Jurnal Biologi Indonesia 10(1): 109-117 (2014)

Fluks Bentik dan Potensi Aktivitas Bakteri Terkait Siklus Nitrogen di Sedimen Perairan
Mangrove Pulau Dua, Banten
(Benthic Fluxes and Potency of Bacterial Activity Related to Nitrogen Cycle in Pulau Dua
Mangrove Sediments, Banten)

Aliati Iswantari 1, Yusli Wardiatno1, Niken T.M Pratiwi1 & Iman Rusmana2
1
Departemen Manajemen Sumberdaya Perairan, FPIK, IPB,
Jl. Agatis, Kampus IPB Darmaga, Bogor, 16680
2
Departemen Biologi, FMIPA, IPB, Jl. Agatis, Kampus IPB Darmaga, Bogor, 16680
Email: aliatiiswantari@gmail.com

Memasukkan: November 2013, Diterima: Januari 2014

ABSTRACT
Mangrove ecosystem has important role as source of nutrient particularly nitrogen in coastal area. Nitrogen (N) is a
limiting factor in marine and coastal area. The aim of this research was to study benthic fluxes and potency of
bacterial activity in sediment of mangroves area, related to nitrogen cycle. This research was conducted in flooded
mangroves area in Pulau Dua. The sediment and overlying water was sampled using sediment core sampler.
Experimental treatment for flux analysis and sediment-slurry were conducted in three hours. Nutrient of NH3-N,
NO2-N, and NO3-N and abundance of nitrifier, denitrifier, DNRA, and ammonifier were analyzed. The results
showed that the abundance of anaerobic bacteria was higher than aerobic bacteria. The dominance of bacterial
groups found in sediment was ammonification bacteria. The highest nutrient concentration in sediment was NH3-
N. Benthic fluxes value showed higher NH3-N tends to release from the sediment to water than NO2-N and NO3-
N. Generally, mangrove sediment in Pulau Dua has higher potency ofbacterial activity (Vmax and Km) in NO3
reduction by anaerobic bacteria than NH3 oxidation by aerobic bacteria.

Keywords: bacteria, benthic fluxes, mangrove, potency of bacterial activity, sediment  

 
ABSTRAK
Ekosistem mangrove memiliki peranan penting sebagai penyumbang nutrien terutama nitrogen di perairan pesisir.
Nitrogen (N) merupakan faktor pembatas di perairan laut dan pesisir. Tujuan penelitian ini adalah untuk
mempelajari fluks bentik dan Potencsi aktivitas bakteri di sedimen area mangrove terkait dengan siklus N.
Penelitian ini dilaksanakan di daerah perairan mangrove Pulau Dua yang selalu tergenang. Sedimen dan overlying
water diambil menggunakan sediment core. Perlakuan untuk analisis fluks bentik dan sediment-slurry dilakukan
selama tiga jam. Analisis dilakukan terhadap nutrien yaitu NH3-N, NO2-N, dan NO3-N, serta kelimpahan
kelompok bakteri nitrifikasi, denitrifikasi, amonifikasi, dan DNRA. Hasil menunjukkan bahwa kelimpahan
kelompok bakteri anaerob lebih tinggi dari bakteri aerob. Kelompok bakteri yang dominan ditemukan di sedimen
mangrove Pulau Dua adalah kelompok bakteri amonifikasi. Kandungan nutrien N tertinggi di sedimen adalah NH3
-N. Nilai fluks bentik menunjukkan NH3-N memiliki kecenderungan lepas dari sedimen ke air yang lebih besar
dibandingkan dengan NO2-N and NO3-N. Secara umum, sedimen mangrove di Pulau Dua memiliki potensi
aktivitas (Vmax dan Km) yang lebih besar dalam reduksi NO3 oleh bakteri anaerob dibandingkan dengan oksidasi
NH3 oleh bakteri aerob.

Kata Kunci: potensi aktivitas bakteri, fluks bentik, mangrove, sedimen

PENDAHULUAN erosi, ombak, dan juga menjadi perangkap sedimen.

