1

METABOLISME

Oleh
Team Biokimia

JURUSAN KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SYIAH KUALA – BANDA ACEH
2007

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 METABOLISME 2

 TUJUAN INSTRUKTIONAL UMUM (TIU)

 Setelah mempelajari mata kuliah ini mahasiswa dapat
menjelaskan konsep pencernaan, bioenergetika, metabolisme
biomolekul dan regulasinya.

 TUJUAN INSTRUKTIONAL KHUSUS (TIK)

 Setelah menyelesaikan mata kuliah ini diharapkan mahasiswa
dapat menjelaskan tentang metabolisme yang meliputi
klasifikasi, koenzim, regulasi dan tempat berlangsungnya
metabolisme

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 METABOLISME 3

SUB POKOK BAHASAN

1. Pengertian umum metabolisme
2. Klasifikasi organisme
3. Reaksi – reaksi kimia dalam metabolisme
4. Koenzim dalam metabolisme
5. Klasifikasi metabolisme
6. Regulasi metabolisme
7. Tempat metabolisme

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 METABOLISME 4

 Metabolisme ▬▬► reaksi-reaksi kimia yang terjadi

dalam organisme

 Perbedaan metabolisme dipelajari melalui pembagian

jenis makhluk hidup
• Autotrop/kemoautotrop ▬▬►organisme yang
menggunakan sumber C dari CO2
• Heterotrop ▬▬►bentuk kehidupan yang
memperoleh energi dari mencernakan sumber C
kompleks

 Metabolisme mempunyai ribuan tahapan reaksi yang

dikontrol secara enzimatik

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 SEL AUTOTROP DAN HETEROTROP 5

Sel Autotrop
 Prokariot : bakteri fotosintetik (alga biru hijau, mengandung
pigmen fotosintetik didalam membran sel)
 Eukariot : sel tumbuhan dan alga (mengandung pigmen
kloroplas, dalam keadaan tanpa cahaya, sel ini menjadi heterotrop

Sel Heterotrop
 Prokariot : bakteri non fotosintetik (contoh: rickettsiae dan
mikoplasma)
 Eukariot : manusia dan hewan

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 SIKLUS CO2 DAN O2 ANTARA SEL AUTOTROP DAN HETEROTROP 6

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 JALUR METABOLISME 7

 Metabolisme intermediet ▬▬►produk dari satu tahap

reaksi sering menjadi reaktan untuk tahap selanjutnya

 Jalur metabolisme ▬▬►serangkaian reaksi spesifik

 Linier ▬▬►glikolisis
 Bercabang ▬▬►biosintesis asam amino
 Siklik ▬▬►siklus asam sitrat
 Spiral ▬▬►degradasi asam lemak

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 JALUR METABOLISME 8

 Contoh jalur metabolisme: a) Linier b)Siklik c)Spiral

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 CARA METABOLISME MENGHASILKAN ENERGI 9

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI-REAKSI KIMIA DALAM METABOLISME 10

 Oksidasi – reduksi
 Transfer gugus
 Hidrolisis
 Pemotongan non hidrolitik
 Isomerisasi dan pengaturan kembali (rearrangement)
 Reaksi pembentukan ikatan menggunakan energi dari
ATP

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI OKSIDASI REDUKSI 11

 Reaksi oksidasi reduksi ▬▬► reaksi yang paling

umun terjadi dalam metabolisme

 Reaksi oksidasi reduksi mempunyai ciri-ciri:

• Mengandung 2 molekul reaktan
• Dapat diidentifikasi melalui transfer atom H
• Enzim yang terlibat dalam reaksi ini ▬▬►
oksidoreduktase (dehidrogenase)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI OKSIDASI REDUKSI 12

 Kapan sebuah atom atau gugus dioksidasi? beberapa

spesies yang lain harus menerima elektron

 Banyak reaksi di couple oleh pasangan koenzim

 NAD+ / NADH
 NADP+ / NADPH
 FAD / FADH2

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 KOENZIM NAD+ / NADH 13

 Digunakan dalam reaksi redoks

 Turunan dari ADP dan vitamin nikotinamida
 Sisi reaksi terletak pada bagian nikotinamida dari
NAD+

