Laporan Praktikum Biokimia
Laporan Praktikum Biokimia
Identifikasi Protein
Oleh :
Shif/Kelompok :B
Asisten :
2015
A. TUJUAN :
Dapat memahami metode identifikasi protein.
B. PRINSIP DASAR :
Uji protein dengan metode identifikasi protein secara kualitatif dapat menggunakan
prinsip:
Uji Biuret: pembentukan senyawa kompleks koordinat yang berwarna yang dibentuk oleh
𝐶𝑢2+ dengan gugus –CO dan –NH pada ikatan peptida dalam larutan suasana basa.
Pengendapan dengan logam: pembentukan senyawa tak larut antara protein dan logam berat.
Pengendapan dengan garam: pembentukan senyawa tak larut antara protein dan ammonium
sulfat
Pengendapan dengan alcohol: pembentukan senyawa tak larut antara protein dan alcohol
Uji koagulasi: perubahan bentuk yang ireversibel dari protein akibat dari pengaruh
pemanasan.
Denaturasi protein: perubahan pada suatu protein akibat dari kondisi lingkungan yang sangat
ekstrim.
C. TEORI DASAR
Protein
Kata protein sebenarnya berasal dari kata Yunani yang berarti pertama yang paling penting,
asal dari kata protos. Protein terdiri dari bermacam-macam golongan makromolekul heterogen.
Walaupun demikian semuanya merupakan turunan dari polipeptida dengan berat molekul yang
tinggi, secara kimia dapat dibedakan antara protein sederhana yang terdiri dari polipeptida
dengan berat molekkul yang tinggi. Secara kimia dapat dibedakan antara protein sederhana yang
terdiri dari polipeptida dan protein kompleks yang mengandung zat-zat makanan tambahan
seperti hern, karbohidrat, lipid atau asam nukleat. Untuk protein kompleks, bagian polipeptida
dinamakan aproprotein dan keseluruhannya dinamakan haloprotein. Secara fungsional protein
juga menunjukkan banyak perbedaan. Dalam sel mereka berfungsi sebagai enzim, bahan
bangunan, pelumas dan molekul pengemban. Tapi sebenarnya protein merupakan polimer alam
yang tersusun dari berbagai asam amino melalui ikatan peptida (Hart, 1987).
Protein adalah suatu senyawa organik yang mempunyai berat molekul besar antara ribuan
hingga jutaan satuan(g/mol). Protein tersusun dari atom-atom C,H,O dan N ditambah beberapa
unsur lainnya seperti P dan S. Atom-atom itu membentuk unit-unit asam amino. Urutan asam
amino dalam protein maupun hubungan antara asam amino satu dengan yang lain, menentukan
sifat biologis suatu protein. (Girinda, 1990).
Protein adalah sumber asam amino yang mengandung unsur C,H,O dan N yang tidak dimiliki
oleh lemak dan karbohidrat. Molekul protein mengandung gula terpor belerang, dan ada jenis
protein yang mengandung unsur logam seperti besi dan tembaga. (Winarnno, 1997).
Kunci ribuan protein yang berbeda strukturnya adalah gugus pada molekul unit
pembangunan protein yang relatif sederhana dibangun dari rangkaian dasar yang sama, dari 20
asam amino mempunyai rantai samping yang khusus, yang berikatan kovalen dalam urutan yang
khas. Karena masing-masing asam amino mempunyai rantai samping yang khusus yang
memberikan sifat kimia masing-masing individu, kelompok 20 unit pembangunan ini dapat
dianggap sebagai abjad struktur protein. (Lehninger, 1996).
Fungsi Protein
Sebagai Enzim
Hampir semua reaksi biologis dipercepat atau di bantu oleh suatu senyawa makromolekul
spesifik yang disebut enzim, dari reaksi yang sangat sederhana seperti reaksi transportasi
karbondioksida yang sangat rumit seperti replikasi kromosom. Protein besar peranannya
terhadap perubahab-perubahan kimia dalam system biologis.
Alat Pengangkut dan Penyimpanan
Banyak molekul dengan MB kecil serta beberapa ion dapat diangkut atau dipindahkan oleh
protein-protein tertentu. Misalnya hemoglobin mengangkut oksigen dalam eritrosit, sedangkan
mioglobin mengangkut oksigen dalam otot.
Pengatur Pergerakan
Protein merupakan komponen utama daging, gerakan otot terjadi karena adanya dua molekul
protein yang saling bergeseran.
