1.

Biosintesis lipid
1.1. Biosintesis asam lemak dan eicosanoid
Pembentukan malonil-KoA
dari asetil-KoA merupakan proses
yang tidak dapat diubah, dikatalisis
oleh asetil-KoA karboksilase.
Enzim bakteri memiliki tiga
subunit polipeptida yang terpisah
(Gambar 1); dalam sel-sel hewan,
ketiga aktivitas adalah bagian dari
polipeptida multifungsi tunggal.
Sel-sel tumbuhan mengandung
kedua jenis asetil-KoA
karboksilase. Dalam semua kasus,
enzim tersebut mengandung gugus Gambar 1. Reaksi Asetil-KoA Karboksilase
prostetik biotin yang secara Sumber: Lehninger, 2008.
kovalen terikat dalam hubungan
amida dengan kelompok e-amino dari residu Lys di salah satu dari tiga polipeptida
atau domain molekul enzim. Reaksi dua langkah yang dikatalisis oleh enzim ini sangat
mirip dengan reaksi karboksilasi yang bergantung pada biotin lainnya, seperti yang
dikatalisis oleh piruvat karboksilase dan propionil-CoA karboksilase. Gugus karboksil,
berasal dari bikarbonat (HCO3-), pertama-tama ditransfer ke biotin dalam reaksi yang
bergantung pada ATP. Kelompok biotinil berfungsi sebagai pembawa sementara CO2,
mentransfernya ke asetil-KoA pada langkah kedua untuk menghasilkan malonil-KoA.
Dalam semua organisme,
rantai karbon panjang asam lemak
berkumpul dalam urutan empat
langkah berulang (Gambar 2),
dikatalisis oleh sistem yang secara
kolektif disebut sebagai sintase
asam lemak. Gugus asil jenuh yang
dihasilkan oleh setiap rangkaian
empat langkah reaksi menjadi
substrat untuk kondensasi Gambar 2. Adisi 2 kaorbon untuk membentuk
selanjutnya dengan gugus malonil lemak asil
teraktivasi. Dengan setiap Sumber: Lehninger, 2008.
perjalanan melalui siklus, rantai asil
lemak diperpanjang oleh dua karbon. Secara singkat, sintesis asam lemak terbagi ke
dalam empat bagian yaitu Kondensasi, Reduksi Grup Karbonil, Dehidrasi, Reduksi
Ikatan Rangkap.
Baik kofaktor pembawa elektron dan gugus pengaktif dalam sekuens anabolik
reduktif berbeda dari yang dalam proses katabolik oksidatif. Ingatlah bahwa dalam
oksidasi, NAD+ dan FAD berfungsi sebagai akseptor elektron dan kelompok pengaktif
adalah kelompok tiol (—SH) dari koenzim A. Sebaliknya, zat pereduksi dalam sekuens
sintetik adalah NADPH dan gugus pengaktif adalah dua gugus yang berbeda-enzim —
SH, seperti yang dijelaskan dalam bagian berikut.
 Palmitat dan stearat
berfungsi sebagai prekursor dari
dua asam lemak tak jenuh
tunggal yang paling umum dari
jaringan hewan: palmitoleat, 16:
1 (∆9), dan oleat, 18: 1 (∆9);
kedua asam lemak ini memiliki
ikatan rangkap cis tunggal
antara C-9 dan C-10. Ikatan
rangkap dimasukkan ke dalam
rantai asam lemak oleh reaksi
oksidatif yang dikatalisis oleh
lemak asil-CoA desaturasi,
suatu oksidase fungsi campuran.