 NAD+ ▬▬►bentuk teroksidasi

 NADH ▬▬►bentuk tereduksi

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 STRUKTUR NAD+ / NADH 14

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 STRUKTUR NADPH 15

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 CONTOH REAKSI NAD+ 16

 Reaksi umum dan reaksi spesifik (etanol)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 KOENZIM FAD (FLAVIN ADENIN DINUKLEOTIDA) 17

 Pembawa elektron lain yang digunakan dalam

metabolisme ▬▬►substratnya beda dengan NAD+

 FAD ▬▬►transfer 2 elektron

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 STRUKTUR FAD 18

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 CONTOH REAKSI FAD 19

 FAD sering digunakan dalam reaksi ▬▬► -CH2- CH2-

dioksidasi menjadi ikatan ganda

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 TRANSFER GUGUS 20

 Reaksi yang berfungsi memindahkan gugus kimia

▬▬►ada dua jenis:
 Intermolekular ▬▬►transfer dari satu molekul ke
molekul lain

 Intramolekular ▬▬►pemindahan satu tempat ke

tempat lain dalam satu molekul

Fosfat ▬▬► gugus penting yang ditransfer dalam

reaksi metabolisme

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 TRANSFER GUGUS ASIL 21

 Koenzim A (CoASH) akan membentuk ikatan tioester

pada gugus asil ▬▬►lebih aktif

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 STRUKTUR KOENZIM A 22

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI HIDROLISIS 23

 Air digunakan untuk memisahkan suatu molekul

menjadi dua molekul yang lain

 Jenis- jenis ikatan yang dapat dipisahkan:

 Ikatan ester ▬▬►lemak
 Ikatan amida ▬▬►protein
 Ikatan glikosidik ▬▬►karbohidrat

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI HIDROLISIS KARBOHIDRAT 24

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI HIDROLISIS PROTEIN 25

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 HIDROLISIS LEMAK 26

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 PEMOTONGAN NON HIDROLITIK 27

 Reaksi pemotongan tanpa menggunakan air

 Enzim yang berperan dalam reaksi ini liase

Contoh reaksi pemotongan non hidrolitik

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 ISOMERISASI DAN PENGATURAN KEMBALI 28

 Reaksinya meliputi dua jenis transformasi kimia

 Pergantian atom hidrogen intermolekular pada lokasi ikatan

ganda
Contohnya : isomerisasi aldosa – ketosa

 Pengaturan kembali intramolekular gugus fungsi, namun hal

ini jarang terjadi

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REAKSI PEMBENTUKAN IKATAN 29

 Reaksi pembentukan ikatan biokimia, semuanya

memerlukan energi

Contoh reaksinya:

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 EKSPERIMEN METABOLISME 30

 Untuk memahami jalur metabolisme, masing-masing

tahap harus diketahui secara detail

 Karakterisasi masing-masing enzim dan koenzim

 Identifikasi jalur kimia, meliputi substrat,

intermediat, produk dan tipe-tipe reaksi

 Identifikasi molekul dan kondisi yang meregulasi

kecepatan seluruh jalur metabolisme

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 EKSPERIMEN METABOLISME 31

 Organisme keseluruhan ▬▬►menggunakan pelacak

isotop (radioaktif) dan diukur produk yang terlabel

 Jaringan dan sel ▬▬►metode ini telah dapat

mempelajari jalur metabolisme yang selama ini belum
terungkapkan ▬▬►siklus asam sitrat dipelajari
menggunakan pendekatan ini

 Ekstrak bebas sel ▬▬►sel dihomogenisasi dalam

bufer untuk membebaskan komponen sel yang akan
dipelajari

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 METABOLISME SECARA UMUM (Gbr 12.2. Biochem, Mathew) 32

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 METABOLISME SECARA SINGKAT (Gbr 12.1. Biochem, Mathew) 33