Selain itu, ekosistem mangrove berperan sebagai
Mangrove merupakan vegetasi yang memiliki penyumbang (sumber) nutrien ke ekosistem pesisir.
peranan penting yang tumbuh di daerah pesisir. Tingginya guguran dari mangrove, degradasi dan
Mangrove berfungsi sebagai pelindung pesisir dari remineralisasinya menjadi salah satu faktor yang

109
Iswantari dkk.
berkontribusi terhadap tingginya kandungan
nutrien di sedimen mangrove (Silva et al. 2007).
Menurut Howarth & Marino (2006), nitrogen
(N) merupakan faktor pembatas yang kritis untuk
produktivitas primer dalam sistem pesisir.
Ekosistem mangrove menyediakan relung
ekologis untuk mikroba yang memiliki peran
beragam dalam daur ulang nutrien (Sahoo &
Dhal 2008). Siklus N di area mangrove paling
utama dilakukan oleh mikroba dibandingkan
dengan proses kimia (Alongi et al. 1992 diacu
dalam Fernandes et al. 2012).
Mikroorganisme yang terkait dengan siklus
N di sedimen perairan, diantaranya nitrifikasi
meliputi AOB (Ammonia Oxidizing Bacteria) dan
NOB (Nitrite Oxidizing Bacteria), denitrifikasi,
anammox (anaerobic ammonium oxidation),
DNRA (dissimilatory nitrate reduction to
ammonium), dan amonifikasi (Rajendran 2011;
Canavan et al. 2007; Zhu et al. 2010). Selain proses
bioturbasi dan bioirigasi oleh bentik organisme,
adanya aktivitas mikroba turut berperan dalam
fluks nutrien bentik-pelagis di sedimen (Tuominen
et al. 1999; Volkenborn et al. 2007). Fluks bentik
dapat menggambarkan aktivitas aktual bakteri
dalam pemanfaatan maupun pembentukan N di
sedimen. Kemampuan bakteri tersebut dalam
beraktivitas didukung oleh potensi aktivitas
bakteri dalam memanfaatkan N.
Tujuan dari penelitian ini adalah mempelajari
fluks N bentik (NH3-N, NO2-N, dan NO3-N)
dan potensi aktivitas bakteri (Vmax dan Km) yang
terkait dengan siklus N pada sedimen perairan
mangrove Cagar Alam Pulau Dua, Banten.
BAHAN DAN CARA KERJA
Penelitian dilakukan pada bulan April hingga
Agustus 2013. Pengambilan contoh air dan
sedimen dilakukan di area mangrove yang selalu
tergenang di daerah Cagar Alam Pulau Dua
bagian barat, Banten.
Alat utama yang digunakan adalah acrylic
sediment core untuk pengambilan contoh air dan
110
sedimen dan alat pemutar untuk perlakuan fluks
bentik. Bahan yang digunakan adalah bahan-
bahan untuk analisis parameter kualitas air dan
bahan-bahan media tumbuh bakteri yang sudah
spesifik untuk kelompok bakteri yang terkait
siklus N.
Bahan untuk analisis NH3-N (amonia-N),
NO2-N (nitrit-N) mengacu pada Eaton et al.
2005 dan NO3-N (nitrat-N) mengacu pada Rand
et al. 1979. Bahan media untuk analisis kelimpahan
kelompok bakteri aerob nitrifikasi dibuat
berdasarkan Bhaskar & Charyulu (2005) dengan
modifikasi sumber N dan C, yaitu AOB (sumber
N: NH3, sumber C: CO3) dan NOB (sumber N:
NO2, sumber C: CO3). Selanjutnya media untuk
analisis kelimpahan kelompok bakteri anaerob
dibuat berdasarkan Rusmana (2007) dengan
modifikasi sumber N dan C, yaitu bakteri
denitrifikasi (sumber N: NO3, sumber C: asetat),
bakteri fermentatif DNRA (sumber N: NO3,
sumber C: glukosa), dan bakteri fermentatif amonifikasi
(sumber N: pepton, sumber C: glukosa).
Pengkondisian anaerob pada media dilakukan
dengan metode OFN (Oxygen Free Nitrogen).
Pengukuran terhadap beberapa parameter
lingkungan perairan di air seperti suhu, pH,
salinitas, dan DO (dissolved oxygen) dilakukan
secara insitu. Pengambilan contoh sedimen juga
dilakukan untuk analisis pH, rasio C/N, dan
tekstur sedimen. Air (overlying water) dan sedimen
diambil menggunakan core hingga kedalaman 15
cm dari permukaan dasar sedimen.
Untuk mengetahui fluks bentik dari sedimen
ke air (overlying water), dilakukan perlakuan pada
contoh sedimen dan air yang sudah diambil
dengan menggunakan sediment core. Selanjutnya
bagian atas dari core tersebut ditutup dengan
