendiri oleh tubuh manusia sehingga tidak tergolong esensial. Ion
glutamat merangsang beberapa tipe saraf yang ada di lidah manusia. Sifat ini dimanfaatkan dalam
industri penyedap. Garam turunan dari asam glutamat, yang dikenal sebagai mononatrium glutamat (
dikenal juga sebagai monosodium glutamat, MSG, vetsin atau micin), sangat dikenal dalam
dunia boga Indonesia maupun Asia Timurlainnya sebagai penyedap masakan.
Asparagin adalah analog dari asam aspartat dengan penggantian gugus karboksil oleh
gugus karboksamid. Asparagin bersifat netral (tidak bermuatan) dalam pelarut air. Fungsi biologi:
Asparagina diperlukan oleh sistem saraf untuk menjaga kesetimbangan dan dalam transformasi asam
amino. Ia berperan pula dalam sintesis amonia.
(C6H14N4O2)
Asam amino ini tergolong setengah esensial bagi manusia dan mamalia lainnya, tergantung pada tingkat
perkembangan atau kondisi kesehatan. Bagi anak-anak, asam amino ini esensial. Pangan yang menjadi
sumber utama arginin adalah produk-produk peternakan (dairy products) seperti daging, susu (dan
olahannya), dan telur. Dari produk tumbuhan dapat disebutkan cokelat dan biji kacang tanah.
Bagi manusia histidina merupakan asam amino yang esensial bagi anak-anak. Fungsi Histidina menjadi
prekursor histamin, suatu amina yang berperan dalam sistem saraf, dankarnosin, suatu asam amino.
(C6H14N2O2)
Lisina tergolong esensial bagi manusia dan kebutuhan rata-rata per hari adalah 1- 1,5 g. Lisina menjadi
kerangka bagi niasin (vitamin B1). Kekurangan vitamin ini dapat menyebabkan pelagra. Lisina juga
dilibatkan dalam pengobatan terhadap penyakitherpes.
merupakan asam amino bukan esensial bagi manusia yang memiliki atom S, bersama-sama
dengan metionin. Atom S ini terdapat pada gugus tiol (dikenal juga sebagai sulfhidril atau merkaptan).
Karena memiliki atom S, sisteina menjadi sumber utama dalam sintesis senyawa-senyawa biologis lain
yang mengandung belerang. Sisteina dan metionin pada protein juga berperan dalam
menentukan konformasi protein karena adanya ikatan hidrogen pada gugus tiol.
(C5H11NO2S)
Asam amino ini penting dalam sintesis protein (dalam proses transkripsi, yang menerjemahkan
urutan basa nitrogen di DNA untuk membentuk RNA) karena kode untuk metionina sama dengan kode
awal (start) untuk suatu rangkaian RNA. Asam amino ini bagi manusia bersifat esensial, sehingga harus
dipasok dari bahan pangan. Sumber utama metionina adalah buah-buahan, daging
(ayam, sapi, ikan), susu (susu murni, beberapa jenis keju), sayuran (spinach, bayam, bawang
putih, jagung), serta kacang-kacangan (kapri, pistacio, kacang mete, kacang merah, tahu, tempe).
Fungsi terpenting prolina tentunya adalah sebagai komponen protein. Sel tumbuh-tumbuhan tertentu
yang terpapar kondisi lingkungan yang kurang cocok (misalnya kekeringan) akan menghasilkan prolina
untuk menjaga keseimbangan osmotik sel. Prolina dibuat dari asam L-glutamat dengan prekursor suatu
asam imino. Prolina bukan merupakan asam amino esensial bagi manusia.
(C9H11NO2)
Fenilalanina adalah suatu asam amino penting dan banyak terdapat pada makanan, yang bersama-sama
dengan asam amino tirosin dan triptofan merupakan kelompok asam amino aromatik yang
memiliki cincin benzena. Fenilalanina bersama-sama
dengan taurindan triptofan merupakan senyawa yang berfungsi sebagai penghantar atau penyampai
pesan (neurotransmitter) pada sistem saraf otak. Dalam keadaan normal, fenilalanina diubah
menjadi tirosin dan dibuang dari tubuh. Gangguan dalam proses inimenyebabkan fenilalanina tertimbun
dalam darah dan dapat meracuni otak serta menyebabkanketerbelakangan mental.
(C9H11NO3)
Dalam transduksi signal, tirosina memiliki peran kunci dalam pengaktifan beberapa enzimtertentu
melalui proses fosforilasi (membentuk fosfotirosina). Bagi manusia, tirosina merupakan
prekursor hormon tiroksin dan triiodotironin yang dibentuk di kelenjar tiroid,pigmen kulit melanin, dan
dopamin, norepinefrin dan epinefrin. Tirosina tidak bersifatesensial bagi manusia. Oleh enzim tirosina
hidroksilase, tirosina diubah menjadi DOPA yang merupakan bagian dari manajemen terhadap
penyakit Parkinson.
Triptofan merupakan satu dari 20 asam amino penyusun protein yang bersifat esensial bagi manusia.
Bentuk yang umum pada mamalia adalah, seperti asam amino lainnya, L-triptofan. Gugus fungsional
yang dimiliki triptofan, indol, tidak dimiliki asam-asam amino dasar lainnya. Akibatnya, triptofan menjadi
prekursor banyak senyawa biologis penting yang tersusun dalam kerangka indol. Triptofan adalah
prekursor melatonin (hormonperangsang tidur), serotonin (suatu transmiter pada sistem saraf)
dan niasin (suatuvitamin).