Penunjang Mekanik
Kekuatan dan daya tahan robek kulit dan tulang disebebkan adanya kolagen, suatu protein
berbentuk bulat panjang dan mudah membentuk serabut
Pertahanan Tubuh atau Imunisasi
Pertahanan tubuh biasanya dalam bentuk antibody, yaitu suatu protein khusus yang dapat
mengenal dan menempel atau mengikat benda-benda asing yang masuk ke dalam tubuh seperti
virus, bakteri, dan sel-sel asing lain.
Media Perambatan Impuls Saraf
Protein yang mempunyai fungsi ini biasanya berbentuk reseptor, misalnya rodopsin, suatu
protein yang bertindak sebagai reseptor penerima warna atau cahaya pada sel-sel mata
Pengendalian Pertumbuhan
Protein ini bekerja sebagai reseptor (dalam bakteri) yang dapat mempengaruhi fungsi bagian-
bagian DNA yang mengatur sifat dan karakter bahan. (Lehninger, 1996)
Sifat fisikokimia setiap protein tidak sama, tergantung pada jumlah dan jenis
asam aminonnya
Berat molekul protein sangat besar
Ada protein yang larut dalam air, ada pula yang tidak larut dalam air, tetapi semua protein
tidak larut dalam pelarut lemak
Bila dalam suatu larutan protein ditambahkan garam, daya larut protein akan berkurang,
akibatnya protein akan terpisah sebagai endapan. Peristiwa pemisahan protein ini disebut salting
out
Apabila protein dipanaskan atau ditambahkan alkohol maka protein akan menggumpal
Protein dapat bereaksi dengan asam dan basa
Struktur Protein
Struktur protein distabilkan oleh 2 macam ikatan yang kuat (peptida dan sulfida) dan dua
macam ikatan yang lemah(hidrogen dan hidrofobik). Ikatan peptida adalah struktur primer
protein yang berasal dari gabungan asam amino L-alfa oleh ikatan alfa-peptida. Bukti utama
untuk ikatan peptida sebagai ikatan struktur primer dituliskan sebagai berikut:
a. Protease adalah enzim yang menghidrolisis protein, menghaslkan polipeptida sebagai
produknya. Enzim ini juga menghidrolisis ikatan peptida protein.
b. Spektrum inframerah protein menunjukkan adanya banyak ikatan peptida
c. Dua protein, insulin dan ribonuklease telah disintesis hanya dengan menggabungkan asam-
asam amino dengan ikatan peptida.
d. Protein mempunyai sedikit gugus karboksil dan gugus amina yang dapat dititrasi.
e. Protein dan polipeptida sintetik bereaksi dengan pereaksi biuret, membentuk warna merah
lembayung. Reaksi ini spesifik untuk 2 ikatan peptida atau lebih.
f. Penyediaan difraksi sinar X pada tingkat kekuatan pisah 0,2mm telah menyajikan identifikasi
ikatan peptida pada protein mioglobin dan hemoglobin. (Winarno, 1997)
Uji Biuret
Pada uji biuret, ketika beberapa tetes larutan CuSO4 yang sangat encer ditambahkan pada
alkali kuat dari peptida atau proteindihasilkan warna ungu, adalah test yang umum untuk protein
dan diberikan oleh peptida yang berisi dua atau lebih rantai peptida. Biuret dibentuk dengan
pemanasan urea dan mempunyai struktur mirip dengan struktur peptida dari protein. (Routh,
1969)
Uji Koagulasi
Protein dengan penambahan asam atau pemanasan akan terjadi koagulasi. Pada pH iso-
elektrik ( pH pada larutan tertentu biasanya sekitar 4-4,5 dimana protein mempunyai muatan
positiof dan muatan negative sama, sehingga saling menetralkan) kelarutan protein sangat
menurun atau mengendap. Pada temperature diatas 60 kelrutan akan berkurang (koagulasi)
karena pada temperature yang tinggi energy kinetic protein meningkat sehingga terjadi getaran
yang cukup kuat untuk merusak ikatan atau struktur sekunder, tersier dan kuarterner koagulasi.
