Protein

By: Nola Suryani Putri – Amelia Lubis

 What is Protein?
• Protein are polypeptides.
• Polypeptides are a chain of amino acids
connected together.
• Amino acids have the general formula NH2-CH(R)-
COOH, where R is anything.
• Polypeptides are made up of 20 combination of
amino acid:
Nitrogen pathway
• Nitrogen menempati porsi 1 – 2 %
dari berat kering tanaman.
Ketersediaan nitrogen dialam
berada dalam beberapa bentuk
persenyawaan, yaitu berupa : N2
(72 % volume udara), N2O, NO,
NO2, NO3 dan NH4+. Di dalam
tanah, lebih dari 90% nitrogen
adalah dalam bentuk N-organik.
• Asimilasi sumber N
Tumbuhan mengambil sumber N dari
alam (tanah). Beberapa berasosiasi
dengan bakteri yang dapat mengikat
langsung N2
 Proses-proses konversi NO3 dan NH3

• Di dalam sel terjadi proses-proses konversi (metabolisme)

nitrogen yang berhasil diserap akar melalui penyerapan
aktifnya.
• Proses tersebut meliputi :
(1) Konversi NO3 menjadi NH3, jika pasokan berupa NO3-,
(2) Aminasi reduktif ke asam keto yang ada ddalam sitozol,
seperti OAA, Piruvat, dan Keto-glutarat
(3) Pembentukan Amida, suatu timbunan gugus amin dalam
tubuh, yaitu Asparagin (C-4), Glutamin (C-5), yaitu NH3
ditambahkan ke asam amino aspartat untuk dijadikan
asparagin, atau ditambahkan ke asam glutamat untuk dijadikan
glutamin.
(4) Transaminasi : gugus amin suatu asam amino dipindahkan ke
as. keto yang lain. Asam amino yan satu mengalami deaminasi
oksidatif dan asam keto yang lain mengalami aminasi reduktif
sehingga menjadi asam amino baru.
Aminasi reduktif
Pembentukan Amida
• Biosintesis Glutamate

• Biosintesis Alanin
Glutamat + piruvat  α-ketoglutarat + alanin
• Biosintesis Tirosin
• Biosintesis ornitin dan prolin
Glutamat adalah prekursor ornitin dan prolin. Dengan
glutamat semialdehid menjadi intermediat titik
cabang menjadi satu dari 2 produk atau lainnya.
• Biosintasis serin
Aktivitas aminotransferase dengan glutamat sebagai
donor menghasilkan 3-fosfoserin, yang diubah
menjadi serin oleh fosfoserin fosfatase.
• Biosintesis glisin
Jalur utama untuk glisin adalah 1 tahap reaksi yang
dikatalisis oleh serin hidroksimetiltransferase.
Sulfur Pathway

Tumbuhan menyerap
sulfur dari
lingkungannya
terutama berupa SO3=
SO4= yang diserap
melalui akar, atau
dalam bentuk gas SO2
dan H2S yang diserap
melalui daun.
 Setelah Sulfat diikat dan
diaktifkan dengan ATP
maka akan terbentuk
adenosin-5fosfosulfat (APS),
oleh aktivitas enzim ATP-
sulfurilase. Selanjutnya, oleh
aktivitas APSkinase, APS
direaksikan lagi dengan ATP
hingga terbentuklah 3-fosfo-
adenosin -5fosfosulfat
(PAPS).
• Biosintesis Sistein
Amino
Acid
Biosynthesis
Overview
Pathway
Amino Acid Biosyntesis
Pathway
Katabolisme Asam Amino
1. Transaminasi
Enzim aminotransferase
memindahkan amin
kepada α-ketoglutarat
menghasilkan glutamat
atau kepada
oksaloasetat
menghasilkan aspartat
2. Deaminasi oksidatif
Pelepasan amin dari
glutamat menghasilkan
ion amonium
 Setelah mengalami pelepasan
gugus amin, asam-asam
amino dapat memasuki
siklus asam sitrat melalui
jalur yang beraneka ragam.

Gugus-gugus amin
dilepaskan menjadi ion
amonium (NH4+) yang
selanjutnya masuk ke
dalam siklus urea.
 Role of Amino Acids in Plants
• Plants are photoautotrophs, and they can synthesize
all organic compounds from inorganic materials
such as carbon dioxide (CO2), water (H2O), and
minerals using light energy. Amino acids are the key
metabolites in nitrogen (N) metabolism of higher
plants:
- Inorganic N assimilate into Gln and Glu
- amino acids are the essential components of
proteins
- amino acids are used for long-distance transport of
nitrogen among organs
 Role of amino acids on inorganic
nitrogen assimilation
• Ammonium ion (NH4+) is first assimilated into
glutamine (Gln) combined with glutamic acid (Glu)
by the enzyme glutamine synthetase (GS)
consuming one molar of ATP
 Role of amino acids for synthesis of
proteins and nucleic acids in plants

• Purine base contains 4 N atoms in a molecule, and

they are derived from two glutamines, one aspartic
acid, and one glycine.
• Pyrimidine base contains 2 N atoms in a molecule,
and they are derived from one glutamine and one
aspartic acid. Amino acids are the precursors of
most of N compounds in plants.
 Role of amino acids for nitrogen
transport and storage in plants

• Amino acids and amides, especially Gln and Asn,

are used for N transport through xylem and phloem
in many plants.
• In addition, these amides are used for temporary N
storage.
 Role of amino acids for
protecting the plants
• 4-Methylene glutamine is a nonprotein amino acid
found only in groundnut (Arachis hypogaea) and
this amide is highly accumulated in the leaves and
stems of the tulip plants
• Some nonprotein amino acids are toxic such as
canavanine and concanavanine A in sword bean
(Canavalia gladiate), and these toxic amino acids
may contribute to protect plant from feeding
damages by animals, insects, or fungi
 Amino acid metabolism in
soybean nodules
• Symbiotic association by soybean and rhizobia is one of the most efficient nitrogen-fixing
system, and it contributes to soybean seed yield
Amino acid metabolism
in soybean roots
Amino acid metabolism
in soybean stems
Amino acid metabolism
in soybean leaves
Amino acid metabolism in
soybean pods and seeds
Recycling of nitrogen from
shoot to roots
Overall nitrogen transport from
fixed N and absorbed N
Thank You