penutup karet yang sudah dipasangkan alat pemutar
berupa magnetic stirer untuk menghomogenkan
air. Sediment core direndam dan diinkubasi selama 3
jam dan alat pemutar dinyalakan selama waktu
inkubasi tersebut. Pengambilan contoh air
dilakukan pada t0 dan t3 jam. Contoh diambil
 Fluks Bentik dan Potensi Aktivitas Bakteri Terkait Siklus Nitrogen
menggunakan syringe diawetkan dengan HgCl2
dan selanjutnya dilakukan analisis NH3-N, NO2-
N dan NO3-N.
Potensi aktivitas bakteri dapat diketahui
melalui percobaan sediment-slurry (Oremland et
al. 1984). Slurry dibuat dari sedimen yang dicampur
dengan air laut buatan dengan perbandingan 1:3.
Terdapat dua perlakuan, yaitu slurry anaerobik
(metode OFN) dengan penambahan NaNO3 untuk
mengetahui reduksi NO3 oleh bakteri anaerob
dan slurry aerobik dengan penambahan NH4Cl
untuk mengetahui oksidasi NH3 oleh bakteri aerob
(Runcie et al. 2003). Konsentrasi total slurry dalam
perlakuan yaitu 0, 100, 300, 500, 800, dan 1000
µM. Setelah ditambahkan nutrien, slurry diinkubasi
selama 3 jam. Selanjutnya dilakukan analisis
kandungan NH3-N, NO2-N, dan NO3-N pada
slurry. Potensi aktivitas bakteri ditentukan melalui
penghitungan nilai Vmax dan Km.
Untuk analisis air pori, sedimen yang digunakan
pada perlakuan fluks bentik dipotong menjadi 3
strata (1-5 cm, 6-10 cm, dan 11-15 cm).
Selanjutnya dilakukan pengekstrakan air pori
sedimen dengan modifikasi metode analisis air
pori pada Giesy et al. (1990) & Harkey et al.
(1994) dan dilakukan analisis NH3-N, NO2-N,
dan NO3-N.
Analisis kelimpahan bakteri dilakukan pada
air dan sedimen yang telah dipotong. Analisis
dilakukan terhadap kelompok bakteri AOB, NOB,
denitrifikasi, DNRA, dan amonifikasi dengan
menggunakan metode MPN (Most Probable
Number). Setelah bakteri ditumbuhkan di media
dan diinkubasi, dilakukan pengujian keberadaan
bakteri. Keberadaan kelompok bakteri AOB dan
denitrifikasi diuji berdasarkan pembentukan
NO2, keberadaan kelompok bakteri NOB diuji
berdasarkan pereduksian NO2, dan keberadaan
kelompok bakteri DNRA dan amonifikasi diuji
berdasarkan pembentukan NH3 pada media.
Hasil dari analisis MPN dihitung dengan
menggunakan perangkat lunak MPN Calculator,
Build 23.
Fluks N bentik dari sedimen ke air (sediment-
overlying water) dihitung menggunakan formula
berikut (Ferguson et al. 2004):
BF=([Ctl-Ct0].V/SA)
T
Keterangan: BF= fluks nutrien bentik (µmol m–2 h–1), Ct0=
konsentrasi nutrien (µmol L–1) di overlying water pada
waktu periode awal, Ct1= konsentrasi nutrien (µmol L–1)
di overlying water pada waktu periode akhir, V= volume
air di overlying water (L) di wadah inkubasi, SA= area
permukaan sedimen (m2) di wadah inkubasi, T= waktu
(h)
Penentuan potensi aktivitas mikrobial (Vmax
dan Km) dilakukan menggunakan persamaan
kinetika Michaelis-Menten, plot Lineweaver-Burk
“double reciprocal” dengan rumus sebagai berikut
(Dowd & Riggs 1965):
Vmax=(1/Vmax)+(Km/Vmax)1/Cs
Keterangan: V= laju aktivitas (µmol jam-1 gram sedimen-1),
Cs= konsentrasi substrat (µM), Vmax= laju aktivitas
maksimum (µmol jam-1 gram sedimen-1), Km=
konsentrasi saat ½ Vmax (µM)
Regresi linier dan uji t digunakan untuk
mengetahui hubungan dan signifikansi perbedaan
antara satu komponen dengan komponen lainnya.
HASIL
Karakteristik Air dan Sedimen
Perairan mangrove Pulau Dua bagian barat
memiliki salinitas yang berkisar 26-27‰, pH 8,
dan kandungan DO yang cukup rendah yaitu
0,66 mg L-1. Karakteristik sedimen dari perairan
mangrove tersebut dapat dilihat pada Tabel 1.
Kelimpahan Bakteri
Kelimpahan bakteri di air dan sedimen
mangrove dapat dilihat pada Gambar 1. Berdasarkan
gambar tersebut, diketahui bahwa kelimpahan
kelompok bakteri nitrifikasi (AOB dan NOB),
denitrifikasi dan DNRA tertinggi di sedimen
111
Iswantari dkk.

