Metabolime

Metabolisme kata berasal dari kata Yunani untuk "perubahan." Metabolismemewakili jumlah dari perubahan kimia yang mengubah nutrisi, "mentah bahan
”yang diperlukan untuk memelihara organisme hidup, menjadi energi dan secara kimiawi
produk sel yang kompleks. Metabolisme terdiri dari ratusan reaksi enzimatik yang diorganisir menjadi jalur diskrit. Jalur ini melanjutkan secara bertahap,
mengubah media menjadi produk akhir melalui banyak zat antara kimia tertentu. Metabolisme terkadang disebut metabolisme perantara untuk
mencerminkan aspek proses ini.
Peta metabolik (Gambar 18.1) menggambarkan hampir semua reaksi utama dari metabolisme perantara karbohidrat, lipid, asam amino,
nukleotida, dan turunannya.
Peta-peta ini sangat kompleks pada pandangan pertama dan tampaknya hampir mustahil untuk belajar dengan mudah. Meskipun penampilan mereka, peta-
peta ini menjadi mudah diikuti setelah rute metabolisme utama diketahui dan mereka
fungsi dipahami. Urutan metabolisme yang mendasarinya dan yang penting keterkaitan antara berbagai jalur kemudian muncul sebagai pola sederhana
dengan latar belakang yang tampaknya rumit.

Peta Metabolik sebagai Satuan Titik dan Garis

Salah satu transformasi yang menarik dari peta metabolisme perantara adalah untuk mewakili masing-masing perantara sebagai titik hitam dan masing-
masing enzim sebagai garis (Gambar
18.2). Kemudian, lebih dari 1000 enzim dan substrat berbeda diwakili
hanya dengan dua simbol.
Bagan ini memiliki sekitar 520 titik (perantara). Meja 18.1 mencantumkan jumlah titik yang memiliki satu atau dua garis atau lebih (enzim) terkait dengan
mereka. Dengan demikian, tabel ini mengklasifikasikan perantara dengan nomor enzim yang bertindak atas mereka. Titik yang terhubung ke satu baris harus
baik nutrisi, bentuk penyimpanan, produk akhir, atau produk ekskretoris metabolisme. Juga, karena banyak jalur cenderung berjalan hanya dalam satu arah
(yaitu, mereka pada dasarnya tidak dapat dikembalikan dalam kondisi fisiologis), sebuah titik yang terhubung dengan hanya dua garis mungkin merupakan
perantara hanya dalam satu jalur dan hanya memiliki satu nasib dalam metabolisme. Jika tiga garis terhubung ke sebuah titik,
bahwa zat antara memiliki setidaknya dua kemungkinan metabolisme; empat baris, tiga nasib; dan seterusnya. Perhatikan bahwa sekitar 80% perantara
hanya terhubung satu atau dua garis dan karenanya hanya memiliki tujuan terbatas dalam sel. Namun,
banyak perantara yang mengalami berbagai nasib. Dalam hal demikian, jalur mengikuti adalah pilihan pengaturan penting. Memang, apakah ada substrat
dialihkan ke jalur metabolisme tertentu adalah konsekuensi dari peraturan
keputusan yang dibuat sebagai tanggapan terhadap sesaat sel (atau organisme) persyaratan energi atau nutrisi. Pengaturan metabolisme sangat menarik dan
subjek penting yang akan sering kita kembalikan.

18.1 ● Hampir Semua Organisme Memiliki Hal yang Sama

Set Dasar dari Jalur Metabolik
Salah satu prinsip pemersatu besar biologi modern adalah yang diperlihatkan organisme ditandai kesamaan dalam jalur metabolisme utama mereka.
Diberikan hampir kemungkinan tak terbatas dalam kimia organik, generalitas ini akan muncul
paling tidak mungkin. Namun itu benar, dan itu memberikan bukti kuat bahwa semua kehidupan memiliki diturunkan dari bentuk nenek moyang yang sama.
Semua bentuk nutrisi dan hampir semua jalur metabolisme berkembang pada prokariota awal sebelum kemunculan eukaryotes 1 miliar tahun yang lalu.
Misalnya, glikolisis, jalur metabolisme dimana energi dilepaskan dari glukosa dan ditangkap dalam bentuk ATP dalam kondisi anaerob, umum terjadi di
hampir setiap sel. Diyakini demikian
menjadi jalur metabolisme yang paling kuno, setelah muncul sebelum penampilan oksigen berlimpah di atmosfer. Semua organisme, bahkan yang itu yang
dapat mensintesis glukosa mereka sendiri, mampu degradasi dan glukosa
Sintesis ATP melalui glikolisis. Jalur menonjol lainnya juga hampir di mana-mana di antara organisme

Keanekaragaman Metabolik
Meskipun sebagian besar sel memiliki set dasar yang sama dari jalur metabolisme sentral, berbeda sel (dan, dengan ekstensi, berbagai organisme) ditandai
oleh jalur alternatif yang mungkin mereka ungkapkan. Jalur ini menawarkan keragaman yang luas
18.1 ● Hampir Semua Organisme Memiliki Perangkat Dasar yang Sama dari Jalur Metabolik 569
Tabel 18.1
Jumlah Titik (Menengah) di Peta Metabolik pada Gambar 18.2 dan Jumlah Garis yang Terkait dengan mereka Garis Dots
1 atau 2 410 3 71 4 20 5 11
6 atau lebih 8
kemungkinan metabolisme. Misalnya, organisme sering diklasifikasikan menurut ke jalur metabolisme utama yang mereka eksploitasi untuk memperoleh
karbon atau energi. Klasifikasi berdasarkan persyaratan karbon mendefinisikan dua kelompok utama, autotrof dan heterotrof. Autotrof adalah organisme
yang hanya bisa menggunakan karbon dioksida sebagai satu-satunya sumber karbon mereka. Heterotrof membutuhkan zat organik bentuk karbon, seperti
glukosa, untuk mensintesis karbon esensial lainnya senyawa. Klasifikasi berdasarkan sumber energi juga memberikan dua kelompok: fototrof dan
chemotrophs. Phototroph adalah organisme fotosintesis, yang menggunakan cahaya sebagai sumber energi. Chemotroph menggunakan senyawa organik
seperti glukosa atau, dalam beberapa kasus, zat anorganik teroksidasi seperti Fe2, NO2, NH4, atau unsur sulfur sebagai sumber energi tunggal. Biasanya,
energi diekstraksi melalui reaksi oksidasi-reduksi. Berdasarkan karakteristik ini, setiap organisme masuk ke dalam salah satu dari empat kategori (Tabel
18.2). Keanekaragaman Metabolik di antara Lima Kerajaan Prokariota (kerajaan Monera — bakteri) menunjukkan keragaman metabolisme yang lebih besar
dari semua empat kerajaan eukariotik (Protoctista [sebelumnya disebut Protozoa], Jamur, Tumbuhan, dan Hewan) disatukan. Prokariota beragam
chemoheterotrophic, photoautotrophic, photoheterotrophic, atau chemoautotrophic.Tidak ada protoctista yang merupakan kemoautotrof; Jamur dan hewan
secara eksklusif chemoheterotrophs; tanaman bersifat photoautotroph, meskipun beberapa heterotrofik dalam mode akuisisi karbon mereka. Peran O2 dalam
Metabolisme Perbedaan metabolisme lebih lanjut antara organisme adalah apakah mereka bisa atau tidak menggunakan oksigen sebagai akseptor elektron
dalam jalur penghasil energi. Itu itu dapat disebut aerob atau organisme aerob; yang lain, disebut anaerob, dapat hidup tanpa O2. Organisme yang O2
diwajibkan untuk hidup disebut wajib aerob; manusia adalah contoh. Beberapa spesies, yang disebut fakultatif anaerob, dapat beradaptasi dengan kondisi
anaerob dengan mengganti elektron lain akseptor untuk O2 dalam jalur penghasil energi mereka; Escherichia coli adalah ujian Namun yang lain tidak bisa
menggunakan oksigen sama sekali dan bahkan diracun olehnya; ini adalah anaerob obligat. Clostridium botulinum, bakteri yang memproduksi botulin
toksin, representatif.
Aliran Energi di Biosfer dan Karbon dan Siklus Oksigen Berhubungan Secara Intim Sumber utama energi untuk kehidupan adalah matahari. Photoautotroph
menggunakan cahaya energi untuk mendorong sintesis molekul organik, seperti karbohidrat, dari CO2 di atmosfer dan air (Gambar 18.3). Sel heterotrofik
kemudian menggunakan ini produk organik sel fotosintesis baik sebagai bahan bakar dan sebagai bahan pembangun, atau prekursor, untuk biosintesis
pelengkap unik mereka sendiri biomolekul. Pada akhirnya, CO2 adalah produk akhir dari metabolisme karbon heterotrofik, dan CO2 dikembalikan ke
atmosfer untuk digunakan kembali oleh fotoautotrof.
Efeknya, energi matahari diubah menjadi energi kimiawi molekul organik oleh fotoautotrof, dan heterotrof memulihkan energi ini dengan memetabolisme
zat organik. Aliran energi dalam biosfer dengan demikian disampaikan dalam siklus karbon, dan dorongan yang mendorong siklus adalah energi ringan.

18.2 ● Metabolisme Terdiri dari Katabolisme (Degradatif

Jalur) dan Anabolisme (Jalur Biosintetik) Metabolisme melayani dua tujuan yang berbeda secara mendasar: generasi energi untuk menggerakkan fungsi vital
dan sintesis molekul biologis. Untuk mencapai tujuan ini, metabolisme sebagian besar terdiri dari dua proses yang berbeda, katabolisme dan anabolisme.
Jalur katabolik biasanya menghasilkan energi, sedangkan jalur anabolik membutuhkan energi. Katabolisme melibatkan oksidatif degradasi molekul nutrisi
kompleks (karbohidrat, lipid, dan protein) diperoleh baik dari lingkungan atau dari cadangan seluler. Itu pemecahan molekul-molekul ini oleh katabolisme
mengarah pada pembentukan yang lebih sederhana molekul seperti asam laktat, etanol, karbon dioksida, urea, atau amonia. Reaksi katabolik biasanya
bersifat eksergonik, dan seringkali merupakan energi kimia dirilis ditangkap dalam bentuk ATP (Bab 3). Karena katabolisme
oksidatif untuk sebagian besar, sebagian dari energi kimia dapat dilestarikan sebagai elektron yang kaya energi ditransfer ke koenzim NAD dan NADP. Ini
dua koenzim tereduksi memiliki peran metabolik yang sangat berbeda: reduksi NAD adalah bagian dari katabolisme; Oksidasi NADPH adalah aspek penting
dari anabolisme. Energi dilepaskan setelah oksidasi NADH digabungkan dengan fosforilasi ADP dalam sel aerobik, dan oksidasi NADH kembali ke NAD
berfungsi untuk menghasilkan lebih banyak ATP; sebaliknya, NADPH adalah sumber daya pereduksi yang dibutuhkan untuk mengemudi reaksi biosintetik
reduktif. Pertimbangan termodinamika menuntut energi yang diperlukan biosintesis zat apa pun melebihi energi yang tersedia dari katabolismenya.
Jika tidak, organisme dapat mencapai status mesin gerak abadi: Beberapa molekul substrat yang katabolismenya menghasilkan lebih banyak ATP daripada
yang dibutuhkan karena resintesisnya akan memungkinkan sel untuk siklus zat ini dan panen pasokan energi yang tak ada habisnya. Anabolisme Adalah
Biosintesis Anabolisme adalah proses sintetis di mana biomolekul bervariasi dan kompleks (protein, asam nukleat, polisakarida, dan lipid) disusun dari yang
lebih sederhana prekursor. Biosintesis semacam itu melibatkan pembentukan kovalen baru ikatan, dan input energi kimia diperlukan untuk menggerakkan
endergonik tersebut proses. ATP yang dihasilkan oleh katabolisme menyediakan energi ini. Selanjutnya, NADPH adalah donor elektron berenergi tinggi
yang sangat baik untuk reaksi reduktif anabolisme. Meskipun peran mereka berbeda, anabolisme dan katabolisme adalah saling terkait karena produk-produk
yang satu menyediakan substrat yang lain (Gambar 18.4). Banyak perantara metabolisme dibagi di antara keduanya proses, dan prekursor yang dibutuhkan
oleh jalur anabolik ditemukan di antara produk katabolisme
Anabolisme dan Katabolisme Tidak Saling Eksklusif
Menariknya, anabolisme dan katabolisme terjadi secara bersamaan di dalam sel. Itu tuntutan yang saling bertentangan dari katabolisme dan anabolisme
bersamaan dikelola oleh sel dalam dua cara. Pertama, sel mempertahankan regulasi ketat dan terpisah baik katabolisme dan anabolisme, sehingga kebutuhan
metabolisme dilayani dengan segera dan busana yang teratur. Kedua, jalur metabolisme yang bersaing seringkali terlokalisasi dalam kompartemen seluler
yang berbeda. Mengisolasi aktivitas yang berlawanan dalam kompartemen yang berbeda, seperti organel yang terpisah, menghindari gangguan
diantara mereka. Misalnya, enzim yang bertanggung jawab atas katabolisme lemak asam, jalur oksidasi asam lemak, terlokalisasi dalam mitokondria.
Sebaliknya, Biosintesis asam lemak terjadi di sitosol. Dalam bab-bab selanjutnya, kita harus melihat bahwa interaksi molekuler tertentu yang bertanggung
jawab atas peraturan tersebut metabolisme menjadi penting untuk pemahaman dan penghargaan biokimia metabolisme.

