RANCANGAN

OBAT

Ika Trisharyanti D. K.
 2 SKS

Pengampu

Ika Trisharyanti D. K.

Broto Santoso

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Jadwal

 Selasa : 13.00-14.30

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Syarat
 Syarat mengikuti kuliah :

Memakai pakaian yang rapi dan sopan

Tidak ramai/membuat kegaduhan

 Syarat mengikuti ujian : minimal kehadiran 75%

tidak berbuat curang saat ujian
syarat lulus ujian

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Kompetensi

 Mampu memahami konsep dasar perancangan obat dan

melakukan desain rancangan obat sederhana dengan teknik
klasik maupun non klasik.

Rancangan Obat Gasal 20-21

Capaian Pembelajaran Mata
Kuliah
 Mampu menjelaskan teknik dalam rancangan obat
didasarkan sifat kimia-fisika dan aktivitas kimia obat.
Mahasiswa menjelaskan pengaruh sifat fisika kimia
terhadap aktivitas biologis senyawa obat.
Mahasiswa dapat menjelaskan langkah-langkah
perancangan obat.

 Mampu menjelaskan teknik optimasi senyawa

penuntun dan aplikasi hubungan kuantitatif struktur
dan aktivitas (HKSA)
Mahasiswa dapat melakukan beberapa metode optimasi
senyawa penuntun.
Mahasiswa dapat menganalisis hubungan kuantitatif
struktur dan aktivitas.
Rancangan Obat Gasal 20-21 6
Capaian Pembelajaran Mata
Kuliah
 Mampu menjelaskan fungsi protein target, ligan, dan
database keduanya untuk digunakan dalam merancang
obat.

Mahasiswa menjelaskan teknik komputasi dan fungsi

protein target dalam rancangan obat.
Mahasiswa menjelaskan fungsi ligan disertai jenis dan
ragamnya dalam uji in silico.
Mahasiswa menjelaskan dan menggunakan database
online ligan dan protein target.

Rancangan Obat Gasal 20-21 7

Capaian Pembelajaran Mata
Kuliah
 Mampu menjelaskan dan melakukan docking molekular,
menganalisis, memprediksi hasil serta menyusun artikel
publikasi dan/atau makalah presentasi.

Mahasiswa menjelaskan dan melakukan orientasi docking

ligan native, penentuan pusat massa dan besaran
gridbox untuk virtual docking.
Mahasiswa menjelaskan dan melakukan penentuan protein
target dan docking terbalik.
Mahasiswa menjelaskan interaksi ligan protein, melakukan
dan menganalisis visualisasi data hasil docking serta
menyajikan dalam bentuk artikel publikasi

Rancangan Obat Gasal 20-21 8

 Deskripsi
 Dasar-dasar teknik perancangan obat baik klasik
maupun non klasik.

 Secara klasik berdasarkan pengaruh sifat FK terhadap

aktivitas biologis : kelarutan dan aktivitas biologis,
stereokimia dan aktivitas biologis, ikatan kimia dan
aktivitas biologis, langkah-langkah merancang obat
serta metode optimasi molekul, dan hubungan
kuantitatif struktur dan aktivitas.

 Teknik non klasik meliputi: desain senyawa penuntun

berbasis protein target, penentuan ligan dengan
beberapa software dan teknik docking dalam
perancangan obat.
9

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Acuan
 Bajorath, J. (Ed.), 2004, Chemoinformatics: Concepts,
Methods, and Tools for Drug Discovery, Humana Press
Inc.

 Bozzolo, G., Noebe, R. D., and Abel, P. B., (Eds.), 2007,

Applied Computational Materials Modeling: Theory,
Simulation and Experiment, Springer Science &
Business Media, LLC.

 Bultinck, P., de Winter,  H., Langenaeker, W., and

Tollenaere, J. P. (Eds.), 2004, Computational Medicinal
Chemistry for Drug Discovery, Marcel Dekker, Inc.
10

Rancangan Obat Gasal 20-21

Acuan
 Hinchliffe, A., 2008, Molecular Modeling for Beginners,
2nd Edition, John Wiley & Sons Ltd.