Tabel 1. Karakteristik sedimen di area mangrove Pulau Dua, Banten

Kedalaman Total N Rasio Tekstursedimen (%)

pH C (%)
(cm) (%) C/N Pasir Debu Liat

0-5 8,17 2,22 0,12 17,81 40,06 53,88 6,06

6-10 8,21 2,35 0,12 19,09 38,55 54,89 6,56

11-15 8,27 1,68 0,21 8,09 39,92 55,19 4,89

 
3,5x103 8x105
Kelimpahan kelompok bakteri

3,0x103
Kelimpahan kelompok bakteri
6x105
(sedimen - MPN gram-1 )

(sedimen - MPN gram-1)

2,5x103
4x105
(air - MPN mL-1 )

2,0x103
1,5x103 (air - MPN mL-1) 2x105
103
5,0x102

0 0
air 0-5 6-10 11-15 air 0-5 6-10 11-15
Strata kedalaman sedimen (cm) Strata kedalaman sedimen (cm)  
Kelimpahan kelompok bakteri

108
(sedimen - MPN gram-1)

Keterangan:
(air - MPN mL-1)

8x107
AOB
6x107 NOB
4x107 Denitrifikasi
DNRA
2x107
Amonifikasi
0
air 0-5 6-10 11-15
Strata kedalaman sedimen (cm)

Gambar 1. Kelimpahan bakteri yang terkait siklus N di air dan sedimen area mangrove Pulau Dua

mangrove Pulau Dua terdapat pada strata 0-5 cm.

Selanjutnya kelimpahan kelompok bakteri amonifikasi Konsentrasi (mg L-1)
di sedimen mangrove Pulau Dua mendominasi 0 10 20 30
kelompok bakteri terkait siklus N lainnya. air0
Keterangan:
Kedalaman (cm)

5
Profil Air Pori Sedimen NH3-N
Berdasarkan Gambar 2, diketahui bahwa NO2-N
10
NO3-N
kandungan NH3-N di air lebih rendah dibandingkan
di sedimen. Sedimen mangrove pada setiap strata 15
kedalaman memiliki kandungan NH3-N yang
lebih tinggi dibandingkan dengan kandungan Gambar 2. Profil nutrien pada air dan air pori sedimen
NO2-N dan NO3-N (P(T<=t) < 0,05). mangrove Pulau Dua

112
 Fluks Bentik dan Potensi Aktivitas Bakteri Terkait Siklus Nitrogen

Fluks Nitrogen pada setiap strata kedalaman sedimen memiliki

Hasil percobaan fluks bentik terhadap air dan laju (Vmax) yang lebih tinggi dibandingkan dengan
sedimen dari Pulau Dua menunjukkan hasil yang aktivitas oksidasi NH3.
cenderung mengarah ke pembentukan N (Gambar 3).
Fluks NH3-N berkisar 44,96-108,82 μmol m–2 h–1, PEMBAHASAN
fluks NO2-N berkisar dari 3,85x10-5-1,57x10-3 μmol
m–2 h–1, dan fluks NO3-N berkisar dari -1,04-2,62 Siklus N di perairan mangrove tidak terlepas
μmol m–2 h–1. Fluks NH3-N merupakan yang paling dari peran mikroorganisme yang hidup di
besar terjadi dibandingkan NO2-N dan NO3-N. dalamnya. Analisis terhadap kelimpahan
Konsentrasi awal dari NH3-N, NO2-N dan NO3- kelompok bakteri nitrifikasi, denitrifikasi, DNRA,
N diduga berkaitan dengan fluks N yang dihasilkan dan amonifikasi di air dan sedimen mangrove
dengan R2 berturut-turut 99,01%, 96,61%, dan dapat mewakili dugaan keberadaan dan keterkaitan
89,55 % (Gambar 3). perannya dalam siklus N.
Nitrifikasi merupakan reaksi penting dalam
Potensi aktivitas Bakteri dalam Reduksi NO3 siklus nitrogen yang membutuhkan oksigen dalam
dan Oksidasi NH3 proses oksidasi NH3 menjadi NO2 dan oksidasi
Berdasarkan Gambar 4a dan 4b, diketahui NO2 menjadi NO3 (Agustiyani et al. 2010;
bahwa semakin tinggi konsentrasi total slury maka Prosser 2005). Pada strata 0-5 cm diduga terdapat
besar NO3 yang direduksi dan NH3 yang dioksidasi oksigen yang lebih memadai dibandingkan kedalaman
semakin meningkat. Selanjutnya nilai Vmax dan Km yang lebih dalam yang menyebabkan kelimpahan
hasil perlakuan slurry dapat dilihat pada Tabel 2. bakteri di strata sedimen di bawahnya menurun
Berdasarkan tabel tersebut, aktivitas reduksi NO3 (Gambar 1). Bila dikaitkan dengan kandungan