Dua substrat yang berbeda,
asam lemak dan NADH atau
NADPH, secara bersamaan
mengalami oksidasi dua
elektron. Jalur aliran elektron
meliputi sitokrom (sitokrom b5)
dan flavoprotein (sitokrom b5
reduktase), keduanya, seperti
lemak asil-CoA desaturase, Gambar 3. Senyawa Turunan Palmitat
berada di ER halus. Bakteri Sumber: Lehninger, 2008.
memiliki dua reduktase sitokrom
b5, satu tergantung pada NAD dan satu lagi tergantung pada NADPH; yang mana di
antaranya adalah donor elektron utama in vivo tidak jelas. Pada tanaman, oleat
diproduksi oleh desaturase stearoyl-ACP dalam stroma kloroplas yang menggunakan
ferredoxin tereduksi sebagai donor elektron.
Hepatosit mamalia dapat dengan mudah memperkenalkan ikatan rangkap pada
posisi ∆9 asam lemak tetapi tidak dapat memperkenalkan ikatan rangkap tambahan
antara C-10 dan ujung terminal-metil. Jadi mamalia tidak dapat mensintesis linoleat,
18:2 (∆9,12), atau α-linolenate, 18: 3 (∆9,12,15). Namun, tanaman dapat mensintesis
keduanya; desaturases yang memperkenalkan ikatan rangkap pada posisi ∆12 dan ∆15
terletak di ER dan kloroplas. Enzim ER bertindak bukan pada asam lemak bebas tetapi
pada fosfolipid, fosfatidilkolin, yang mengandung setidaknya satu oleat yang terkait
dengan gliserol. Baik tanaman dan bakteri harus mensintesis asam lemak tak jenuh
ganda untuk memastikan fluiditas membran pada suhu yang dikurangi. Karena mereka
adalah prekursor yang diperlukan untuk sintesis produk-produk lain, linoleate dan α-
linolenate adalah asam lemak esensial untuk mamalia; mereka harus diperoleh dari
bahan nabati makanan.

1.2. Biosintesis triasilgriserol

Sebagian besar asam lemak yang disintesis atau dicerna oleh suatu organisme
memiliki satu dari dua nasib: penggabungan ke dalam triasilgliserol untuk
penyimpanan energi metabolik atau penggabungan ke dalam komponen membran
fosfolipid. Pemartisian antara nasib
alternatif ini tergantung pada kebutuhan
organisme saat ini. Selama pertumbuhan
yang cepat, sintesis membran baru
membutuhkan produksi fosfolipid
membran; ketika suatu organisme memiliki
persediaan makanan berlimpah tetapi tidak
tumbuh secara aktif, ia mencurahkan
sebagian besar asam lemaknya menjadi
lemak penyimpanan. Kedua jalur dimulai
pada titik yang sama: pembentukan ester
asil lemak dari gliserol. Pada bagian ini
membahas rute ke triasilgliserol dan
peraturannya, dan produksi gliserol 3-fosfat
dalam proses gliseroneogenesis.
Hewan dapat mensintesis dan
menyimpan triasilgliserol dalam jumlah
besar, untuk digunakan nanti sebagai bahan
bakar. Manusia dapat menyimpan hanya
beberapa ratus gram glikogen di hati dan
otot, hampir tidak cukup untuk memasok
kebutuhan energi tubuh selama 12 jam.
Sebaliknya, jumlah total triasilgliserol yang
tersimpan dalam tubuh rata-rata 70 kg
adalah sekitar 15 kg, cukup untuk
mendukung kebutuhan energi basal selama
12 minggu. Triasilgliserol memiliki
kandungan energi tertinggi dari semua
nutrisi yang tersimpan. Kapan pun
karbohidrat dicerna melebihi kapasitas Gambar 3. Pembentukan
organisme untuk menyimpan glikogen, Phosphatidic Acid
kelebihannya diubah menjadi triasilgliserol Sumber: Lehninger, 2008.
dan disimpan dalam jaringan adiposa.
Tanaman juga memproduksi triasilgliserol sebagai bahan bakar yang kaya energi,
terutama disimpan dalam buah-buahan, kacang-kacangan, dan biji-bijian.
