Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry 2018; 7(1): 968-973

Pradesh, India

E-ISSN: 2278-4136
P-ISSN: 2349-8234
JPP 2018; 7(1): 968-973
Received: 21-11-2017
Accepted: 22-12-2017

Seema Verma
Department of Soil Science
and
Water Management,
College of
Forestry, University of
Horticulture and Forestry-
Nauni, Solan, Himachal
Pradesh, India

Rashmi Sharma
Assistant Professor,
Department
of Microbiology, DAV
University
Jalandhar, Punjab, India

Anjali Chauhan
Assistant Professor,
Department
of Soil Science and Water
Management, College of
Forestry, University of
Horticulture and Forestry-
Nauni, Solan, Himachal
Pradesh, India

Correspondence
Anjali Chauhan
Assistant Professor,
Department
of Soil Science and Water
Management, College of
Forestry, University of
Horticulture and Forestry-
Nauni, Solan, Himachal
 menunjukkan kolonisasi Bacillus sp. bersama dengan Pseudomonas sp., Enterobacter sp., Acinetobacter
sp. dan beberapa bakteri pelarutkan-P yang tidak teridentifikasi dalam rhizosfer tomat.

Kata kunci: Rhizobacteria, pelarutan fosfat, aktivitas antijamur

Pendahuluan
Tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) merupakan keluarga Solanaceae, adalah tanaman sayur
yang paling banyak dibudidayakan setelah kentang dan India adalah salah satu produsen tomat
terbesar di dunia dengan produksi hampir 1, 87, 35.900 metrik ton (MT) pada area budidaya
Plant growth seluas 8, 82.000 ha (FAO, 2010). Area yang ditanami tomat dalam HP adalah 29.420 ha
dengan produksi 6, 27.280 MT. Himachal Pradesh hanya merupakan 3,35% dari total produksi
promoting and tomat di negara tersebut (NHB, 2014).
antagonistic Produksi tomat berkelanjutan dibatasi di seluruh dunia oleh penyakit dan hama. Rhizoctonia
solani dan Fusarium oxysporum, sebuah patogen jamur yang ditularkan melalui tanah dari
potential of kedua rumah kaca dan tomat yang ditanam di dunia. Fusarium Layu tomat yang disebabkan
indigenous oleh Fusarium oxysporum. f.sp. lycopersici dan Rhizoctonia solani menyebabkan redaman,
kanker, pembusukan akar, pembusukan buah, penyakit dedaunan, menyebabkan kerugian
PGPR from ekonomi yang serius (Sasirekha et al. 2012).
Variasi yang tak berujung dan kompleksitas dari banyak penyakit tanaman yang disebabkan
tomato oleh jamur telah menyebabkan perkembangan sejumlah besar fungisida; sayangnya beberapa
seedlings patogen tanaman telah mengembangkan resistensi terhadap fungisida tertentu (Agrios, 2005).
Selain itu, penggunaan bahan kimia memiliki efek buruk terhadap lingkungan dan organisme
grown in mid non-target. Oleh karena itu, pengembangan alat biologis yang efektif yang dapat menggantikan
hill regions of agrokimia yang sangat lazim yaitu pupuk kimia dan pestisida diperlukan untuk kemajuan
dalam praktik pertanian berkelanjutan. Penelitian PGPR merupakan upaya yang terbukti
Himachal menjadi strategi yang menjanjikan (Adesemoye et al. 2008; Zaidi et al. 2009).
Pradesh Mempromosikan pertumbuhan rhizobacteria (PGPR) yang menawarkan pendekatan yang
ramah lingkungan untuk meningkatkan produksi dan kesehatan tanaman. Mereka memberikan
efek menguntungkan pada tanaman dengan mengkolonisasi akar dan merangsang pertumbuhan
Seema Verma, tanaman secara keseluruhan dengan meningkatkan perkecambahan biji, kemunculan tanaman,
perkembangan akar, nutrisi mineral, pemanfaatan air dan biokontrol patogen tanaman
Rashmi Sharma and (Egamberdiyeva dan Hoflich 2004; Siddiqui 2006). Oleh karena itu, sangat penting untuk
Anjali Chauhan mengisolasi dan menyaring galur asli PGPR dari bibit tomat sebagai pemacu pertumbuhan dan antagonis
tanaman, yang dapat digunakan, sebagai bio-inokulan untuk meningkatkan pertumbuhan dan hasil panen
