Anda di halaman 1dari 3

K-MER

Selly Anastassia Amellia Kharis


Pengertian k-mer
• Estimasi jarak k-mer = alternative untuk memperkirakan jarak evolusi
berdasarkan “multiple alignment”
• Multiple sequence = cara mensejajarkan beberapa barisan DNA
secara bersamaan untuk memperoleh tingkat kemiripan yang optimal
• Tetapi, penggunaan metode ini pada beberapa barisan DNA yang panjang
memiliki kelemahan dalam efisiensi waktu
• Subbarisan k-mer dapat digunakan untuk mencari kemiripan dengan
cara menghitung banyaknya k-mer yang muncul dari sejumlah
kemungkinan permutasi k-mer yang digunakan
Program K-Mer di R

Anda mungkin juga menyukai