120 0,010 3
F lu k s N O 2 -N (µ m o l m -2 h -1 )
Fluks N H 3 -N (µ m ol m -2 h -1 )

Fluks N O 3 -N (µ m ol m -2 h -1 )

100 0,008 2
80
0,006 1
60
0,004 0
3

40

20
0,002 -1

0 0,000 -2
1 2 3 1 2 3 1 2 3
Titik pengambilan contoh Titik pengambilan contoh Titik pengambilan contoh

Gambar 3. Fluks NH3-N, NO2-N, dan NO3-N bentik di perairan mangrove Pulau Dua

Tabel 2. Laju aktivitas bakteri maksimum (Vmax) dan Konsentrasi (Km) pada sedimen mangrove Pulau Dua
Reduksi NO 3 OksidasiNH3
Strata
Vmax Vmax
kedalaman -1
Km R2 Km R2
(µmol jam gram (µmol jam-1 gram
(cm) (µ M)  (%) (µ M) (%)
sedimen-1) sedimen-1)
0-5 58,82 815,88 99,81 23,81 2348,10 98,44
6-10 62,50 843,13 99,76 17,86 555,89 67,73
11-15 32,26 379,68 93,97 21,28 148,09 71,81
 
113
Iswantari dkk.

600
a
500
Konsentrasi (µM)

400

300

200

100

0
0 100 300 500 800 1000 0 100 300 500 800 1000 0 100 300 500 800 1000
0-5 6-10 11-15
Konsentrasi yang ditambahkan (µM) per strata sedimen (cm)

1400
1200 b
Konsentrasi (µM)

1000
800
600
400
200
0
0 100 300 500 800 1000 0 100 300 500 800 1000 0 100 300 500 800 1000

0-5 6-10 11-15

Konsentrasi yang ditambahkan (µM) per strata sedimen (cm)

Keterangan: NH3 NO2 NO3

Gambar 4. Hasil analisis NH3, NO2, dan NO3 pada perlakuan sediment- slurry a) dengan penambahan NaNO3 dan
b) dengan penambahan NH4Cl

DO di air yang berkisar 0,66-0,88 mg L-1, dapat
diduga kandungan DO pada sedimen lebih rendah.
Namun pada kondisi ini bakteri nitrifikasi masih
dapat ditemukan. Hocaoglu et al. (2011)
menyatakan bahwa proses nitrifikasi masih bisa
berjalan pada DO sangat rendah yaitu 0,15-0,5
mg L-1 meskipun tidak optimal.
Denitrifikasi adalah proses mikrobial dimana
NO3 dan NO2 diubah menjadi N2O dan N2 di
sedimen aerobik maupun anaerobik (Long et al.
2013). Secara umum, kelimpahan bakteri denitrifikasi
yang ditemukan lebih tinggi dari bakteri DNRA
(Gambar 1). Kondisi rasio C/N di sedimen
mangrove Pulau Dua tergolong sedang dan
semakin ke strata yang lebih dalam rasionya
semakin rendah rendah (Tabel 1). Pada rasio C/N
rendah, proses yang dapat mendominasi adalah
denitrifikasi, sedangkan pada C/N tinggi, proses
yang dapat mendominasi adalah DNRA (Koike &
Hattori 1978; Nedwell 1982 diacu dalam
Rusmana 2007).
Berdasarkan Gambar 1, kelompok bakteri
amonifikasi diketahui merupakan bakteri yang
dominan ditemukan di sedimen mangrove Pulau
Dua. Pada penelitian yang dilakukan Badjoeri et
al. (2010) di lahan tambak juga menunjukkan
bahwa bakteri penghasil amonium merupakan
bakteri dengan kelimpahan tertinggi yang
ditemukan di sedimen. Bakteri amonifikasi
merupakan bakteri heterotrof yang mampu