Dalam jaringan hewan, triasilgliserol dan gliserofosfolipid seperti
phosphatidylethanolamine berbagi dua prekursor (fatty acyl-CoA dan L-glycerol 3-
phosphate) dan beberapa langkah biosintesis. Sebagian besar gliserol 3-fosfat berasal
dari glikolitik menengah dihidroksiaseton fosfat (DHAP) melalui kerja sitokolik NAD-
linked gliserol 3-fosfat dehidrogenase; di hati dan ginjal, sejumlah kecil gliserol 3-
fosfat juga terbentuk dari gliserol oleh aksi gliserol kinase. Prekursor lain dari
triasilgliserol adalah lemak asil-CoA, dibentuk dari asam lemak oleh asil-CoA
sintetase, enzim yang sama yang bertanggung jawab untuk aktivasi asam lemak untuk
oksidasi β.
Tahap pertama dalam biosintesis triasilgliserol adalah asilasi dari dua gugus
hidroksil bebas Lgliserol 3-fosfat oleh dua molekul lemak asil-KoA untuk
 menghasilkan diasilgliserol 3-fosfat, lebih
umum disebut asam fosfatidat atau
fosfatidat. Asam fosfatidik hanya ada
dalam jumlah jejak dalam sel tetapi
merupakan perantara tengah dalam
biosintesis lipid; dapat dikonversi menjadi
triasilgliserol atau gliserofosfolipid. Dalam
jalur menuju triasilgliserol, asam fosfatidat
dihidrolisis oleh asam fosfatidat fosfatidat
untuk membentuk 1,2-diasilgliserol.
Diasilgliserol kemudian dikonversi
menjadi triasilgliserol melalui
transesterifikasi dengan asil lemak-CoA
ketiga.Biosintesis kolesterol, steroid dan
isoprenoid.
Glyceroneogenesis adalah versi
Gambar 4. Pembentukan
singkat dari glukoneogenesis, dari piruvat
Triasilgliserol
menjadi DHAP, diikuti oleh konversi
Sumber: Lehninger, 2008.
DHAP menjadi gliserol 3-fosfat oleh
sitokolik NAD-linked gliserol 3-fosfat dehydrogenase. Gliserol 3-fosfat selanjutnya
digunakan dalam sintesis triasilgliserol. Glyceroneogenesis ditemukan pada 1960-an
oleh Lea Reshef, Richard Hanson, dan John Ballard, dan secara bersamaan oleh
Eleazar Shafrir dan rekan-rekan kerjanya, yang tertarik dengan kehadiran dua enzim
glukoneogenik, piruvat karboksilase dan fosfoenolpiruvat carboxykinase, dalam
jaringan adiposa, di mana glukosa tidak disintesis. Setelah periode yang lama tidak
diperhatikan, minat pada jalur ini telah diperbarui dengan menunjukkan hubungan
antara gliseroneogenesis dan diabetes yang mulai lambat (tipe 2), seperti yang akan
kita lihat.
Gliseroneogenesis memiliki banyak peran. Dalam jaringan adiposa,
gliseroneogenesis digabungkan dengan reesterifikasi asam lemak bebas mengontrol
laju pelepasan asam lemak ke darah. Dalam jaringan adiposa coklat, jalur yang sama
dapat mengontrol laju di mana asam lemak bebas dikirim ke mitokondria untuk
digunakan dalam termogenesis (lihat Gambar 19-34). Dan pada manusia yang
berpuasa, gliseroneogenesis di hati saja mendukung sintesis gliserol 3-fosfat yang
cukup untuk menjelaskan hingga 65% asam lemak yang diesterifikasi menjadi
triasilgliserol. Aliran melalui siklus triasilgliserol antara hati dan jaringan adiposa
dikendalikan sebagian besar oleh aktivitas PEP karboksibase, yang membatasi laju
glukoneogenesis dan gliseroneogenesis.

