Muat File

Langkah pertama saat menggunakan OVITO adalah memuat data simulasi yang
akan divisualisasikan. OVITO dapat membaca beberapa format file dan akan
mencoba mendeteksi format file secara otomatis.
Untuk memuat hasil simulasi ke dalam OVITO pilih File → Load File command
dari menu utama, atau tombol yang sesuai di toolbar (atau Ctrl + I ).

Buka file output.xyz di OVITO

Pemetaan kolom
Setelah membuka file data, dialog pemetaan kolom file akan muncul,
memungkinkan Anda menetapkan kolom data yang disimpan dalam file ke
properti partikel. Perangkat lunak SKMF default menetapkan kolom secara
otomatis sebagai koordinat x, y, z dan transparansi yang mewakili komposisi.
Dialog dapat diakses juga dengan menekan tombol Edit kolom pemetaan ... di sisi
kanan jendela utama di bagian bawah.
 Memasuki menu pemetaan kolom
Tiga kolom pertama adalah koordinat atom, untuk Posisi pilih ini.
Kolom keempat sesuai dengan komposisi di setiap situs. Pilih Warna,
Transparansi, atau Radius untuk berbagai jenis visualisasi. Klik OK.
Contoh mengubah kolom Transparansi menjadi Warna R (R berarti saluran merah)
Setelah pemetaan kolom File Anda sekarang kembali ke jendela utama OVITO.

Navigasi dan tampilan

Viewports menampilkan tampilan tiga dimensi dari snapshot simulasi yang baru
saja Anda muat. Setiap viewport dapat dipindahkan secara independen. Anda
dapat memutar gambar dengan mengklik kiri di atasnya dan menggerakkan mouse
sambil menekan tombol. Dengan aksi yang sama tetapi dengan mengklik kanan
Anda dapat memindahkan gambar ke atas dan ke kiri. Satu juga dapat
memperbesar viewport di bawah kursor dengan memutar roda mouse. Untuk
memaksimalkan salah satu viewport, klik di atasnya, lalu tekan tombol di
baris bawah. Anda juga dapat menemukan tombol khusus di sana untuk tindakan,
rotasi, terjemahan, dan zoom yang disebutkan di atas.
Satu dapat mengubah radius bola yang mewakili atom dengan mengklik pada
baris Partikel di sisi kanan jendela dan mengubah nilai radius partikel Default.

Area pandang perspektif Maksimal, atom yang diwakili oleh bola dengan radius
1,2, komposisi ditunjukkan sebagai Transparansi

Memuat seri waktu

Sampai sekarang, OVITO hanya menunjukkan keadaan awal dari sistem yang
kami simulasikan. Untuk memuat semua kondisi tercatat dari sistem yang
disimpan dalam file, seseorang harus mengklik pada baris output.xyz [XYZ file]
di sisi kanan jendela, dan centang kotak File berisi opsi deret waktu tepat di atas
kolom Edit memetakan ... tombol.
Memuat setiap kondisi sistem yang tercatat
Setelah langkah ini, Anda dapat menggunakan penggeser di bawah area pandang
untuk memilih keadaan tercatat untuk menampilkan atau menekan tombol putar
berbentuk segitiga untuk menonton keseluruhan proses sebagai animasi.

Pengodean warna
Untuk visualisasi yang lebih baik, Anda dapat menggunakan pengubah kode
Warna. Di sisi kanan jendela, klik menu tarik-turun Tambah modifikasi ... dan
pilih Pengodean warna. Ini memberikan warna ke setiap atom berdasarkan nilai
properti lain dari atom itu. Di sub-menu Properti: pilih properti yang Anda
tetapkan ke kolom komposisi keempat pada langkah pemetaan kolom.
Pilih kode Warna sebagai modifikasi
 Contoh memilih properti Color R sebagai dasar pengkodean Warna
Penting untuk dicatat bahwa pengodean Warna tidak mempengaruhi properti yang
dipilih (kecuali warna, jelas), jadi cara ini dapat mewakili komposisi di situs
seperti misalnya jari-jari dan warna bola pada saat yang sama, opsi mana yang
digunakan dengan bijak dapat menghasilkan angka 3D yang lebih mudah untuk
dipahami dan dipahami.
Satu dapat mengubah gradien warna dari menu drop-down atau bahkan memuat
peta warna kustom. Nilai-nilai yang kedua ujung skala warna mewakili dapat
diubah juga. Setiap nilai yang berada di atas atau di bawah rentang yang diberikan
akan diwakili oleh bagian atas atau bawah dari peta warna, karenanya.

Kode warna menggantikan saluran warna merah antara 0 dan 1 nilai dengan peta
warna Pelangi

Mengiris sampel
Dari beberapa opsi pengubah OVITO kami ingin menyebutkan satu lagi.
Penggeser Slice memotong semua atom pada satu sisi bidang tak terbatas di ruang
angkasa, atau hanya memperlihatkan partikel-partikel dalam irisan dengan lebar
tertentu. Ini dapat digunakan untuk membuat potongan melintang atau irisan
sampel.
Memilih modifikasi Slice
Memotong sampel menjadi dua dengan pengubah Slice
AffineTransformationModifier Affine transformasi
AmbientOcclusionModifier Ambient oklusi
AssignColorModifier Assign color
AtomicStrainModifier Strain atom
BinAndReduceModifier Bin dan kurangi
Analisis BondAngleAnalysisModifier Bond-angle
CalculateDisplacementsModifier Perpindahan vektor
ClearSelectionModifier Hapus seleksi
ColorCodingModifier Kode warna
CombineParticleSetsModifier Menggabungkan set partikel
CommonNeighborAnalysisModifier Analisis tetangga umum
ComputeBondLengthsModifier Hitung panjang ikatan
ComputePropertyModifier Menghitung properti
ConstructSurfaceModifier Bangun jala permukaan
Analisis KoordinasiNumberModifier Koordinasi
KoordinasiPolyhedraModifier Koordinasi polyhedra
CreateBondsModifier Buat obligasi
CreateIsosurfaceModifier Buat isosurface
DeleteSelectedParticlesModifier Hapus partikel yang dipilih
DislokasiAnalysisModifier Analisis dislokasi (DXA)
ExpandSelectionModifier Perluas seleksi
FreezePropertyModifier Freeze properti
HistogramModifier Histogram
IdentifyDiamondModifier Identifikasi struktur berlian
Pilihan InvertSelectionModifier Invert
LoadTrajectoryModifier Load lintasan
ManualSelectionModifier Pemilihan manual
PolyhedralTemplateMatchingModifier pencocokan template Polyhedral
PythonScriptModifier skrip Python
ScatterPlotModifier Scatter plot
SelectParticleTypeModifier Pilih tipe partikel
ShowPeriodicImagesModifier Tampilkan gambar periodik
SliceModifier Slice
Analisis VoronoiAnalysisModifier Voronoi
Analisis VoroTopModifier VoroTop
Analisis WignerSeitzAnalysisModifier Wigner-Seitz cacat
WrapPeriodicImagesModifier Bungkus pada batas-batas periodik