Lembar Kerja Mahasiswa (LKM)

Biokimia

Untuk Mahasiswa Biologi

FMIPA UNM
 LKM Biokim 03

JUDUL : Daur Krebs dan STE

Tinjauan Umum

Semua sel membutuhkan energi sepanjang waktu, dan sumber energi utama mereka adalah
ATP. Cara sel digunakan untuk membuat ATP bervariasi tergantung pada ketersediaan
oksigen dan susunan biologisnya. Dalam banyak kasus sel-sel berada di lingkungan yang
kaya oksigen. Misalnya, ketika Anda duduk dan membaca kalimat ini, Anda bernafas dalam
oksigen, yang kemudian dibawa ke seluruh tubuh Anda oleh sel darah merah. Tetapi,
beberapa sel tumbuh di lingkungan tanpa oksigen (ragi dalam pembuatan anggur atau bakteri
yang menyebabkan botulisme dalam makanan kaleng), dan kadang-kadang sel hewan harus
berfungsi tanpa oksigen yang cukup (seperti dalam berlari cepat). Di dalam
aktivitas Anda akan mulai melihat proses aerobik dan anaerob yang digunakan oleh semua
organisme menghasilkan ATP.

Glukosa, atau molekul berbasis karbon apa saja, dapat dibakar dalam oksigen (teroksidasi)
untuk menghasilkan karbon dioksida dan air. Reaksi pembakaran melepaskan sejumlah besar
energi. Namun, pelepasan energinya adalah tidak terkendali. Suatu organisme tidak akan
mampu menangani semua energi itu sekaligus untuk melakukan pekerjaan sel. Respirasi
seluler pada dasarnya adalah reaksi yang sama seperti pembakaran, tetapi oksidasi glukosa
terjadi pada beberapa langkah terkontrol. Jumlah energi yang sama pada akhirnya dilepaskan,
tetapi secara bertahap dilepaskan, terkontrol. Molekul energi potensial tinggi ATP diproduksi
sementara atom karbon digunakan untuk membentuk berbagai molekul energi potensial
rendah lainnya. Setiap langkah ini dikatalisis oleh Enzim spesifik untuk langkah itu. Gambar
1 di atas menggambarkan keadaan ideal untuk respirasi seluler. Dalam beberapa situasi,
bagaimanapun, satu molekul glukosa mungkin tidak menghasilkan 38 molekul ATP.

I. Respirasi Seluler : C6H12O6 + O2  6CO2 + 6H2O + energi

 Gambar 1. Model Respirasi seluler
Perhatikan gambar di atas
1. Apa reaktan respirasi seluler?
..............................................................................................................................................
2. Apa produk respirasi seluler?
..............................................................................................................................................

3. Respirasi sel terjadi dalam empat fase: glikolisis , reaksi tautan , siklus Krebs , dan

fosforilasi oksidatif .
a. Fase respirasi sel mana yang terjadi dalam sitoplasma sel?
.......................................................................................................................................
b. Fase respirasi seluler mana yang terjadi pada mitokondria?
......................................................................................................................................
c. Manakah dari empat fase respirasi seluler yang membutuhkan oksigen?
......................................................................................................................................
d. Manakah dari empat fase respirasi seluler yang menghasilkan karbon dioksida?
......................................................................................................................................
e. Manakah dari empat fase respirasi seluler yang menghasilkan air?
....................................................................................................................................

4. Tujuan dari respirasi sel adalah untuk menyediakan sel dengan energi dalam bentuk ATP.
a. Manakah dari empat fase respirasi seluler yang menghasilkan produksi ATP?
....................................................................................................................................
b. Berapa banyak ATP (total) yang diproduksi untuk setiap molekul glukosa yang
mengalami seluler pernafasan?
....................................................................................................................................
c. Reaktan ATP apa yang harus tersedia dalam sel untuk menghasilkan ATP?
...................................................................................................................................
d. Kemukakan beberapa proses seluler yang memerlukan energi atau ATP.
....................................................................................................................................
5. Selain ATP, molekul lain apa yang tampak sebagai molekul berenergi potensial
tinggi (pembawa energi bebas) selama respirasi sel?
....................................................................................................................................

Persamaan Reaksi : Molekul Akseptor Elektron

2e- + NAD+ + H+ → NADH .....(i)
- + +
2e + FAD + 2H → FADH2 . ....(ii)
- +
2e + ½O2 + 2H → H2O ...........(iii)

6. Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD +) dan flavin adenine dinucleotide

(FAD) adalah koenzim yang digunakan dalam respirasi seluler untuk
mengangkut elektron energi potensial tinggi ke rantai tranpsor elektron (langkah
dalam fosforilasi oksidatif) di mitokondria. Pada akhir respirasi sel, oksigen
adalah akseptor elektron terakhir. Reaksi dalam Persamaan Reaksi : Molekul
Akseptor Elektron menunjukkan akseptor elektron dalam proses mengambil
elektron.

a. Berapa banyak elektron dalam ion hidrogen (H +)?

....................................................................................................................................
b. Adalah ion hidrogen dengan muatan positifnya yang cenderung tertarik ke
NAD+, FAD atau O2 tanpa sebuah input energi bebas? Jelaskan alasanmu.
....................................................................................................................................
c. Pertimbangkan muatan pada reaksi (i). Dapatkah dua partikel positif (H +)
bergabung membentuk partikel netral? Jelaskan alasanmu.
....................................................................................................................................

Oksidasi adalah pengurangan elektron. Reduksi adalah penambahan elektron.

Kedua proses tersebut harus berjalan seiring. Dengan kata lain, elektron tidak dapat
ditambahkan ke sesuatu kecuali ada sesuatu yang melepas elektron.

7. Apakah reaksi pada reaksi oksidasi atau reduksi pada Persamaan Reaksi :
Molekul Akseptor Elektron ?
............................................................................................................................
8. Bentuk nikotinamid adenin dinukleotida manakah yang merupakan bentuk
"tereduksi", NAD+ atau NADH? Jelaskan alasanmu
............................................................................................................................
9. Sesuai Gambar 1, glukosa mengalami perubahan berikut selama respirasi sel. Di
setiap langkah NADH atau FADH diproduksi. Apakah glukosa teroksidasi atau
tereduksi selama respirasi seluler? Jelaskan alasanmu.

10. Gambar 1 menunjukkan sepuluh molekul NADH yang diproduksi selama

respirasi seluler. Reaktan apa harus tersedia di dalam sel agar molekul-molekul
ini dapat diproduksi?
............................................................................................................................
11. Ion hidrogen dan elektron yang dibawa oleh NADH dan FADH 2 digunakan
dalam fosforilasi oksidatif.
a. Molekul apa yang dihasilkan ketika ion hidrogen dan elektron dikeluarkan
dari NADH dan FADH2 ?
..........................................................................................................................
b. Apakah penghilangan ion dan elektron hidrogen dari oksidasi atau reduksi
NADH dan FADH2 ? Jelaskan alasan Anda.
..........................................................................................................................
c. Prediksikan apa yang terjadi pada molekul produk tersebut setelah
"melepaskan" ion hidrogen dan elektronnya.
..........................................................................................................................

12. Sel dapat bertahan hidup untuk periode singkat tanpa oksigen. Hanya fase
glikolisis respirasi seluler terjadi dalam keadaan itu.
a. Hitung jumlah molekul ATP yang dapat dihasilkan dari satu molekul
glukosa jika oksigen tidak tersedia.
...........................................................................................................................
b. Karena fosforilasi oksidatif tidak lagi terjadi ketika oksigen tidak tersedia,
prediksi apa pada akhirnya akan terjadi pada pasokan NAD + dalam sel jika
hanya glikolisis yang terjadi?
...........................................................................................................................

Energi dalam Lingkungan Anaerob

Gambar 2. Eneri dalam lingkungan anerob

13. Periksa dua proses anaerob dalam Gambar 2. Apakah oksigen digunakan dalam
kedua proses?
.....................................................................................................................

14. Apa definisi dari anaerob?

....................................................................................................................

15. Bandingkan keluaran energi (dalam bentuk ATP) untuk molekul glukosa yang
mengalami glikolisis dan fermentasi dengan molekul glukosa yang mengalami
respirasi seluler.
............................................................................................................
16. Efisiensi sel tergantung pada sifat siklik NAD+ dan NADH. Membentuk
molekul NAD+ dari bahan mentah setiap kali dibutuhkan membutuhkan
jumlah besar energi dan sumber daya. Meskipun langkah-langkah fermentasi
yang ditunjukkan pada Gambar 2 tidak memberikan ATP apa pun, mereka
sangat penting untuk produksi energi sel. 
Prediksi apa yang akan terjadi pada pasokan energi dalam sel jika fermentasi
tidak terjadi dalam kondisi anaerob.
..............................................................................................................

17. Kelelahan otot yang Anda rasakan ketika melakukan aktivitas berat (sprint
misalnya) disebabkan oleh penumpukan asam laktat di jaringan otot tubuh
Anda. Jelaskan fenomena ini dalam konteks respirasi dan fermentasi sel.
...................................................................................................................