5. UJI KOAGULASI
Alat : 1. Tabung reaksi Bahan : 1. Asam asetat 1 M
2. pipet tetes 2. larutan protein
3. gelas ukur 3. Reagen millon
4. stopwatch 4. air
5. batang pengaduk
6. DENATURASI PROTEIN
Alat : 1. Tabung reaksi Bahan : 1. Larutan albumin
2. Pipet tetes 2. Buffer asetat pH 4,7 (1 M)
3. gelas ukur 3. HCl 0,1 M
4. stopwatch 4. NaOH 0,1 M
5. thermometer, pH meter
PROSEDUR KERJA
1. UJI BIURET
5ml larutan protein dijenuhkan dengan ammonium sulfat ditambahkan sedikit garam.
↓
Diaduk hingga melarut kemudian ditambahkan sedikit lagi ammonium sulfat lalu diaduk lagi.
↓
Setelah larutan jenuh, lalu disaring.
↓
Uji kelarutan endapan didalam air
↓
Endapan diuji lagi dengan Reagen Millon dan difiltrat dengan uji biuret
Uji Koagulasi
Denaturasi Protein
DATA PENGAMATAN
PEMBAHASAN
1. UJI BIURET
Larutan yang digunakan pada reaksi uji protein, terutama pada uji biuret adalah albumin
dan gelatin. Albumin didapat dari larutan putih telur, telur sebagai sumber protein mempunyai
banyak keunggulan antara lain, kandungan asam amino paling lengkap dibandingkan bahan
makanan lain seperti ikan, daging, ayam, tahu, tempe, dll. Nilai gizi telur sangat lengkap, yeitu
merupakan sumber protein yang baik, kadarnya sekitar 14%, sehingga dari tiap butir telur akan
diperoleh sekitar 8 gram protein. Kandungan asam amino proteinnya sangat lengkap. Telur kaya
fosfor dan besi, tetapi kandungan kalsiumnya rendah. Selain itu telur juga mengandung vitamin
B kompleks, serta vitamin dan D.
Pada percobaan biuret ini yaitu yang pertama larutan protein (albumin) ditambahkan
larutan natrium hidroksida 2,5 N yang kemudian diaduk. Pada albumin terdapat endapan putih di
dalam larutan, yang mulanya albumin berwarna putih kental. Penambahan larutan natrium
hidroksida pada larutan protein tersebut yaitu sebagai katalis yang berfungsi untuk
menghancurkan atau memecahkan protein. Kemudian ditambahkan juga dengan larutan tembaga
sulfat pada larutan protein tersebut (albumin). Terjadi perubahan warna pada larutan albumin
setelah ditambahkan tembaga sulfat dan dikocok yaitu warna larutan menjadi berwarna ungu dan
warna ungu tetap tidak hilang walaupun ditambahkan larutan tembaga sulfat setetes demi tetes
dan kemudian di kocok, serta masih terdapat endapan putih, yang mulanya larutan tersebut
berwarna putih terdapat endapan. Untuk membuktikan adanya peptida pada protein (albumin),
yaitu dengan penambahan larutan tembaga sulfat pada larutan albumin, larutan tembaga sulfat
yang bersifat basa bereaksi dengan polipeptida, sedangkan polipeptida merupakan penyususn
protein. Yang menandakan positif adanya protein yaitu terdapat ikatan peptida lebih banyak,
dapat dibuktikan saat penambahan larutan tembaga sulfat setetes demi tetes dan dikocok larutan
tetap berwarna ungu, hal ini menandakan bahwa ikatan peptidanya kuat, karena apabila ikatan
peptinya lemah, saat larutan protein ditambahkan tembaga sulfat yaitu warna ungunya akan
memudar saat dikocok.
Reaksi uji biuret ini memberikan hasil yang positif akibat pembentukan senya kompleks
Cu 2+ gugus CO dan NH dari suatu rantai peptida dalam suasana basa. Dipeptida dari asam-
asam amino histidin, serin, dan treonin tidak memberikan reaksi untuk uji biuret. Pada percoban
larutan sampel yang memberikan hasil uji positif adalah albumin.
2. PENGENDAPAN DENGAN LOGAM
Pada percobaan pengendapan dengan logam, 2 tabung yang berisi larutan albumin, pada
tabung pertama ditambahkan HgCl2 dan tabung kedua ditambahkan PbSO4, penambahan larutan
HgCl2 dan PbSO4 pada larutan albumin secara bersamaan, supaya dapat dibandingkan larutan
mana yang lebih cepat bereaksi, dan yang lebih bereaksi adalah larutan albumin yang
ditambahkan HgCl2. warna albumin yang ditambahkan HgCl2 yaitu putih, sedangkan pada
albumin yang ditambahkan PbSO4 berwarna putih keruh. Warna semula laruta albumin yaitu
putih kental.
Dari percobaan diatas, masing-masing larutan protein (albumin) yang ditambahkan
HgCl2 lebih cepat bereaksi dibandingkan PbSO4. Larutan protein yang ditambahkan HgCl2
lebih cepat bereaksi karena apabila protein direaksikan dengan logam akan terjadi ikatan lebih
kuat dan itu yang menyebabkan terjadi reaksi lebih cepat, sehingga akan mempengaruhi logam
berat terhadap larutan protein. Dan hal ini juga terjadi karena tetapan disosiasi HgCl2 lebih besar
daripada PbSO4. Pada saat ditambahkan ke dalam larutan protein, HgCl2 akan terionisasi dan
lebih banyak dalam bentuk Hg2+sehingga protein lebih cepat bereaksi dengan Hg2+ tersebut dan
menghasilkan endapan atau gumpalan dalam jumlah yang lebih banyak ketimbang pengendapan
oleh logam PbSO4 yang memiliki tetapan disosiasi lebih kecil dari Hg.
Ikatan yang amat kuat dari reaksi protein yang ditambahkan dengan HgCl2 akan
memutuskan ikatan jembatan garam, sehingga akan terjadi denaturasi, secara bersama gugus –
COOH dan gugus –NH2 yang terdapat pada protein dapat bereaksi dengan ion logam berat dan
dapat membentuk senyawa kelat. Ion-ion yang dapat membentuk endapan logam dengan protein
antara lain adalah Ag, Ca, Zn, Hg, Fe, Cu, Co, Mn, dan Pb. Selain gugus –COOH dan gugus –
NH2, gugus –R pada molekul asam amino tertentu dapat pula mengadakan reaksi dengan ion
atau senyawa lain. Gugus –SH pada molekul akan bereaksi dengan dengan ion Hg. Jumlah
endapan yang dihasilkan dipengaruhi oleh kereaktifan logam berat yang ditambahkan. Logam
Hg lebih reaktif daripada logam Pb karena merupakan logam transisi pada sistem periodik.
3. PENGENDAPAN DENGAN GARAM
Yang dilakukan pada percobaan ini adalah protein (albumin) dijenuhkan dengan
amonium sulfat. Dengan cara ditambahkan amonium sulfat, ditambahkan amonium sulfat dan
juga diaduk lagi sehingga tertinggal sedikit garam.
Pada larutan protein tersebut (albumin) terdapat endapan putih dilapisan bawah, endapan
putih itu adalah endapan garam yang tidak larut akibat ditambahkan dengan ammonium sulfat,
peristiwa pemisahan protein ini disebut salting out. Hal ini terjadi karena ammonium sulfat
memiliki tingkat kelarutan yang lebih tinggi daripada protein. Sehingga pada saat penambahan
ammonium sulfat, ammounium sulfat akan melarut dalam air/pelarutnya dan mendesak protein
keluar, kembali dalam bentuk solidnya sehingga terbentuklah protein yang terendapkan. Dan
endapan putih tersebut juga di saring menggunakan kertas saring, kemudian hasil saring dari
protein tersebut (albumin) dilarutkan menggunakan air, dilarutkan menggunakan reagen Millon,
dan difiltrat juga dengan uji biuret. Pada endapan garam yang dilarutkan dengan air yaitu semua
endapan larut, karena sifat garam yang hidrofobik, jadi saat garam dilarutkan pada air, garam
akan menyerap air sehingga garam mudah larut dalam air. Bila garam netral yang ditambahkan
berkonsentrasi tinggi, maka protein akan mengendap. Pengendapan terus terjadi karena
kemampuan ion garam untuk mengdehidrasi, sehingga terjadi kompetisi antara garam anorganik
dengan molekul protein untuk mengikat air.Karena garam anorganik lebih menarik air maka
jumlah air yang tersedia untuk molekul protein akan berkurang.
Pada hasil endapan albumin yang ditambahkan amonium sulfat dilarutkan dengan reagen
millon yaitu endapan tidak larut pada reagen millon dan endapannya berwarna orange, padahal
mulanya endapan tersebut berwarna putih. Prinsip reagen millon itu sendiri pembentukan garam
merkuri dari tirosin yang tertitrasi. Tirosin merupakan asam amino yang mempunyai molekul
fenol pada gugus R-nya, yang akan membentuk garam merkuri dengan pereaksi millon. Dari
hasil percobaan, diketahui bahwa protein albumin mengandung Tirosin sebagai salah asam
amino penyusunnya. Tirosin memiliki molekul fenol pada gugus R-nya.
Selain dilarutkan dalam air dan reagen millon, hasil endapan protein yang ditambahkan
dengan amonium sulfat juga di filtrat dengan ditambahkan NaOH, dan kemudian juga
ditambahkan dengan CuSO4. Pada endapan albumin yang difiltrat dan ditambahkan NaOH, yaitu
menjadi larutan jernih dan setelah ditambah CuSO4 larutan berubah menjadi berwarna biru.
Warna biru inilah yang menjunjukan bahwa masih ada ikatan peptida dalam larutan, ini berarti
juga masih ada protein dalam larutan yang belum terendapkan sempurna dengan penambahan
garam amonium sulfat tersebut.
6. DENATURASI PROTEIN
Disiapkan 3 tabung rekasi yang berisi larutan albumin masing-masing sebanyak 4,5 ml,
pada tabung pertama yang berisi larutan albumin ditambahkan dengan HCl 0,1 M sebanyak 0,5
ml, setelah ditambahkan HCl 0,1 M pada larutan albumin, yaitu larutan tetap berwarna putih
keruh. Kemudian larutan tersebut dipanaskan selama 15 menit, setelah dipanaskan terjadi
endapan putih, cairan putih diatasnya sedikit. Protein akan terdenaturasi atau mengendap bila
berada pada titik isolistriknya, yaitu pH dimana jumlah muatan positif sama dengan jumlah
muatan negatifnya.
Pada tabung yang kedua berisi larutan albumin ditambahkan dengan NaOH 0,1 M 0,5 ml,
reaksi yang di dapat setelah penambahan NaOH pada larutan albumin yaitu warnanya tetap putih
keruh. Kemudian larutan tersebut dipanaskan selama 15 menit, setelah dipanaskan terjadi reaksi
yaitu endapan putih, cairan putih diatasnya sedikit.. Setelah larutan tersebut didinginkan lalu
ditambahkan dengan Buffer asetat pH 4,7 (5 M) 5 ml dan tidak ada perubahan yang terjadi.
Seharusnya protein yang dilarutkan dalam HCl maupun NaOH, keduanya tidak menunjukkan
adanya pengendapan ini akibat dari kesalahan praktikan mungkin pada saat praktikum memakai
pipet tetes yang tidak dicuci pada saat mengambil antara zat 1 dengan yang lainnya sehingga
tercampur. Namun setelah ditambahkan buffer asetat dengan volume berlebih, protein pun
mengendap hal ini menunjukkan bahwa protein albumin mengendap pada titik isolistriknya,
yaitu sekitar pH 4,7. Setelah pemanasan ketiga tabung tidak terjadi perubahan apapun.
Seharusnya menghasilkan endapan yang lebih banyak dengan tingkat pengendapan sama seperti
di atas, hal tersebut dikarenakan panas dapat mengacaukan ikatan hydrogen ddan interaksi
hidrofobik non polar, hal ini terjadi karena suhu tinggi yang dapat meningkatkan energy kinetic
dan menyebabkan molekul penyusun protein bergerak atau bergetar sangat cepat, sehingga
mengkacaukan ikatan protein tersebut.
DAFTAR PUSTAKA
Girindra, A. 1986. Biokimia I. Gramedia, Jakarta.
Hart,H, 1987, KIMIA ORGANIK, alih bahasa: Sumanir Ahmadi, Erlangga, Jakarta
Lehninger, A. 1988. Dasar-dasar Biokimia. Terjemahan Maggy Thenawidjaya. Erlangga, Jakarta
Ridwan, S. 1990. Kimia Organik edisi I. Binarupa Aksara: Jakarta
Routh, J.I, 1969, ESSENTIAL of GENERAL ORGANIC and BIOCHEMISTRY, W.B.Sounders
Company, Philadelphia
Wibowo, luqman. 2009. Deskripsi dan macam-macam tingkatan struktur protein. Bandung
Winarno, F.G, 1997, KIMIA PANGAN dan GIZI, Gramedia Pustaka Utama, Jakarta