senyawa organik

Acta Crystallographica Bagian C pusat stereogenik dalam rantai samping propana-1,2-diol melekat pada C sp 2 atom,
Komunikasi Struktur yang dinyatakan dif®cult untuk menjelaskan dengan metode spektroskopi.
kristal
ISSN 0108-2701

Sebuah analog semi-sintetis dari

sarcophine cembranoid

Hesham Fahmy, Sebuah Jordan K. Zjawiony, Sebuah Sherief Khalifa b

dan Frank R. Fronczek c *

Sebuah Departemen Farmakognosi dan Pusat Nasional untuk Produk Natural Penelitian, Lembaga Penelitian Ilmu
The con®guration dan konformasi cembranoid (I) diilustrasikan pada
Farmasi, Sekolah Farmasi, Universitas Mississippi, Universitas, MS 38677-1848, USA, b Departemen Farmakognosi,
Gambar. 1. konformasi dari cincin 14-beranggota, dijelaskan oleh sudut torsi
Fakultas Farmasi, Universitas Suez Canal, Ismailia, Mesir, dan c Departemen Kimia, Louisiana State University, Baton

Rouge, LA 70803-1804, USA Correspondence e-mail: ffroncz@lsu.edu

pada Tabel 1, berbeda secara substansial dari yang sarcophine (Bernstein et
al., 1974; El Sayed et al., 1998). Sarcophine tidak memiliki gugus OH pada C13
dan memiliki -lactone di C1ÐC2 ( yaitu C1 C15 ikatan rangkap), daripada
propana-1,2-diol substituen sini. Perbedaan kecil dalam porsi cincin membawa
Menerima 25 November 2002 Diterima 15
epoksida, dengan tiga sudut torsi endocyclic di urutan C6ÐC7ÐC8Ð
Januari 2003 online 31 Januari 2003
C9ÐC10ÐC11 menunjukkan deviasi rata-rata hanya

Judul molekul, 2 ( R) - [( 1 E, 3 E, 7 S, 8 S, 11 E, 13 R) - 13-hidroksi

9.1 . Namun, dalam sarcophine, kelompok metil C18 adalah berorientasi (dalam
4,8,12-trimetil-7,8-epoxycyclotetradeca-1,3,11-trien-1-il] propana-1,2-diol, C 20 H 32
Gambar. 1), sedangkan di (I), C18 poin ke luar dan atom H pada C3 poin ke ring
HAI 4, adalah analog semi-sintetik dari sarcophine, yang cembranoid alami asal
14-beranggota. Demikian juga, sudut torsi tentang C10ÐC11, yang menentukan
laut, terisolasi dari karang lunak Sarcophyton glaucum. Konformasi dari cincin
orientasi kelompok metil C20, adalah 177,26 (17) di (I) dan ÿ 95,7 (4) di
14-beranggota berbeda secara substansial dari yang sarcophine. Dua
sarcophine. Dengan demikian, cincin 14-beranggota dari (I) terletak kira-kira di
kelompok OH dari bagian propana-1,2-diol membentuk lemah ikatan hidrogen
pesawat, dengan deviasi rms dari 0,37 AE dan deviasi maksimum hanya 0,758
intramolekul yang tidak biasa dengan O O jarak 2,788 (2) AE, dan molekul
(2) AE untuk C5 atom. Cincin di sarcophine sedikit kurang planar, dengan
dihubungkan ke dalam rantai ganda oleh ikatan hidrogen antarmolekul dengan
deviasi rms dari 0,49 AE dan deviasi maksimum 0,825 (4) AE untuk C13 atom.
O O jarak 2,772 (2) dan 2,849 (2) AE.

Ikatan hidrogen dalam (I) diilustrasikan pada Gambar. Obligasi 2. Hidrogen yang
disumbangkan oleh atom O1 dan O4 menghubungkan molekul menjadi rantai ganda,
Komentar yang memperpanjang di 2 1 arah. Itu

Cembranoids, diterpenoid dengan cincin 14-beranggota, telah diisolasi dari

darat dan laut sumber (Wahlberg & Eklund, 1992). Beberapa cembranoids dari
karang lunak memiliki spektrum yang sangat luas kegiatan biologis, termasuk
aktivitas penghambatan terhadap promotor tumor (Suganuma et al.,