 Politzer, P., and Maksić, Z. B. (Eds.), 1996, Molecular

Electrostatic Potentials: Concepts and Applications,
Theoretical and Computational Chemistry Series,
Volume 3, Elsevier Science.

 Siswandono dan Soekardjo (Ed.), 1998, Prinsip-prinsip

Rancangan Obat, Airlangga University Press,
Surabaya.

 Jurnal-jurnal
Rancangan Obat Gasal 20-21 11
 Materi

 Pendahuluan

 Langkah-langkah perancangan obat

 Pengaruh sifat fisika kimia terhadap aktivitas

biologis senyawa-senyawa obat

 Metode optimasi senyawa penuntun

 Hub. kuantitatif struktur-aktivitas

12

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Materi
 Teknik komputasi dan fungsi protein target dalam
rancangan obat berupa penggolongan protein target
dalam database RSCB, jenis interaksi ligan protein
target hasil pengukuran lab, dan prosedur preparasi
protein target dalam uji in silico dan parameter
penilaiannya.
 Fungsi ligan disertai jenis dan ragamnya dalam uji in
silico yang dibagi dalam sub materi klasifikasi ligan
dalam rancang obat berdasarkan fungsinya, jenis dan
contoh deskriptor ligan target serta aturan Lipinski of
Fives, serta prosedur preparasi ligan target dalam uji in
silico dan penjelasan parameter penilaiannya.
13

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Database online ligan dan protein target yaitu
jenis dan ragam database ligan dan protein
target melalui teknik penentuan ligan native
dalam protein target yang diperoleh dalam
database dan secara teknik homologi dalam
prosedur umum pemanfaatan database ligan dan
protein target.
 Orientasi docking ligan native, penentuan pusat
massa dan besaran gridbox untuk virtual docking
yaitu prosedur penentuan pusat massa, gridbox,
binding site pocket, dan orientasi docking.

Rancangan Obat Gasal 20-21 14

 Penentuan protein target dan docking terbalik,
berupa teknik homologi protein target
menggunakan database FASTA protein secara
online, parameter penilaian protein target homolog
dalam uji in silico dan prosedur docking terbalik
dengan berbagai perangkat lunak terkait.
 Interaksi ligan protein, melakukan dan
menganalisis visualisasi data hasil docking
dilakukan dengan teknik visualisasi dan penentuan
interaksi ligan protein hasil docking dengan
perangkat lunak terkait dan prosedur penentuan
interaksi ligan protein dan visualisasi hasil docking

Rancangan Obat Gasal 20-21 15

TUGAS
  PPT

 Diupload selambatnya Senin 14 September 2020

 Nama File = PPT/Jurnal-RO-Kel …

 Presentasi mulai pertemuan ke-3

17

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Pengaruh sifat fisika kimia terhadap aktivitas
biologis senyawa-senyawa obat ---

dari buku/jurnal

 Hub. kuantitatif struktur-aktivitas --- dari jurnal

berbahasa inggris

 PPT maksimal 30 slide

Rancangan Obat Gasal 20-21 18

 Hub. sifat kimia fisika (ionisasi dan kelat) dengan
aktivitas
 Hub. sifat kimia fisika (stereokimia) dengan aktivitas
 Hub. sifat kimia fisika (potensial redoks dan kelarutan)
dengan aktivitas
 Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (dari Jurnal)
 Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (dari Jurnal)
 Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (dari Jurnal)
 Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (dari Jurnal)

Rancangan Obat Gasal 20-21 19

 Pengembangan Obat

 Obat : senyawa yang digunakan untuk pengobatan

penyakit dan semua senyawa kimia yang dapat
mempengaruhi atau menimbulkan efek pada sistem
biologis, termasuk insektisida, fungisida, herbisida.

 trial and error  biaya pengembangan obat baru ±

Rp. 7,5 trilyun, waktu ± 10 tahun.

 Dari 5.000 senyawa baru, kemungkinan hanya 1 (satu)

senyawa yang secara klinik dapat digunakan sebagai
obat.

