1.

Komponen Kimia Sel

Semua organisme hidup, dari mikroba sampai ke mamalia terdiri dari zat kimia
baik dari anorganik dan organik yang muncul dalam proporsi yang sama, dan melakukan
tugas umum yang sama. Ada empat kelas makromolekul dalam sel hidup yaitu asam
nukleat, protein, polisakarida, dan lipid. Senyawa ini memiliki bobot molekul mulai dari
1 x 103 hingga 1 x 106, diciptakan melalui polimerisasi blok bangunan yang memiliki
bobot molekul dalam kisaran 50 hingga 150.

Sel mempunyai 4 famili besar dari molekul organik kecil, molekul organik kecil
dari sel adalah senyawa berbasis karbon yang memiliki bobot molekul dalam kisaran 100
dari 1000 dan berisi hingga 30 atau lebih atom karbon. Mereka biasanya ditemukan
bebas dalam larutan dan memiliki banyak tujuan berbeda.

Beberapa digunakan sebagai subunit monomer untuk membangun

makromolekul polimer raksasa-protein, asam nukleat, dan polisakarida besar-sel. Yang
lain bertindak sebagai sumber energi dan dipecah dan berubah menjadi molekul kecil
lainnya dalam labirin jalur metabolik intraseluler. Banyak molekul kecil memiliki lebih
dari satu peran dalam sel, misalnya bertindak baik sebagai subunit potensial untuk
makromolekul dan sebagai sumber energi.

1) Gula menyediakan sumber energi untuk sel yang merupakan subunit polisakarida
Gula mempunyai rumus yang paling sederhana yaitu monosakardia yang
merupakan senyawa dengan rumus umum (CH2O) n, di mana n biasanya 3, 4, 5, 6, 7,
atau 8. Gula dan molekul yang dibuat juga disebut karbohidrat karena formula
sederhana ini. Glukosa misalnya memiliki rumus C6H12O6.
Gula dapat berupa dalam sebuah cincin atau bentuk rantai terbuka. Dalam
bentuk rantai terbuka, gula mengandung sejumlah gugus hidroksil dan salah satu
Aldehida (H > C = O) atau satu kelompok keton (C = O). Kelompok Aldehida atau
keton memainkan peran khusus. Pertama, dapat bereaksi dengan gugus hidroksil
dalam molekul yang sama untuk mengubah molekul menjadi cincin dalam bentuk
cincin karbon Aldehida atau keton asli kelompok dapat dikenali sebagai satu-satunya
yang terikat dua oksigen.Kedua, setelah cincin terbentuk, karbon yang sama ini
dapat dikaitkan lebih jauh dengan salah satu karbon yang bantalan gugus hidroksil
pada molekul gula lain, menciptakan disakarida seperti sukrosa, yang terdiri dari
glukosa dan unit fruktosa. Polimer gula yang lebih besar berkisar dari oligosakarida
(trisakarida, tetrasakarida, dan seterusnya) sampai dengan polisakarida raksasa,
yang dapat berisi ribuan unit monosakarida.

Reaksi ini termasuk dalam kategori umum reaksi yang disebut reaksi kondensasi,
di mana dua molekul bergabung bersama sebagai akibat dari hilangnya molekul air.
 Reaksi terbalik (di mana air ditambahkan) disebut hidrolisis. Perhatikan bahwa salah
satu dari dua bentuk adalah karbon yang bergabung dengan dua oksida melalui
bentuk cincin gula. Jenis umum ikatan kovalen antara dua molekul gula dikenal
sebagai ikatan glikosidik.
2) Asam Lemak
Molekul asam lemak seperti asam palmitat, memiliki dua daerah yang berbeda
secara kimiawi. Salah satunya adalah rantai hidrokarbon panjang, yang hidrofobik
dan tidak sangat reaktif kimiawi. Yang lain adalah karbokksil (-COOH), yang
berperilaku sebagai asam (asam karboksilat), terionisasi dalam larutan (-COO-),
sangat hidrofilik, dan bersifat reaktif kimiawi. Hampir semua molekul asam lemak
dalam sel secara kovalen dihubungkan ke molekul lain oleh kelompok asam

karboksilat mereka.