Di dalam tubuh organisme, terdapat 20 macam asam amino yang menyusun protein. Kedua
puluh asam amino tersebut sering disajikan dalam 5 kelompok besar berdasarkan sifat
kimiawi gugus sampingnya. Meskipun demikian, mengingat semua asam amino tersebut
merupakan hal yang tidak mudah dilakukan. Walaupun penggolongan tersebut tidak
dimaksudkan untuk dihafalkan.
Salah satu cara untuk membantu mengingat 20 macam asam amino tersebut adalah
dengan menggunakan “Rule of Thumb”. Disebut demikian karena memang
melibatkan thumb = jempol, he... :-). Berikut aturan dan penjelasannya:
Sebelum sampai pada contoh, ada beberapa aturan yang harus selalu diperhatikan.
Pergelangan tangan menggambarkan struktur dasar asam amino. Bagian ini akan
selalu tetap untuk kedua puluh asam amino.
Atom karbon yang pertama terletak di tengah telapak tangan atau di buku jari yang
pertama untuk beberapa asam amino.
Atom berikutnya (dapat berupa karbon, oksigen, nitrogen, atau sulfur) menempati
buku dan ujung jari (seperti pada gambar di atas.
Ini dia contohnya:
Glu (Glutamate) dan Gln (Glutamine) memiliki bentuk yang sama, hanya jenis atom dan
ikatannya berbeda
Lys (Lysine): ingat panjang (L untuk long – Bahasa Inggris)
Arg (Arginine): sama panjang dengan lysine, tetapi bercabang pada ujungnya
Nah, kalau rule of thumb tadi kurang membantu dan merasa terlalu dipaksakan, masih ada
cara jitu satu lagi. Gambar berikut bisa dicetak dalam ukuran kecil sehingga mudah dibawa
dalam kantong baju. Jadi, bisa dilihat kapan saja, termasuk saat ujian, he... :D
Asam amino merupakan unit pembangun protein yang dihubungkan melalui ikatan peptida pada
setiap ujungnya. Protein tersusun dari atom C, H, O, dan N, serta kadang-kadang P dan S. Dari
keseluruhan asam amino yang terdapat di alam hanya 20 asam amino yang yang biasa dijumpai
pada protein.
Dari struktur umumnya, asam amino mempunyai dua gugus pada tiap molekulnya, yaitu gugus
amino dan gugus karboksil, yang digambarkan sebagai struktur ion dipolar. Gugus amino dan
gugus karboksil pada asam amino menunjukkan sifat-sifat spesifiknya. Karena asam amino
mengandung kedua gugus tersebut, senyawa ini akan memberikan reaksi kimia yang yang
mencirikan gugus-gugusnya. Sebagai contoh adalah reaksi asetilasi dan esterifikasi. Asam amino
juga bersifat amfoter, yaitu dapat bersifat sebagai asam dan memberikan proton kepada basa
kuat, atau dapat bersifat sebagai basa dan menerima proton dari basa kuat.
Semua asam amino yang ditemukan pada protein mempunyai ciri yang sama, gugus karboksil
dan amino diikat pada atom karbon yang sama. Masing-masing berbeda satu dengan yang lain
pada gugus R-nya, yang bervariasi dalam struktur, ukuran, muatan listrik, dan kelarutan dalam
air. Beberapa asam amino mempunyai reaksi yang spesifik yang melibatkan gugus R-nya.
Melalui reaksi hidrolisis protein telah didapatkan 20 macam asam amino yang dibagi
berdasarkan gugus R-nya, berikut dijabarkan penggolongan tersebut : asam amino non-polar
dengan gugus R yang hidrofobik, antara lain Alanin, Valin, Leusin, Isoleusin, Prolin,
Fenilalanin, Triptofan dan Metionin. Golongan kedua yaitu asam amino polar tanpa muatan pada
gugus R yang beranggotakan Lisin, Serin, Treonin, Sistein, Tirosin, Asparagin dan Glutamin.
Golongan ketiga yaitu asam amino yang bermuatan positif pada gugus R dan golongan keempat
yaitu asam amino yang bermuatan negatif pada gugus R. Dari ke-20 asam amino yang ada, di
bagi 2 Jenis asam amino:
a.asam amino essensial yaitu asam amino yang dibutuhkan tubuh tetapi tidak dapat disintesis
dalam tubuh
contoh:arginin,histidin,leusi,isoleusin,metionin,fenilalanin,threonin,triptofan,valin,lisin.
b.asam amino nonesensial yaitu asam amino yang dapat disintesis dalam tubuh manusia.
contoh:alanin,glisin,asam glutamat, prolin,serin,sistein,aspartat,hidroksi prolin,tiroksin.
5 COMMENTS
Tingkatan Struktur Protein (Image from wikipedia)
Protein adalah makromolekul yang unik sekaligus memiliki struktur yang kompleks. Meskipun protein hanya tersusun
atas asam amino yang ada 20 jenis saja, namun untuk dapat berfungsi, ia akan melipat-lipat dan membentuk suatu
struktur tertentu yang sangat presisi sekaligus sulit diprediksi hingga saat ini. Karena strukturnya yang unik dan
presisi itulah maka protein memiliki fungsi yang spesifik yang berbeda satu dengan lainnya.
