JURNAL PRAKTIKUM

KIMIA KLASTER

MODIFIKASI ZEOLIT DENGAN SENYAWA BETA-SIKLODEKSTRIN (BCD)

SEBAGAI BIOSENSOR KOLESTEROL

Disusun Oleh:

Nama : Alya Salma Dhiya Saputro

NPM : 1806206883

Kelompok : 4

Rekan Kerja : 1. Dea Gresia Dolok Saribu

2. Eva Dwi Yanti

3. Muh Nur Afif Luthfi

4. Rofida Aryeni

Asisten Labotarium : Kak Afif

Tanggal Praktikum : 22 Maret 2021

DEPARTEMEN KIMIA

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS INDONESIA

2021
 1. Judul Praktikum :

Modifikasi Zeolit dengan Senyawa Beta-Siklodekstrin (BCD) sebagai Biosensor Kolesterol

2. Tujuan :

 Mempelajari struktur dasar dari zeolit serta kegunaannya secara umum

 Mengolah data kristalografi dari suatu zeolit menggunakan program Vesta
sehingga dapat diperoleh pola XRD, informasi kristal dan kerangka 3D zeolit
 Mempelajari prinsip dasar dari simulasi penambatan molekul (docking) dan
aplikasinya dalam penelitian di bidang kimia, baik di bidang material maupun
farmasetika,
 Melakukan simulasi docking untuk mekanisme kerja dari biosensor berbasis
beta- siklodekstrin dan aplikasinya sebagai biosensor non-enzimatik
kolesterol.

3. Teori Dasar :

Kolesterol merupakan senyawa sterol yang merupakan prekursor dari berbagai hormon tubuh
dan vitamin D (Sulimovici & Boyd, 1970). Penelitian terkini menemukan bahwa terdapat
korelasi antara konsentrasi kolesterol dalam darah dengan penyakit jantung koroner; dimana
semakin tinggi konsentrasi kolesterol dalam darah seseorang maka semakin tinggi pula
resikonya terkena serangan jantung (Deedwania et al., 2007).

Senyawa β-siklodekstrin (BCD) merupakan senyawa oligosakarida siklik yang terbentuk dari
tujuh unit D-glukopiranosa yang terhubung oleh ikatan glikosidik α-1,4 dengan rongga luar
hidrofilik dan rongga dalam yang bersifat hidrofobik. Oleh karena sifat uniknya dan
solubilitasnya yang tinggi di dalam air, senyawa BCD telah banyak dikembangkan sebagai
biosensor (Willyam et al., 2020).

Untuk meningkatkan kinerja sensor, telah banyak peneliti mengembangkan elektroda

termodifikasi material berpori seperti zeolit (Muresan, 2010), dengan memanfaatkan sifat-
sifat khas yang dimiliki zeolit seperti memiliki kerangka aluminasilikat yang teratur, rigid,
berpori dan memiliki luas permukaan yang besar (Wise, 2005). Senyawa aktif yang menjadi
sensor dapat ditambatkan pada permukaan dan bagian dalam pori-pori zeolit, sehingga
diharapkan selektifitas sensor terhadap senyawa target dapat lebih baik. Tetapi, memang
diperlukan modifikasi pada kerangka zeolit, karena pada umumnya konduktifitas zeolit cukup
rendah (Muresan, 2010),).

Zeolit adalah merupakan mineral aluminosilikat 3-dimensi yang memiliki framework anion
terbuka yang terbentuk dari pembagian oksigen antara TO4 (tetrahedral) dengan T merupakan
Si dalam bentuk [AlO4]- atau Si dalam bentuk [SiO4]- yang tersusun dari umumnya corner
sharing, dimana muatan frameworknya dikarenakan substitusi 𝑆𝑖4+ dengan 𝐴𝑙3+ membentuk
kerangka dengan muatan negatif yang diimbangi oleh kation monovalen atau divalen yang
berada bersama air (Kadja, 2019).

Pada praktikum kali ini, akan dilakukan simulasi penentuan kerangka zeolit hasil sintesis
menggunakan program Vesta dan studi komputasi dengan menggunakan pendekatan simulasi
penambatan molekul (molecular docking simulation) untuk memprediksi afinitas pengikatan
dan konformasi dari pembentukan kompleks inklusi dari BCD-kolesterol dan BCD-MB.

4. Alat dan Bahan :

a. Alat
 Aplikasi VESTA
 Aplikasi PyRx
 Aplikasi Discovery Studio 2020 Visualizer
b. Bahan
 Zeolit
 Metilen biru
 β-siklodekstrin (BCD)

5. Cara Kerja :
 Simulasi Powder Pola Difraksi XRD dan Struktur 3D Zeolit
a. Instalasi Aplikasi VESTA

b. Mencari File CIF

 c. Struktur Kristal 3D dalam VESTA

d. Simulasi X-Ray Difraction Pattern

 Simulasi Penambatan Molekul Senyawa Beta-Siklodekstrin (BCD) dengan

Kolesterol
a. Instalasi Software yang Diperlukan
1. Instalasi Software PyRx

2. Instalasi Discovery Studio 2020 Visualizer

b. Tahapan Pra-Docking
1. Tahapan Pengunduhan Material yang Digunakan

2. Tahapan Pra-Docking
c. Simulasi Penambatan Molekul
1. Simulasi Penambatan Molekul BCD-Kolesterol dan BCD-MB

2. Analisis Hasil Docking Kompleks BCD-Kolesterol dan BCD-MB