Mode Organisasi Enzim di Jalur Metabolik

Jalur metabolisme individu anabolisme dan katabolisme terdiri dari langkah-langkah enzimatik berurutan (Gambar 18.5). Beberapa jenis organisasi
dimungkinkan. Enzim beberapa sistem multienzim mungkin ada secara fisik terpisah, entitas terlarut, dengan perantara yang menyebar (Gambar 18.5a). Di
lain contohnya, enzim jalur dikumpulkan untuk membentuk multienzim diskrit kompleks, dan media diubah secara berurutan saat dilewatkan dari enzim ke
enzim (Gambar 18.5b). Jenis organisasi ini memiliki keunggulan bahwa zat antara tidak hilang atau diencerkan dengan difusi. Dalam pola ketiga
dari organisasi, enzim yang biasa terdapat pada jalur berada bersama sebagai sistem terikat membran (Gambar 18.5c). Dalam hal ini, peserta enzim (dan
mungkin substrat juga) harus berdifusi hanya dalam dua dimensi membran untuk berinteraksi dengan tetangga mereka. Seperti penelitian mengungkapkan
organisasi ultrastructural sel di pernah detail yang lebih besar, lebih banyak dan lebih banyak dari apa yang disebut sistem enzim terlarut ditemukan untuk
secara fisik disatukan ke dalam kompleks fungsional. Jadi, dalam banyak (mungkin semua) jalur metabolisme, enzim yang bekerja berurutan terkait dengan
stabil kompleks multienzim yang kadang-kadang disebut sebagai metabolon, kata yang berarti "unit metabolisme."
Jalur Katabolisme Menyatu dengan Beberapa Produk Akhir Jika kita mensurvei katabolisme nutrisi penghasil energi utama (karbohidrat,lipid, dan protein)
dalam sel heterotrofik yang khas, kita melihat bahwa degradasi zat-zat ini melibatkan suksesi reaksi enzimatik. Di hadapan oksigen (katabolisme aerob),
molekul-molekul ini terdegradasi akhirnya menjadi karbon dioksida, air, dan amonia. Katabolisme aerobik terdiri dari tiga tahap yang berbeda. Pada tahap
1, makromolekul nutrisi rusak turun ke blok bangunan masing-masing. Mengingat keragaman besar makromolekul, blok bangunan ini mewakili jumlah
produk yang agak terbatas. Protein menghasilkan 20 komponen asam amino, polisakarida memberi naik menjadi unit karbohidrat yang dapat dikonversi
menjadi glukosa, dan lipid rusak turun menjadi gliserol dan asam lemak (Gambar 18.6).
Di tahap 2, kumpulan blok bangunan produk dihasilkan di tahap 1 lebih lanjut terdegradasi untuk menghasilkan rangkaian intermediet metabolik yang lebih
sederhana. Deaminasi asam amino menyebabkan kerangka karbon asam -keto. Beberapa asam -keto ini adalah zat antara siklus asam sitrat dan diberi makan
langsung ke katabolisme tahap 3 melalui siklus ini. Yang lain dikonversi menjadi piruvat asam karbon -keto-karbon atau pada gugus asetil-koenzim
A (asetil-KoA). Glukosa dan gliserol dari lipid juga menghasilkan piruvat, sedangkan asam lemak dipecah menjadi dua unit karbon yang muncul sebagai
asetil CoA. Karena piruvat juga menimbulkan asetil-KoA, kita melihat bahwa degradasi nutrisi makromolekul konvergen ke produk akhir yang umum, asetil
CoA (Gambar 18.6). Pembakaran gugus asetil asetil-KoA oleh siklus asam sitrat dan fosforilasi oksidatif untuk menghasilkan CO2 dan H2O merupakan
tahap 3 dari katabolisme. Produk akhir dari siklus asam sitrat, CO2 dan H2O, adalah produk limbah utama katabolisme aerobik. Seperti yang akan kita lihat
di Bab 20, oksidasi asetil-KoA selama metabolisme tahap 3 menghasilkan sebagian besar energi yang dihasilkan oleh sel.

Anabolic Pathways Diverge, Mensintesis Varietas yang Mencengangkan Biomolekul dari Set Blok Bangunan Terbatas Kumpulan molekul prekursor
sederhana yang cukup terbatas cukup untuk disediakan untuk biosintesis dari hampir semua konstituen seluler, baik itu protein, asam nukleat, lipid, atau
polisakarida. Semua zat ini dikonstruksi dari blok bangunan yang sesuai melalui jalur anabolisme. Pada gilirannya, blok bangunan (asam amino, nukleotida,
gula, dan asam lemak) dapat dihasilkan dari metabolit dalam sel. Misalnya, asam amino dapat terbentuk dengan aminasi kerangka karbon asam -keto yang
sesuai, dan piruvat dapat dikonversi menjadi heksosa untuk biosintesis polisakarida.

Intermediate amfibi
Beberapa jalur sentral metabolisme perantara, seperti sitrat siklus asam, dan banyak metabolit dari jalur lain memiliki tujuan ganda — mereka melayani
dalam katabolisme dan anabolisme. Sifat ganda ini tercermin dalam penunjukan jalur seperti amfibi daripada semata-mata katabolik atau anabolik.
Dalam hal apa pun, berbeda dengan katabolisme — yang menyatu dengan yang umum menengah, asetil-KoA — jalur anabolisme berbeda dari yang kecil
sekelompok perantara metabolisme sederhana untuk menghasilkan berbagai seluler yang spektakuler konstituen.

Jalur Katabolisme dan Perbedaan Anabolisme dalam Cara Penting

Jalur anabolik untuk sintesis produk akhir yang diberikan biasanya tidak sama persis dengan jalur yang digunakan untuk katabolisme dari zat yang sama.
Beberapa dari perantara mungkin umum untuk langkah-langkah di kedua jalur, tetapi berbeda reaksi enzimatik dan metabolit unik menandai langkah-
langkah lain. Baik contoh perbedaan ini ditemukan dalam perbandingan katabolisme glukosa menjadi asam piruvat melalui jalur glikolisis dan biosintesis
glukosa dari piruvat oleh jalur yang disebut glukoneogenesis. Jalur glikolitik dari glukosa ke piruvat terdiri dari 10 enzim. Meskipun sepertinya efisien untuk
sintesis glukosa dari piruvat untuk dilanjutkan dengan pembalikan ke-10 langkah, glukoneogenesis hanya menggunakan tujuh enzim glikolitik secara
terbalik, mengganti tiga yang tersisa dengan empat enzim khusus untuk biosintesis glukosa. Dengan cara yang sama, jalur yang bertanggung jawab untuk
mendegradasi protein asam amino berbeda dari sistem sintesis protein, dan degradasi oksidatif asam lemak menjadi dua-karbon kelompok asetil-KoA tidak
mengikuti yang sama jalur reaksi sebagai biosintesis asam lemak dari asetil-KoA. Regulasi Metabolik Nikmat Berbagai Jalur untuk Sekuens Metabolik yang
Disutradarai secara berlawanan Alasan kedua untuk jalur yang berbeda melayani dalam arah metabolisme yang berlawanan adalah bahwa jalur tersebut
harus diatur secara independen. Jika katabolisme dan anabolisme melewati set jalur metabolisme yang sama, pertimbangan keseimbangan akan menentukan
bahwa memperlambat lalu lintas di satu arah dengan menghambat reaksi enzimatik tertentu tentu akan memperlambat lalu lintas sebaliknya arah. Regulasi
anabolisme dan katabolisme independen dapat dilakukan hanya jika dua proses kontras ini bergerak di sepanjang rute yang berbeda atau,
dalam hal jalur bersama, langkah-langkah pembatas nilai berfungsi sebagai titik regulasi dikatalisis oleh enzim yang unik untuk setiap urutan
yangberlawanan
(Gambar 18.7).

Siklus ATP
Kita melihat di Bab 3 bahwa ATP adalah mata uang energi sel. Dalam fototrof, ATP adalah salah satu dari dua produk utama yang kaya energi yang
dihasilkan dari transformasi dari energi cahaya menjadi energi kimia. (Yang lainnya adalah NADPH; lihat
berikut diskusi.) Dalam heterotrof, jalur katabolisme memiliki sebagai mereka Tujuan utama pelepasan energi bebas yang bisa ditangkap dalam bentuk
ikatan anhidrida fosfat kaya energi dalam ATP. Pada gilirannya, ATP menyediakan energi yang menggerakkan bermacam-macam aktivitas semua sel hidup
— sintesis biomolekul kompleks, pekerjaan osmotik yang terlibat dalam pengangkutan zat ke dalam sel, karya motilitas sel, karya kontraksi otot. Ini
beragam kegiatan semuanya ditenagai oleh energi yang dilepaskan dalam hidrolisis ATP ke ADP dan Pi. Dengan demikian, ada siklus energi dalam sel di
mana ATP berfungsi sebagai pembuluh membawa energi dari fotosintesis atau katabolisme ke energi yang membutuhkan proses unik untuk sel hidup
(Gambar 18.8).

Jalur Metabolik Terkotak Dalam Sel Meskipun bagian dalam sel prokariotik tidak dibagi lagi menjadi kompartemen oleh membran internal, sel masih
menunjukkan beberapa pemisahan metabolisme. Misalnya, jalur metabolisme tertentu, seperti sintesis fosfolipid dan fosforilasi oksidatif, terlokalisasi dalam
membran plasma. Juga protein biosintesis dilakukan pada ribosom. Sebaliknya, sel-sel eukariotik secara luas dikotak-kotakkan oleh sistem endomembran.
Masing-masing sel ini memiliki inti sejati yang dibatasi oleh a membran ganda disebut amplop nuklir. Amplop nuklir terus menerus dengan sistem
endomembran, yang terdiri dari dibedakan daerah: retikulum endoplasma; kompleks Golgi; berbagai membranbounded vesikel seperti lisosom, vakuola, dan
mikroba; dan, pada akhirnya, membran plasma itu sendiri. Sel eukariotik juga memiliki mitokondria dan, jika mereka fotosintesis, kloroplas. Gangguan pada
membran sel dan fraksinasi isi sel ke dalam komponen organel telah diizinkan analisis fungsi masing-masing (Gambar 18.15). Setiap kompartemen adalah
didedikasikan untuk fungsi metabolisme khusus, dan enzim yang sesuai fungsi-fungsi khusus ini terkurung bersama dalam organel. Di banyak
contoh, enzim dari urutan metabolisme terjadi bersamaan di dalam membran organel. Dengan demikian, aliran intermediet metabolik dalam sel adalah spa-
secara terpisah dan terpisah secara kimia. Misalnya, 10 enzim glikolisis ditemukan dalam sitosol, tetapi piruvat, produk glikolisis, dimasukkan ke dalam
mitokondria. Organel ini mengandung enzim siklus asam sitrat, yang mengoksidasi piruvat menjadi CO2. Sejumlah besar energi dilepaskan dalam proses
ditangkap oleh sistem fosforilasi oksidatif membran mitokondria dan digunakan untuk menggerakkan pembentukan ATP (Gambar 18.16).

Vitamin Yang Mengandung Adenine Nucleotides Beberapa golongan vitamin berkaitan dengan, atau merupakan prekursor dari, koenzim itu mengandung
nukleotida adenin sebagai bagian dari strukturnya. Koenzim ini termasuk dinukleotida flavin, dinukleotida piridin, dan koenzim A.
Bagian nukleotida adenin dari koenzim ini tidak berpartisipasi aktif dalam reaksi koenzim ini; melainkan, itu memungkinkan yang tepat
enzim untuk mengenali koenzim. Secara khusus, nukleotida adenin sangat meningkatkan afinitas dan spesifisitas koenzim untuk situsnya di
enzim, karena banyak situs untuk ikatan hidrogen, dan juga kemungkinan ikatan hidrofobik dan ionik yang dibawanya ke struktur koenzim.

19.1 â— Tinjauan Glikolisis

Gambaran umum jalur glikolitik disajikan pada Gambar 19.1. Sebagian besar Rincian jalur ini (jalur metabolisme pertama yang dijelaskan) adalah
bekerja pada paruh pertama abad ke-20 oleh ahli biokimia Jerman Otto Warburg, G. Embden, dan O. Meyerhof. Bahkan, urutan reaksi
pada Gambar 19.1 sering disebut sebagai jalur Embdenâ € “Meyerhof. Glikolisis terdiri dari dua fase. Yang pertama, serangkaian lima reaksi, glukosa
dipecah menjadi dua molekul gliseraldehida-3-fosfat. Dalam fase kedua, lima reaksi selanjutnya mengubah dua molekul gliseraldehida ini 3-fosfat menjadi
dua molekul piruvat. Fase 1 mengkonsumsi duamolekul ATP (Gambar 19.2). Tahap-tahap selanjutnya dari glikolisis menghasilkan produksi
dari empat molekul ATP. Jaringnya adalah 4 2 2 molekul ATP yang diproduksi per molekul glukosa.

Tarif dan Regulasi Reaksi Glikolitik Bervariasi di Antara Spesies Mikroorganisme, tumbuhan, dan hewan (termasuk manusia) melakukan 10 reaksi
glikolisis dengan cara yang kurang lebih serupa, meskipun tingkat individu reaksi dan cara mengatur mereka berbeda dari spesies
untuk spesies. Namun, perbedaan yang paling signifikan di antara spesies adalah caranya di mana piruvat produk digunakan. Tiga kemungkinan jalur untuk
piruvat ditunjukkan pada Gambar 19.1. Pada organisme aerob, termasuk manusia, piruvat dioksidasi (dengan hilangnya gugus karboksil sebagai CO2), dan
sisanya unit dua karbon menjadi kelompok asetil dari asetil-koenzim A. Asetil ini kelompok dimetabolisme oleh siklus asam trikarboksilat (dan teroksidasi
penuh) untuk menghasilkan CO2 Elektron yang dilepaskan dalam proses oksidasi ini kemudian dilewatkan melalui sistem transpor elektron mitokondria dan
digunakan untuk menghasilkan molekul ATP oleh fosforilasi oksidatif, sehingga menangkap sebagian besar metabolism energi yang tersedia dalam molekul
glukosa asli.

19.2 â € œ Pentingnya Reaksi yang Digabungkan dalam Glikolisis

Proses glikolisis mengubah sebagian, tetapi tidak semua, energi metabolism dari molekul glukosa menjadi ATP. Perubahan energi gratis untuk konversi
glukosa menjadi dua molekul laktat (rute anaerob yang ditunjukkan pada Gambar 19.1) adalah 183,6 kJ / mol: (19.1)
Proses ini terjadi tanpa oksidasi atau reduksi bersih. Meski beberapa individu langkah-langkah di jalur melibatkan oksidasi atau reduksi, langkah-langkah ini
mengimbangi satu sama lain persis. Dengan demikian, konversi molekul glukosa menjadi dua molekul laktat hanya melibatkan penataan ulang ikatan, tanpa
jarring kehilangan atau keuntungan elektron. Energi yang disediakan melalui penataan ulang ini menjadi bentuk yang lebih stabil (energi lebih rendah)
adalah bagian yang relatif kecil energi total yang diperoleh dari glukosa. Produksi dua molekul ATP dalam glikolisis membutuhkan energi
proses:
2ADP 2Pi 88n 2ATP 2H2O (19.2)
G ° 2 30,5 kJ / mol 61,0 kJ / mol
610 Bab 19 â € “Glikolisis
Glikolisis
C6H12O6 2H3C CHOH
G
MENDEKUT
183,6 kJ / mol
2H +
Glikolisis menggabungkan dua reaksi ini:
Glukosa 2ADP 2Pi 88n 2 laktat 2ATP 2H 2H2O (19.3)
GÂ ° 183,6 61 122,6 kJ / mol
Dengan demikian, dalam kondisi keadaan standar, (61 / 183.6) 100%, atau 33%, gratis energi yang dilepaskan dipertahankan dalam bentuk ATP dalam
reaksi-reaksi ini. Namun, seperti yang kita bahas dalam Bab 3, berbagai kondisi larutan, seperti pH, konsentrasi, kekuatan ionik, dan keberadaan ion logam,
secara substansial dapat berubah perubahan energi gratis untuk reaksi semacam itu. Dalam kondisi seluler aktual,
perubahan energi bebas untuk sintesis ATP (Persamaan 19.2) jauh lebih besar, dan sekitar 50% dari energi gratis yang tersedia diubah menjadi ATP.
Jelas, kemudian, lebih dari cukup energi gratis tersedia dalam konversi glukosa menjadi laktat untuk mendorong sintesis dua molekul ATP.