1996; Tius, 1988). Dalam rangka untuk mendapatkan senyawa baru dengan
aktivitas kemopreventif, yang sarcophine produk alami laut, terisolasi dari
karang lunak Sarcophyton glaucum, menjadi sasaran serangkaian modi®cations
kimia (Katsuyama et al., 2002). Salah satu produk yang diperoleh sebagai hasil
dari modi®cations tersebut adalah analog judul, (I). Senyawa ini ditampilkan
aktivitas penghambatan signi®cant terhadap promotor tumor 12- HAI- tetradecanoylphorbol-13-acetate
(TPA) dalam virus Epstein Barr ± awal-antigen aktivasi assay (Katsuyama

et al., 2002). Kami telah melakukan analisis struktur kristal (I) ke con®rm
struktur dan untuk menetapkan con®guration pusat stereogenik di atom C13
dan C15. The con®guration relatif (I) dibandingkan dengan sarcophine
memungkinkan penentuan con®guration dari pusat-pusat stereogenik pada
atom C13 dan C15 sebagai R, R. Ini adalah kasus ®rst dari penentuan
con®guration dari
Gambar 1
Pandangan dari molekul (I), dengan skema atom-penomoran. ellipsoids perpindahan
diambil di tingkat probabilitas 50% dan atom H akan ditampilkan sebagai bulatan kecil dari
jari-jari yang sewenang-wenang. The con®guration mutlak ditugaskan dibandingkan dengan
sarcophine (lihat Eksperimental).

Acta Cryst. ( 2003). C 59, o85 ± o87 DOI: 10,1107 / S0108270103001288 # 2003 International Union of Kristalografi o85
senyawa organik

rantai-menghubungkan Unit ikatan hidrogen mengandung 12 atom, dan sudut ÿ 56,53 (17) di (I), mungkin sebagai akibat dari fakta bahwa, di kedua
melibatkan tiga molekul dan tiga ikatan hidrogen antarmolekul. Dua kelompok senyawa ini, atom O2 membentuk ikatan hidrogen antarmolekul normal
OH dari bagian propana-1,2-diol membentuk ikatan hidrogen intramolekul ketimbang ikatan hidrogen intramolekul lemah. Dengan demikian, di (I),
lemah, dengan atom O1 sebagai akseptor. Meskipun O O jarak tidak lama, konformasi rantai samping propana-1,2-diol muncul akibat dari dua faktor, yang
cincin ®vemembered membebankan geometri miskin pada donor dan intramolekul H H interaksi dan ikatan hidrogen intramolekul.
akseptor. Jenis ikatan hidrogen intramolekul lemah dalam substituen
propanediol agak tidak biasa. Mereka tampak hadir hanya ketika kuat
kemungkinan ikatan antarmolekul yang tidak menguntungkan (Andrea et al., 1997),
dan biasanya komponen dalam ikatan hidrogen bi-atau trifurcated, di mana
komponen lainnya yang antarmolekul (Kopf et al., 1990; Jeffrey & Maluszynska, Eksperimental
1990; Jeffrey, 1997). Yang tidak biasa interaksi intramolekul lemah dalam (I),
Penyusunan senyawa judul dari sarcophine telah dijelaskan oleh Katsuyama et al. ( 2002).
yang tidak didukung oleh komponen antarmolekul, mirip dengan yang di
Kristal (I) ditumbuhkan dari heksana ± aseton (1: 1) solusi.
hydrazide asam galactonic (Andrea et al., 1997), di mana O O jarak

Data kristal

C 20 H 32 HAI 4 Mo K parameter radiasi Cell dari

2,748 (3) AE dan sudut sekitar H adalah 118 (4) . Brock (2002) baru-baru ini
M r = 336,46 monoklin, 2443
meneliti kemasan kristal di diol vicinal, dan juga telah mencatat kelangkaan re¯ections = 2,5
P 21
jenis interaksi intramolekul. yeh et al. ( 1994) dan Dahlqvist et al. ( 1998) telah a = 5,858 (2) ae ± 30,0 = 0,08 mm ÿ
1
b = 8,232 (2) ae
menghitung bahwa, dengan tidak adanya ikatan hidrogen antarmolekul, ikatan
c = 19,241 (6) AE = = T 100 K Plate, kuning
hidrogen intramolekul di diol vicinal menyebabkan 91,315 (10) pucat
V = 927,6 (5) ae 3 0,32 0.22 0,05 mm
Z=2
kurang ajar Conformer menjadi ca 8 kJ mol ÿ 1 rendah energi daripada
D x = 1,205 Mg m ÿ 3
anti Conformer.
Sebuah pencarian dari database Cambridge Struktural (CSD; Allen, 2002)
Pengumpulan data
untuk rantai samping propana-1,2-diol dengan atom C1, C2 dan C14 tidak
Nonius KappaCCD daerah-detektor 2647 re¯ections dengan I> 2 ( I) R int = 0,021
menghasilkan hits. Fragmen paling mirip di CSD memiliki sp 2 atomC1 melekat
difraktometer (dengan pendingin Oxford
dua lainnya C sp 2 atom dalam cincin fenil, bukan ke sp 2 C2 dan sp 3 atom C14 di Cryosystems Cryostream) max = 30

