BIOKIMIA

KHAIRUN NIDA
2016
 PUSTAKA
1. Campbell,Reece, Mitchel. Biologi.
Erlangga. Edisi ke8. 2010
2. Campbell,Reece, Mitchel. Biology. 10th
ed.. 2014
3. Harper. Biokimia. EGC. Ed.29. 2014
4. Harper. Biokimia. 30th ed.. 2014
5. Koolman, Heinrich. Septelia Inawati W.
Atlas berwarna dan teks biokimia. 1995
 POKOK BAHASAN BIOKIMIA
• Terdiri dari 14 item, terbagi menjadi bahan UTS
& UAS.
• Bahan UTS membicarakan tentang molekul2
kecil (mikro molekul) & molekul besar
(makromolekul) yg ada dalam makhluk hidup
secara umum dengan sudut pandang molekuler
maupun seluler
• Bahan UAS membicarakan tentang metabolisme
molekul-molekul tsb., baik anabolismenya
maupun katabolismenya.
• File word
Bab 1. Molekul-molekul

sistem hidup
 Biokimia
• Mencoba memahami fenomena hidup dengan
menggunakan prinsip dan konsep kimia.
• Kata kunci : hidup & kimia
• Lebih mudah : tanda-tanda / fenomena hidup
• Kimia  ? : ilmu yang mempelajari segala sesuatu
tentang materi & energi dan semua seluk beluk antara
keduanya.
• Apa hubungan hidup (Bios), tepatnya fenomena hidup
dengan kimia ?
• Fenomena hidup diperlihatkan oleh makhluk hidup,
sesuatu yang berupa benda / materi  ? .
Ciri-ciri materi hidup
 7 ciri materi hidup
1. Keteraturan
2. Reproduksi
3. Pertumbuhan dan perkembangan
4. Pemanfaatan/Ekstraksi energi
5. Respon thd lingkungan
6. Homeostasis
7. Adaptasi
 3 fungsi dasar hidup :
# gerak (lokomosi)
# gradien dengan extrasel ([ ], to, pH,
bioelektrik)
# replikasi / reproduksi
• Gerak (lokomosi) :
- perubahan orientasi / posisi
- aktif :sumber energi dlm
selmetabolisme
- bertujuan (bukan gerak acak) :
• Gradien dengan ekstrasel :
Pd makhluk hidup, kondisi intra¢ # ekstra¢, dlm hal
to, pH, [bbg senyawa], muatan listrik.
 ada gradien selama ¢ hidup (bbp menit pd 1 sel
bakteri – 200 – 300 tahun pd kura-kura
Galapagos)
# Hukum termodinamika II :
Dalam 2 sistem berbeda,  energi bebas (yg dpt
digunakan u/ suatu kerja) selalu  dalam
perjalanan waktu, sampai tercapai
keseimbangan homogen antara kedua sistem
Hirarki organisasi biologis
 Hirarki organisasi biologis
• Elektron, proton & netron
• Atom
• Molekul
• organel
• sel
• jaringan
• organ
• Organisme (MH)
 Pengelompokan sel
1. Prokariot
2. Eukariot
 Tabel. Perbandingan antara sel prokariot dan eukariot

Karakteristik Prokariot Eukariot

Ukuran sel umumnya 0,5-5 μm 10-100 μm

Inti sel Tidak terbungkus membran inti sehingga tidak disebut nukleus Inti sejati yang terbungkus membran inti dan memiliki
tetapi nukleiod nukleolus

Organel yang terbungkus membran Tidak ada Ada, seperti lisosom, kompleks golgi, mitokondria, retikulum
endoplasma, dan kloroplas

Dinding sel Biasanya ada, tersusun atas peptidoglikan Jika ada, struktur kimia sederhana

Vesikel gas Ada Tidak

Membran sel Tanpa karbohidrat dan biasanya tanpa sterol Sterol dan karbohidrat ada sebagai reseptor

Sitoplasma Tanpa sistoskeleton atau aliran sitoplasmik Ada sistoskeleton dan terjadi aliran sitoplasmik

Ribosom Ukuran kecil (70s) Ukuran besar (80s)

Kromosom (DNA) Kromosom tunggal melingkar tanpa protein histon Kromosom linear melipat dengan terikat protein histon