20

Rancangan Obat Gasal 20-21

 21

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Berdasarkan sumbernya obat digolongkan
menjadi :

Obat alami : obat yang berasal dari alam 

tanaman : morfin dan atropin; hewan : minyak
ikan dan hormon; mineral : belerang (S) dan KBr.

Obat sintetik : obat yang murni hasil sintesis.

22

Rancangan Obat Gasal 20-21

 23

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Rancangan obat :

 Usaha mengembangkan obat, yang sudah diketahui

struktur molekul dan aktivitas biologisnya, atas
dasar penalaran yang sistematik dan rasional,
mengurangi faktor coba-coba.

 Proses mengembangkan lebih lanjut obat dengan

tujuan mendapatkan obat baru dengan efek biologis
yang diinginkan dan mengurangi atau
menghilangkan efek samping yang ada.
24

Rancangan Obat Gasal 20-21

  There are various aims in drug design:

1. The drug should have a good selectivity for its target

2. The drug should have a good level of activity for its target

3. The drug should have minimum side effects

4. The drug should be easily synthesized

5. The drug should be chemically stable

6. The drug should have acceptable pharmacokinetics

properties

7. The drug should be non-toxic

25

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Langkah-langkah dalam merancang obat :

 Mencari senyawa penuntun (lead compound)

Senyawa penuntun : senyawa yang dapat menimbulkan
aktivitas biologis

Senyawa yang dikembangkan mempunyai sifat kurang

menguntungkan : aktivitas lemah, kurang spesifik, efek
samping besar, kurang stabil, masa kerja singkat, atau
mempunyai bau dan rasa yang kurang menyenangkan.

26

Rancangan Obat Gasal 20-21

  Manipulasi molekul (modifikasi struktur) :
mensintesis sejumlah turunan senyawa
penuntun, melakukan identifikasi struktur dan
menguji aktivitas biologisnya.

Gugus atau substituen yang disubstitusikan

dapat dipilih dengan menggunakan : metode
Topliss, metode pencarian Fibonacci, metode
rangkaian optimisasi simpleks atau analisis
klaster.
27

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Merancang bentuk pemakaian dan
aturan dosis yang sesuai

Uji farmakologi, toksikologi, klinik

28

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Pencarian Senyawa Aktif
RANCANGAN OBAT

Uji Toksisitas Akut

Penapisan Farmakologis

Uji Stabilitas Uji Toksisitas Subakut

Uji Farmakologis Lanjut

Studi Uji Teratogenisitas

Farmakokinetik Calon Obat Baru dan Mutagenisitas
pada Hewan
Uji Klinik Fasa I

Pengembangan
dan Uji Stabilitas Uji Klinik Fasa II Studi Toksisitas
Bentuk Sediaan Klinik

Studi
Uji Klinik Fasa III
Farmakokinetik
pada Manusia

Aplikasi Obat Baru

Pemasaran Obat

Uji Klinik Fasa IV

(Setelah Obat 29
Beredar)
Rancangan Obat Gasal 20-21
 Animal Phase

 Precedes human testing

 watching for toxic effects,side effects,
addictions, cancerous tumors or fetal
deformities
 Calculating the Therapeutic Index (TI)…. The
difference between the dosage that produces a
Therapeutic Effect and the dosage that
produces a Toxic Effect
30

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Rancangan Obat Rasional
Merancang obat secara rasional berhubungan dengan
pengetahuan tentang :
1. Mekanisme kerja dan sisi kerja obat pada tingkat molekul dan
tingkat elektronik
2. Hubungan kualitatif dan kuantitatif struktur kimia dan aktivitas
biologis
3. Reseptor obat
4. Model interaksi obat‑reseptor
5. Efek farmakologis dari gugus spesifik
6. Mekanisme reaksi kimia dan biokimia
7. Biosintesis metabolit dan konstituen lain dalam organisme hidup
8. Perbedaan biokimia antara manusia dan parasit
31

Rancangan Obat Gasal 20-21

 32

Rancangan Obat Gasal 20-21

 Selamat berjuang seoptimal mungkin...

33

Rancangan Obat Gasal 20-21