(I). fragmen yang ditemukan hanya dalam dua senyawa, dua isomer dari endokapilar! scan dengan offset 8313 re¯ections h = ÿ 8! 8
diukur 2875 re¯ections independen k = ÿ 11! 11
2- { Hai-[( bicyclo [2.2.1] hept-5-en-2-yl) sul®nyl] fenil propana}-1,2-diol
l = ÿ 26! 27
(refcodes WOFXEU dan WOFXIY; Abe et al., 1999), yang keduanya rasemat.
Konformasi rantai samping propana-1,2-diol di WOFXEU dan WOFXIY agak
Re®nement
berbeda dari yang (I), karena mereka memiliki sudut torsi C2D C1ÐC15ÐO2
Re®nement di F 2 w = 1 / [ 2 ( F Hai 2) + ( 0,0385 P) 2
dari ÿ 30,4 (4) dan ÿ 38,4 (4) , Masing-masing, sementara di (I), itu hampir hilang
R [F 2> 2 ( F 2)] = 0.036 + 0,2001 P]
cahayanya, pada 3,3 (2) . sudut torsi ini tampaknya dikendalikan oleh tuntutan wR (F 2) = 0,089 dimana P = (F Hai 2 + 2 F c 2) / 3 (/ ) max < 0,001
sterik dari atom H pada atom C14, C16 dan C17. Dalam (I), jarak tersebut S = 1,04 2875 re¯ections 230 parameter
atom H diobati dengan campuran 0.22 e ae ÿ 3
terdekat adalah antara H14 B dan H16 B, di 2,08 AE. Besarnya O2Ð max =

ÿ 0,21 e ae ÿ 3
min =
C15ÐC16ÐO1 sudut torsi 14,7 (4) yang lebih besar di WOFXEU dan 11.1 (4) lebih Struktur mutlak: tidak ditentukan;
besar di WOFXIY dari kurang ajar re®nement independen dan dibatasi Friedel pasang rata-rata

Tabel 1
Dipilih parameter geometris (AE, ).

O1ÐC16 1,436 (2) C1ÐC2 1,348 (2)

O2ÐC15 1,442 (2) C2ÐC3 1,452 (2)
O3ÐC7 1,449 (2) C3ÐC4 1,347 (2)
O3ÐC8 1,455 (2) C7ÐC8 1,474 (2)
O4ÐC13 1,446 (2) C11ÐC12 1,332 (2)

C7ÐO3ÐC8 61,03 (11)

C14ÐC1ÐC2ÐC3 5.8 (3) C8ÐC9ÐC10ÐC11 ÿ 79,6 (2)

C1ÐC2ÐC3ÐC4 179,55 (18) C10ÐC11ÐC12ÐC13 177,84 (16)
C2ÐC3ÐC4ÐC5 ÿ 169,72 (16) C11ÐC12ÐC13ÐC14 115,01 (17)
C3ÐC4ÐC5ÐC6 ÿ 114,76 (18) C2ÐC1ÐC14ÐC13 74,7 (2)
C4ÐC5ÐC6ÐC7 70.2 (2) C12ÐC13ÐC14ÐC1 ÿ 129,46 (14)
C5ÐC6ÐC7ÐC8 90,3 (2) C2ÐC1ÐC15ÐO2 3.3 (2)
Gambar 2
C6ÐC7ÐC8ÐC9 ÿ 158,39 (16) O2ÐC15ÐC16ÐO1 ÿ 56,53 (17)
Sebuah stereoview dari unit sel (I), yang menunjukkan ikatan hidrogen. Pandangan sedikit miring ke Sebuah,
C7ÐC8ÐC9ÐC10 88,63 (19)
dengan b horisontal.

o86 Hesham Fahmy et al. C 20 H 32 HAI 4 Acta Cryst. ( 2003). C 59, o85 ± o87
 senyawa organik

Meja 2 Referensi
Ikatan hidrogen geometri (AE, ).
Abe, H., Tsuchida, D., Kashino, S., Takeuchi, Y. & Harayama, T. (1999). Chem.
Pharm. Banteng. 47, 833 ± 837. Allen, FH (2002). Acta Cryst. B 58, 380 ± 388. Altomare, A., Burla,
D dh SEBUAH D dh H SEBUAH DA D dh SEBUAH
MC, Camalli, M., Cascarano, G., Giacovazzo, C.,

O1ÐH10 O4 saya 0.88 (3) 1,92 (3) 2,772 (2) 162 (2)
O2ÐH20 O1 0,85 (3) 2,35 (3) 2,788 (2) 113 (2) Guagliardi, A., Moliterni, AGG, Polidori, G. & Spagna, R. (1999). J. Appl. Kristal. 32, 115 ± 119.
O4ÐH40 O1 ii 0,77 (3) 2,08 (3) 2,849 (2) 176 (3) ANDREA, C., Luger, P., Fuhrhop, J.-H. & Hahn, F. (1997). Acta Cryst. B 53, 490 ±

Kode simetri: (i) ÿ x; 1 2 ?? y; 1 ÿ z; ( ii) x; y ÿ 1; z. 497.

atom H ditempatkan di posisi dihitung, dipandu oleh peta perbedaan, dengan jarak
CDH 0,95 ± 1,00 AE dan U iso ( H) = 1,2 U eq ( C) (1,5 U eq untuk metil), dan setelah itu
diperlakukan sebagai berkuda. Koordinat atom H hidroksi yang re®ned. Parameter torsi
itu re®ned untuk setiap kelompok metil. The con®guration mutlak tidak dapat ditentukan
Bernstein, J., Shmeuli, U., Zadock, E., Kashman, Y. & NeÂeman, I. (1974). tetra
Hedron, 30, 2817 ± 2824. Brock, CP (2002). Acta Cryst. B 58, 1025 ± 1031. Dahlqvist, M., Hotokka,
M. & Rae saÈnen, M. (1998). Chem. Phys. 229, 137 ±
147.
El Sayed, KA, Hamann, MT, Waddling, CA, Jensen, C., Lee, SK,

dari data X-ray, tetapi ditugaskan berdasarkan con®guration diketahui sarcophine Dunstan, CA & Pezzuto, JM (1998). J. Org. Chem. 63, 7449 ± 7455. Farrugia, LJ (1997). J. Appl.
Kristal. 30, 565. Jeffrey, GA (1997). Sebuah Pengantar Hidrogen Bonding. New York:
(Kashman, 1977). pasang Friedel yang rata-rata.

Pengumpulan data: KUMPULKAN ( Nonius, 2000); re®nement sel: HKL SCALEPACK
( Otwinowski & Kecil, 1997); reduksi data: HKL DENZO ( Otwinowski & Kecil, 1997) dan SCALEPACK;
Program (s) digunakan untuk memecahkan struktur: TUAN 97 (Altomare et al., 1999);
Oxford University Press Inc. Jeffrey, GA & Maluszynska, H. (1990). Carbohydr. Res. 207, 211 ±
219. Kashman, Y. (1977). Kelautan Natural Products Chemistry, disunting oleh DJ
Faulkner & WH Fenical, pp. 17 ± 21. New York: Plenum. Katsuyama, I., Fahmy, H., Zjawiony, JK,
Khalifa, S., Kilada, R., Konoshima,
T., Takasaki, M. & Tokuda, H. (2002). J. Nat. Melecut. 65, 1809 ± 1814. Kopf, J., Brandenburg, H.,
Seelhorst, W. & Koll, P. (1990). Carbohydr. Res. 200,

Program (s) digunakan untuk struktur re®ne: SHELXL 97 (Sheldrick, 1997); grafis molekul: ORTEP- 339 ± 354. Nonius (2000). MENGUMPULKAN. Nonius BV, Delft, Belanda. Otwinowski, Z. & Kecil,
W. (1997). Metode dalam enzim, Vol. 276,
3 untuk Windows ( Farrugia, 1997); perangkat lunak yang digunakan untuk mempersiapkan
materi untuk publikasi: SHELXL 97. Pembelian difraktometer itu dimungkinkan oleh Makromolekul Kristalografi, Bagian A, diedit oleh CW Carter Jr & RM manis, pp. 307 ± 326. New

hibah No. LEQSF (1999 ± 2000) -ESH-TR-13, dikelola oleh Louisiana Dewan York: Academic Press. Sheldrick, GM (1997). SHELXL 97. Universitas goe Göttingen, Jerman.
Suganuma, M., Okabe, S., Sueoka, E., Iida, N., Komori, A., Kim, S. & Fujiki, H.
Bupati.
(1996). Kanker Res. 56, 3711 ± 3715. Tius, MA (1988). Chem. Putaran. 88, 719 ± 732. Wahlberg, I. &
Eklund, AM (1992). Prog. Chem. Org. Nat. Melecut. 59, 141 ±
Tambahan data untuk kertas ini tersedia dari arsip elektronik IUCr (Referensi: GA1004).
Layanan untuk mengakses data ini dijelaskan di bagian belakang jurnal. 224.
Yeh, T.-S., Chang, Y.-P., Su, T.-M. & Chao, I. (1994). J. Phys. Chem. 98, 8921 ±
8929.

Acta Cryst. ( 2003). C 59, o85 ± o87 Hesham Fahmy et al. C 20 H 32 HAI 4 o87