BASIC

BIOLOGY OF cELL

dr. KAMAJAYA,MSc,SpAnd.
Bagian Biologi FK-USU, Medan.

Dilarang copy.
A. Struktur umum sel.
 NUCLEUS.
1. Nuclear membrane
2. Chromatin,
3. Nucleolus,
4. Nuclear matrix.

PROTOPLASMA
(CELL)

CYTOPLASM
1. Plasma membrane,
2. Organella,
a. mitochondria
b. ribosome,
c. reticulum
endoplasmic,
d. golgi apparatus,
e. centriole,
f. lysosome,
3. inclusions.
a. granule ecretion,
b. pigmet,
4. nuclear matrix.
Nuclear membrane 1. Nucleus.Nucleolus
Nucleoplasm
(matrix)

Chromatin
 1.1. NUCLEAR MEMBRANE
Nuclear membrane berupa 2 unit
membrane paralel yi.: membran luar
dan membran dalam, terpisah celah
sempit (40-70 nm) disbt. Sisterna
perinukleus.
Membran luar Lamina fibrosa, struktur protein
Membran dalam berikatan erat dg membran dalam.
terdiri atas 3 polipeptida disbt lamin.
Di tempat-tempat tertentu membran
Sisterna perinukleus
luar dan membran dalam menyatu
berupa celah sirkuler, dsbt pori-inti,
berukuran rata-rata 70 nm. Pori
memp. membran kedap elektron
berupa diafragma, suatu protein
berlapis tunggal.
Sering dijumpai poliribosom melekat
pori
ke membran luar. Dan terkadang
selaput inti berhubungan langsung
dg RER.
1.2. CHROMATIN
• 2 jenis kromatin : heterokro-
matin dan eukromatin. Hetero-
kromatin berupa gumpalan
nukleoprotein yg basofilik.
Eukromatin lebih pucat.
•Proporsi heterokromatin dan
eukromatin dlm nukleus mem-
berikan penampilan inti-sel yg
gelap dan terang.
•Kromatin adalah nukleosom,
mengandung : 2 copy histon
masing-masing terdiri atas
H2A, H2B, H3, dan H4, dan
diluarnya melibatkan 166 psg
basa DNA
 CHROMosome
Sewaktu pembelahan sel (mitosis
atau meiosis), kromatin memendek
dan mem besar disebut kromosom.
Kromosom mengandung materi
genetik (gen) yang menurunkan sifat
dari parental (orang-tua) kepada
turunan-turunan nya.
Gen (materi genetik) ini secara
biokimia adalah Asam Deoksi ribo
nukleat (DNA).
DNA berupa pasangan ganda
(double helix) Gula (deoksiribose +
Phosphate), dan diantara pasangan
dihubungkan oleh pasangan basa
nitrogen (purine dan pyrimidine).
1.3. NUCLEOLUS.

• Strukturnya bulat diameter sekitar 1 mm,

mengandung RNA dan protein.
• Umumnya bersifat basofilik.
• Melalui mikroskop elektron terdapat 3
unsur berbeda 1 atau lbh. Daerah pucat
terdiri atas pengatur DNA. Urutan basa
nya mirip sandi r-RNA (ribosomal-RNA).
• Di dekat pengatur DNA terdpt serat pars
fibrosa mengandung transkrip primer gen
r-RNA
• Unsur ketiga pars granulosa mengandung
granul-granul (ribosom yg mau matang).
• Heterokromatin sering tampak melekat ke
nukleolus, namun fungsinya blm diketahui.
1.4. NUCLEAR MATRIX

• Matrix nuklear adalah unsur yg mengisi ruang

diantara kromatin-kromatin dan nukleolus.
• Terdiri dari protein, dan ada pula yg ber aktivitas
enzim, metabolit dan ion-ion.
• Lamina fibrosa dari membran inti merupakan
bagian dari matrix, dan membentuk
nukleoskeleton.
• Nukleoskeleton kemungkinan membantu
pembentukan protein dasar dimana lengkung DNA
terikat.
2. CYTOPLASM
 2.1. PLASMA MEMBRANE
Plasma membrane mempunyai ketebalan
7,2 – 10 nm. Mempunyai struktur berlapis
tiga disebt membran unit.
Membran terluar, sebagai kulit-sel disebut
glikokalix mengandung protein (glikoprotein)
dan lemak (glikolipid) yg juga mengandung
karbohidrat, bersifat hidrolitik.
Membran tengah, berbentuk mozaik.
Protein-protein yg menonjol dimana-mana terlibat dlm sistem ulang-
alik (shuttle) menggerakkan elektrollit dan metabolit halus kedalam
dan keluar sel. Membran dalam menghadap sitoplasma mengatur
metabolisme sel, dan respons-sel thd sinyal kimiawi dari luar, dan
bersifat hidrofobik.
Pengambilan materi tertentu dari luar sel dapat dgn cara endositosis
dan pelepasan materi sel keluar disbt exositosis. Dikenal pula ada 2
bentuk cara mengeluarkan dan memasukkan cairan sel disebut
pinositosis.
2.2. ORGANELLA :
a. Mitochondria