Sebuah asam lemak terdiri dari rantai hidrokarbon hidrofobik yang melekat
kelompok asam karboksilat hidrofilik. Gambar yang ditampilkan adalah asam
palmitat, asam lemak yang berbeda memiliki ekor hidrokarbon yang berbeda. Pada
gambar A merupakan rumus struktural asam lemak, gugus asam karboksilat
 ditunjukkan dalam bentuk terionisasi. Pada gambar B adalah model bola dan stik.
Pada gambar C adalah model pengisian ruang.
Asam lemak berfungsi sebagai cadangan makanan terkonsentrasi di sel, karena
mereka dapat dipecah untuk menghasilkan sekitar enam kali lebih banyak energi
yang dapat digunakan, berat badan untuk berat badan, sebagai glukosa. Mereka
disimpan dalam sitoplasma banyak sel dalam bentuk tetesan molekul triasilgliserol,
yang terdiri dari tiga rantai asam lemak bergabung dengan molekul gliserol, molekul
ini adalah lemak hewan yang ditemukan dalam daging, mentega, dan krim, dan
minyak tanaman seperti minyak jagung dan minyak zaitun. Ketika diperlukan untuk
memberikan energi, rantai asam lemak dilepaskan dari triasilgliserol dan dipecah
menjadi dua unit karbon. Unit dua karbon ini identik dengan yang berasal dari
pemecahan glukosa dan mereka memasuki jalur reaksi menghasilkan energi yang
sama.
3) Asam Amino
Asam amino adalah kelas bervariasi molekul, dengan satu properti
mendefinisikan mereka semua memiliki kelompok asam karboksilat dan kelompok
amino, keduanya terkait dengan atom karbon tunggal yang disebut α-karbon.
Varietas kimia mereka berasal dari rantai samping yang juga melekat pada α-
karbon. Pentingnya asam amino untuk sel berasal dari peran mereka dalam
membuat protein, yang polimer asam amino bergabung Head-to-Tail dalam rantai

panjang yang kemudian dilipat menjadi struktur tiga dimensi yang unik untuk setiap
jenis protein. Linkage kovalen antara dua asam amino yang berdekatan dalam rantai
protein disebut ikatan peptida rantai asam amino juga dikenal sebagai polipeptida.
 Dua puluh jenis asam amino yang ditemukan dalam protein, masing-masing
dengan rantai sisi yang berbeda dan melekat pada atom α-karbon. 20 asam amino
yang sama terjadi berulang-ulang dalam semua protein, baik dari bakteri, tumbuhan,
maupun hewan. Bagaimana kelompok yang tepat dari 20 asam amino muncul
adalah salah satu misteri seputar evolusi kehidupan, tidak ada alasan kimia yang
jelas.
Fleksibilitas kimia yang menyediakan 20 asam amino standar sangat penting
untuk fungsi protein. Lima dari 20 asam amino memiliki rantai samping yang dapat
membentuk ion dalam larutan dan dengan demikian dapat membawa muatan. Yang
lainnya tidak bermuatan beberapa adalah polar dan hidrofilik, dan beberapa
nonpolar dan hidrofobik.
4) Nukleotida
Nukleotida adalah molekul yang terdiri dari senyawa cincin yang mengandung
nitrogen yang dihubungkan dengan gula lima karbon. Gula ini dapat berupa ribosa
atau deoxyribosa, dan membawa satu atau lebih gugus fosfat (panel 2-6, hlm.120 –
121). Nukleotida mengandung ribosa yang dikenal sebagai ribonucleotides, dan yang
mengandung deoxyribosa sebagai deoxyribonucleotides.
 Cincin yang mengandung nitrogen umumnya disebut sebagai basis di bawah
kondisi asam mereka masing-masing dapat mengikat H (proton) dan dengan
demikian meningkatkan konsentrasi OH-ion dalam larutan berair. Ada kemiripan
keluarga yang kuat antara basis yang berbeda. Cytosine (C), Timina (T), dan uracil (U)
disebut pyrimidines karena mereka semua berasal dari enam beranggota cincin
pirimidin Guanina (G) dan adenin (A) adalah senyawa purin.
Urutan linear nukleotida dalam DNA atau RNA encode menyimpan informasi
genetik sel. Kemampuan basis dalam molekul asam nukleat yang berbeda untuk
mengenali dan berpasangan dengan satu sama lain dengan hydrogen yaitu ikatan G
dengan C, dan A dengan T atau U mendasari semua keturunan dan evolusi.