0 penilaian0% menganggap dokumen ini bermanfaat (0 suara)
16 tayangan3 halaman
Dokumen tersebut memberikan instruksi lengkap tentang cara kerja isolasi DNA dan PCR. Isolasi DNA melibatkan proses inkubasi sampel, sentrifugasi, dan transfer supernatan untuk memisahkan DNA dari kotoran. PCR melibatkan pembuatan koktail reaksi dengan menghitung volume reagen yang dibutuhkan untuk empat sampel DNA dan satu kontrol negatif.
Deskripsi Asli:
Isolasi DNA
Judul Asli
Cara kerja isolasi DNA dan PCR_Lia Fitria_412118050
Dokumen tersebut memberikan instruksi lengkap tentang cara kerja isolasi DNA dan PCR. Isolasi DNA melibatkan proses inkubasi sampel, sentrifugasi, dan transfer supernatan untuk memisahkan DNA dari kotoran. PCR melibatkan pembuatan koktail reaksi dengan menghitung volume reagen yang dibutuhkan untuk empat sampel DNA dan satu kontrol negatif.
Dokumen tersebut memberikan instruksi lengkap tentang cara kerja isolasi DNA dan PCR. Isolasi DNA melibatkan proses inkubasi sampel, sentrifugasi, dan transfer supernatan untuk memisahkan DNA dari kotoran. PCR melibatkan pembuatan koktail reaksi dengan menghitung volume reagen yang dibutuhkan untuk empat sampel DNA dan satu kontrol negatif.
Sebelum melakukan protokol apapun ,pastikan bahwa ruangan kerja memiliki aliran yang tepat untuk menghindari kontaminasi sampel atau reagen. Contoh ini dibuat untuk siswa yang kidal.Tip dan pipet disebelah kiri, rak dan sampel ada di tengah dan ember buangan ada di sebelah kanan - Kit koleksi DNA genetik , menutup tabung untuk melepaskan buffer, dan mencampur solusinya dengan inversi. - Pada titik ini, tabung sampel tidak boleh diberi label untuk menjaga anonimitas siswa selama proses genotyping. Menggunakan P1000 micropipet, 500 mikroliter ditransfer dari masing-masing tabung pengumpulan ke tabung microsentrifuge baru . - Saat melakukan pipet dalam volume besar, buat solusi perlahan untuk menghindari gelembung atau mencemari micropipet. - Setelah solusi ditransfer, tutup tabung dan tutup sampel (Ulangi proses ini untuk semua sampel yang tersisa). - Inkubasi sampel di heat block , blok panas harus diputar ke 50 derajat dan dihidupkan dengan membalik saklar. Jika sedang panas, cahayanya akan menyala merah. - Tempatkan sampel diblok panas. - Inkubasi ini harus berjalan setidaknya selama 90 menit tetapi bisa juga dibiarkan semalaman. - Tabung berisi 20 mikroliter DNA genetik solusi pemurnian berpemilik. PrepiT akan disediakan. - Setelah sampel diinkubasi, transfer seluruh volume ke tabung yang mengandung larutan pemurnian. Kalau larutan dalam tabug menjadi keruh, ini normal. - Campur solusinya dengan vortex , untuk menghidupkan vortex , tekan saklar kebawah untuk menyentuh dan putar kenop searah jarum jam untuk memastikan kecepatan maksimum. Pegang satu tabung setiap kali dan tekan bagian atas pad hitam untuk memulai getaran (Ulangi proses ini untuk semua sampel yang tersisa). - Sematkan semua sampel dalam es selama 10 menit. Kotoran dalam solusi akan dihapus oleh sentrifugasi. - Setelah membalik saklar dibelakang microsentrifuge tekan tombol buka. - Lepaskan tutup logam di dalam dengan menarik kenop. - Pastikan tabung diberi label baik dengan huruf atau angka. - Sebelum memasukannya ke sentrifuge. Muat sampel dengan engsel menghadap ke luar dan menyeimbangkan tabung di rotor dengan memastikan bahwa semua tabung memiliki volume yang sama. Pasang kembali tutup logam dan tekan sampai berbunyi klik dengan aman. Tutup microsentrifuge dengan lembut. Ubah waktu sentrifuge dengan menekan panah ke waktu yang diinginkan. Dalam hal ini, 5 menit. Tekan panah dengan kecepatan untuk menavigasi ke RPM yang tepat. Dalam hal ini, 14.5 ribu RPM adalah masks yang dapat dilakukan oleh sentrifuge dan cukup dekat dengan kecepatan yang kita inginkan. - Tekan tombol