114
 Fluks Bentik dan Potensi Aktivitas Bakteri Terkait Siklus Nitrogen
memanfaatkan N organik secara langsung dan
mengubahnya menjadi amonia. Tingginya
guguran dari vegetasi mangrove (Silva et al. 2007)
diduga menjadi sumber bahan organik yang tinggi
bagi perairan mangrove yang kemudian
dimanfaatkan oleh bakteri amonifikasi.
Kandungan NH3-N di sedimen mangrove
Pulau Dua lebih tinggi dibandingkan dengan
NO2-N dan NO3-N (Gambar 2). Hal ini diduga
lebih terkait dengan kelimpahan kelompok
bakteri amonifikasi (penghasil NH3) yang
mendominasi kelimpahan bakteri di setiap strata
kedalaman sedimen mangrove Pulau Dua. Menurut
Silva et al. (2007), degradasi dan remineralisasi
bahan organik merupakan salah satu faktor yang
berkontribusi terhadap tingginya konsentrasi N di
sedimen mangrove. Rendahnya kandungan NO2-
N dan NO3-N diduga terkait dengan rendahnya
kandungan oksigen di sedimen. Menurut Jørgensen
& Revsbech (1985), kandungan oksigen di
sedimen semakin dalam akan semakin rendah.
Hal ini dapat menyebabkan aktivitas bakteri
aerob dalam oksidasi NH3 dan NO2 menjadi
rendah.
Siklus N merupakan proses yang ber-
kesinambungan. Produk dari suatu proses reduksi
maupun oksidasi dalam siklus N dapat digunakan
untuk menjalankan proses lainnya (Zhu et al. 2010).
Fluktuasi pembentukan maupun pemanfaatan
NH3-N, NO2-N, dan NO3-N tersebut diduga
terkait dengan adanya keberadaan dan aktivitas
kelompok bakteri terkait siklus N di sedimen.
Berdasarkan hasil perhitungan, fluks NH3-N dan
NO2-N di perairan mangrove Pulau Dua cenderung
bernilai positif yang lebih mengarah ke
pembentukan NH3-N dan NO2-N, sedangkan
fluks NO3-N cenderung bernilai negatif yang
menunjukkan terjadi pemanfaatan NO3-N
(Gambar 3).
Fluks NH3-N lebih tinggi dibandingkan
fluks NO2-N dan NO3-N. Hal ini diduga terkait
dengan tingginya kelimpahan kelompok bakteri
amonifikasi dan tingginya kandungan NH3-N di
sedimen mangrove. Berdasarkan hal tersebut,
sedimen mangrove Pulau Dua berpotensi sebagai
penyumbang amonia yang cukup besar ke perairan.
Berdasarkan hasil analisis regresi, terdapat dugaan
bahwa terjadinya fluks N di perairan terkait
dengan faktor kimia yaitu konsentrasi insial (awal)
nutrien tersebut. Bila konsentrasi awal nutrien di
air rendah, maka fluks bentik yang dihasilkan
akan tinggi, dan sebaliknya.
Berdasarkan hasil analisis perlakuan sediment-
slurry anaerobik (Gambar 4a), diketahui bahwa
telah terjadi reduksi NO3 yang diduga dilakukan
oleh kelompok bakteri denitrifikasi dan DNRA.
Hasil dari reduksi NO3 oleh kelompok bakteri
denitrifikasi dapat dilihat pada adanya
peningkatan kandungan NO2 seiring dengan
meningkatnya reduksi nitrat. Namun hasil
reduksi dari bakteri DNRA tidak dapat dilihat
karena kandungan NH3 mengalami penurunan.
Hal ini dikarenakan NH3 juga digunakan oleh
bakteri denitrifikasi untuk beraktivitas (Rusmana
2007). Berdasarkan hal tersebut, dapat diduga
bahwa kelompok bakteri denitrifikasi lebih dominan
dalam melakukan reduksi nitrat di sedimen
mangrove Pulau Dua yang didukung oleh
kelimpahan bakteri denitrifikasi yang lebih tinggi
dibandingkan dengan bakteri DNRA.
Pada perlakuan sediment-slurry aerobik (Gambar
4b) diduga telah terjadi aktivitas oksidasi NH3
