KIMIA SEL MIKROORGANISME

DOSEN:
D R . D E S S Y Y O S WAT Y
Dari mana sel mikroorganisme
yang pertama berasal

Bakteri Fungi Virus Yeast/ragi

3.8 milyar tahun yang lalu struktur proselular
evolusi sel.

Sel bakteri: suatu unit yang mendasar dari kehidupan.

Susunan kimia sel mikroba :
a. Penyusun utama sel (C, H, O, N, dan P): 95 % dari
berat kering sel
b. Unsur lain:
- Air
- protoplasma, dinding sel, lipida, polisakarida,
polifosfat, protein, asam amino dan senyawa
lain.
1. Ikatan dan Reaksi Kimia

Proses metabolisme
(oksidasi-reduksi)

Kimia sel (metabolisme): semua reaksi kimia yang terjadi dalam

sel hidup + enzim energi sintesis komponen sel ,
kegiatan selular (cth: pergerakan) dan nutrien sederhana (cth: asam
lemak, glukosa, senyawa aromatik).

Reaksi kimia terdiri atas:

a. Disimilasi (katabolik): perombakan nutrien membebaskan
energi
b. Asimilasi (anabolik): energi sintesis/fungsi sel lainnya
Proses oksidasi – reduksi energi

Oksidasi: pelepasan elektron

Reduksi: penangkapan elektron
Cth: H2 2e- + 2H+
dikatalisis
Fosforilasi oksidatif: reaksi oksidasi enzim
dehidrogenase transfer eletron + proton yang
dibebaskan aseptor eletron intermedier.
Cth: NAD+ , NADP+ NADH, NADPH
Energi terdiri atas:
a. Sinar matahari (mikroba fototropik/fotosintesis)
b. Oksidasi senyawa kimia (mikroba autotropik atau
kemosintesis kemotropik)

Fotosintesis terdiri atas:

a. Cyanobacteria
CO2 + 2 H2O sinar matahari H2O+ [CH2O]n + O2
(klorofil)

b. Non Cyanobacteria: anaerob

CO2 + 2H2A sinar matahari H2O + [CH2O]n + 2A
(klorofil)
Non Cyanabacteria:
a. Chlorobiceae (green sulfur bacteria)

CO2 + 2H2 sinar matahari CH2O + H2O

CO2 +2H2S sinar matahari CH2O + H2O + 2S

b. Chromatiaceae (purple sulfur bacteria): menggunakan

bakterioklorofil sebagai aseptor eletron. Cth: Amoebobacter,
Chromatium, Lamprobacter, Lamprocystis, Thiocapsa,
Thiocystis, Thiodictyon, Thiopedia dan Thiospirillum.

c. Rhodospirillaceae (Rhodospirillum, Rhodopseudomonas)

CO2 + 2CH3CHOHCOOH sinar matahari CH2O + H2O +
2CH3COCOOH
Chlorobiaceae Chromatiaceae

Rhodospirillaceae
Autotrofik : CO2 sebagai sumber karbon

a. Oksidasi sulfur (Thiobacillus)

2S +3O2+ 2H2O 2H2SO4

b. Oksidasi amonia (Nitrosomonas)

2NH4Cl + 3O2 2HNO2 + 2HCl +2H2O

c. Oksidasi nitrit (Nitrobacter)

2NaNO2 + O2 2NaNO3

d. Oksidasi hidrogen
2H2 + O2 2H2O
e. Oksidasi senyawa Fe (Siderocapsa)
4FeCO3 + O2 + 6H2O 4Fe(OH)3 + 4CO2

Heterotrofik: Senyawa organik sebagai sumber makanan

Type makanan Sumber energi Sumber karbon

Photo-autotrofik cahaya CO2

Chemo-autotrofik Senyawa anorganik CO2

(H2, NH3, NO2, H2S)

Photo-heterotrofik cahaya Senyawa organik

Chemo-heterotrofik Senyawa organik Senyawa organik

Bakteri obligat aerob: oksigen sebagai reseptor terakhir
Bakteri obligat anaerob: tanpa oksigen bebas
Bakteri fakultatif : oksigen atau senyawa anorganik
sebagai aseptor elektron terakhir.
Bakteri mikroaetrifilik: sedikit oksigen
Fermentasi:
Kondisi anaerob, elektron dan proton ditransfer dari
senyawa oksidasi menuju senyawa organik
produk fermentasi .
Cth: Gula mikroba asam piruvat