Abstract tanaman tersebut. Mengingat daerah pertumbuhan tomat yang berbeda yang salah satunya berada di
bawah rentang tengah Himachal Pradesh, India ditambang untuk isolasi isolat rhizobakteri yang efisien.
Sebanyak 859 rhizobacteria
Strain rhizobacterial yang terisolasi selanjutnya disaring untuk meningkatkan pertumbuhan tanaman dan
dan 574 isolat
potensi biokontrol terhadap patogen jamur tomat.
endorhizobacterial diperoleh
dari lokasi penanaman tomat
yang berbeda di Himachal ~ 968 ~
Pradesh, India.. Populasi rhizo
dan endorhizobacteria yang
dominan sehubungan dengan
lokasi menunjukkan variasi
dan pertumbuhan populasi
mereka, diamati lebih baik
pada nutrien agar
dibandingkan dengan media
Pikovskaya. Semua isolat
disaring untuk percobaan
pemacu pertumbuhan tanaman
dan hanya 17 isolat yang
ditemukan sebagai pelarut
fosfat yang efisien dengan 15
mm atau lebih pembentukan
zona halo pada media PVK.
Isolat efisien ini selanjutnya
disaring untuk memperbaiki
nitrogen atmosfer dengan
menumbuhkannya pada media
bebas nitrogen serta untuk
aktivitas anti-jamur terhadap
dua patogen jamur tomat yaitu
Fusarium oxysporum dan
Rhizoctonia solani. Dari
keseluruhan total bakteri,
58,82% ditemukan sebagai
pemecah nitrogen sementara
52,94% menunjukkan
penghambatan terhadap
patogen yang ditularkan
melalui tanah. Karakterisasi
morfologis dan biokimia
Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry
Materi dan Metode
Lokasi Penelitian dan pengumpulan sampel
Untuk pengumpulan sampel tanah dan akar rizosfer dipilih
tujuh lokasi penanaman tomat yang berbeda di Himachal
Pradesh, India yang berada di bawah daerah pertengahan
bukit, yaitu Fagu (Rajgarh), Habbni pull, Tickri, Pandha,
Gaura, Chail dan Nando. Sampel tanah / akar komposit
ditempatkan dalam kantong plastik dan disimpan di bawah
kondisi pendingin.
Isolasi rhizobacteria
Pada rhizosphere tomat, 10 gram tanah (rhizosphere / bulk)
ditimbang dan dicampur dengan 90 ml air suling steril dalam
250 ml labu kerucut. Labu diguncang dengan kuat selama 5
hingga 10 menit untuk membentuk suspensi yang homogen.
Campuran tanah tersebut kemudian dibiarkan mengendap
selama 10-15 menit sebelum diproses lebih lanjut. Suspensi
diencerkan secara seri dan pengenceran disepuhkan (Wollum
1982) pada nutrient agar (NA) dan medium agar Pikovskaya
(PVK), secara terpisah dengan tiga ulangan pada setiap
kalinya. Pelat diinkubasi pada suhu 28 ± 2 0C selama 24-72
jam dan jumlah dinyatakan dalam cfu g-1.
Isolasi endorhizobacteria
Untuk isolasi endo-rhizobacteria, akar dicuci secara
menyeluruh di bawah air keran untuk menghilangkan partikel
tanah yang melekat dan kemudian permukaan disterilkan
dengan merendamnya kedalam etanol 80% selama 3-4 menit.
Akar kemudian dicelupkan dalam buffer fosfat 0,05 M steril,
pH 7,0 selama 30 menit dan terakhir, dicuci 3 kali dengan air
suling. Akar kemudian dipotong kecil-kecil dan di basahkan
dalam buffer yang sama menggunakan lesung dan alat
penumbuk yang telah disterilkan (Patel dan Desai 2015).
Suspensi diencerkan dan dibagi menjadi 10 lipatan dan
jumlah bakteri dinyatakan dalam cfu g-1.
Kualitatif solubilisasi fosfat
Aktivitas pelarutan fosfat primer dari isolat bakteri diuji
dengan menggoreskannya pada pelat agar agar Pikovskaya
kemudian pelat diinkubasi pada suhu 37°C selama 72 jam.
Kelarutan bakteri fosfor ditunjukkan dengan zona berwarna
kuning yang diproduksi di sekitar koloni bakteri yang
terisolasi (Pikovskaya 1948).
Penilaian kuantitatif pelarut fosfat
Perkiraan kuantitatif P oleh isolat bakteri potensial dilakukan
dengan menginokulasi 50 ml kaldu Fosfat (NBRIP) Institut
Penelitian Nasional Botani (Nautiyal 1999), ditambah dengan