19.3 ● Fase Pertama Glikolisis

Salah satu cara untuk mensintesis ATP menggunakan energi bebas metabolik yang terkandung di dalamnya molekul glukosa akan mengubah glukosa
menjadi satu (atau lebih) dari energi tinggi fosfat pada Tabel 3.3 yang memiliki energi bebas keadaan standar hidrolisis lebih negatif daripada ATP.
Molekul-molekul dalam Tabel 3.3 itu dapat disintesis dengan mudah dari glukosa adalah phosphoenolpyruvate, 1,3-bisphosphoglycerate,
dan asetil fosfat. Bahkan, pada tahap pertama glikolisis, glukosa diubah menjadi dua molekul gliseraldehida-3-fosfat. Energi dilepaskan dari molekul
berenergi tinggi ini pada fase kedua glikolisis kemudian digunakan untuk mensintesis ATP.
Reaksi 1: Fosforilasi Glukosa oleh Hexokinase atau Glucokinase — Reaksi Priming Pertama
Reaksi awal jalur glikolisis melibatkan fosforilasi glukosa pada atom karbon 6 baik dengan hexokinase atau glukokinase. Formasi dari
fosfoester semacam itu secara termodinamik tidak menguntungkan dan membutuhkan energy input untuk beroperasi ke arah maju (Bab 3). Energi berasal
dari ATP, suatu persyaratan yang pada mulanya tampak kontraproduktif. Glikolisis dirancang untuk membuat ATP, tidak mengkonsumsinya. Namun, reaksi
heksokinase, glukokinase (Gambar 19.2) adalah salah satu dari dua reaksi priming dalam siklus. Sama seperti kuno, pompa air yang dioperasikan dengan
tangan (Gambar 19.3) harus dipersiapkan dengan pompa kecil jumlah air untuk memberikan lebih banyak air ke sumur minyak haus, glikolisis
jalur membutuhkan dua molekul ATP priming untuk memulai urutan reaksi dan memberikan empat molekul ATP pada akhirnya.
Reaksi lengkap untuk langkah pertama dalam glikolisis adalah? -D-Glukosa? ATP4? 88n? -D-glukosa-6-fosfat2? ? ADP3? ? H? (19,4)
? G °? ? ? 16,7 kJ / mol Hidrolisis ATP membuat 30,5 kJ / mol tersedia dalam reaksi ini, dan fosforilasi "biaya" glukosa 13,8 kJ / mol (lihat Tabel 19.1).
Jadi, itu Reaksi membebaskan 16,7 kJ / mol dalam kondisi keadaan standar (konsentrasi 1M), Dalam kondisi seluler, reaksi glikolisis pertama ini bahkan
lebih menguntungkan dari pada kondisi standar. Seperti yang ditunjukkan pada Bab 3, energi bebas berubahuntuk setiap reaksi tergantung pada konsentrasi
reaktan dan produk. Persamaan 3.12 pada Bab 3 dan data pada Tabel 19.2 dapat digunakan untuk menghitungnilai untuk? G untuk heksokinase, reaksi
glukokinase dalam eritrosit:
? G ?? G °? ? RT ln (19.5)
? G ?? 16,7 kJ / mol? (8,314 J / mol K) (310 K) ln
? G ?? 33.9 kJ / mol
Dengan demikian, GG bahkan lebih disukai dalam kondisi seluler daripada pada kondisi standar. Sebagai kita akan lihat nanti dalam bab ini, salah satu dari
reaksi heksokinase, glukokinase beberapa yang mendorong glikolisis maju. Keuntungan Seluler Glukosa Fosforilasi Penggabungan fosfat ke dalam glukosa
dalam energi yang menguntungkan ini Reaksi ini penting karena beberapa alasan. Pertama, fosforilasi menjaga substrat di dalam sel. Glukosa adalah
molekul netral dan dapat berdifusi melintasi membran sel, tetapi fosforilasi memberi muatan negatif pada glukosa, dan membran plasma pada dasarnya
kedap terhadap glukosa-6-fosfat (Gambar 19.4). Selain itu, konversi cepat glukosa menjadi glukosa-6-fosfat menjaga konsentrasi glukosa intraseluler
rendah, mendukung difusi glukosa ke dalam sel. Selain itu, karena kontrol regulasi hanya dapat dikenakan pada reaksi bukan pada kesetimbangan,
termodinamika yang menguntungkan dari reaksi pertama ini menjadikannya situs penting untuk regulasi.

Hexokinase
Pada sebagian besar sel hewan, tumbuhan, dan mikroba, enzim yang memfosforilasi glukosa adalah hexokinase. Diperlukan ion magnesium (Mg2?) Untuk
reaksi ini enzim kinase lainnya di jalur glikolitik. Substrat yang benar untuk reaksi hexokinase adalah MgATP2 ?. Km nyata untuk glukosa hewan Enzim
otot rangka sekitar 0,1 mM, dan dengan demikian enzim beroperasi efisien pada kadar glukosa darah normal 4 mM atau lebih. Tubuh yang berbeda
jaringan memiliki isozim hexokinase yang berbeda, masing-masing menunjukkan agak berbeda sifat kinetik. Enzim hewan secara allosterik dihambat oleh
produk, glukosa-6-fosfat. Kadar glukosa-6-fosfat yang tinggi menghambat heksokinase aktivitas sampai konsumsi oleh glikolisis menurunkan
konsentrasinya. Itu reaksi hexokinase adalah salah satu dari tiga titik dalam jalur glikolisis yang ada diatur. Seperti namanya, hexokinase dapat
memfosforilasi varietas gula heksosa, termasuk glukosa, manosa, dan fruktosa.

Reaksi 2: Phosphoglucoisomerase mengkatalisis Isomerisasi Glukosa-6-Fosfat

Langkah kedua dalam glikolisis adalah tipe umum dari reaksi metabolik: isomerisasi dari gula. Dalam kasus khusus ini, karbonil oksigen dari glukosa- 6-
fosfat digeser dari C-1 ke C-2. Jumlah ini untuk isomerisasi suatu aldosa (glukosa-6-fosfat) menjadi ketosa — fruktosa-6-fosfat (Gambar 19.6).
Reaksi ini diperlukan karena dua alasan. Pertama, langkah selanjutnya dalam glikolisis adalah fosforilasi pada C-1, dan OOH hemoglobin glukosa akan lebih
sulit untuk memfosforilasi daripada hidroksil primer sederhana. Kedua, isomerisasi untuk fruktosa (dengan gugus karbonil pada posisi 2 dalam bentuk linier)
mengaktifkan karbon C-3 untuk pembelahan pada langkah keempat glikolisis. Enzimnya yang bertanggung jawab atas isomerisasi ini adalah
phosphoglucoisomerase, juga dikenal sebagai glukosa isomerase fosfat. Pada manusia, enzim membutuhkan Mg2? untuk aktivitas dan sangat spesifik untuk
glukosa-6-fosfat. The? G °? adalah 1,67 kJ / mol, dan nilai? G dalam kondisi seluler (Tabel 19.1) adalah? 2.92 kJ / mol. Ini nilai yang kecil berarti bahwa
reaksi beroperasi mendekati kesetimbangan dalam sel dan mudah dibalik. Phosphoglucoisomerase berasal melalui perantara enediol, seperti yan ditunjukkan
pada Gambar 19.6. Meskipun bentuk glukosa yang dominan 6-fosfat dan fruktosa-6-fosfat dalam larutan adalah bentuk cincin (Gambar 19.6), isomerase
mengubah bentuk rantai terbuka G-6-P dengan rantai terbuka bentuk F-6-P. Reaksi pertama yang dikatalisasi oleh isomerase adalah pembukaan dari cincin
pyranose (Gambar 19.6, Langkah A). Pada langkah selanjutnya, proton C-2 dihapus dari substrat oleh residu basa pada enzim, memfasilitasi pembentukan
perantara enediol (Gambar 19.6, Langkah B). Proses ini kemudian beroperasi agak terbalik (Gambar 19.6, Langkah C), membuat gugus karbonil
di C-2 untuk menyelesaikan pembentukan fruktosa-6-fosfat. Bentuk furanose produk terbentuk dengan cara biasa oleh serangan hidroksil C-5 pada gugus
karbonil, seperti yang ditunjukkan.