Struktur protein memiliki tingkatan, kita akan melihat bagaimana asam amino sebagai monomer penyusun protein
tersusun sehingga membentuk struktur protein.
Dimana R adalah gugus samping mulai dari yang paling sederhana –H (glycine | gly) hingga yang memiliki gugus
samping siklik seperti tryptophan (trp). Gambar di bawah ini adalah struktur dari 20 jenis asam amino penyusun
protein. Gugus R ada yang bersifat netral, bermuatan positif, negatif, ada yang hidrofilik dan hidrofobik.
Asam amino (selanjutnya disebut AA saja) dapat membentuk rantai karena gugus amino (–NH2) suatu AA dapat
bereaksi dengan gugus karboksilat (–COOH) pada AA lainnya. Molekul rantai yang terbentuk dinamakan peptida, jika
rantainya relatif pendek (<10 AA) biasa disebut oligopeptida, jika rantainya panjang disebut polipeptida atau protein
(sekitar 50 – 2000 residu AA). Ikatan yang terbentuk antar AA dinamakan ikatan peptida.
Karena reaksi pembentukan peptida membebaskan 1 molekul air, maka jumlah AA penyusun
Berdasarkan konvensi, penyebutan urutan AA dimulai dari AA yang memiliki gugus –NH2 (disebut N terminal) hingga
Rantai peptida biasa disebut “backbone” alias tulang punggung sedangkan gugus R biasa disebut gugus samping.
Struktur Primer
Struktur Primer Protein (Image from w3.hwdsb.on.ca)
Secara sederhana, struktur primer protein adalah urutan asam amino penyusun protein yang disebutkan dari kiri (N-
terminal) ke kanan (C-terminal). AA bisa ditulis dalam singkatan 3 huruf atau 1 huruf. Jadi untuk gambar di atas bisa
Gly-Pro-Thr-Gly-Thr-Gly-Glu-Ser-Lys-Cys-Pro-Leu-Met-Val-Lys-Val-Leu-Asp-Ala-Val-Arg-Gly-
Ser-Pro-Ala
atau
GPTGTGESKCPLMVKVLNAVRGSPA
Cara penulisan yang terakhir (kode 1 huruf) lebih banyak digunakan karena lebih praktis.
Struktur primer terbentuk karena ikatan peptida antar AA selama proses biosintesis protein atau translasi. Urutan
asam amino dapat ditentukan dengan metode Degradasi Edman atau Tandem Mass Spectrophotometry. Atau bisa
juga dari hasil translasi in silico gen pengkode protein tersebut.
Struktur Sekunder
Pada bagian tertentu dari protein, terdapat susunan AA yang membentuk suatu struktur yang reguler dengan sudut-
sudut geometri tertentu. Ada dua struktur sekunder utama yaitu alfa-helix dan beta-sheet. Struktur ini terjadi akibat
Pada gambar sebelah kiri, terlihat bahwa struktur alfa-helix terbentuk oleh ‘backbone‘ ikatan peptida yang
membentuk spiral dimana jika dilihat tegak lurus dari atas, arah putarannya adalah searah jarum jam menjauhi
pengamat (dinamakan alfa). Satu putaran terdiri atas 3.6 residu asam amino dan struktur ini terbentuk karena adanya
ikatan hidrogen antara atom O pada gugus CO dengan atom H pada gugus NH (ditandai dengan garis warna
oranye).
Seperti halnya alfa-helix, struktur beta-sheet juga terbentuk karena adanya ikatan hidrogen, namun seperti terlihat
pada gambar sebelah kanan, ikatan hidrogen terjadi antara dua bagian rantai yang pararel sehingga membentuk
Tidak semua bagian protein membentuk struktur alfa-helix dan beta-sheet, pada bagian tertentu mereke tidak
Struktur Tersier
Struktur tersier adalah menjelaskan bagaimana seluruh rantai polipeptida melipat sendiri sehingga membentuk
struktur 3 dimensi. Pelipatan ini dipengaruhi oleh interaksi antar gugus samping (R) satu sama lain. Ada beberapa
tambahan).
samping akan membentuk struktur tersier. Karena pada gugus samping bisa banyak terdapat gugus seperti –OH, –
berfluktuatif dari satu gugus samping dapat membentuk ikatan dengan dipol berlawanan pada gugus samping lain.
Ikatan Van Der Waals (Image from uic.edu)
Jembatan Sulfida
Cysteine memiliki gugus samping –SH dimana dapat membentuk ikatan sulfida dengan –SH pada cystein lainnya,
ikatan ini berupa ikatan kovalen sehingga lebih kuat dibanding ikatan-ikatan lain yang sudah disebutkan di atas.
Struktur Quartener
Protein atau polipeptida yang sudah memiliki struktur tersier dapat saling berinteraksi dan bergabung menjadi suatu
multimer. Protein pembentuk multimer dinamakan subunit. Jika suatu multimer dinamakan dimer jika terdiri atas 2
subunit, trimer jika 3 subunit dan tetramer untuk 4 subunit. Multimer yang terbentuk dari subunit-subunit identik
disebut dengan awalan homo–, sedangkan jika subunitnya berbeda-beda dinamakan hetero–. Misalnya hemoglobin
yang terdiri atas 2 subunit alfa dan 2 subunit beta dinamakan heterotetramer.
Struktur Quartener Protein Hemoglobin (Image from sciencecases.org)
Perlu diketahui bahwa beberapa protein dapat berfungsi sebagai monomer sehingga ia tidak memiliki struktur
quartener.