Mitochondria berupa
membran terdiri atas membran
luar, dan membran dalam yg
membentuk lipatan kearah
lumen disebut krista.
Berfungsi untuk
mengobah energi kimia
menjadi energi yg mudah
dimanfaatkan.
Sebagian energi disimpan dalam ikatan fosfat ber
energi tinggi (ATP).
Ruang antar krista diisi matrix terdiri dari protein
dan sedikit DNA ( mt-DNA) dan RNA.
2.2. ORGANELLA.
B. RIBOSOM

Ribosom adalah partikel kecil yg kedap

elektron, berukuran 20x30 nm. Tersusun
dari 4 RNA ribosom (r-RNA) dan hampir
80 protein yg berbeda.
Ditemukan pd hampir semua jenis sel dgn
jumlah dan distribusi yg berbeda.
Ribosom dpt berupa granul tunggal atau
berkelompok (poliribosom/polisom). Dlm
hal ini disatukan oleh RNA (m-RNA).
Poliribosom yg melekat ke membran ER
(endoplasmic reticulum) menterjemahkan
m-RNA→ protein.
 2.2. ORGANELLA.
C. ENDOPLASMIC RETICULUM

Endoplasmic Reticulum (ER), serangkaian

membran yg berfungsi menyalurkan
makromolekul-makromolekul dlm sel.
Ada 2 bentuk ER, yakni : ER granuler dan
ER non-granuler. ER granuier mempunyai
permukaan yg kasar dipenuhi oleh
ribosom, organella tempat sintesa protein.
ER non-granuler berupa pipa-pipa tersu-
sun seperti kisi-kisi. Membran ini terlihat
sewaktu proses detoxifikasi dlm proses
metabolisme lemak di hati atau steroid di
testis dan ovarium.
Di otot skeletal ber-fungsi dlm kontraksi
otot.
Juga berfungsi dlm komunikasi dan sistem
transportasi sel.
 2.2. ORGANELLA :
d. GOLGI APPARATUS

Aparat Golgi berupa komplex Golgi; dibawah mikroskop

berupa daerah terang.
Aparat Golgi terdiri dari tumpukan lempengan-lempengan
membran sedikit melengkung disebut sakula.
Permukaan yg cembung menghadap ke ER (Endoplasmic
Reticulum). Permukaan ini disbt permukaan belum-matang
Permukaan lainnya disbt permukaan matang, melepaskan
banyak gelembung-gelembung kecil.
Aparat Golgi tampaknya bekerja sbg
sistem pengumpul produk sel bermole-
kul besar (makromolekul).
Tumpukan aparat Golgi disbt
diktiosom.
Enzim pengangkut gula (glikosil
transferase) terdpt di membran aparat
Golgi Aparat Golgi menambahkan
gula terminal pd glikoprotein.
 2.2. ORGANELLA.
E. CENTRIOLE
Centrosom merupakan struktur sitoplasma (organella-sel)
tempat asal keluar nya serabut-serabut (spindle fibers) yg
berfungsi utama dlm proses pembelahan sel (mitosis dan
meiosis).
Centrosom terdiri dari : centriole dikelilingi oleh centrosphere,
dan memproduksi central atau spindle fibers.
Komplex centriole berfungsi penting dlm
pembelahan sel utk mekanisme pemisahan
komplit pasangan komponen nukleus yi.
kromosom. Mazia menemukan bahwa
centriole berupa protein yg jumlahnya besar
(11,5% dari jumlah total protein telur kuda-
laut).
Komplex centriole mengandung RNA. Kontraksi
spindle fibers disebabkan oleh gabungan protein
centriole dgn ATP yg ada di sitoplasma.
 2.2. ORGANELLA.
F. LISOSOM

Lisosom adalah organella sel yg kecil dan bulat terikat pd membran, ber
ukuran sekitar 0,25 – 0,5 µm. Mengandung asam hidralase, asam nukleat dan
karbohidrat. Lisosom dijumpai pd semua sel kecuali eritrosit . Tampaknya
berfungsi pencernaan sel.
Lisosom muda berasal dari tunas aparat Golgi, disbt. Lisosom primer.
Vacuola yg mengambil zat asing di sitoplasma (proses fagositosis) kemudian
diberinama fagosom. Fagosom mendekati lisosom (komplex fagosom-
lisosom) → fagolisosom. Lisosom mengeluarkan enzim hidrolase mencerna-
kan bahan asing tsb.
Perombakan sel selama morfogenesis atau-
pun kematian sel (otolisis) spt yg disebabkan
oleh penyakit, dilakukan oleh enzim-enzim
lisosom. Perusakan diri-sendiri (otofagi) ini
terjadi bila ER non-granular membungkus
bahan-bahan tertentu, kemudian dikonsumsi
vakuola otofagi dgn meng inokulasi kan enzim
dari lisosom. Vakuola fagosit dan facuola
otofagi dsbt lisosom sekunder.
 3. INCLUSIONS.