Fermentasi terdiri atas:

a. Asam homolaktat (Streptococcus, Lactobacillus)

Asam piruvat NHDA NAD+ asam laktat

b. Alkohol (yeast)
Asam piruvat CO2 asetaldehid NHDA NAD+
etil alkohol
c. Asam campuran (Escherichia coli)
Asam piruvat NHDA NAD+ asam laktat
Asam suksimat etil alkohol asam asetat +
H2 + CO2

d. Butylen glycol (Entherobacter, Pseudomonas, Bacillus)

2 piruvat CO2 asam asetolaktat CO2 asetoin
NHAD NAD+ 2,3 butylen glicol
e. Asam propionat (Propioniacterium, Veillonela)
3 asam piruvat CO2 asam asetat

f. Asam butirat, butanol, aseton (Clostridium)

4 asam piruvat 4CO2 4 asetil CoA asam asetat
Bakteri autotrofik

Thiobacillus Coccolithophores

Bakteri heterotrofik:

Vibrio Aeromonas Pseudomonas Bacillus Nocardia

Corynebacterium Streptomyces
Respirasi:
Tranfor elektron mentransfer elektron aseptor
elektron terakhir

Respirasi aerob: oksigen sebagai aseptor eletron terakhir

Respirasi anaerob: senyawa anorganik yaitu:
a. Reduser sulfat (Desulfovibrio: pembentuk spora)
SO4 2- + 8 e- + 8 H+ S2- + H2O
Senyawa organik sbg sumber karbon: heterotrofik

b. Reduser nitrat (Escherichia, Bacillus, Pseudomonas)

2NO3- + 12 e- + 12H+ N2 + 6H2O
Proses denitrifikasi : hilangnya nitrat dari tanah
(pertanian), baik untuk pengolahan limbah.

c. Bakteri metan : dalam usus hewan ruminansia

CO2 + 8 e- + 8H+ CH4 + 2H4O
Proses metabolisma: enzim yang membantu reaksi kimia
dalam sel hidup (katalisator).

Kerja enzim bergantung pada:

- Suhu
- pH
- Konsentrasi substrat
- Konsentrasi enzim

Proses metabolisme energi dan makro molekul

kegiatan proses lain dalam sel bakteri.
2. Makro molekul
a. Polisakarida
- Polisakarida: polimer beberapa gula sederhana yang
dihubungkan ikatan glikosidik.
Karbohidrat (gula): campuran organik (C, H, O)
perbandingan 1:2:1.
Fungsi: cadangan makanan, bahan struktural.

b. Lemak (lipid): hidrokarbon yang sukar larut dalam air

Fungsi: lapisan pelindung, transpor energi.
Struktur lemak: gliserida.
Lipid: lemak dan minyak sebagai sumber karbon.
Enzim: lipase (triacylglycerol acylhydrolase)
diasilgliserol, monoasilgliserol, gliserol, asam lemak.

Lokasi pemutusan ikatan gliserol pada triasilgliserol:

- Lipase non-spesifik : memutus ikatan gliserol dari
triasilgliserol pada tiga posisi, menghasilkan
diasilgliserol, monoasilgliserol atau 3 molekul asam
lemak dan gliserol.
- Lipase spesifik : memutus ikatan gliserol dari
triasilgliserol pada posisi satu dan tiga, menghasilkan
1,2-diasilgliserol dan 2- monoasilgliserol.
Materi organik didegradasi oleh lipase lipase
disekresi ke lingkungan (sebelum diangkut ke dalam
sel bakteri).

c. Protein
- Protein terdiri atas:
* Protein globuler: partikel bulat, cth: enzim/katalis
*Protein serabut/struktural: berbentuk panjang,
cth: keratin (rambut)
Bakteri proteolitik: pengurai protein
Bakteri lipolitik: pemecah protein
d. Asam amino
Susunan protein: beberapa asam amino yang dihubungkan
dengan ikatan peptida. 15 protein, 10.000 asam amino.
Asam amino: unsur organik yang membentuk protein.
Tugas individu (Dessy):
- Makalah, minimal 7 halaman, daftar pustaka.
- Dikumpul pada tanggal 25 Oktober 2011 (minggu ke-6).
- Dilarang copy paste dari internet.

Topik, pilih salah satu:

1. Peranan kimia sel mikroorganisme
2. Keuntungan dan kerugian interaksi mikroba dengan
hewan
3. Keuntungan dan kerugian interaksi mikroba dengan
manusia
4. Peranan metabolisme mikroorganisme
5. Genetika mikroorganisme