Pembelahan sel Pembelahan biner Mitosis

Rekombinasi seksual Tanpa meiosis, hanya transfer fragmen DNA Meiosis

Sensitivitas terhadap antibiotik Sensitif Tidak sensitif

Kesamaan prokariot & eukariot
Merupakan struktur yang amat teratur yang
bertugas menjalankan proses-proses rumit
demi kelangsungan hidup sel
Struktur dasar dan fungsi sel
 Struktur dasar dan fungsi sel
• Dgn menganalisis struktur biologis, dapat
diketahui bagaimana cara kerjanya
• Dgn diketahuinya fungsi suatu struktur,
dapat dianalisa konstruksi struktur
tersebut
• Contoh bentuk sayap burung berbentuk
aerodinamis
• Rangka internal sayap burung ringan tapi
kuat dengan bentuk sarang lebah
Contoh lain
 Reaksi kimia di dalam dan di
luar sel
• 2 sistem :
A. tabung reaksi berisi :
- air (H2O)
- dialiri dengan CO2 murni
- sumber sinar uv dengan rentangan 
tertentu
- sumber energi panas, bila perlu
B. cawan Petri, berisi :
- air (H2O)
- CO2 , cukup dari udara saja ( [ ] <<)
- disinari dengan cahaya matahari saja.
- sehelai daun segar
• Diharapkan :
terjadi pembentukan glukosa dari molekul
air dan CO2 (fotosintesis) baik di A mau
pun di B, menurut reaksi
6 CO2 + 6 H2O  C6H12O6 + 6O2
Kenyataan :
- di A tidak terjadi reaksi kimia apa pun,
termasuk reaksi kimia yang diharapkan
- di B terjadi reaksi kimia yang diharapkan,
yaitu pembentukan glukosa
Catatan :
- bahan baku yang diperlukan terdapat, baik di
A mau pun di B
- kondisi di A lebih terstandarisasi dari pada di
B
- hk2 fisikokimia yang berlaku di A = di B
- satu-satunya beda : makhluk hidup di B
B, yang mempunyai daun segar, suatu
makhluk hidup (=sistem organisasi
molekul) yang mampu menata benda-
benda “mati” (anorganik) berupa CO2 dan
H2O, menjadi molekul bagian tak
terpisahkan dari makhluk hidup (organik),
yaitu C6H12O6.
Dapat dinyatakan dalam reaksi kimia
kondisi fisikokimia
• sel memungkinkan kondisi & hk fisikokimia
biasa bekerja secara terarah & produktif
• Sel haruslah suatu struktur dengan
suatu sistem, organisasi & keteraturan
yang tinggi, bukan sesuatu yang acak /
baur / difus
 AIR
• QS 21:30 ……..Kami jadikan segala
sesuatu yang hidup dari air……(Islam 130
ayat)
• Sirakh 29:21 Kebutuhan pokok untuk
hidup ialah air dan makanan serta….
(katolik 9 ayat)
• Air adalah……..
• Pentingnya air: -pengaruh polaritas air
- polaritas air
menghasilkan ikatan hidrogen
• Kejadian 1:20 Berfirmanlah Allah: "Hendaklah dalam air berkeriapan makhluk yang
hidup, dan hendaklah burung beterbangan di atas bumi melintasi cakrawala."
• Yehezkiel 47:8-9 Ia berkata kepadaku: "Sungai ini mengalir menuju wilayah timur,
dan menurun ke Araba-Yordan, dan bermuara di Laut Asin, air yang mengandung
banyak garam dan air itu menjadi tawar, sehingga ke mana saja sungai itu mengalir,
segala makhluk hidup yang berkeriapan di sana akan hidup. Ikan-ikan akan menjadi
sangat banyak, sebab ke mana saja air itu sampai, air laut di situ menjadi tawar dan
ke mana saja sungai itu mengalir, semuanya di sana hidup.
• Sirakh 29:21 Kebutuhan pokok untuk hidup ialah air dan makanan serta pakaian dan
perumahan untuk menudungi ketelanjangan
Pengaruh polaritas air
 Keistimewaan air
1. Perilaku kohesi air
2. Kemampuan menstabilkan suhu
3. Pemuaiannya pada saat membeku
4. Pelarut serbaguna
Keistimewaan air
Kebutuhan energi
bagi sistem hidup
 PENGELOMPOKAN MAKHLUK HIDUP
Berdasarkan Kebutuhan Energinya
1. Autotrof
- Fototrof
- Kemotrof
2. Heterotrof
- Herbivora
- Carnivora
- Omnivora
 Soal belajar
1. Apa yang dimaksud dengan biokimia?
2. Hal-hal apa saja yang dibicarakan dalam biokimia?
3. Sebutkan 3 mikromolekul & 7 makromolekul yg ada dalam
makhluk hidup!
4. Sebutkan 7 ciri-ciri materi hidup
5. Sebutkan 3 fungsi dasar hidup
6. Bagaimana pengelompokan sel secara umum
7. Apa beda prokariot & eukariot? Sebutkan contohnya masing-
masing 3!
8. Apa hubungan antara struktur dasar dan fungsi sel pada
makhluk hidup?
9. Sebutkan keistimewaan air sebagai penunjang kehidupan
10. Jelaskan posisi atom dan molekul dalam hirarki sistem biologis
11. Sebutkan penggolongan organisme menurut kebutuhan
energinya
12. Apa yang membedakan reaksi kimia di dalam dan di luar sel
hidup?