0,5 persen tricalcium fosfat (TCP) dan diinkubasi selama 11
hari dalam kondisi terguncang pada 28 ± 2 ° C. Kandungan
fosfat anorganik dalam supernatant ditentukan secara
spektrofotometri dengan metode warna kuning vanado-
molybdate (Jackson 1973). Jumlah P yang dilarutkan
diekstrapolasi dari kurva standar kalium dihidrogen ortofosfat
dan dinyatakan sebagai μ g ml-1 di atas kontrol.
Kemampuan tumbuh di media bebas nitrogen
Satu lingkaran dari pengkultur selama 24 jam dari masing-
masing isolat direaksikan pada media agar glukosa bebas
nitrogen dan diinkubasi pada 28 ± 2 °C selama 24-28 jam.
Pertumbuhan bakteri di piring menunjukkan kemampuan
mengikat nitrogen dari isolat (Jensen, 1987).
Aktivitas antagonis bakteri terhadap patogen jamur
Aktivitas antagonis isolat bakteri diuji terhadap Fusarium
oxysporum dan Rhizoctonia solani menggunakan metode
agar-agar (Berg et al. 2000). Isolat rhizobakteri digoreskan
pada satu tepi pelat kentang dekstrosa agar (PDA) yang
~ 969 ~
mengandung 5 mm colokan miselium di bagian tengah dan
penghambatan pertumbuhan dihitung setelah 5 hingga 7 hari
inkubasi pada suhu 28±2 °C selama 5 hari dengan
menggunakan metode yang dijelaskan oleh Vincent, (1947).
Karakterisasi morfologis dan metabolisme isolat bakteri
Karakterisasi morfo-biokimia isolat bakteri dilakukan
berdasarkan morfologi koloni, pemeriksaan mikroskopis, dan
uji biokimia. Karakterisasi dibuat sesuai dengan Bergey's
Manual of Systematic Bacteriology (Vos et al., 2009).
Hasil
Isolasi dan enumerasi bakteri rhizo dan endorhizospher
Tanah dan tomat yang dikumpulkan dari lokasi yang berbeda
menjadi sasaran isolasi dan penghitungan pada nutrien agar
dan medium agar Pikovskaya dan hasilnya dinyatakan sebagai
cfu g-1 dari seluruh tanah dan sistem akar.
Populasi bakteri rizosfer ditemukan paling tinggi pada Pandha
(200 × 105 cfu g-1 tanah) sementara Chail memiliki jumlah
rhizobakteri terendah (50 × 105 cfu g-1 tanah) pada media
nutrient agar (Tabel 1). Persentase bakteri pelarut fosfat untuk
situs yang berbeda berkisar antara 32-100%, dengan
persentase tertinggi di Chail serta Nando (100%) dan terendah
di Gaura (32%). Kecuali Fagu dan Gaura, lima lokasi lainnya
memiliki 50% atau lebih populasi bakteri pelarut-P.
Populasi endorhizobacterial lebih banyak pada nutrien agar
daripada media Pikovskaya sehingga menunjukkan bahwa
nutrien agar lebih tepat untuk isolasi bakteri endofit daripada
medium Pikovskaya. Pada nutrien agar, populasi
endorhizobacterial tertinggi (200 × 105 cfu g-1) diperoleh di
Fagu dan terendah di Gaura (19 × 105 cfu g-1). Demikian pula
pada agar Pikovskaya, populasi endorhizobacterial maksimum
diperoleh dari Fagu (150 × 105 cfu g-1) dan tidak ada
endorhizobacteria yang diperoleh dari tarikan Habbni, Tickri
dan Pandha yang mungkin disebabkan oleh tidak adanya
substrat di lokasi-lokasi ini. Zona halo bening yang
membentuk bakteri pelarut P ditemukan paling tinggi di
Gaura dan Chail (100%) diikuti oleh Fagu (93%) dan Nando
(88%).
Pertumbuhan tanaman mempromosikan karakteristik
isolat bakteri
Pelarut fosfat (PSB) telah dipertimbangkan sebagai salah satu
alternatif yang mungkin untuk memediasi pelarutan fosfat
anorganik dan meningkatkan ketersediaannya bagi tanaman.
Dari 278 rhizobacteria pelarut P dan 200 endorhizobacteria,
hanya 17 isolat yang ditemukan sebagai pelarut P potensial
dan menunjukkan pembentukan zona halo lebih dari 15 mm
pada agar PVK (data tidak ditampilkan). 17 bakteri pelarut-P
yang efisien ini selanjutnya disaring untuk penilaian
kuantitatif pelarut P dengan menggunakan kaldu NBRIP yang
ditambah dengan 0,5 persen TCP selama 11 hari inkubasi
(Tabel 3).