oleh kelompok bakteri nitrifikasi. Namun hasil
aktivitas dari bakteri tersebut tidak tergambar
pada hasil NO2-N dan NO3-N yang didapatkan.
Hal tersebut mengindikasikan rendahnya aktivitas
oksidasi NH3 oleh kelompok bakteri nitrifikasi.
Fluks dapat menggambarkan aktivitas aktual
dari mikroorganisme dalam memanfaatkan
pencemar N yang terjadi sebenarnya di perairan
tersebut. Sedangkan Vmax dan Km mencerminkan
potensi aktivitas pada kondisi ideal mikroorganisme
perairan untuk memanfaatkan pencemar N.
Berdasarkan hasil perhitungan, diketahui bahwa
laju aktivitas maksimum (Vmax) aktivitas reduksi
NO3 pada setiap strata sedimen oleh bakteri
115
Iswantari dkk.
anaerob lebih tinggi dibandingkan dengan
oksidasi NH3 bakteri aerob (Tabel 2). Nilai Km
pada reduksi NO3 cenderung lebih tinggi
dibandingkan dengan oksidasi NH3 kecuali pada
strata 0-5 cm. Fox (1991) diacu dalam Putra
(2009) menyatakan bahwa nilai Km kecil berarti
kompleks E-S mantap dan afinitas enzim terhadap
substrat tinggi, sedangkan bila nilai Km besar
afinitasnya menjadi rendah. Secara umum,
tingginya aktivitas reduksi NO3 dibandingkan
dengan oksidasi NH3 di sedimen mangrove Pulau
Dua diduga terkait dengan kelimpahan bakteri
anaerob yang lebih tinggi dibandingkan bakteri
aerob.
KESIMPULAN
Fluks N bentik yang terjadi di perairan
mangrove Pulau Dua mengindikasikan sumbangan
NH3-N dari sedimen ke perairan yang lebih besar
dibandingkan dengan NO2-N dan NO3-N.
Secara umum, potensi aktivitas (Km dan Vmax)
reduksi NO3 oleh bakteri anaerob pada sedimen
mangrove Pulau Dua lebih tinggi dibandingkan
dengan oksidasi NH3 oleh bakteri aerob.
DAFTAR PUSTAKA
Agustiyani, D., RM. Kayadoe, & H. Imamuddin.
2010. Oksidasi nitrit oleh bakteri
heterotrofik pada kondisi aerobik. J. Biol.
Indones. 6(2): 265-275.
Badjoeri, M., YP. Hastuti, T. Widiyanto, & I.
Rusmana. 2010. Kelimpahan bakteri penghasil
senyawa amonium dan nitrit pada sedimen
tambak sistem semi intensif. Limnotek. 17
(1): 102-111.
Bhaskar, K. & PBBN. Charyulu. 2005. Effect of
environmental factors on nitrifying bacteria
isolated from the rhizosphere of Setaria
italica (L.) Beauv. Afr. J. Biotechnol. 4(10):
1145-1146.
Canavan, RW., AM. Laverman, & CP. Slomp.
116
2007. Modeling nitrogen cycling in a
coastal fresh water sediment. Hydrobiologia.
584: 27-36.
Dowd, JE., DS. Riggs. 1965. A comparison of
estimates of michaelis-menten kinetic constants
from various linear transformations. J. Biol.
Chem. 240 (2): 863-869.
Eaton, AD., LS. Clesceri, AE. Greenberg, & EW.
Rice. 2005. Standard method for the
examination of water and wastewater. 21st
ed. APHA-AWWA- WPCF. Washington D.C.
Ferguson, AJP., BD. Eyre, & JM. Gay. 2004.
Benthic nutrient fluxes in euphotic sediments
along shallow sub-tropical estuaries,
northern New South Wales, Australia.
Aquat. Microb. Ecol. 37: 219-235.
Fernandes, SO., VD. Michotey, S. Guasco, PC.
Bonin, & PAL. Bharathi. 2012. Denitrification
prevails over anammox in tropical mangrove
sediments (Goa, India). Mar. Environ. Res.
74: 9-19.
Giesy, JP., CJ. Rosiu, RL. Graney, & MG. Henry.
1990. Benthic invertebrate bioassays with
toxic sediment and pore water. Environ.
Toxicol. Chem. 9(2): 233-248.
Harkey, GA., PF. Landrum, & SJ. Klaine. 1994.
Comparison of whole-sediment, elutriate