Inclusions merupakan benda-benda sel yg bersifat sementara di

sitoplasma. Terutama gumpalan-gumpalan metabolit. Gumpalan
ini bermacam bentuk , misalnya tetes lipid di jaringan lemak, sel-
sel kortex adrenal, dan sel-sel hepar.
Gumpalan karbohidrat terlihat di beberapa sel berupa glikogen.
Protein ditimbun dlm sel sbg granul sekresi yg secara periodik
dilepas ke medium extra seluiler.
Pigmen seringkali ditemukan dalam sel. Pigmen dpt diproduksi
sel, mis., melanin diproduksi di melanosit; dan ada pula yg
berasal dari luar sel, mis. karoten.
Ada pula pigmen yg permanen di sel, misalnya lipofusin,
substansi coklat kekuningan. Dijumpai terutama di sel syaraf
(neuron) dan sel miokardium. Pigmen ini kwantitasnya meningkat
seiring dgn peningkatan usia.
 b. CELL CYCLE
AND REPRODUCTION.

dr. Kamajaya,MSc,SpAnd.
Dept. Biology FK-USU, Medan.
CELL CYCLE.

G1 Prophase
S-phase = fase sintesa.
Metaphase G1 = fase Gap-1.

M-PHASE M-phase = fase mitosis

S-PHASE Anaphase G2 = fase Gap-2.

Telophase
G2
 CELL DIVISION.
MITOTIC DIVISION
Pada sel-sel somatis
1 fase pembelahan sel.
prophase – metaphase –
anaphase – telophase.
Hasil akhir 2 buah anak-sel.
Diploid set kromosom
MEIOTIC DIVISION
Pada sel-sel gamet
2 fase pembelahan sel
I. Meiosis-I :
prophase-I – metaphase-I –
anaphase-I – telophase-I.
I. Meiosis-II :
prophase-II – metaphase-II
– anaphase-II – telophase-II
Hasil akhir 4 buah anak-sel.
Haploid set kromosom.
1. Mitosis.
• Mitosis merupakan proses pembelahan sel-
induk membentuk dua sel-anak dengan
karyotip identik, dan identik pula dengan
sel-induk sebelumnya.
• Pembelahan sel mitosis terjadi di sel
somatis maupun sel gametik.
• Fase dimana sel tidak dlm fase membelah
disbt. Interphase. Pd fase ini sel sedang ber
metabolis atau ber istirahat (fase Gap1
atau Gap2).
• Pembelahan Mitosis terdiri atas 4 fase :
Prophase – Metaphase – Anaphase –
Telophase.
1. Mitosis.
 CELL DIVISION.
MITOTIC DIVISION
Pada sel-sel somatis
1 fase pembelahan sel.
prophase – metaphase –
anaphase – telophase.
Hasil akhir 2 buah anak-sel.
Diploid set kromosom
MEIOTIC DIVISION
Pada sel-sel gamet
2 fase pembelahan sel
I. Meiosis-I :
prophase-I – metaphase-I –
anaphase-I – telophase-I.
I. Meiosis-II :
prophase-II – metaphase-II
– anaphase-II – telophase-II
Hasil akhir 4 buah anak-sel.
Haploid set kromosom.
• 2. Meiosis.
– Diploid nukleus di akhir mitosis mengandung satu
haploid set kromosom berasal dari ibu dan satu
lainnya dari ayah.
– Pembelahan meiosis pd proses gametogenesis
akan menghasilkan sel ovum dan sel sperma
dengan haploid set kromosom.
– Pembelahan meiosis terjadi dalam dua tahapan,
yakni : Meiosis-I dan Meiosis-II.
• Meiosis-I (the first meiotic division).
– Terjadi dalam 4 fase : Prophase-I, Metaphase-I,
Anaphase-I dan Telophase-I.
• Meiosis-II ( the second meiotic division).
– Fase meiosis ini mirip dgn pembelahan sel mitosis.
– Prophase-II.
• Kondensasi kromosom.
– Metaphase-II.
• Kedua anak-sel mengorganisir spindle melekat ke centromere
yg masih menyatu utk kedua sister chromatid.
• Centromere berada diequator bidang spindle meiosis-II.
– Anaphase-II.
• Centromere membelah dua, dan kedua chromatid tertarik ke
kedua kutub sel.
– Telophase-II.
• Nuclear membrane terbentuk mengelilingi setiap set
kromosom dan terjadi proses cytokinesis.
• Kromosom memanjang dan menipis.
– Akhir proses pembelahan sel meiosis, akan terbentuk 4
buah anak sel haploid dari sebuah sel diploid.
2. MEIOSIS.
 THE GENETIC MATERIAL.
THE CELL