1.3. Biosintesis Membran Phospolipid

Langkah pertama sintesis gliserofosfolipid dibagi dengan jalur menuju
triasilgliserol, (Gambar 4) dua gugus asil lemak diesterifikasi menjadi C-1 dan C-2
dari L-gliserol 3-fosfat untuk membentuk asam fosfatidat. Umumnya tetapi tidak
selalu, asam lemak pada C-1 jenuh dan bahwa pada C-2 tidak jenuh. Rute kedua
menuju asam fosfatidat adalah fosforilasi diasilgliserol oleh kinase spesifik.
 Kelompok kepala polar
gliserofosfolipid dilekatkan
melalui ikatan fosfodiester, di
mana masing-masing dari dua
hidroksil alkohol (satu pada
kelompok kepala polar dan satu
pada C-3 gliserol) membentuk
ester dengan asam fosfat. Dalam
proses biosintesis, salah satu
hidroksil pertama kali diaktifkan
oleh perlekatan nukleotida,
cytidine diphosphate (CDP).
Sitidin monofosfat (CMP)
kemudian dipindahkan dalam
serangan nukleofilik oleh hidroksil Gambar 5. Strategi penempelan fosfat
lain (Gbr. 21-24). CDP dilekatkan Sumber: Lehninger, 2008.
pada diasilgliserol, membentuk asam fosfatidat teraktivasi CDP-diasilgliserol (strategi
1), atau pada hidroksil kelompok kepala (strategi 2). Sel-sel eukariotik menggunakan
kedua strategi, sedangkan bakteri hanya menggunakan yang pertama. Pentingnya inti
nukleotida sitidin dalam biosintesis lipid ditemukan oleh Eugene P. Kennedy pada
awal 1960-an.
Strategi pertama untuk perlekatan kelompok kepala diilustrasikan oleh sintesis
fosfatidilserin, fosfatidletanolamin, dan fosfatidilgliserol dalam E. coli. Diacylglycerol
diaktifkan dengan kondensasi asam fosfatidat dengan cytidine triphosphate (CTP)
untuk membentuk CDP-diacylglycerol, dengan eliminasi pirofosfat (Gbr.21–25).
Pemindahan CMP melalui serangan nukleofilik oleh gugus hidroksil serin atau oleh
hidroksil C-1 gliserol 3-fosfat masing-masing menghasilkan fosfatidilserin atau
fosfatidilgliserol 3-fosfat. Yang terakhir diproses lebih lanjut dengan pembelahan
monoester fosfat (dengan melepaskan Pi) untuk menghasilkan fosfatidilgliserol.
Phosphatidylserine dan phosphatidylglycerol dapat berfungsi sebagai prekursor dari
lipid membran lain pada bakteri (Gbr. 21-25). Dekarboksilasi gugus serin dalam
fosfatidilserin, dikatalisis oleh fosfatidilserin dekarboksilase, menghasilkan
fosfatidiletanolamina. Dalam E. coli, kondensasi dua molekul fosfatidilgliserol,
dengan eliminasi satu gliserol, menghasilkan kardiolipin, di mana dua diasilgliserol
bergabung melalui kelompok kepala yang sama.

1.4. Biosintesis Kolesterol, Steroid, dan Isoprena

Kolesterol, seperti asam lemak rantai panjang, terbuat dari asetil-KoA, tetapi
rencana perakitannya sangat berbeda. Dalam percobaan awal, hewan diberi makan
asetat berlabel 14C baik dalam karbon metil atau karbon karboksil. Pola pelabelan
dalam kolesterol yang diisolasi dari dua kelompok hewan memberikan cetak biru
untuk mengerjakan langkah-langkah enzimatik dalam biosintesis kolesterol. Sintesis
berlangsung dalam empat tahap, seperti yang ditunjukkan pada Gambar 6: 1.
kondensasi dari tiga unit asetat untuk membentuk zat antara enam karbon, mevalonate;
2. konversi mevalonate menjadi unit isoprene teraktivasi; 3. polimerisasi enam unit
isoprene 5-karbon untuk membentuk squalene linier 30-karbon; dan 4. siklisasi
squalene untuk membentuk empat cincin inti
steroid, dengan serangkaian perubahan lebih lanjut
(oksidasi, penghilangan atau migrasi kelompok
metil) untuk menghasilkan kolesterol.
Tahap pertama dalam biosintesis kolesterol
mengarah ke mevalonate menengah. Dua molekul
asetil-KoA mengembun untuk membentuk
asetoasetil-KoA, yang mengembun dengan
molekul ketiga asetil-KoA untuk menghasilkan
senyawa enam-karbon β-hidroksi-β-metilglutaryl-
KoA (HMG-KoA). Dua reaksi pertama ini
dikatalisis oleh tiolase dan HMG-CoA sintase.
Sintase HMG-CoA sitosolik dalam jalur ini
berbeda dari isozim mitokondria yang
mengkatalisis sintesis HMG-CoA dalam
pembentukan tubuh keton . Reaksi ketiga adalah
langkah komitmen dan pembatasan tingkat:
pengurangan HMG-CoA menjadi mevalonate, dan
karenanya masing-masing dari dua molekul
NADPH menyumbangkan dua elektron.
Reduktase HMG-CoA, protein membran integral
dari ER halus, adalah titik utama regulasi pada
jalur menuju kolesterol, seperti yang akan kita
Gambar 6. Sistesis Kolesterol
lihat. Sumber: Lehninger, 2008.
Tahap 2 Konversi Mevalonat menjadi Dua
Isopren Aktif. Pada tahap berikutnya sintesis kolesterol, tiga kelompok fosfat
ditransfer dari tiga molekul ATP untuk mevalonate. Fosfat yang melekat pada gugus
hidroksil C-3 mevalonat dalam zat antara 3-fosfo-5-pirofosfomvalonat adalah
kelompok yang baik; pada langkah berikutnya, baik fosfat ini dan gugus karboksil
terdekat pergi, menghasilkan ikatan rangkap dalam produk lima karbon, ∆3-
isopentenyl pirofosfat. Ini adalah isopren teraktivasi pertama dari pusat pembentukan
kolesterol. Isomerisasi ∆3-isopentenil pirofosfat menghasilkan isoprena teraktivasi
kedua, dimetilalil pirofosfat. Sintesis isopentenyl pirofosfat dalam sitoplasma sel
tanaman mengikuti jalur yang dijelaskan di sini. Namun, kloroplas tanaman dan
banyak bakteri menggunakan jalur independen mevalonate. Jalur alternatif ini tidak
terjadi pada hewan, sehingga merupakan target yang menarik untuk pengembangan
antibiotik baru.
Tahap 3 Kondensasi Enam Unit Isoprene Aktif untuk Membentuk Squalene.
Isopentenyl pyrophosphate dan dimethylallyl pyrophosphate sekarang menjalani
kondensasi head-to-tail, di mana satu pirofosfat gugus dipindahkan dan rantai 10-
karbon, geranyl pirofosfat, dibentuk. ("Kepala" adalah ujung dari mana pirofosfat
bergabung.) Geranyl pirofosfat mengalami kondensasi head-to-tail lain dengan
isopentenyl pirofosfat, menghasilkan 15 karbon farnesyl pirofosfat antara 15 karbon
menengah. Akhirnya, dua molekul farnesyl pirofosfat bergabung head to head, dengan
eliminasi kedua kelompok pirofosfat, untuk membentuk squalene. Nama-nama umum
perantara ini berasal dari sumber dari mana mereka pertama kali diisolasi. Geraniol,
komponen minyak mawar, memiliki aroma geranium, dan farnesol adalah senyawa
aromatik yang ditemukan pada bunga pohon akasia Farnese. Banyak aroma alami yang
berasal dari tumbuhan disintesis dari unit isoprena. Squalene, pertama kali diisolasi
dari hati hiu (genus Squalus), memiliki 30 karbon, 24 di rantai utama dan 6 dalam
bentuk cabang kelompok metil.
Tahap 4 Konversi Squalene ke Cincin Empat. Nukleus Steroid Ketika molekul
squalene direpresentasikan seperti dalam, hubungan struktur liniernya dengan struktur
siklik sterol menjadi jelas. Semua sterol memiliki empat cincin gabungan yang
membentuk nukleus steroid, dan semuanya adalah alkohol, dengan gugus hidroksil di
C-3 — demikian nama "sterol." Aksi squalene monooxygenase menambahkan satu
atom oksigen dari O2 ke ujung rantai squalene, membentuk epoksida. Enzim ini adalah
NADPH oksidase fungsi campuran lainnya yang mengurangi atom oksigen lain dari
O2 menjadi H2O. Ikatan rangkap produk, squalene 2,3-epoksida, diposisikan
sedemikian rupa sehingga reaksi terpadu yang luar biasa dapat mengubah linear
squalene epoksida menjadi struktur siklik. Pada sel-sel hewan, siklisasi ini
menghasilkan pembentukan lanosterol, yang mengandung empat cincin karakteristik
dari inti steroid. Lanosterol akhirnya dikonversi menjadi kolesterol dalam serangkaian
sekitar 20 reaksi yang mencakup migrasi beberapa kelompok metil dan penghapusan
yang lain. Penjelasan tentang jalur biosintesis yang luar biasa ini, salah satu yang
paling kompleks yang diketahui, dilakukan oleh Konrad Bloch, Feodor Lynen, John
Cornforth, dan George Popják pada akhir 1950-an.
Sintesis hormon steroid membutuhkan
pengangkatan sebagian atau semua karbon dalam "rantai
samping" pada C-17 dari cincin D kolesterol.
Pengangkatan rantai samping terjadi di mitokondria
jaringan steroidogenik. Penghapusan melibatkan
hidroksilasi dari dua karbon yang berdekatan di rantai
samping (C-20 dan C-22) diikuti oleh pembelahan ikatan
di antara mereka. Pembentukan berbagai hormon juga
melibatkan pengenalan atom oksigen. Semua reaksi
hidroksilasi dan oksigenasi dalam biosintesis steroid
dikatalisis oleh fungsi campuran oksidasi yang
menggunakan NADPH, O2, dan sitokrom mitokondria P-
450.
Selain perannya sebagai perantara dalam Gambar 6. Hormon steroid
biosintesis kolesterol, isopentenyl pirofosfat adalah turunan kolesterol
Sumber: Lehninger, 2008.
prekursor teraktivasi dari sejumlah besar biomolekul
dengan beragam peran biologis (Gbr. 21-47). Mereka termasuk vitamin A, E, dan K;
pigmen tanaman seperti karoten dan rantai phytol klorofil; karet alam; banyak minyak
atsiri (seperti prinsip harum minyak lemon, eucalyptus, dan musk); hormon remaja
serangga, yang mengendalikan metamorfosis; dolichol, yang berfungsi sebagai
pembawa yang larut dalam lemak dalam sintesis polisakarida kompleks; dan
ubiquinone dan plastoquinone, pembawa elektron dalam mitokondria dan kloroplas.
Secara kolektif, molekul-molekul ini disebut isoprenoid. Lebih dari 20.000 molekul
isoprenoid yang berbeda telah ditemukan di alam, dan ratusan yang baru dilaporkan
setiap tahun.
 Prenilasi (perlekatan kovalen dari isoprenoid)
adalah mekanisme umum dimana protein berlabuh
ke permukaan bagian dalam membran sel pada
mamalia. Dalam beberapa protein ini, lipid yang
menempel adalah kelompok farnesyl 15-karbon;
yang lain memiliki kelompok geranylgeranyl 20-
karbon. Enzim yang berbeda menempel dua jenis
lipid. Ada kemungkinan bahwa reaksi prenilasi
menargetkan protein ke membran yang berbeda,
tergantung pada lipid yang menempel. Prenilasi
protein adalah peran penting lainnya untuk turunan
isoprena dari jalur menuju kolesterol.
Gambar 7. Gambaran
biosintesis isoprenoid
Sumber: Lehninger, 2008.