KONSEP DAN PRINSIP DASAR

BIOKIMIAWI
PENYUSUN TUBUH MANUSIA

Bagian Biokimia
Fakultas Kedokteran UNHAS
 TUJUAN PEMBELAJARAN
• Tujuan Umum
– Setelah mengikuti dan mempelajari kuliah ini mahasiswa dapat
memahami dan menjelaskan konsep dan prinsip dasar
biokimiawi penyusun tubuh manusia
• Tujuan Khusus
Stlh mengikuti dan mempelajari kuliah ini mahasiswa dapat:
– Mengidentifikasi wujud materi
– Menjelaskan struktur atom (elektron, proton dan neutron)
– Mendefinisikan istilah nomor atom, nomor massa, dan isotop
– Mendefinisikan istilah , ion, molekul, radikal
– Menjelaskan bagaimana ikatan ionik dan kovalen terbentuk
– Membedakan antara molekul polar dan non polar
– Menjelaskan konsep mol
– Menyebutkan unsur utama yg trkndung dlm tubuh manusia
 Wujud Materi (1)

• Materi (matter): segala sesuatu yang menempati

ruang dan mempunyai massa

• Kimia (chemistry): ilmu tentang materi dan

perubahannya

• Biokimia (biochemistry): ilmu yang mempelajari

struktur, organisasi, dan fungsi materi kehidupan

(Chang, 2005; Mathews, 2000)

 Wujud Materi (2)

• Tiga Wujud Materi

– Padat: rigid dengan bentuk pasti
– Cair: dapat mengalir dan berbentuk sesuai wadahnya
– Gas: dapat mengembang tanpa batas

• Ketiga wujud materi dapat berubah dari wujud

satu menjadi wujud yang lain

• Materi dapat digolongkan berdasarkan susunan

dan sifatnya menjadi zat, campuran, unsur,
senyawa.
(Chang, 2000)
 Wujud Materi (3)

• Zat (subtance): materi yang memiliki susunan

tertentu atau tetap dan sifat-sifat yang tertentu
pula. Contoh: air, CO2

• Campuran (mixture): penggabungan dua atau

lebih zat di mana dalam penggabungan ini zat-zat
tersebut mempertahankan identitasnya masing-
masing. Contoh: udara

(Chang, 2005)
 Wujud Materi (4)

• Zat dapat berupa unsur atau senyawa

• Unsur (element): suatu zat yang tidak dapat

dipisahkan lagi menjadi zat-zat yang lebih
sederhana dengan cara kimia. Ada 113 unsur
yang telah diidentifikasi

• Senyawa (substance): suatu zat yang tersusun

atas atom-atom dari dua unsur atau lebih yang
terikat secara kimia dengan perbandingan yang
tetap
(Chang, 2005)
 STRUKTUR ATOM (1)

• Atom: unit terkecil dari suatu unsur yang dapat

melakukan penggabungan kimia

• Struktur internal atom → partikel subatom:

elektron, proton,neutron

• Elektron: partikel bermuatan negatif

• Proton: partikel-partikel bermuatan dalam inti
• Neutron: partikel netral yang mempunyai massa
lebih besar daripada massa proton
(Chang, 2005)
 STRUKTUR ATOM (2)

Massa dan Muatan Partikel Subatom

Muatan
Partikel Massa (g) Coulomb Satuan Muatan

Elektron 9,10939 x 10-28 -1,6022 x 10-19 -1

Proton 1,67262 x 10-24 +1,6022 x 10-19 +1
Neutron1,67493 x 10-24 0 0
NOMOR ATOM, NOMOR MASSA, & ISOTOP (1)

• Atom dapat diidentifikasikan berdasarkan jumlah

proton dan neutron yang dikandungnya

• Nomor atom (atomic number): jumlah proton dalam

inti setiap atom suatu unsur

• Identitas kimia suatu atom dapat ditentukan cukup

berdasarkan nomor atomnya

• Contoh: nomor atom nitrogen 7, berarti setiap atom

nitrogen netral memiliki 7 proton dan 7 elektron
NOMOR ATOM, NOMOR MASSA, & ISOTOP (2)

• Nomor massa (mass number): jumlah total

neutron dan proton yang ada dalam inti atom
suatu unsur

• Nomor massa= jumlah proton + jumlah

neutron
= nomor atom + jumlah neutron
NOMOR ATOM, NOMOR MASSA, & ISOTOP (3)

• Atom-atom suatu unsur tertentu tidak semuanya

bermassa sama

• Isotop (isotope): atom-atom yang mempunyai

nomor atom yang sama tetapi berbeda nomor
massanya
Tabel periodik
ION, MOLEKUL, DAN RADIKAL (1)

• Ion: sebuah atom atau sekelompok atom yang

mempunyai muatan

• Kation (cation): ion dengan muatan total positif

Atom Na Ion Na+

11 proton 11 proton
11 eletron 10 elektron
• Anion: ion yang muatan totalnya negatif

Atom Cl Ion Cl-

17 proton 17 proton
17 elektron 18 elektron
ION, MOLEKUL, DAN RADIKAL (1)

• Ion monoatomik (monoatomic ion): ion-ion yang

hanya mengandung satu atom. Contoh: F3+, S2-,
N3-, Mg2+, Na+, Cl-

• Ion poliatomik (polyatomic ion): ion-ion yang

mengandung lebih dari satu atom. Contoh: OH-
(ion hidroksida), CN- (ion sianida), NH4+ (ion
amonium)
 ION, MOLEKUL, DAN RADIKAL (3)
• Molekul (molecule): suatu agregat (kumpulan)
yang terdiri dari sedikitnya dua atom dalam
susunan tertentu yang terikat bersama oleh gaya-
gaya kimia (=ikatan kimia)

• Molekul diatomik (diatomic molecule): molekul

yang hanya mengandung dua atom. Contoh: H2,
N2, Cl2, Br2, I2

• Molekul poliatomik (polyatomic molecule):

molekul yang mengandung lebih dari dua atom.
Contoh: air (H2O), amonia (N3H)
 ION, MOLEKUL, DAN RADIKAL (4)
• Radikal : atom², molekul², atau ion² yg
mengandung elektron yg tdk berpasangan
• Elektron yang tidak berpasangan ini biasanya
mempunyai reaktivitas yang tinggi
• Radikal bebas memegang peran penting pd sjmlah
proses biologi,bbrapa diantaranya diperlukan bagi
kehidupan,seperti mmbunuh bakteri intraselular
o/ granulosit neutrofil. Radikal bebas jg
berimplikasi pd proses cell signaling trtntu
• ROS (reactive oxygen species) superoksida (O2-),
hidrogen peroksida(H2O2), radikal peroksil (ROO.)
dan radikal hidroksil (OH.)
Respiratory brust pada neutrofil

• Saat netrofil dan sel fagosit lainnya “menelan”

bakteri, sel-sel ini menunjukkan peningkatan yang
cepat dalam konsumsi oksigen
• Fenomena ini menunjukkan penggunaan yang
cepat akan oksigen dan produksi “derivat reaktif”
dalam jumlah yang besar seperti O2., H2O2, OH.,
dan OCl- (ion hipoklorite)
• Beberapa produk ini dapat berfungsi sebagai agen
mikrobisidal yang poten
• Sistem rantai transport elektron yang
bertanggungjawab pada respiratory burst disebut
NADPH oksidase
Respiratory burst
Respiratory Burst

• Dari proses tersebut di atas hidrogen peroksida

terbentuk secara spontan melalui reaksi:
O2 + O2 + 2H → H2O2 + O2
• H2O2 selanjutnya diperlukan untuk aktifitas enzim
mieloperoksidase atau dinetralisir melalui fungsi
glutation peroksidase dan katalase
• Proses pembunuhan bakteri di dalam fagolisosom
bergantung pada kombinasi dari peningkatan pH,
ion superoksida, dan derivat oksigen serta peptida
bakterisidal (defensin), cathepsin G, protein
kationik
Mieloperoksidase dalam neutrofil
• Neutrofil memiliki enzim yang unik yang disebut
mieloperoksidase
• Enzim ini mengkatalisis reaksi:
mieloperoksidase
H2O2 + X- + H+ HOX + H2O
• X- dapat berupa Cl-, Br-, I- atau SCN-
• Cl->>> karena memiliki jumlah yang besar di dalam
sel, membentuk HOCl (asam hipoklorat)
• HOCl bersifat merusak sel sekaligus mikrobisidal
yang kuat
• Di dalam sel HOCl beraksi dengan amine membentuk kloramin
yang tidak menyebabkan kerusakan jaringan namun tetap
berpotensi sebagai mikrobisidal
IKATAN IONIK DAN IKATAN KOVALEN

• Ikatan ionik: ikatan yang terbentuk sebagai hasil

transfer satu atau lebih elektron dari unsur logam
kepada unsur non-logam. Contoh: NaCl, CaO

• Ikatan kovalen: ikatan yang terbentuk dari

pemakaian bersama dua elektron oleh dua atom
• Ikatan kovalen terdiri atas dua tipe:
– Ikatan kovalen polar
– Ikatan kovalen non-polar
MOLEKUL POLAR DAN NON POLAR

• Molekul polar: molekul diatomik yang mengandung

atom-atom unsur yang berbeda dan memiliki
momen dipol
• Molekul non polar: molekul diatomik yang
mengandung atom-atom unsur yang sama dan
tidak memiliki momen dipol
• Momen dipol: ukuran kuantitatif kepolaran ikatan
• Untuk molekul yang tersusun atas tiga atau lebih
atom, ada tidaknya momen dipol ditentukan oleh
kepolaran ikatan dan geometri molekul
• Contoh molekul polar:
– Air
– Gas: ammonia (NH3), sulfur dioxide (SO2),
hydrogen sulfide (H2S)

• Contoh molekul non polar:

– Cairan: hidrokarbon
– Gas: helium (He), neon (Ne), krypton (Kr),
xenon (Xe), hydrogen (H2), nitrogen (N2), oxygen
(O2), carbon dioxide (CO2), methane (CH4),
ethylene (C2H4)
 KONSEP MOL

• Mol adalah jumlah dari substansi apapun (atom,

ion, molekul, elektron) yang memiliki jumlah
partikel yang sama dengan partikel yang terdapat
pada 12.000g karbon-12
• Jumlah partikel tersebut dikenal sebagai
konstanta atau bilangan Avogadro (NA), 6,02x1023
• Satu mol atom karbon adalah 6,02x1023 atom
karbon
UNSUR UTAMA DALAM TUBUH MANUSIA
Unsur Persentase
Karbon 50
Oksigen 20
Hidrogen 10
Nitrogen 8,5
Kalsium 4
Fosfor 2,5
Kalium 1
Sulfur 0,8
Natrium 0,4
Klor 0,4
Magnesium 0,1
Besi 0,01
Mangan 0,001
Yodium 0,00005
UNSUR UTAMA DALAM TUBUH MANUSIA
• Karbon, hidrogen, oksigen, dan nitrogen
merupakan kostituen utama sebagian besar
biomolekul
• Fosfat merupakan komponen asam nukleat serta
molekul lain, dan juga tersebar secara luas dalam
bentuk terionisasi di dalam tubuh
• Kalsium memainkan peran penting dalam banyak
proses biologik. Contoh: mekanisme pembekuan darah
• Unsur² yg diberi warna merah mmiliki peran
beragam.Kbanyakan unsur ² tersebut ditemukan
hampir setiap hari dlm praktik kedokteran ketika
menghadapi penderita dengan gangguan
keseimbangan elektrolit (K+, Na+, Cl-, Mg2+),anemia
defisiensi besi (Fe2+) dan penyakit tiroid(I-)