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 KLASIFIKASI METABOLISME 34

 Katabolisme ▬▬►jalur degradasi (penguraian)

▬▬►produksi energi
Molekul organik kompleks didegradasi menjadi
molekul yang lebih kecil

 Anabolisme ▬▬►jalur konstruksi (biosintesis)

▬▬►memerlukan energi
Biosintesis senyawa organik yang lebih kompleks

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 HUBUNGAN ENERGI ANTARA LINTAS KATABOLIK DAN ANABOLIK 35

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 TIGA TAHAP KATABOLISME 36

1. Pemecahan makromolekul menjadi senyawa unit

pembangun (building block) ▬▬►tidak ada energi
yang berguna

2. Oksidasi produk tahap 1 menjadi asetil KoA

▬▬►menghasilkan energi yang terbatas

3. Oksidasi asetil KoA menjadi CO2, H2O dan energi

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 SKEMA KATABOLISME 37

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 PROSES KATABOLISME 38

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 ENERGI HASIL METABOLISME 39

 Metabolisme 1 mol glukosa menghasilkan 32 ATP

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REGULASI METABOLISME 40

 Melalui kerja enzim alosterik ▬▬►penghambatan

kembali atau penghambatan produk akhir

 Pengaturan hormon ▬▬►hormon melakukan

rangsangan atau hambatan aktivitas metabolik
spesifik

 Pengaturan sintesis enzim ▬▬►menghidupkan

atau mematikan biosintesis enzim ▬▬► induksi
enzim

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REGULASI ENZIM ALOSTERIK 41

 Dua jenis regulasi enzim alosterik ▬▬►

 Mekanisme biasa

 Aktivasi feedforward

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REGULASI HORMON (Gbr 13.16 Lehninger) 42

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 REGULASI INDUKSI ENZIM (Gbr 13.17 Lehninger) 43

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 SEL DAN MITOKONDRIA 44

Sel

membran
luar
Membran
dalam

Mitokondria

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 45
glikolisis membrane membran
luar dalam

Rangkaian
transpor
elektron
Daur
Krebs

H+
e-
O2

kompartemen H2O
luar

kompartemen
Jurusan Kimia FMIPA dalam Universitas Syiah Kuala
 TEMPAT METABOLISME 46

 Sitosol ▬▬► glikolisis, glukoneogenesis, aktivasi

asam amino dan sintesis asam lemak

 Mitokondria ▬▬► siklus asam sitrat, transport

elektron dan fosforilasi oksidatif, oksidasi asam lemak
dan katabolisme asam amino

 Ribosom ▬▬► sintesis protein

 Retikulum endoplasma ▬▬► sintesis lipid

 Badan mikro ▬▬► siklus glioksilat (pada tumbuhan)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 47
glikolisis membrane membran
luar dalam

Rangkaian
transpor
elektron
Daur
Krebs

H+
e-
O2

kompartemen H2O
luar

kompartemen
Jurusan Kimia FMIPA dalam Universitas Syiah Kuala
 METABOLISME 48

 KESIMPULAN
 Metabolisme ▬▬►Reaksi – reaksi kimia dalam organisme

 Klasifikasi organisme ▬▬► autotrop dan heterotrop

 Koenzim dalam metabolisme ▬▬►NAD+/NADH, FAD/FADH2 dan

koenzim A

 Klasifikasi metabolisme ▬▬►anabolisme dan katabolisme

 Regulasi metabolisme ▬▬►enzim alosterik, pengaturan hormon

dan induksi enzim

 Tempat metabolisme ▬▬►sitosol: glikolisis, mitokondria: siklus

asam sitrat, transpor elektron dan fosforilasi oksidatif

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 METABOLISME 49

 Soal – soal latihan

1. Jelaskan hubungan antara organisme autotrop dan heterotrop

2. Jelaskan klasifikasi metabolime

3. Jelaskan perbedaan antara koenzim NAD+ dan FAD

4. Jelaskan mekanisme regulasi induksi enzim

5. Sebutkan organel-organel tempat berlangsungnya metabolisme

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala