FILSAFAT BIOKIMIA

OLEH

Dr LA ODE SUMARLIN, M.Si

Program Studi Kimia

Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah
Jakarta
What is life & How do
we life?
Where were we came
from?
 Darwin (1809-1882)

• Apakah evolusi itu terjadi?

• Bagaimanakah kehidupan bermula?

Louis Pasteur(1822-1895)
 What exactly makes us different from our animal cousins?

With the completion of the human

genome project, we now know that at the
DNA level, we are 96–98% identical to
our closest cousin, the chimpanzee.

We have sought to understand what we are made of, what drives our
constant fight against entropy, and what defines us as thinking, living
entities?
What is the nature of the mind? How do the emergent properties of
consciousness arise from the underlying interactions of synapses and
neural pathways in our brain?
What is love, hate, and emotion?

It is quite clear from decades of research that everything we feel, whether it be

sensation or emotion, is mediated by the release of molecules, largely
neuropeptides, between synapses in the brain.
Dopamine, serotonin, epinephrine, and a large cadre of other small molecules act as
the signals between our brain cells. Our understanding is growing piecemeal, but as
with the emergence of consciousness, soon we will hopefully be able to synthesize a
complete model of emotion, including not only happiness, anger, sadness, joy, fear,
and courage, but also spiritual experiences, amazement, and euphoria.
 APA YANG ANDA KETAHUI
TENTANG BIOKIMIA
DIPELAJARI :
❖Sifat zat kimia yang terdapat dalam jasad hidup
❖Senyawa yang diproduksinya
❖Fungsi dan transformasi zat kimia itu
❖Telaah transformasi tersebut sehubungan dengan aktivitas
kehidupan

Jasad hidup itu merupakan kumpulan zat tak hidup (inanimate

mattter). Dapat diisolasi dan dipelajari dengan berbagai cara
kimia dan fisika seperti yang biasa dilakukan terhadap senyawa
kimia.

Jasad hidup ini dapat didefinisikan sebagai kumpulan zat tak

hidup yang dapat berbaur dan bereaksi serta berinteraksi satu
sama lain dengan cara dan susunan yang sangat rumit namun
diatur dengan baik.
 CIRI ZAT HIDUP
• Susunan molekul zat hidup rumit dan terorganisir
dengan rapi: struktur dalam (internal structure) yang
teratur terdiri atas susunan molekul kimia organik
yang kompleks; tiap organisme mempunyai susunan
yang berlainan; strukturnya sangat berbeda daripada
zat tak hidup yang ada disekelilingnya seperti tanah,
air dan batuan yang merupakan campuran yang tidak
teratur dari berbagai senyawa kimia sederhana.

• Setiap komponen zat hidup mempunyai fungsi yang

berlainan dan khusus.

• Zat hidup berkemampuan untuk mengambil energi

dari sekelilingnya.

• Zat hidup mempunyai kemampuan untuk mereplikasi

diri.
 Perkembangan Biokimia
• Paracellus (1493-1541) : Mengaitkan ilmu kimia dengan
bidang pengobatan
• Dalton (1804) : Bidang analisis kuantitatif untuk mengenal
senyawa kimia dalam jasad hidup beserta sintesis dan
degradasinya dinamakan.......BIOKIMIA STRUKTUR
• Lavoisier : Menemukan hubungan pembentukan panas
dengan penguapan dan Hukum kekekalan energi .....KIMIA
DINAMIKA
• Penemuan enzim sebagai katalisator : Memperkuat
landasan pengetahuan dalam bidang nutrisi dan
metabolisme. Metabolisme digunakan untuk mengetahui
penyebab timbulnya beberapa penyakit
• Perkembangan bidang Biologi
• Perkembangan bidang mikrobiologi : Proses biokimia dapat
diterangkan melalui penelitian mikrobiologi.
 Perkembangan Biokimia
(Lanjutan)
• Penemuan-penemuan baru yang merangsang perkembangan
BIOKIMIA :
• Prinsip-prinsip pemindahan energi dalam sel
• Mekanisme pengaturan metabolisme
• Peran membran dalam sel dan ribosom serta berbagai
elemen struktur yang lain dalam sel yaitu susunan asam
amino yang menentukan konformasi 3 dimensi dari protein
dengan segala fungsi biologisnya serta pengetahuan dasar
molekulernya. Hal ini memperkuat kehadiran biokimia yang
menunjang biologi.
• Jadi ILMU BIOKIMIA memberi pengertian mendasar
mengenai aktivitas kimia dalam segala jasad dalam
menunjang pengetahuan kedokteran dan pertanian. Bidang
kedokteran untuk penentuan diagnosis penyakit sampai
pengobatannya. Bidang pertanian untuk teknologi
berproduksi dan pasca panen serta pembenihan, pemuliaan
tanaman dan hewan.
ORGANISASI KEHIDUPAN
MAHLUK
HIDUP
Mis : Sist pernapasan,
pencernaan, etc SISTEM ORGAN

Mis : akar, batang,

daun,, jantung, paru ORGAN

Mis : jar epithel, xilem,

floem, epidermis, etc JARINGAN

SEL
• Beberapa cakupan BIOKIMIA :
• Unsur-unsur dan molekul kimia apa saja yang
terdapat dalam jasad hidup ?
• Berapa jumlah dan bandingannya
• Apa fungsinya?
• Bagaimana mereka berinteraksi satu sama lain ?
• Bagaimana bisa ada di sana ?
• Molekul yang terdapat dalam jasad hidup
dinamakan biomolekul :
a. Tunduk pada hukum kimiawi
b. Berinteraksi satu sama lain dengan prinsip-
prinsip yang berlainan
c. Hampir semua merupakan senyawa
karbon.26
 Atom Karbon & Gugus Fungsional
ATOM KARBON:
• saling memberi pasangan elektron pada sesamanya membentuk ikatan
tunggal yang stabil dengan 1 sampai 4 karbon yang lain.
• Dapat memberi 2 elektron membentuk ikatan rangkap
• Ikatan kovalen
c.1. Lurus pasang
c.2. Bercabang
c.3. Siklik

Gugus fungsional biomolekul

• Gugus yang lebih reaktif dibanding dengan tulang karbon yang jenuh
• Sifat – sifat kimia dan reaksi suatu biomolekul dapat di duga
• Terdiri dari : (1) Gugus hiroksil, (2) Gugus amino, (3) Gugus karbonil,
(4) Gugus karboksil
• Terdapat biomolekul lebih dari satu gugus fungsional misalnya asam
amino yang memiliki gugus amino dan gugus karboksil.
 MAKROMOLEKUL
Unit pembentuk makromolekul
Protein dibentuk oleh 21 macam asam amino yang terdiri dari :
1. gugus karboksil
2. gugus amino
3. gugus R yang berlainan pada setiap asam amino

Fungsi asam amino :

a. Membentuk senyawa pengatur rangsangan syaraf.
b. Zat awal pembentuk hormon
c. Alkaloid : bersifat racun pada tumbuhan.

Asam nukleat dibentuk dari 8 macam nukleotida (4 macam DNA dan 4 macam RNA) yang terdiri
dari
1. Basa Nitrogen
2. Gula berkarbon-5
3. Asam fosfat
Antara DNA dan RNA berbeda pada pasangan basa gulanya

Polisakarida memiliki monomer glukosa dan membentuk selulosa, pati, glikogen, laktosa, sukrosa,
manosa, dan fruktosa.

Lemak dapat berupa bentuk padat dan cair dan berasal dari gliserol yang membentuk ester dengan
berbagai asam lemak :
❖Komponen membran sel
❖Komponen lilin pengaman daun dan buah
❖Zat pembangun biomolekul lain.
 Protein engineering

Structure of protein
Drug design
 Biokimia Sebagai ilmu Lintas Disipliner
BIOLOGI SEL
KIMIA ORGANIK Struktur, fungsi dan
Sifat dan morfologi regulasi biomolekul
Sifat dan karakteristik sel
biomolekul
Studi lintas metabolisme
BIOFISIK dan pengaturannya

Teknik penentuan struktur

biomolekul
Dinamika Kehidupan
BIOKIMIA
BIOMEDIS 1. Pertukaran energi &
biosintesis
Pengenalan jenis penyakit melalui 2. Reaksi kimia (fungsi &
studi biomolekul pengaturan enzim)

MIKROBIOLOGI Transmisi Informasi

Pengaturan lintas metabolik melalui GENETIKA Genetik (Replikasi,
bantuan organisme uniseluler Pengkodean, Restrukturisasi
Studi pewarisan sifat dan rekombinasi genetik)
menurun
Manfaat Ilmu Biokimia BAGI KESEJAHTERAAN MANUSIA

Pemanfaatan biopestisida & GMO (Genetically modified organism)

MANFAAT ILMU BIOKIMIA BAGI
KESEJAHTERAAN MANUSIA

Pengembangan
biosensor
APLIKASI LAINNYA

DNA untuk analisa forensik

TERIMA KASIH
 PRODUK KEGIATAN 1 (20 Feb 2018)

• Referensi hasil bacaan (per individu)

• Skema hasil diskusi kelompok (45 menit)
• Presentasi skema