Pengertian k-mer • Estimasi jarak k-mer = alternative untuk memperkirakan jarak evolusi berdasarkan “multiple alignment” • Multiple sequence = cara mensejajarkan beberapa barisan DNA secara bersamaan untuk memperoleh tingkat kemiripan yang optimal • Tetapi, penggunaan metode ini pada beberapa barisan DNA yang panjang memiliki kelemahan dalam efisiensi waktu • Subbarisan k-mer dapat digunakan untuk mencari kemiripan dengan cara menghitung banyaknya k-mer yang muncul dari sejumlah kemungkinan permutasi k-mer yang digunakan Program K-Mer di R