Kelarutan TCP oleh isolat ini berkisar antara 112,21-667,17
μg ml-1 (Tabel 3). Peningkatan pelarut P diamati selama 5-7
hari inkubasi kemudian setelah itu diamati penurunannya.
Tingkat pelarutan P tertinggi secara signifikan adalah 667,17
μg ml-1 ditunjukkan oleh isolat TX-II setelah 7 hari inkubasi
diikuti oleh PZ-I dan HB yang menunjukkan pelarutan P
masing-masing 601,33 dan 557,17 μg ml-1. Pelarutan P
minimum yaitu 112,21 μg ml -1 tercatat dalam isolat TX-III
setelah 3 hari inkubasi.
Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry
Pada 17 strain bakteri pelarut-P yang dipilih disaring
kemudian diuji kemampuannya untuk dapat tumbuh pada
medium bebas nitrogen dan hanya 10 yang mampu tumbuh
pada medium bebas nitrogen. Strain yang dipilih juga disaring
untuk antibiosis in vitro terhadap jamur patogen yaitu,
Fusarium oxysporum dan Rhizoctonia solani (Tabel 4). Dari
tujuh belas, 10 isolat (58,82%) menunjukkan tindakan
penghambatan terhadap Fusarium oxysporum dan sembilan
isolat (52,94%) menghambat Rhizoctonia solani. Terhadap
Fusarium oxysporum, aktivitas antagonis tertinggi
ditunjukkan oleh strain TX-II (62,00%), sedangkan terhadap
Rhizoctonia solani, penghambatan tertinggi diberikan oleh
strain PZ-I (54,44%).
Karakterisasi Morfo-biokimia dari isolat PSB yang efisien
Isolat dengan efisiensi soulbization fosfat maksimum
dikarakterisasi secara tentatif berdasarkan karakteristik
morfologis dan biokimia (Tabel 5). Mayoritas isolat adalah
bakteri gram positif, berbentuk batang, motil dan endospore.
Semua isolat ini bersifat positif untuk katalase dan negatif
untuk tes MR. Isolat bakteri secara tentatif diidentifikasi
sebagai spesies Pseudomonas, Bacillus, Enterobacter,
Enterococcus, Acinetobacter sesuai kriteria Bergey's Mannual
of Systematic Bacteriology. Namun, beberapa spesies tetap
tidak teridentifikasi.
Diskusi
Rhizosphere adalah medan perang interaksi antara
mikroorganisme dan akar tanaman. Wilayah tanah ini jauh
lebih kaya bakteri daripada sebagian besar tanah di sekitarnya
(Hiltner 1904). Rhizobacteria dianggap sebagai komunitas
mikrobiota paling penting yang pada dasarnya meningkatkan
pertumbuhan tanaman dengan mengubah seluruh struktur
komunitas mikroba dan melindungi akar tanaman terhadap
berbagai fitopatogen (Benizri et al. 2001). Daerah penanaman
tomat pertengahan bukit di Himachal Pradesh, India sedikit
dieksplorasi sehubungan dengan keragaman PGPR. Sejauh ini
telah ada upaya-upaya yang dapat diabaikan untuk
mempelajari pertumbuhan tanaman yang mempromosikan
sifat-sifat dan keanekaragaman PGPR yang terkait dengan
tomat yang ditanam di daerah pegunungan bagian tengah
negara bagian.
Oleh karena itu dalam penelitian ini, rhizobacteria dan endo
rhizobacteria diisolasi dari tanah dan sampel akar tomat yang
tumbuh di tujuh lokasi yang berbeda pada District Solan dan
Sirmaur di Himachal Pradesh, India. Sebanyak 859
rhizobacteria dan 574 endorhizobacteria diisolasi pada agar-
NA, di mana 278 rhizobacteria dan 200 bakteri
endorhizospheric ditemukan sebagai pelarut-P. Bakteri pelarut
fosfat (PSB) meningkatkan ketersediaan P untuk tanaman
dengan memineralisasikan P organik dan melarutkan fosfat
endapan yang ada di dalam tanah (Rodriguez et al. 2006).
Dalam penelitian ini, persentase tertinggi rizobakteria pelarut-
P mungkin dikuatkan dengan banyaknya substrat P yang tidak
larut di lokasi pengambilan sampel (Arjun dan Harikrishnan,
2011). Zona halo bening yang membentuk bakteri pelarut P
tertinggi ditemukan di Gaura dan Chail diikuti oleh Fagu dan
Nando. Dari 278 rhizobacteria pelarut P dan 200
endorhizobacteria, hanya 17 yang pelarut P efisien dan
menunjukkan zona halo yang jelas lebih dari 15 mm pada