and pore-water exposures for use in
assessing sediment-associated organic
contaminants in bioassays. Environ.
Toxicol. Chem. 13(8): 1315-1329.
Hocaoglu, SM, G. Insel, EU. Cokgor, & D.
Orhon. 2011. Effect of low dissolved
oxygen on simultaneous nitrification and
denitrification in a membrane bioreactor
treating black water. Biores. Technol. 102:
4333-4340.
Howarth, RW. & R. Marino. 2006. Nitrogen as
the limiting nutrient for eutrophication in
coastal marine ecosystems: Evolving views
over three decades. Limnol. Oceanogr. 51(1,
part 2): 364-376.
Jørgensen, BB. & NP. Revsbech. 1985. Diffusive
 Fluks Bentik dan Potensi Aktivitas Bakteri Terkait Siklus Nitrogen
boundary layers and the oxygen uptake of
sediments and detritus. Limnol. Oceanogr.
30(l): 11-122.
Koike, I. & A. Hattori. 1978. Denitrification and
ammonia formation in anaerobic coastal
sediments. Appl. Environ. Microbiol. 35(2):
278-282.
Long A., J. Heitman, C. Tobias, R. Philips, & B. Song.
2013. Co-occurring anammox, denitrification,
and codenitrification in agricultural soils.
Appl. Environ. Microbiol. 79(1): 168-176.
Oremland, RS., C. Umberger, CW. Culbertson,
& RL. Smith. 1984. Denitrification in San
Francisco Bay intertidal sediments. Appl.
Environ. Microbiol. 47(5): 1106-1112.
Prosser, JI. 2005. Nitrification. Dalam: Hillell, D.
Encyclopedia of Soils in the Environment.
Academic Press. Elsevier. 31-39
Putra, GPG. 2009. Penentuan kinetika enzim
poligalakturonase (PG) endogenous dari
pulp biji kakao. Jurnal Biologi. XIII(1): 21 -24.
Rajendran, J. 2011. Nitrification activity in New
Zealand soils and the variable effectiveness
of dicyandiamide. [Disertasi]. New Zealand:
Massey University.
Rand, MC., AE. Greenberg, & MJ. Taras. 1979.
Standard method for the examination of
water and wastewater. 14th ed. APHA-
AWWA-WPCF. Washington D.C.
Runcie, JW., RJ. Ritchie, & AWD. Larkum.
2003. Uptake kinetics and assimilation of
inorganic nitrogen by Catenella nipae and
Ulva lactuca. Aquat. Bot. 76: 155–174.
Rusmana, I. 2007. Effects of Temperature on
denitrifying growth and nitrate reduction
end products of Comamonas testosteroni
isolated from estuarine sediment. Microbiol.
Indones. 1(1): 43-47.
Sahoo, K. & NK. Dhal. 2008. Potential microbial
diversity in mangrove ecosystems: A review.
Indian J. Mar. Sci. 38(2): 249-256.
Silva, CARE., SR. Oliveira, RDP. Rêgo, & AA.
Mozeto. 2007. Dynamics of phosphorus
and nitrogen through litter fall and
decomposition in a tropical mangrove
forest. Mar. Environ. Res. 64(4): 524-534.
Tuominen, L, K. Mäkelä, KK. Lehtonen, H.
Haahti, S. Hietanen, & J. Kuparinen.
1999. Nutrient fluxes, porewater profiles
and denitrification in sediment influenced
by algal sedimentation and bioturbation by
Monoporeia affinis. Estuar. Coast. Shelf.
S. 49: 83-97.
Volkenborn, N., L. Polerecky, SIC. Hedtkamp,
JEE. van Beusekom, & D. de Beer. 2007.
Bioturbation and bioirrigation extend the
open exchange regions in permeable
sediments. Limnol. Oceanogr. 52(5): 1898-
1909.
Zhu, G., MSM. Jetten, P. Kuschk, KF. Ettwig, &
C. Yin. 2010. Potential roles of anaerobic
ammonium and methane oxidation in the
nitrogen cycle of wetland ecosystems. Appl.
Microbiol. Biotechnol. 6: 1043-1055.
117