Other articles you may like:
Mengenal DNA Lebih Dekat (Anatomi DNA)
Replikasi DNA
Proses Perbaikan DNA yang Rusak: Mencari Jarum dalam Tumpukan Jerami
Tags: 3d structure amino acid peptide protein protein structure struktur molekul
Asam Nukleat
Kata Kunci: asam nukleat, larutan asam, larutan basa, senyawa gula,struktur asam
Asam nukleat adalah makromolekul pertama yang berhasil diisolasi dari dalam inti sel. Asam nukleat
berbentuk rantai linier yang merupakan gabungan monomer nukleotida sebagai unit pembangunnya.
Molekul ini menyimpan informasi pertumbuhan sel dan reproduksi.
Monomer nukleotida sebagai struktur primer asam nukleat diperoleh dari hasil hidrolisis asam nukleat.
Proses hidrolisis lebih lanjut dari monomer nukleotida akan dihasilkan asam fosfat dan nukleosida.
Proses hidrolisis ini dilakukan dalam suasana basa. Jika hidrolisis dilanjutkan kembali terhadap
senyawa nukleosida dalam larutan asam berair akan dihasilkan molekul gula dan basa nitrogen
dengan bentuk heterosiklik. Sehingga komposisi molekul penyusun asam nukleat diketahui dengan
jelas, seperti yang ditunjukkan gambar 14.54 hingga bagan pada Gambar 14.57.
Dari Gambar 14.54 tampak bahwa struktur utama asam nukleat adalah molekul gula yang
mengandung asam posfat dan basa Nitrogen yang dihubungkan dengan ikatan posfodiester
membentuk rantai panjang. Monomer nukleotida dapat dilihat pada Gambar 14.55 dan 14.56.
Gambar 14.55. Molekul Nukleotida
Senyawa gula penyusun nukleotida merupakan gula dengan atom Karbon 5 (lima) yaitu 2-deoksi-D-
ribosa dan D-ribosa, lihat Bagan dibawah ini.
dari cytosine), guanin (G), timin (T) dan urasil (U), lihat Bagan 14.58.
Asam nukleat dalam sel terdiri dari DNA (DeoxyriboNucleic Acid) dan RNA (RiboNucleic Acid). Kedua
jenis asam nukleat ini memiliki perbedaan basa purin yang merupakan molekul penyusunnya. Untuk
RNA disusun oleh gula D-ribosa dan basa urasil. Sedangkan untuk DNA disusun oleh gula 2-deoksi-D-
ribosa yaitu gula D-ribosa yang kehilangan gugus OH pada atom C nomor 2 dan basa timin.
Pengertian Asam Nukleat
Asam nukleat adalah biopolymer yang berbobot molekul tinggi dengan unit monomernya mononukleotida. Asam
nukleat terdapat pada semua sel hidup dan bertugas untuk menyimpan dan mentransfer genetic, kemudian
menerjemahkan informasi ini secara tepat untuk mensintesis protein yang khas bagi masing-masing sel. Asam
nukleat, jika unit-unit pembangunnya deoksiribonukleotida , disebut asam deoksiribonukleotida (DNA) dan jika terdiri-
dari unit-unit ribonukleaotida disebut asam ribonukleaotida (RNA).
DNA (deoxyribonucleic acid) merupakan senyawa pembangun gen yang bila diuraikan terdiri 3 komponen sederhana
:
a. Senyawa base, yaitu amina heterosiklik yang dikenal sebagai purin (adenine = A, guanine = G) dan pirimidin (timin
= T, sitosin = C, dan urasil = U.
b. Gula berkarbon 5 (ribose atau 2-deoksiribosa),
c. Asam fosfat
DNA tersusun dari gula 2-deoksiribosa , basa-basa nitrogen adenine (A), guanine (G), timin (T), dan sitosin (C).
struktur DNA adalah heliks ganda (double helix). Keteraturan DNA dikenal sebagai aturan pasangan basa (base-
pairing rules) yaitu jumlah adenine sama dengan jumlah tamin (A=T), jumlah guanine sama dengan jumlah sitosin
(G=C), jadi jumlah basa purin sama dengan jumlah basa pirimidin (G+A = C+T).
RNA berperan penting dalam sintesis protein yang berlangsung dalam sitoplasma. Ada tiga bentuk RNA yang
terdapat dalam sel, yaitu mRNA (messenger RNA), rRNA (ribosom RNA), dan tRNA (transfer RNA). Tiap bentuk
RNA mempunyai bobot molekul dan komposisi yang berlainan tetapi khas untuk tiap macam bentuk RNA. Ketiga
RNA ini terdiri atas rantai tunggal poliribonukleotida . RNA mempunyai bagian untaian berganda yang terjadi akibat
pembolakan rantai membentuk suatu bentuk yang mirip tusuk konde. Dalam bentuk ini A berpasangan dengan U dan
G berpasangan dengan C.
Sumber: http://id.shvoong.com/writing-and-speaking/2122803-pengertian-asam-nukleat/#ixzz28sXzZMlD
Macam-macam RNA
RNA dapat dibedakan menjadi dua kelompok utama, yaitu RNA genetik dan RNA non-genetik.
1. RNA genetik
RNA genetik memiliki fungsi yang sama dengan DNA, yaitu sebagai pembawa keterangan genetik.
RNA genetik hanya ditemukan pada makhluk hidup tertentu yang tidak memiliki DNA, misalnya virus.
Dalam hal ini fungsi RNA menjadi sama dengan DNA, baik sebagai materi genetik maupun dalam
mengatur aktivitas sel.
1. RNA non-genetik
RNA non-genetik tidak berperan sebagai pembawa keterangan genetik sehingga RNA jenis ini hanya
dimiliki oleh makhluk hidup yang juga memiliki DNA. Berdasarkan letak dan fungsinya, RNA non-
genetik dibedakan menjadi mRNA, tRNA, dan rRNA.
1) mRNA (messenger RNA) atau ARNd (ARN duta)
mRNA merupakan RNA yang urutan basanya komplementer (berpasangan) dengan salah satu urutan
basa rantai DNA. RNA jenis ini merupakan polinukleotida berbentuk pita tunggal linier dan disintesis
oleh DNA di dalam nukleus. Panjang pendeknya mRNA berhubungan dengan panjang pendeknya
rantai polipeptida yang akan disusun. Urutan asam amino yang menyusun rantai polipeptida itu
sesuai dengan urutan kodon yang terdapat di dalam molekul mRNA yang bersangkutan. mRNA
bertindak sebagai pola cetakan pembentuk polipeptida. Adapun fungsi utama mRNA adalah
membawa kode-kode genetik dari DNA di inti sel menuju ke ribosom di sitoplasma. mRNA ini
dibentuk bila diperlukan dan jika tugasnya selesai, maka akan dihancurkan dalam plasma.
A
2) tRNA (transfer RNA)
atau ARNt (ARN transfer)
RNA jenis ini dibentuk di
dalam nukleus, tetapi menempatkan diri di dalam sitoplasma. tRNA merupakan RNA terpendek dan
bertindak sebagai penerjemah kodon dari mRNA. Fungsi lain tRNA adalah mengikat asam-asam
amino di dalam sitoplasma yang akan disusun menjadi protein dan mengangkutnya ke ribosom.
Bagian tRNA yang berhubungan dengan kodon dinamakan antikodon.
Gb. Struktur tRNA
3) rRNA (ribosomal RNA) atau ARNr (ARN ribosomal)
RNA ini disebut ribosomal RNA karena terdapat di ribosom meskipun dibuat di dalam nukleus. RNA
ini berupa pita tunggal, tidak bercabang, dan fleksibel. Lebih dari 80% RNA merupakan rRNA. Fungsi
dari RNA ribosom adalah sebagai mesin perakit dalam sintesis protein yang bergerak ke satu arah
sepanjang mRNA. Di dalam ribosom, molekul rRNA ini mencapai 30-46%.
Dengan adanya penjelasan materi di atas, terdapat perbedaan antara DNA dan RNA.
Tabel . Perbedaan DNA dan RNA
DNA (Deoxyribo Nukleat RNA (Ribo Nukleat Acid)
Acid)
- Letak Dalam inti sel, mitokondria, Dalam inti sel, sitoplasma dan
kloroplas, senriol. ribosom.
- Bentuk Polinukleotida ganda yang Polinukleotida tunggal dan
terpilin panjang pendekl
- Gula Deoxyribosa Ribosa
- Basanya Golongan purin : adenine dan Golongan purin : adenine dan
guanine guanine
Golongan pirimidin : cytosine dan Golongan pirimidin : cytosine dan
timin urasil
- Fungsi - mengontrol sifat yang - sintesis protein
menurun
- sintesis protein
- sintesis RNA
- Kadarnya Tidak dipengaruhi sintesis Dipengaruhi sintesis protein.
protein. Macam ARN :
Letak basa nitrogen dari kedua pita ARN duta
ADN saling berhadapan dengan ARN ribosom
pasangan yang tetap yaitu Adenin
selalu berpasangan dengan Timin, ARN transfer
Cytosin dengan Guanin. Kedua pita
itu diikatkan oleh ikatan hidrogen.
Gb. Jenis-jenis RNA yang dibentuk dari hasil transkripsi DNA merupakan bahan dasar sintesis protein
DNA(Deoksiribosa nukleid acid) terdiri dari beberapa nukleotida. Nukleotida terdiri dari satu gugus
posfat, satu gula lima karbon yang disebut deoksiribosa, dan salah satu dari empat basa nitrogen yang
terdiri dari dua jenis yakni purin (memiliki satu cincin karbon ganda); adenin dan guanin, dan pirimidin
(memiliki satu cincin karbon); sitosin dan timin.
Nukleotida terdiri dari empat jenis:
1. Deoksiadenilat: satu gugus posfat – satu gula deoksiribosa – basa nitrogen adenin
2. Deoksiguanilat: satu gugus posfat – satu gula deoksiribosa – basa nitrogen guanin
3. Deoksisitidilat: satu gugus posfat – satu gula deoksiribosa – basa nitrogen sitosin
4. Deoksiguanilat: satu gugus posfat – satu gula deoksiribosa – basa nitrogen guanin
Menurut James Watson danFrances Crick (1953) DNA adalah suatu heliks ganda. DNA tersusun
menjadi suatu rantai dengan ikatan fosfodiester yang menyatukan karbon 3’ dan karbon 5’ dalam arah
berlawanan. Sebuah rantai atau untai DNA berikatan dengan DNA rantai komplemennya disatukan
dengan ikatan hidrogen antar basa nitrogennya sedangkan posfat dan gulanya dihubungkan oleh suatu
ikatan kovalen.
DNA memiliki kode genetik untuk mengatur fungsi sel dengan cara membentuk protein, namun
bagaimana caranya DNA yang terdapat di nukleus dapat mengatur kegiatan pada sitoplasma? Kode
genetik DNA di transkripsi dalam bentuk RNA yang nantinya akan menembus pori nukleus ke sitoplasma.
DNA dapat ber-replikasi dengan bantuan enzim DNA polimerase, pertama-tama DNA berpisah
menjadi satu untai kemudian DNA polimerase akan membentuk nukleotida komplemennya jika DNA
polimerase berjalan dari 3’ ke 5’ maka komplemen DNA berbentuk 5’ ke 3’. Selain membentuk DNA,
enzim DNA polimerase juga berfungsi untuk mengkoreksi nukleotida yang terbentuk, apabila salah maka
enzim ini akan memutuskan nukleotida tadi dan menggantinya dengan yang baru, jika terjadi kesalahan
pembentukan nukleotida komplemen maka akan terjadi mutasi.
RNA dibentuk oleh enzim polimerase yang menambahkan dua gugus posfat yang mempunyai ikatan
berenergi tinggi, fungsinya untuk mempercepat reaksi kimia pembentukan rantai nukleotida RNA yang
lebih panjang. Untuk lebih jelasnya berikuti ini dipaparkan cara bekerja enzim polimerase dalam
pembentukan molekul RNA:
Enzim RNA polimerase akan menempel pada suatu tempat yang disebut promotor pada DNA,
Kemudian enzim ini akan melepaskan untaian ganda DNA kedalam bentuk rantai tunggal,
Enzim RNA polimerase membentuk nukleotida RNA sebagai komplemen dari DNA rantai tunggal tadi,
setiap nukleotida RNA akan membentuk molekul RNA dengan menghubungkan posfat dengan gula
pada nukleotida lain melalui ikatan kovalen dan bantuan energi dari pelepasan dua gugus posfat
terakhir yang mempunyai ikatan berenergi tinggi,
Kemudian pada suatu tempat pada DNA yang dinamakan chain terminating sequence enzim ini akan
melepaskan diri,
Tidak lama setelah itu RNA akan terlepas dari DNA karena afinitas ikatan hidrogen antara DNA
dengan DNA lebih besar dari DNA dengan RNA.
Catatan: Pada proses transkipsi untai ganda DNA dipisahkan menjadi dua untai tunggal namun hanya
satu untai saja yang dijadikan cetakan untuk membentuk RNA, RNA diapit oleh molekul guanin diujung 5’
bernama guanine cap dan molekul adenin di ujung 3’ poly-A tail proses selanjutnya poly-A tail akan
tereduksi.
RNA yang telah dibentuk seperti penjelasan di atas (RNA heteronukleus/hnRNA) tidak bisa
langsung digunakan tetapi harus melewati proses pematangan di nukleus. hrRNA memiliki intron
(penyekat) dan ekson (yang akan diekspresikan) dalam proses pematangan intron pada RNA dibuang
(stretches) dan ekson digabungkan kembali (splicing). Setelah matang RNA dilepaskan ke sitoplasma
melalui pori-pori nukleus.
RNA terdiri dari tiga jenis yakni:
RNA mesengger (RNAm)/kodon: molekul RNA panjang yang dibawa dari nukleus dan tersuspensi
pada sitoplasma untuk menentukan asam amino apa yang akan dibentuk.
RNA transfer (RNAt)/anti kodon: molekulnya lebih kecil dari RNAm, fungsinya untuk membawa asam
amino ke ribosom dalam perakitan protein. RNAt bentuknya mirip dengan daun semanggi bagian
tengahnya diisi oleh triplet (anti kodon) yang akan berikatan longgar hidrogen dengan triplet (kodon)
pada RNAm dalam ribosom untuk membentuk asam amino (translasi). Asam amino dibawa RNAt
dengan cara berikatan pada gugus hidroksil ribosa pada asam adenilat yang berada pada bagian
ujung RNAt.
RNA ribosom(RNAr): RNAr adalah tempat perakitan protein yang sebenarnya, disini RNAm melekat
pada proses translasi. 60% ribosom adalah RNAr.
Catatan: Ribosom bekerja seperti pabrik manufaktur. Ribosom dibentuk di nukleolus, disini RNAr akan
berikatan dengan protein ribosom untuk membentuk sub unit primordial ribosom yang nantinya dibawa
keluar dari nukleolus dan akan matang menjadi ribosom fungsional di sitoplasma.
Pada proses translasi RNAm melekat pada lebih dari satu ribosom (poliribosom). Proses translasi
dimulai dengan inisiasi ketika kodon RNA memiliki triplet AUG (codon initiation/CI), kemudian terjadi
proses elongasi, dan diakhiri dengan terminasi ketika kodon RNA memiliki triplet UAA, UGA, dan UAG
(codon terminating/CT) pada saat ini bagian terakhir dari molekul protein disinyalkan dan kemudian
molekul protein ini lepas ke sitoplasma. Protein terbentu berupa protein fungsional ataupun struktural.
Catatan: Pada proses translasi di RE kasar protein terbentuk lebih banyak dilepaskan ke sitoplasma
dibanding ke lumen RE.
Protein
Protein dibentuk dari beberapa asam amino. Asam-asam amino berikatan satu sama lain melalui ikatan
peptida (gugus –OH pada –COOH salah satu asam amino bergabung dengan –H pada –NH2 asam
amino yang lain membentuk air dan tempat yang ditinggalkan tadi bergabung membentuk molekul
protein). Susunan asam amino dalam protein menentukan fungsi protein itu. Protein dapat mempunyai
fungsi struktural, fungsional/enzim, ataupun pengatur yang mengubah tempat transkripsi DNA.
Protein dapat menjadi pengatur, protein jika berikatan dengan penguat akan meningkatkan suatu
ekspresi gen sedangkan jika berikatan dengan peredam maka akan menurunkan proses transkripsi.
Inilah yang menyebabkan kenapa pada tempat-tempat tertentu suatu ekspresi gen akan hilang
contohnya: Sel otot memproduksi protein aktin tapi tidak memproduksi hemoglobin.
Fungsi utama dari DNA adalah sebagai pengatur aktivitas sel namun DNA tidak melakukannya secara
langsung. DNA mentrankripsikan dirinya menjadi RNA. RNA inilah yang berperan secara langsung dalam
pembentukan protein, RNA di dalam ribosom melewati proses translasi, suatu proses penerjemahan
kodon pada RNAr oleh RNAt, yang akan menghasilkan susunan asam amino pembentuk protein. Protein
ini dapat berfungsi sebagai protein struktural, fungsional, maupun pengatur.
DNA adalah komponen dari kehidupan, agar dapat berfungsi maksimal maka DNA harus disalin secara
akurat dan ditransmisikan ke sel anak, dan informasi dalam DNA harus diekspresikan. Jika terjadi
kesalahan dalam proses replikasi, transkripsi, ataupun translasi dapat menyebabkan kesalahan pada
protein yang seharusnya dibentuk dan hal ini akan membuat suatu abnormalitas pada penderitanya.
Selain DNA, sebagian besar sel prokariot dan sel eukariot juga memiliki asam nukleat yang lain yaitu
RNA. RNA singkatan dari ribonucleic acidatau asam ribonukleat. RNA merupakan hasil transkripsi
dari suatu fragmen DNA, sehingga RNA merupakan polimer yang jauh lebih pendek dibanding DNA.
Tidak seperti DNA yang biasanya dijumpai di dalam inti sel, kebanyakan RNA ditemukan di dalam
sitoplasma, terutama di ribosom. Berikut akan diuraikan tentang struktur RNA dan macam RNA.
1. Struktur RNA
Molekul RNA mempunyai bentuk yang berbeda dengan DNA. RNA memiliki bentuk pita tunggal dan
tidak berpilin. Tiap pita RNA merupakan polinukleotida yang tersusun atas banyak ribonukleotida.
Tiap ribonukleotida tersusun atas gula ribosa, basa nitrogen, dan asam fosfat.
Basa nitrogen RNA juga dibedakan menjadi basa purin dan basa pirimidin. Basa purinnya sama
dengan DNA tersusun atas adenin (A) dan guanin (G), sedangkan basa pirimidinnya berbeda dengan
DNA yaitu tersusun atas sitosin (C) dan urasil (U).
Gb. Struktur RNA
Tulang punggung RNA tersusun atas deretan ribosa dan fosfat. Ribonukleotida RNA terdapat secara
bebas dalam nukleoplasma dalam bentuk nukleosida trifosfat, seperti adenosin trifosfat (ATP),
guanosin trifosfat (GTP), sistidin trifosfat (CTP), dan uridin trifosfat (UTP). RNA disintesis oleh DNA di
dalam inti sel dengan menggunakan DNA sebagai cetakannya.
Berikut merupakan perbandingan antara struktur DNA dan struktur RNA
a. 1 – 2 – 3
b. 1 – 3 – 5
c. 1 – 3 – 4
d. 1 – 2 – 5
e. 3 – 4 - 5
2. Pertumbuhan yang terjadi karena adanya kegiatan titik tumbuh di ujung akar dan di ujung batang disebut …
a. Pertumbuhan primer
b. Pertumbuhan sekunder
c. Pertumbuhan tersier
d. Perkecambahan
e. Diferensiasi
a. Epigaeal
b. Hipogaeal
c. Transversal
d. Longitudinal
e. diferensial
4. Kelompok tanaman dibawah ini yang memiliki pola perkecambahan tipe hipogaeal adalah …
a. Jagung, semangka, kacang tanah dan salak
5. Dua kecambah diletakkan di suatu tempat, yang satu terkena cahaya, sedangkan yang lain tidak terkena
cahaya. Kecambah yang diletakkan di tempat gelap jauh lebih panjang daripada kecambah yang diletakkan
di tempat terang. Hal ini menunjukkan bahwa …
Kedua tanaman di atas mendapatkan perlakuan yang berbeda. Tanaman B mendapatkan tambahan hormone
pertumbuhan sedangkan tanaman A tidak. Jenis hormone pertumbuhan yang ditambahkan pada tanaman B
adalah …
a. Auksin
b. Sitokinin
c. Giberelin
d. Asan absisat
e. Gas etilen
a. Hormon auksin berpengaruh sama dengan cahaya matahari dalam proses pertumbuhan tanaman
8. Enzim merupakan biokatalisator di dalam tubuh yang tersusun atas protein. Manakah yang tidak termasuk
sifat enzim?