agar PVK. Diameter zona halo tergantung pada sifat,
kuantitas dan laju difusi asam organik yang dihasilkan oleh
mikroorganisme ke dalam media yang ada disekitarnya.
~ 970 ~
(Vessey, 2003). 17 bakteri pelarut P yang efisien ini
selanjutnya disaring untuk estimasi kuantitatif pelarutan P
menggunakan kaldu NBRIP.
Ranjan et al. (2013) juga mengisolasi PSB dari sampel tanah
yang berbeda dan memilih 12 isolat PSB yang efisien pada
kemampuan mereka untuk membentuk zona bening pada
media agar Pikovskaya. Pelarutan P berkisar antara 218,2-
667,1 μg / ml. Hasil kami sesuai dengan Nautiyal et al. (2000)
yang mengamati pelarutan TCP dalam kisaran 200-450 μg ml -
1
oleh bakteri pelarut P dari tanah alkali di India tropis.
Penurunan konsentrasi-P yang terlarut dapat disebabkan oleh
laju serapan mikroba yang lebih tinggi daripada solubilasinya
selama periode inkubasi kemudian juga karena menipisnya
substrat itu sendiri (Rodriguez dan Fraga 1999). Imobilisasi
ulang sebagian P yang larut seperti yang dilaporkan oleh
Chun-qiao et al. (2009) \juga bisa menjadi alasan penurunan
konsentrasi P pada tahap inkubasi selanjutnya.
Dalam penelitian ini, isolat bakteri pelarut-P juga
menunjukkan penghambatan phytopathogens Fusarium
oxysporum dan Rhizoctonia solani. Penghambatan
pertumbuhan phytopathogens dapat dikaitkan dengan
produksi antibiotik (Kavroulakis et al. 2010), enzim
ekstraseluler (Amaresan et al. 2012)\, menginduksi resistensi
sistemik (Liu et al. 1996), dan pembentukan biofilm (Haggag
& Timmusk, 2008). Mirip dengan hasil kami, Sharma et al.
(2015; 2016) melaporkan Bacillus subtilis strainS25 dan 2a1
yang menunjukkan penghambatan berbagai jamur
fitopatogenik.
Berbagai uji morfologis dan biokimia diperlukan untuk
identifikasi PGPR yang tepat ke tingkat spesies. Semua isolat
mewakili koloni yang berbeda secara morfologis (Tabel 5).
Morfotip terpilih ini mewakili populasi rizobakteri yang
paling dominan. Meskipun berlaku untuk sejumlah kecil
spesies bakteri, penggunaan morfotipe koloni yang memiliki
ciri khas dan uji biokimia memiliki relevansi ekologis untuk
mendapatkan informasi tentang distribusi rhizobacteria di
lingkungan rhizosfer dan jaringan akar tanaman tomat.
Berdasarkan karakteristik morfologis dan biokimia sebagian
besar isolat secara tentatif diidentifikasi sebagai Bacillus sp.
diikuti oleh Pseudomonas sp. Kejadian Bacillus sp. ada di
setuju dengan laporan sebelumnya di mana Bacillus sp. telah
sering diisolasi dari tomat (Suarez et al. 2008; Banerjee et al.
2010). Dominasi Bacillus dikarenakan kemampuannya untuk
dapat secara efisien menggunakan nutrisi yang disediakan
oleh tanaman melalui eksudat, termasuk eksudat akar yang
memberikan tekanan selektif pada proliferasi kelompok
bakteri tertentu. Selain itu Enterobacter dan Acinetobacter ini
diisolasi dan beberapa strain tidak teridentifikasi. Mirip
dengan pekerjaan kami, Abdeljalil et al. (2016) mengisolasi
25 PGPR efisien dari rhizosfer tomat yang mengalami
identifikasi morfo-biokimia. Sebagian besar strain termasuk
dalam genus Bacillus. Selain Chryseobacterium,
Enterobacter, dan Klebsiella ini juga diisolasi. Jenis tanaman
Spesies juga memiliki efek mendalam pada dinamika
komunitas mikroba, dengan efek tipe tanah biasanya melebihi
tipe tanaman (McSpadden Gardener, 2004). Ciri-ciri
fisiologis, seperti dinding sel berlapis-lapis, pembentukan
endospore yang tahan stres, dan sekresi antibiotik peptida,
molekul sinyal peptida, dan enzim ekstraseluler, berkontribusi
basil pada kelangsungan hidup mereka di bawah kondisi
lingkungan yang berbeda untuk periode waktu yang lama.
Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry

Table 1: Enumeration of culturable rhizospheric bacterial population associated with tomato seedlings from different locations
5 -1
Rhizosphere soil bacteria population (× 10 cfu g )
Location Percentage of P-solubilizers (%)
Nutrient agar (NA) Pikovskaya agar (PVK) P-solubilizers
Fagu 125 116 43 37.07
Habbni pull 118 102 80 78.43
Tickri 100 32 16 50.00
Pandha 200 80 68 85.00
Gaura 195 100 32 32.00
Chail 50 21 21 100.00
Nando 71 18 18 100.00

Table 2: Endophytic bacterial population associated with associated with tomato seedlings from different locations
5 -1
Endorhizobacterial population (×10 cfu g roots)
Location Nutrient agar Percentage of P-solubilizers (%)
Pikovskaya agar (PVK) P-solubilizers
(NA)
Fagu 200 150 140 93.00
Habbni pull - - - -
Tickri 150 - - -
Pandha 100 - - -
Gaura 19 12 12 100.00
Chail 20 2 2 100.00
Nando 85 52 46 88.00

Table 3: Quantitative estimation of phosphate solubilization exhibited by bacterial isolates in NBRIP broth at different days of incubation
-1
Phosphate solubilization (µg ml )
Isolates Days of incubation
3 5 7 9 11
FR-II 283.00 405.83 342.17 326.33 325.71
H-I 143.83 219.33 278.42 273.00 235.08
HB-I 298.00 557.17 545.08 471.33 412.17
HB-II 218.00 270.08 253.11 235.08 235.00
HB-III 160.23 218.29 341.56 245.51 181.22
TX-I 170.50 235.08 308.83 294.00 218.00
TX-II 457.17 545.08 667.17 607.58 553.00
TX-III 112.21 190.76 218.0 215.67 147.23
PX 267.58 290.64 370.50 368.83 324.25
PZ-I 311.65 495.08 601.33 515.5 459.23
PZ-III 475.43 512.58 460.22 331.20 215.65
G-II 368.83 432.58 370.08 293.82 161.11
G-IV 162.83 229.33 268.42 239.00 205.08
CH-I 190.50 225.08 278.83 204.00 118.00
CH-III 217.00 357.17 345.08 271.33 212.17
CH-IV 167.58 190.64 270.50 268.83 224.25
ND-II 275.43 312.58 260.22 231.20 175.65

Table 4: Nitrogen fixing and antagonistic activities of bacterial isolates against fungal pathogens
Antifungal activity (% GI)
Isolates Growth on nitrogen free medium
Fusarium oxysporum Rhizoctonia solani
FR-II + 54.44 42.22
H-I ND 51.11 ND
HB-I + 46.66 46.66
HB-II ND 38.88 ND
HB-III + ND ND
TX-I ND ND 44.44
TX-II + 62.00 42.22
TX-III + 42.22 42.22
PX ND ND ND
PZ-I + ND 54.44
PZ-III ND 54.44 51.11
G-II + 60.00 ND
G-IV ND ND ND
CH-I ND ND ND
CH-III + 42.22 ND
CH-IV + 42.22 46.66
ND-II + ND 51.11

~ 971 ~
Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry

Table 5: Morphological and biochemical characterization of bacterial isolates against fungal pathogens
Biochemical tests
Probable
Isolates Colony characteristics Gram
MR VP Indole Citrate Oxidase Catalase Urease Starch identification
reaction
FR-II Small, circular, raised + - + - - + + - + Bacillus sp.
H-I Large, rhizoidal, raised - - - - + + + - - Pseudomonas sp.
HB-I Large, flat, smooth + - + - + + + + - Bacillus sp.
HB-II Small, rhizoidal, raised + - + - - + + - + Bacillus sp.
HB-III Large, rhizoidal, raised _ _ + - + - + - - Enterobacter sp.
TX-I Large, glistening, mucoid + _ + _ + _ + - + Bacillus sp.
TX-II Small, rough, rhizoidal + - + - - + + - - Unidentified
TX-III Small, circular, flat + - + - + + + - + Unidentified
PX Small, circular, rough + - - - + - + - - Acinetobacter sp
PZ-I Small, rhizoidal, lobate + - + - + - + - + Bacillus sp.
PZ-III Small, rhizoidal, raised + - + - + + + - + Bacillus sp.
G-II Large, rough, raised - - - - + + + - - Pseudomonas sp
G-IV Large, irregular, raised + - + - - - + + - Bacillus sp.
CH-I Large, irregular, lobate - - + - - - + - - Unidentified
CH-III Large, irregular, smooth, lobate - - - - + + + - + Pseudomonas sp
CH-IV Large, circular, flat + - + - + - + - - Bacillus sp.
ND-II Punctiform, flat, glistening - - + - - - + + - Unidentified

Kesimpulan Successfully strategy for the selection of new strawberry-

Hasil yang diperoleh untuk penelitian ini cukup
menggembirakan bahwa dalam banyak cara isolat
rhizobakteri dan endorhizobakterial menunjukkan potensi in-
vitro yang kuat dalam pelarutan-P dan aktivitas antijamur.
Dengan demikian, isolat-isolat ini selanjutnya dapat
dievaluasi untuk karakteristik yang lebih disukai tanaman,
serta responsnya dalam kondisi lapangan sehingga ini dapat
dikembangkan sebagai inokulan tanah yang berhasil untuk
peningkatan pertumbuhan tanaman.
Ucapan Terima kasih
Para penulis berterima kasih kepada ICAR Semua Proyek Jaringan
India tentang Keanekaragaman Hayati Tanah & Pupuk Hayati, New
Delhi, India, karena telah memberikan dukungan keuangan.
Daftar Pustaka
1. Abdeljalil NOB, Vallance J, Gerbore J, Bruez E, Martins
G. Characterization of Tomato-associated Rhizobacteria
Recovered from Various Tomato-growing Sites in
Tunisia. Journal of Plant Pathology and Microbiology
2016; 7:351. doi:10.4172/2157-7471.1000351.
2. Adesemoye A, Torbert H, Kloepper J. Enhanced plant
nutrient use efficiency with PGPR and AMF in an
integrated nutrient management system. Canadian
Journal of Microbiology. 2008; 56(10):876-886.
3. Agrios GN. Department of plant pathology. Amsterdam:
University of Florida, Elsevier Academic. 2005, 635.
4. Amaresan N, Jayakumar V, Kumar Krishna, Thajuddin
N. Endophytic bacteria from tomato and chilli, their
diversity and antagonistic potential against Ralstonia
solanacearum. Archives of Phytopathology and Plant
Protection. 2012; 45:344-355.
5. Arjun JK, Harikrishanan K. Metagenomic analysis of
bacterial diversity in the rice rhizosphere soil
microbiome. Biotechnology Bioinformatics and
Bioengineering 2011; 1(3):361-367.
6. Banerjee S, Palit R, Sengupta C, Standing D. Stress
induced phosphate solubilization by Arthrobacter sp. and
Bacillus sp. isolated from tomato rhizosphere. Australian
Journal of Crop Sciences. 2010; 4(6):378-383.
7. Benizri E, Baudoin E, Guckert A. Root colonization by
inoculated plant growth-promoting rhizobacteria.
Biocontrol Science and Technology. 2001; 5:557-574.
8. Berg G, Kurze S, Buchner A, wellington EM, Smalla K.
~ 972 ~
associated rhizobacteria antagonistic to Verticilliun wilt.
Canadian Journal of Microbiology. 2000; 46:1-10.
9. Cazorla FM, Romero D, Perez-Garcia A, Lugtenberg BJJ,
Vincente AD, Bloemerg G. Isolation and characterization
of antagonistic B. subtilis strains from avocado
rhizoplane displaying biocontrol activity. Journal of
Applied Microbiology. 2007; 103:1950-1959.
10. Chowdhury SP, Schmid M, Hartmann A, Tripathi AK.
Identification of diazotrophs in the culturable bacterial
community associated with roots of Lasiurus sindicus, a
perennial grass of Thar Desert, India. Microbial Ecology.
2007; 54:82-90.
11. Chun-qiao X, Huan HE, Zhang W. Characterization of
tricalcium phosphate solubilization by Stenotrophomonas
maltophilia YC isolated from phosphate mines. Journal
of Central South University of Technology. 2009; 16:581-
587.
12. Egamberdiyeva D, Hoflich G. Effect of plant growth
promoting bacteria on growth and nutrient uptake of
cotton and pea in a semi-arid region of Uzbekistan.
Journal of Arid Environments. 2004; 56:293-301. Doi:
10.1016/SO140-1963(03)00050-8.
13. FAO, “Statistical databases and data-sets of the Food and
Agriculture Organization of the United Nations, 2010.
14. Haggag WM, Timmusk S. Colonization of peanut roots
by biofilm-forming Paenibacillus polymyxa initiates
biocontrol against crown rot disease. Journal of Applied
Microbiology. 2008; 104:961-969.
15. Hiltner L. Uber neuere Erfahrungen und probleme auf
dem gebiet der bodenbakteriologie und unter besonderer
berücksichtigung der gründüngung und brachte. Arbeiten
der Deutschen Landwirtschaftlichen Gesellschaft. 1904;
98:59-78.
16. Hoitink HAJ, Boehm MJ. Biocontrol within the context of
soil microbial communities: a substrate dependent
phenomenon. Annual Reviews of Phytopathology. 1999;
37:427-446.
17. JacksonML. Soil chemical analysis. Prentice Hall, New
Delhi, India, 1973.
18. Jensen ES. Inoculation of pea by application of
Rhizobium in planting furrow. Plant and Soil. 1987;
97:63-70.
19. Kavroulakis N, Ntougias S, Katsou P, Damaskinou A,
Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry

Zervakis GI. Antagonistic bacteria of composted agro- and grain yield in common bean by overexpressing
industrial residues exhibit antibiosis against soil-borne trehalose-6-phosphate synthase in rhizobia. Mol Plant
fungal plant pathogens and protection of tomato plants Microbe Interact 2008; 21(7):958-66.
from Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici. Plant doi:10.1094/MPMI-21-7-0958.
Soil. 2010; 333:233-247. 37. Sundara-Rao WWB, Sinha MK. Phosphate dissolving
20. Kim J, Rees DC. Nitrogenase and biological nitrogen microorganisms in the soil and rhizosphere. Indian
fixation. Biochemistry. 1994; 33:389-397. Journal of Agricultural Science. 1963; 33:272-278.
21. Liu L, Kloepper JW, Tuzin S. Induction of systemic 38. Vessey JK. Plant growth promotion rhizobacteria a
resistance in cucumber against Fusarium wilt by plant biofertilizers. Plant and Soil. 2003; 255:571-586.
growth-promoting rhizobacteria. Phytopathology. 1996; 39. Vincent JM. Distortion of fungal hyphae in the presence
85:695-698. of certain inhibitors. Nature. 1947; 150:158-850.
22. Mcspadden Gardener BB. Ecology of Bacillus and 40. Vos P, Garrity G, Joes D, Krieg NR, Ludwig W, Rainey
Paenibacillus species in agricultural systems. FA et al. The Firmicutes Bergey’s Mannual of
Phytopathology. 2004; 94:1252-1258. Systematic Bacteriology. Williams and Wilkins, 2009,
23. National Horticulture Database, website: www.nhb.gov.in 1984, 3
24. Nautiyal CS, Bhadauria S, Kumar P, Lal H, Mondal R, 41. Wollum AG. Cultural method of soil microorganisms.
Verma D. Stress induced phosphate solubilizing in Methods of soil analysis, Part II, chemical and
bacteria isolated from akaline soils. FEMS Microbiology microbiological properties. American Society of
Letters. 2000; 182:291-296. Agronomy. Inc. Publisher Madison, Wisconsin, USA
25. Nautiyal CS. An efficient microbiological growth 1982, 781-802.
medium for screening phosphate solubilizing 42. Zaidi A, Khan M, Ahemad M, Oves M. Plant growth
microorganisms. FEMS Microbiology Letters. 1999; promotion by phosphate solubilizing bacteria. Acta
170:265-270. Microbiologica et Immunologica Hungarica. 2009;
26. Patel PV, Desai PB. Isolation of rhizobacteria from paddy 56(3):263-284.
field and their traits for plant growth promotion. Research
Journal of Recent Sciences. 2015; 4:34-41.
27. Pikovskaya RI. Mobilization of phosphorus in soil in
connection with the vital activity of some microbial
species. Mikrobiologiya. 1948; 7:362-370.
28. Ranjan A, Rajan M, Mahalakshmi A, Sridevi M. Isolation
and characterization of phosphate-solubilizing bacterial
species from different crop fields of Salem, Tamil Nadu,
India. International Journal of Nutrition, Pharmacology,
Neurological Diseases. 2013; 3:29-33.
29. Rodriguez H, Fraga R. Phosphate solubilizing bacteria
and their role in plant growth promotion. Biotechnology
Advances. 1999; 17:319-339.
30. Rodriguez H, Fraga R, Gonzalez T, Bashan Y. Genetics of
phosphate solubilization and its potential applications for
improving plant growth promoting bacteria. Plant and
Soil 2006; 287:15-21.
31. Sasirekha B, Ashwini, Shivakumar S. Multifarious
antagonistic potentials of rhizosphere associated bacterial
isolates against soil borne diseases of Tomato. Asian
Journal of Plant Sciences and Research. 2012; (2):180-
186.
32. Sharma R, Walia A, Chauhan A, Shirkot CK. Multi-trait
plant growth promoting bacteria from tomato rhizosphere
and evaluation of their potential as bioinoculant. Applied
Biological Research. 2015; 17(2):1-12.
33. Sharma R, Sharma P, Chauhan A, Walia A, Shirkot CK.
Plant growth promoting activities of rhizobacteria
isolated from Podophyllum hexandrum growing in North-
West regions of Himalayas. Proceedings of National
Academy of Sciences, India Section B: Biological
Sciences. 2016; DOI 10.1007/s40011-016-0722-2.
34. Siddiqui ZA. PGPR: prospective biocontrol agents of
plant pathogens. In ‘PGPR: biocontrol and
biofertilization.’ (Ed. ZA Siddiqui) 2006, 111-142.
(Springer: Dordrecht, The Netherlands)
35. Srivastav S, Yadav KS, Kundu BS. Prospect of using
phosphate solubilizing Pseudomonas as biofungicides.
Indian Journal of Microbiology. 2004; 44:91-94.
36. Suarez R, Wong A, Ramirez M, Barraza A, Orozco MD,
Cevallos MA et al. Improvement of drought tolerance

~ 973 ~