Reaksi 3: Phosphofructokinase — Reaksi Priming Kedua

Tindakan phosphoglucoisomerase, "memindahkan" kelompok karbonil dari C-1 hingga C-2, menciptakan fungsi alkohol primer baru di C-1 (lihat Gambar
19.5).
Langkah selanjutnya dalam jalur glikolitik adalah fosforilasi kelompok ini oleh
fosfofruktokinase. Sekali lagi, substrat yang menyediakan fosforil grup adalah ATP. Seperti hexokinase, reaksi glukokinase, fosforilasi dari fruktosa-6-fosfat
adalah reaksi priming dan bersifat endergonik: Fruktosa-6-P? Pi 88n fructose-1,6-bifosfat (19,6) ? G °? ? 16,3 kJ / mol Ketika digabungkan (dengan
fosfofruktokinase) dengan hidrolisis ATP, keseluruhan Reaksi (Gambar 19.7) sangat eksergonik: Fruktosa-6-P? ATP 88n fruktosa-1,6-bifosfat? ADP (19.7)
? G °? ? ? 14,2 kJ / mol ? G (dalam eritrosit) ?? 18,8 kJ / mol Pada pH 7 dan 37 ° C, kesetimbangan reaksi fosfofruktokinase berada jauh di sana kanan.
Sama seperti reaksi heksokinase yang mengikat sel untuk mengambil glukosa Reaksi fosfofruktokinase mengikat sel untuk memetabolisme glukosa daripada
mengubah ke gula lain atau menyimpannya. Begitu pula dengan energi bebas yang besar perubahan reaksi hexokinase membuatnya menjadi kandidat yang
potensial untuk regulasi, sehingga reaksi fosfofruktokinase adalah situs regulasi yang penting— memang, situs paling penting dalam jalur glikolitik.

Peraturan Phosphofructokinase
Phosphofructokinase adalah "katup" yang mengendalikan laju glikolisis. ATP adalah sebuah inhibitor allosterik dari enzim ini. Di hadapan konsentrasi ATP
yang tinggi, fosfofruktokinase berperilaku kooperatif, plot aktivitas enzim versus fruktosa-6-fosfat adalah sigmoid, dan Km untuk fruktosa-6-fosfat adalah
meningkat (Gambar 19.8). Dengan demikian, ketika level ATP cukup tinggi dalam sitosol, glikolisis "mati." Di bawah sebagian besar kondisi seluler, ATP
konsentrasi tidak bervariasi pada rentang yang luas. Konsentrasi ATP dalam otot selama olahraga berat, misalnya, hanya sekitar 10% lebih rendah dari itu
selama keadaan istirahat. Tingkat glikolisis, bagaimanapun, bervariasi jauh lebih banyak. SEBUAH kisaran besar tingkat glikolitik tidak dapat langsung
dihitung hanya dengan 10% perubahan level ATP. AMP membalikkan penghambatan karena ATP, dan kadar AMP dalam sel dapat meningkat
secara dramatis ketika kadar ATP menurun, karena aksi enzim adenilat kinase, yang mengkatalisasi reaksi ADP? ADP 34 ATP? AMP dengan konstanta
kesetimbangan: Keq? ? 0,44 (19,8) Adenylate kinase dengan cepat mengubah ADP, ATP, dan AMP untuk mempertahankan ini kesetimbangan. Level ADP
dalam sel biasanya 10% dari level ATP, dan level AMP sering kurang dari 1% dari konsentrasi ATP. Dalam kondisi seperti itu, perubahan kecil dalam
konsentrasi ATP karena hidrolisis ATP menghasilkan a peningkatan relatif jauh lebih besar pada tingkat AMP karena adenilat kinase aktivitas.

Jelas, aktivitas fosfofruktokinase tergantung pada ATP dan AMP

tingkat dan merupakan fungsi dari status energi seluler. Aktivitas fosfofruktokinase meningkat ketika status energi turun dan menurun ketika energi
statusnya tinggi. Tingkat aktivitas glikolisis menurun ketika ATP berlimpah dan meningkat ketika lebih banyak ATP diperlukan. Glikolisis dan siklus asam
sitrat (akan dibahas dalam Bab 20) digabungkan melalui fosfofruktokinase, karena sitrat, zat antara dalam asam sitrat siklus, adalah inhibitor allosterik
fosfofruktokinase. Saat asam sitrat siklus mencapai saturasi, glikolisis (yang "memberi makan" siklus asam sitrat di bawah kondisi aerobik) melambat.
Siklus asam sitrat mengarahkan elektron ke dalam rantai transpor elektron (untuk tujuan sintesis ATP dalam fosforilasi oksidatif) dan juga menyediakan
molekul prekursor untuk jalur biosintesis. Penghambatan glikolisis oleh sitrat memastikan bahwa glukosa tidak akan terikat kegiatan ini jika siklus asam
sitrat sudah jenuh. Fosfofruktokinase juga diatur oleh? -D-fruktosa-2,6-bifosfat, suatu aktivator alosterik ampuh yang meningkatkan afinita fosfofruktokinase
untuk substrat fruktosa-6-fosfat (Gambar 19.9). Stimulasi fosfofruktokinase juga dicapai dengan mengurangi efek penghambatan ATP (Gambar 19.10).
Fruktosa-2,6-bifosfat meningkatkan aliran bersih glukosa melalui glikolisis dengan menstimulasi fosfofruktokinase dan, seperti yang akan kita lihat pada
Bab 23, dengan menghambat fruktosa-1,6-bisphosphatase, enzim yang mengkatalisasi reaksi ini dalam arah yang berlawanan.