mulai. Sentrifuge akan mulai berputar .Pastikan tidak ada getaran keras, yang mungkin berarti bahwa tabung tidak seimbang atau tutup internalnya terlepas. Jika ini terjadi, tekan segera tombol stop. - Saat putaran berputar, dapatkan empat tabung baru dan beri label. - Saat putaran selesai, tutup sentrifuge akan terbuka. Lepaskan tutup internal dan lepaskan sampel dengan lembut untuk menghindari mengganggu pellet. - Tempatkan tabung dari sampel yang sama sejalan satu sama lain untuk memudahkan transfer solusi. - Setelah sentirugasi, lihat pellet putih yang telah terkumpul di bagian bawah dari tabung di sisi engsel. Pellet ini mengandung kotoran dalam larutan. DNA ada di supernatan. Menggunakan P1000, transfer 400 mikroliter supernatan yang berisi DNA ke tabung baru. - Tempatkan ujung di sisi tabung yang berlawanan dari pellet dan tarik perlahan untuk menghindari gangguan. Ulangi proses ini untuk sampel yang tersisa
Cara kerja PCR
Sebelum memulai protokol ini, siswa harus mengisi lembar kerja yang disediakan halaman terakhir dari dokumen ini memungkinkan siswa untuk menghitung volume pereaksi yang tepat untuk dicampur dalam penciptaan koktail utama. - Tujuan dari koktail adalah untuk mencampur semua reagen umum dalam sampel multi prosedur untuk menghindari kelebihan pemipaan dan potensi kesalahan dalam contoh ini. Prosedur untuk empat siswa memperkuat gen aktinin 3 dari semua empat sampel DNA mereka informasi ini diisi di sebelah kiri, sisi sisi lembar kerja di sisi kanan siswa menggunakan persamaan untuk tentukan jumlah tabung yang dibutuhkan dan pengali volume reagen dalam selain empat sampel DNA, sampel kontrol negatif selalu. Karena itu diperlukan lima tabung untuk reaksi dalam pembuatan kesalahan pemipaan koktail dicatat dengan menambahkan sampel lain, oleh karena itu pengganda untuk grup ini adalah 6. Setiap baris tabel satu mewakili pereaksi yang digunakan dalam semua sampel, menjalani reaksi PCR pengali diisi dalam semua baris , kolom pengali dari tabel satu bergerak di setiap baris volume yang ditunjukkan pereaksi dikalikan dengan pengali 12,5 X 6 = 75 mikroliter paku merah ditambahkan ke koktail 11,5 X 6 = 69 mikroliter air yang ditambahkan ke koktail 0,5 X 6 = 3 mikroliter masing masing pemain depan dan reverse primer ditambahkan ke koktail akhirnya jumlah dari volume ini seharusnya sama dengan produk dari baris terakhir 75+69+3+3 =150 mikroliter volume total dalam koktail jumlah ini cocok dengan 25 X 6. - Tabel dua digunakan sebagai panduan untuk pelabelan sampel PCR seperti yang ditunjukkan jumlahkan sampel PCR secara kolektif untuk tidak membingungkan sampel diantara kelompok dalam contoh ini siswa ini telah menyisihkan sampel bernomor 5 hingga 9, nama sampel diisi di kolom 2 dan primer digunakan untuk setiap sampel diisi dakam 2 kolom terakhir. Dalam contoh ini primer ke depan adalah aktin dan 3f dan primer terbalik adalah aktin dan 3 adalah primer yang sama digunakan untuk semua sampel reagen umum. - Disediakan oleh air biologi molekuler, forward primer yang anda harus pastikan untuk memeriksa penandaan PCR pastikan bahwa anda menggunakan konsentrasi yang tepat secara terbalik. - Primer dan sel darah merah, sel darah merah perlu dicairkan sebelum digunakan, tetapi begitu dicairkan, simpan larutan diatas es untuk mencegah degradasi enzim, selanjutnya siapkan koktail dengan menggunakan volume dan reagen yang ditunjukkan pada lembar kerja mendapatkan tabung baru dan label sebagai koktail. - Saat membuat koktail yang terbaik adalah memulai dengan volume terbesar, sel datah merah adalah volume terbesar yang harus dijaga agar larutan tetap es, mungkin alih- alih air ditambahkan terlebih dahulu saat menambakan masing- masing reagen pastikan untuk menggunakan mikropipet yang sesuai untuk volume ditambahkan.