a. Mengalami denaturasi pada suhu tinggi
e. Bekerja spesifik
9. Manakah dari bahan makanan dibawah ini yang termasuk produk fermentasi?
Fotosintesis terjadi melalui dua tahapan reaksi, yaitu reaksi terang dan reaksi gelap. Kharakteristik reaksi
terang adalah …
a. 1 – 2 – 3
b. 1 – 4 – 5
c. 1 – 3 – 5
d. 2 – 3 – 5
e. 2 – 3 - 6
11.Pada proses reaksi terang fotosintesis, dihasilkan O2 (oksigen) yang berasal dari …
a. CO2 (karbondioksida)
c. C6H12O6 (glukosa)
a. Struktur berupa benang batang, atau bengkok yang mengandung zat yang mudah menerina mengikat
dan menyerap warna
b. Kromosom terdapat dalam inti sel berupa benang-benang tipis yang disebut kromosom
d. Makhluk hidup satu dengan yang lain jumlah kromosom somatiknya tidak sama
14.Bagian dari kromosom yang berfungsi menghindari bersambungnya kromosom satu dengan yang lain
ditunjukkan oleh nomer …
a. Lekukan kedua
b. Sentromer
c. Kromonemata
d. Satelit
e. telomer
a. 1 – 2 – 3 – 4 dan 5
b. 2 – 3 – 4 – 5 dan 1
c. 2 – 3 – 4 – 1 dan 5
d. 4 – 2 – 1 – 3 dan 5
e. 1 – 4 – 2 – 3 dan 5
17.Jumlah kromosom autosom gajah adalah 78 buah. Berapakah jumlah kromosom yang terdapat pada sperma
gajah jantan?
a. 39 buah
b. 39 pasang
c. 40 buah
d. 40 pasang
e. 77 buah
1. Kromosom memendek dan menebal, sentriol membelah dan bergerak ke kutub yang berlawanan
2. Kromosom beristirahat, dan terjadi sitokinesis
3. Membrane inti menghilang, kromosom di susun di bidang tengah oleh benang spindle
4. Dua kromatid bergerak ke kutub-kutub yang berlawanan
a. 1 – 3 – 4 – 2
b. 1 – 4 – 2 – 3
c. 3 – 2 – 4 – 1
d. 3 – 4 – 1 – 2
e. 1 – 2 – 3 - 4
a. A
b. B
c. C
d. D
e. E
a. A
b. B
c. C
d. D
e. E
24.Manakah dari pernyataan dibawah ini yang tidak termasuk pola hereditas tipe gen kodominan?
25.Kelinci betina normal dengan genotip Wchw dikawinkan dengan kelinci jantan himalaya dengan genotp
Whw. Rasio fenotip F1 nya adalah …
26.Pada lalat buah gen warna mata terpaut kromosom seks. Lalat buah jantan bermata putih disilangkan
dengan lalat betina mata merah. Bila F1 disilangkan dengan sesamanya, maka perbandingan lalat bermata
merah dengan lalat bermata putih pada F2 adalah …
a. 1 : 1
b. 1 : 2
c. 3 : 1
d. 1 : 3
e. 2 : 1
27.Pada persilangan AABB dengan aabb menghasilkan F1 semuanya AaBb, dan setelah di uji silang diperoleh
data AB = 897, Ab = 104, aB = 96 dan ab = 903, maka dari keterangan di atas telah terjadi peristiwa pindah
silang dengan nilai NPS sebesar ….
a. 10%
b. 20%
c. 40%
d. 60%
e. 80%
28.Pada manusia factor H menyebabkan kulit hitam, makin banyak factor H ini makin hitam warna warna
kulitnya. Sebaliknya factor h menyebabkan warna kulit putih. Bila individu mengandung semua factor H warna
kulit hitam, 3 H warna kulit coklat tua, 2 H warna kulit sedang, 1 H warna kulit coklat muda. Bila seorang laki-
laki berkulit coklat tua kawin dengan wanita berkulit coklat muda, maka kemungkinan keturunannya adalah …
a. XBXB × XBY
b. XbXb × XbY
c. XbXb × XBY
d. XBXb × XbY
e. XBXb × XBY
a. O
b. AB
c. B homozigot
d. Ahomozigot
e. A atau B homozigot
Petunjuk:
Soal terdiri atas tiga bagian, yaitu pernyataan, kata sebab, dan alas an yang disusun secara berurutan.
Pilihan jawaban adalah sebagai berikut:
A. Jika pernyataan betul, alasan betul, dan keduanya menunjukkan sebab akibat
B. Jika pernyataan betul, alasan betul tapi keduanya tidak menunjukkan sebab akibat
SEBAB
Jawab…
SEBAB
Jawab…
SEBAB
Jika golongan darah A dan B disilangkan hasilnya tidak aka ada golongan darah O
Jawab…
SEBAB
Jawab…
5. Anabolisme adalah, proses penyusunan senyawa sederhana menjadi senyawa kompleks, yang memerlukan energy
SEBAB
Jawab…
Petunjuk:
1. Memrlukan energy
2. Reaksi endergonik
3. Dari sederhana ke kompleks
4. Suhu rendah
Jawab…
2. Susunan DNA…
1. Nitrogen
2. Gugus gula
3. HCL
4. Asam Fosfat
Jawab…
3. Fungsi DNA…
1. Gol. A ( IA IO)
2. Gol. B ( IO IO)
3. Gol. AB ( IA IB )
4. Gol. O ( IB IO)
Jawab…
5. Ciri-Ciri meiosis…
Jawab…