Reaksi 4: Pembelahan Fructose-1,6-bisP oleh

Fructose Bisphosphate Aldolase Fruktosa bifosfat aldolase membelah fruktosa-1,6-bifosfat di antara Karbon C-3 dan C-4 menghasilkan dua fosfat triosa.
Produknya adalah dihydroxyacetone fosfat (DHAP) dan gliseraldehida-3-fosfat. Reaksinya (Gambar 19.11) memiliki konstanta kesetimbangan sekitar 10 4
M, dan G ° yang sesuai 23,9 kJ / mol. Nilai-nilai ini mungkin menyiratkan bahwa reaksi tidak berjalan secara efektif dari kiri ke kanan seperti yang tertulis.
Namun demikian Reaksi membuat dua molekul (gliseraldehida-3-P dan dihidroksiaseton-P) dari satu molekul (fruktosa-1,6-bifosfat), dan dengan demikian
keseimbangannya sangat dipengaruhi oleh konsentrasi. Nilai G dalam eritrosit sebenarnya 0,23 kJ / mol (lihat Tabel 19.1). Pada konsentrasi fisiologis,
reaksi pada dasarnya berada pada keseimbangan.
Reaksi 5: Triose Phosphate Isomerase
Dari dua produk reaksi aldolase, hanya gliseraldehida-3-fosfat masuk langsung ke fase kedua glikolisis. Fosfat triose lainnya, dihydroxyacetone phosphate,
harus dikonversi menjadi glyceraldehyde-3-phosphate oleh enzim triose phosphate isomerase (Gambar 19.14). Reaksi ini dengan demikian memungkinkan
kedua produk dari reaksi aldolase untuk melanjutkan glikolitik jalur, dan pada dasarnya membuat karbon C-1, C-2, dan C-3 sebagai permulaan molekul
glukosa setara dengan karbon C-6, C-5, dan C-4. Itu mekanisme reaksi melibatkan perantara enediol yang dapat menyumbangkan keduanya proton
hidroksilnya menjadi residu dasar pada enzim dan dengan demikian menjadi baik dihidroksiaseton fosfat atau gliseraldehida-3-fosfat (Gambar 19.15). Triose
phosphate isomerase adalah salah satu enzim yang telah berevolusi keadaan "kesempurnaan katalitik," dengan angka turnover di dekat batas difusi
(Bab 14, Tabel 14.5).
Reaksi triomer fosfat isomerase melengkapi fase pertama glikolisis,
setiap glukosa yang melewati dikonversi menjadi dua molekul gliseraldehida-3-fosfat. Meskipun dua langkah terakhir dari jalur tersebut adalah tidak
menguntungkan secara energi, urutan reaksi lima langkah keseluruhan memiliki net G ° dari 2,2 kJ / mol (Keq 0,43). Ini adalah energi bebas hidrolisis dari
keduanya priming molekul ATP yang membuat kesetimbangan keseluruhan tetap dekat ke 1 dalam kondisi kondisi standar. Net G dalam kondisi seluler
adalah cukup negatif (53,4 kJ / mol dalam eritrosit).
19.4 ● Fase Kedua Glikolisis
Bagian kedua dari jalur glikolitik melibatkan reaksi yang mengubah energi metabolik dalam molekul glukosa menjadi ATP. Secara keseluruhan, empat baru
Molekul ATP diproduksi. Jika dua dianggap mengimbangi dua ATP yang dikonsumsi pada fase 1, hasil bersih 2 ATP per glukosa direalisasikan. Fase II
dimulai dengan oksidasi gliseraldehida-3-fosfat, reaksi dengan "tendangan" energi yang cukup besar untuk menghasilkan fosfat berenergi tinggi, yaitu 1,3-
bisfosfogliserat (Gambar 19.16). Transfer fosforil dari 1,3-BPG ke ADP ke membuat ATP sangat menguntungkan. Produk, 3-fosfogliserat, dikonversi
melalui beberapa langkah menuju phosphoenolpyruvate (PEP), fosfat berenergi tinggi. PEP dengan mudah mentransfer gugus fosforilnya ke ADP dalam
piruvat kinase reaksi untuk membuat ATP lain.
Reaksi 6: Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase
Dalam reaksi glikolitik pertama yang melibatkan oksidasi-reduksi, gliseraldehida
3-fosfat dioksidasi menjadi 1,3-bisfosfogliserat oleh gliseraldehida-3-fosfat
dehidrogenase. Meskipun oksidasi aldehida menjadi karboksilat
asam adalah reaksi yang sangat eksergonik, reaksi keseluruhan (Gambar 19.17) melibatkan
baik pembentukan anhidrida karboksilat-fosfat dan reduksi
NAD? untuk NADH dan karena itu sedikit endergonik pada keadaan standar, dengan a panas dalam reaksi ini diarahkan ke pembentukan fosfat berenergi
tinggi senyawa, 1,3-bisphosphoglycerate, dan reduksi NAD ?. Reaksinya mekanisme melibatkan serangan nukleofilik oleh kelompok OSH sistein pada
karbon karbonil gliseraldehida-3-fosfat untuk membentuk hemithioacetal (Gambar 19.18). Intermediate hemithioacetal terurai oleh hidrida
(H ??) transfer ke NAD? untuk membentuk thioester berenergi tinggi. Serangan nukleofilik oleh fosfat menggantikan produk, 1,3-bisphosphoglycerate, dari
enzim. Enzim dapat dinonaktifkan dengan reaksi dengan iodoacetate, yang bereaksi dengan dan memblokir sistein sulfhidril esensial. Reaksi gliseraldehida-
3-fosfat dehidrogenase adalah tempat terjadinya aksi arsenate (AsO4 3?), Suatu anion analog dengan fosfat. Arsenate adalah sebuah substrat efektif dalam
reaksi ini, membentuk 1-arseno-3-phosphoglycerate (Gambar 19.19), tetapi arsenat asil cukup tidak stabil dan dihidrolisis dengan cepat. 1-Arseno-3-
phosphoglycerate terurai untuk menghasilkan 3-phosphoglycerate, produk dari reaksi ketujuh glikolisis. Hasilnya adalah glikolisis berlanjut di hadapan
arsenate, tetapi molekul ATP terbentuk dalam reaksi 7 (fosfogliserat kinase) tidak dibuat karena langkah ini telah dilewati. Kestabilan 1-arseno-3-
fosfogliserat efektif memisahkan oksidasi dan kejadian fosforilasi, yang biasanya tergabung erat dalam gliseraldehida Reaksi dehidrogenase 3-fosfat.
Reaksi 7: Fosfogliserat Kinase
Jalur glikolitik memecah bahkan dalam hal ATP dikonsumsi dan diproduksi dengan reaksi ini. Enzim phosphoglycerate kinase mentransfer fosforil
kelompok dari 1,3-bisphosphoglycerate ke ADP untuk membentuk ATP (Gambar 19.20).Karena setiap molekul glukosa mengirimkan dua molekul
gliseraldehida-3-fosfat ke fase kedua glikolisis dan karena dua ATP dikonsumsiper glukosa dalam reaksi fase pertama, reaksi kinase fosfogliserat
"Membayar" utang ATP yang diciptakan oleh reaksi priming. Seperti yang mungkin diharapkan untuk enzim transfer fosforil, Mg2? ion diperlukan untuk
aktivitas, dan benar substrat nukleotida untuk reaksi adalah MgADP ?. Sangat tepat untuk dilihat reaksi keenam dan ketujuh glikolisis sebagai pasangan
berpasangan, dengan 1,3-bisb fosfogliserat sebagai zat antara. Reaksi fosfogliserat kinase cukup eksergonik pada keadaan standar untuk menarik
dehidrogenase G-3-P reaksi bersama. (Faktanya, aldolase dan triose phosphate isomerase jugaditarik ke depan oleh fosfogliserat kinase.) Hasil bersih dari ini
digabungkan reaksi adalah Glyceraldehyde-3-phosphate ADP Pi NAD 88n 3-phosphoglycerate ATP NADH H GÂ ° 12,6 kJ / mol (19,9)
Reaksi 8: Phosphoglycerate Mutase
Langkah-langkah yang tersisa di jalur glikolitik mempersiapkan sintesis kedua
Setara dengan ATP. Ini dimulai dengan reaksi mutase phosphoglycerate
(Gambar 19.23), di mana gugus fosforil 3-fosfogliserat dipindahkan dari C-3 ke C-2. (Istilah mutase diterapkan pada enzim yang mengkatalisasi migrasi
dari kelompok fungsional dalam molekul substrat.) Perubahan energi gratis untuk reaksi ini sangat kecil dalam kondisi seluler (G 0,83 kJ / mol dalam
eritrosit). Enzim fosfogliserat mutase diisolasi dari berbeda sumber menunjukkan mekanisme reaksi yang berbeda. Seperti yang ditunjukkan pada Gambar
19.24, the enzim yang diisolasi dari ragi dan dari otot kelinci membentuk zat antara fosfoenzim, gunakan 2,3-bisphosphoglycerate sebagai kofaktor, dan
menjalani antarmolekul transfer gugus fosforil (di mana fosfat produk 2-fosfogliserat bukan itu dari substrat 3-fosfogliserat). Yang lazim bentuk
fosfogliserat mutase adalah fosfoenzim, dengan gugus fosforil terikat secara kovalen ke residu histidin di lokasi aktif. Kelompok fosforil ini dipindahkan ke
posisi C-2 substrat untuk membentuk transien, enzim-terikat 2,3-bisphosphoglycerate, yang kemudian terurai oleh fosforil kedua transfer dari posisi C-3
antara ke histidin residu pada enzim. Sekitar sekali dalam setiap 100 pergantian enzim, zat antara, 2,3-bisphosphoglycerate, terlepas dari situs aktif,
meninggalkan enzim tidak aktif, tidak terfosforilasi. Enzim yang tidak terfosforilasi dapat diaktifkan kembali dengan mengikat 2,3-BPG. Untuk alasan ini,
aktivitas maksimal fosfogliserat mutase mensyaratkan adanya sejumlah kecil 2,3-BPG. Mekanisme berbeda beroperasi dalam enzim bibit gandum. 2,3-
Bisphosphoglycerate bukan kofaktor. Sebagai gantinya, enzim melakukan intramolekul transfer gugus fosforil (Gambar 19.25). C-3 fosfat adala dipindahkan
ke residu situs aktif dan kemudian ke posisi C-2 dari aslinya molekul substrat untuk membentuk produk, 2-fosfogliserat.
Reaksi 9: Enolase
Ingatlah bahwa, sebelum mensintesis ATP dalam reaksi kinase fosfogliserat, pertama-tama perlu membuat substrat yang memiliki fosfat berenergi tinggi.
Reaksi 9 glikolisis juga membuat fosfat berenergi tinggi dalam persiapan untuk sintesis ATP. Enolase mengkatalisasi pembentukan fosfoenolpiruvat dari 2-
phosphoglycerate (Gambar 19.26). Reaksi pada intinya melibatkan a dehidrasiâ € ”penghilangan molekul airâ €” untuk membentuk struktur enol dari
SEMANGAT. GÂ ° untuk reaksi ini relatif kecil pada 1,8 kJ / mol (Keq 0,5); dan, dalam kondisi seluler, G sangat mendekati nol. Mengingat kondisi ini,
mungkin sulit pada awalnya untuk memahami bagaimana reaksi enolase berubah substrat dengan energi bebas hidrolisis yang relatif rendah menjadi suatu
produk (PEP) dengan energi bebas hidrolisis yang sangat tinggi. Teka-teki ini diklarifikasi dengan nyata- mengetahui bahwa 2-fosfogliserat dan PEP
mengandung jumlah potensial yang sama energi metabolik, berkenaan dengan dekomposisi menjadi Pi, CO2, dan H2O. Apa reaksi enolase yang dilakukan
adalah mengatur ulang media menjadi bentuk yang darinya lebih banyak energi potensial ini dapat dilepaskan pada hidrolisis. Enzimnya adalah sangat
dihambat oleh ion fluoride dengan adanya fosfat. Inhibisi muncul dari pembentukan fluorophosphate (FPO3 2?), Yang membentuk kompleks dengan Mg2?
di situs aktif enzim.
Reaksi 10: Piruvate Kinase
Reaksi sintesis ATP kedua glikolisis dikatalisis oleh piruvat kinase, yang membawa jalur akhirnya ke titik cabang piruvatnya. Piruvat kinase memediasi
transfer gugus fosforil dari fosfoenolpiruvat ke ADP untuk membuat ATP dan piruvat (Gambar 19.27). Reaksi membutuhkan Mg2? dan apakah dirangsang
oleh K? dan kation monovalen tertentu lainnya. 19.4 ● Fase Kedua Glikolisis 629 GAMBAR 19.28 ● Konversi fosfoenolpiruvat (PEP) menjadi piruvat
mungkin Tautomerisasi bersifat spontan (? G °??? 35-40 kJ / mol) dan menyumbang banyak perubahan energi gratis untuk hidrolisis PEP.
Piruvat
GAMBAR 19.27 ● Reaksi piruvat kinase. Keq yang sesuai pada 25 ° C adalah 3,63? 105, dan jelas bahwa piruvat Keseimbangan reaksi kinase terletak
sangat jauh ke kanan. Efek konsentrasi mengurangi besarnya perubahan energi bebas di lingkungan seluler, tetapi? G dalam eritrosit masih cukup
menguntungkan pada? 23.0 kJ / mol. Perubahan energi bebas tinggi untuk konversi PEP ke piruvat adalah karena sebagian besar ke konversi enol tautomer
yang sangat menguntungkan dan spontan piruvat ke bentuk keto yang lebih stabil (Gambar 19.28) mengikuti langkah transfer kelompok fosforil.

Besar negatif? G reaksi ini membuat piruvat kinase menjadi target yang cocok situs untuk regulasi glikolisis. Untuk setiap molekul glukosa dalam glikolisis
jalur, dua ATP dibuat pada tahap piruvat kinase (karena dua triose molekul diproduksi per glukosa dalam reaksi aldolase). Karena jalur impas dalam hal
ATP pada reaksi kinase fosfogliserat (dua ATP dikonsumsi dan dua ATP diproduksi), dua ATP diproduksi oleh piruvat kinase mewakili "hasil" dari
glikolisis — hasil bersih dari dua ATP smolekul. Piruvat kinase memiliki situs alosterik untuk banyak efektor. Ini diaktifkan oleh AMP dan fruktosa-1,6-
bifosfat dan dihambat oleh ATP, asetil-KoA, dan alanin. (Perhatikan bahwa alanin adalah α-asam amino mitra? –Keto asam, piruvat.) Selanjutnya, piruvat
kinase hati diatur oleh kovalen modifikasi. Hormon seperti glukagon mengaktifkan protein yang tergantung pada cAMP kinase, yang mentransfer gugus
fosforil dari ATP ke enzim. Fosforilasi bentuk piruvat kinase lebih kuat dihambat oleh ATP dan alanin dan memiliki Km lebih tinggi untuk PEP, sehingga,
di hadapan tingkat fisiologis PEP, enzim tidak aktif. Kemudian PEP digunakan sebagai substrat untuk glukosa sintesis dalam jalur glukoneogenesis (akan
dijelaskan dalam Bab 23), sebagai gantinya terjadi melalui glikolisis dan siklus asam sitrat (atau rute fermentasi). Geometri situs aktif yang disarankan untuk
piruvat kinase, berdasarkan pada NMR dan EPR studi oleh Albert Mildvan dan rekannya, disajikan pada Gambar 19.29. Karbonil oksigen piruvat dan fosfor
ATP terletak dalam 0,3 nm satu sama lain di situs aktif, konsisten dengan transfer langsung fosforil kelompok tanpa pembentukan zat antara fosfoenzim.