NUCLEUS CYTOPLASM

CHROMOSOM

NON-PROTEIN PROTEIN

NUCLEIC-ACID PROTEIN COMPLEX

DNA RNA HISTONE NONHISTONE

 1. THE GENETIC MATERIAL.
1.1.The Search of the Genetic Material.

1.1.1. The Principal Characteristics of Genetic

Material.
a. It must contain, in a stable form.
b. It must Replicate accurately
c. It must be capable of change.
1.1.2. The search of the Genetic Material.
Friedrich Miescher (1869).
The discovery of nucleic acid.
Early 1920 experiments showed that Chromosomes
are carriers of Hereditary Information.
• Frederick Griffith (1928) :
– working with two strains of Streptococcus pneumoniae
(pneumococcus : S- and R-strains).
– Unknown agent responsible for the change in Genetic
Material  called Trasforming Principle.
• Oswald T. Avery, Colin M. MacLeod and Maclyn McCarty
(1930s and 1940s) :
– To identify the transforming principle. They used enzyme :
Nuclease, Ribonuclease (RNase) and Deoxyribonuclease
(DNase)  No transformation; and suggested that DNA
was the Genetic Material.
• Alfred D. Hershey and Martha Chase (1953) : were studying a
bacteriophage called T2. Phage consist of only DNA and
protein,  believed that DNA was the genetic material.
• A. Gierer and G. Schramm (1956) :  RNA was the
Genetic Material of tobacco mosaic virus (TMV)
1.2. The Composition and Structure of DNA and RNA.

• DNA and RNA are Polymeres - large molecules that consist of many
similar smaller molecules, called monomer  (nucleotides).
Nucleotide contains of : Sugar pentose (deoxyribose and ribose);
Nitrogen bases (purine and pyrimidine) and Phosphate.
• Nucleotide contains of : Sugar pentose (deoxyribose and ribose);
Nitrogen bases (purine and pyrimidine), and Phosphate.
– The Purines : Adenine (A) and Guanine (G).
– The Pyrimidines : Thymine (T), Cytosine (C),
and Uracil (U).
A combination of a sugar pentose (deoxyri-bose or ribose) + a
nitrogen base  a Nucleoside,
+ a Phosphate  a Nucleotide.
• Nucleotide + nucleotide + nucleotide + …… …….……………
 a nucleic acid (DNA or RNA).
 Pentose sugars :
Deoxyribose and Ribose.
5’ O
HCOH2 OH

4’ C 1’
H H 5’
H H
O
HCOH2
C3’ 2’C OH

4’ C C 1’
OH H
DEOXYRIBOSE H H
H H

C 3’ 2’
C
OH OH
RIBOSE
Dr. Kamajaya,MSc,SpAnd.
Dept.Biologi FK-USU.
Medan.
 DNA replications :
1. Reproductive, and
2. Synthesis replications.

G2 Cell-cycle.
S-phase = Synthesis
phase.
S-phase M-phase
G1 = Gap-1 phase.
M-phase = Mitotic phase
G1 G2 = Gap-2 phase.
 DNA replication.
1. Reproductive replication.

• 3 models of replication :
– 1. Conservative model,
– 2. Semiconservative model, and
– 3. Dispersive model.
• DNA replication known as a semicon-
servative model (The Messelson-Stahl
experiment, 1958).
–  Each progeny molecule retains
one of the parental strands.
Semiconservative DNA
Replication
1. Reproductive replication.

a. At the mitotic phase.

b. Transcript by DNA.
c. Transcription along
of DNA chains.
d. Transcription occur
in both DNA-
template.
e. End product is 2
doughter cells.
 2. SYNTHESIS REPLICATION

– In the synthesis phase.

– Not along the DNA chain, just only in
specific regions called Replicons.
– DNA-RNA transcription.
– Transcription occurs only in a leading
strands.
– The end product is mRNA → carries the
genetic information from nucleus to the
ribosome.
 The molecular Apparates for
1. Translation processes
1. Messenger Ribonucleic acid
2. 30S ribosomal subunit
3. 50S ribosomal subunit
2. 4. Initiation Factor :
1. IF-1 = initiation factor-1
2. IF-2 = initiation Factor-2
3. IF-3 = initiation Factor-3
4. GTP = Guanosine triphosphate
3. 5. GDP = Guanosine diphosphate.

5. fMet-tRNA

5.
4.b.
4.a.
Initiation of translation
Elongation of translation.
Termination of translation
Translation : Termination process.
SELAMAT BELAJAR

TERIMA KASIH