PERANAN TEST DIAGNOSTIK COVID-19

(An Update on Interpretation of Laboratory result for Covid-19)

Muh. Nasrum Massi

D e p a r t e m e n t o f M e d i c a l M i c r o b i o l o g y, F a c u l t y o f
Medicine, Universitas Hasanuddin.
MOLECULAR DETECTION OF SARS COV-2
L a b o r a t o r y o f C l i n i c a l M i c r o b i o l o g y, U n i v e r s i t a s
Hasanuddin Hospital, Makassar
 JENIS PEMERIKSAAN LABORATORIUM

PATOLOGI KLINIK

MIKROBIOLOGI KLINIK

PATOLOGI ANATOMI

PARASITOLOGI KLINIK
 Characteristic virus
Coronaviruses are the largest known RNA viruses, with
genomes up to 32 kb.
These viruses possess an envelope and a single-stranded,
positive-sense RNA genome.
Encoded 27 proteins including RdRP RNA dependent RNA
polymerase and 4 structural protein
4 structural protein : Spike surface glycoprotein (S); Small
envelope protein (E) ; Matriks Protein (M) ; Nucleocapsid
protein (N)
LABORATORY DIAGNOSTIC (swab)
 LABORATORY DIAGNOSTIC

DIAGNOSIS COVID-19
1.SWAB PCR
2.TCM
3. RAPID TEST
 JENIS PCR DAN REAGENT

SUMBER: SLIDE DIR P2PML KEMENKES

 Cobas 6800/8800

https://diagnostics.roche.com/id/en_us/products_and_solutions/molecular-lab/cobas-6800-8800-systems.html
First line screening assay: E gene
assay Confirmatory assay: RdRp gene
assay Additional confirmatory assay: N gene assay
Genome SARS COV-2
Perbandingan alat dx Covid
 GENE-XPERT COVID-19
Prinsip kerja Real-time PCR
Menggunakan kartrid sekali pakai yang digunakan pada
alat GeneXpert
Diimplementasikan di Indonesia sebagai alat diagnosis
TB/TB RO sejak 2012 sesuai rekomendasi WHO.
Selain TB, alat TCM dapat dipergunakan sebagai alat
diagnosis HIV, HepC, dll.

Closed-system
Seluruh proses ekstraksi RNA/DNA dan
amplifikasi terjadi di dalam katrid
Tahapan pengolahan spesimen relatif mudah,
sehingga pelatihan teknis mudah
Hasil cepat (TB ~2 jam), sehingga pasien dapat
segera diobati
 Rapid Test Covid-19

 mendeteksi antibodi (IgM dan IgG) atau

Antigen SARS-CoV-2
 Sampel: whole blood, serum, plasma
untuk
Antibodi sedangkan untuk antigen
menggunakan swab Nasopharinx
 metode lateral flow imunokromatografi
 Hasil cepat (2-10 mnt)  manajemen
pasien lebih cepat dan sederhana
 Hasil positif rapid test harus dikonfirmasi
10/26/2020
lagi dengan pemeriksaan PCR 13
RAPID TEST COVID-19
 INTERPRETASI HASIL PCR DAN RAPID TEST
HASIL PCR HASIL IgM HASIL IgG INTERPRETASI KLINIK
POSITIF POSITIF POSITIF FASE INFEKSI AKTIF DENGAN KEKEBALAN TERTENTU

POSITIF POSITIF NEGATIF EARLY STAGE OF INFECTION DENGAN TANPA IgG ANTIBODI ATAU KONSENTRASI
RENDAH IgG

POSITIF NEGATIF NEGATIF WINDOW PERIODE INFECTION DENGAN TANPA ANTIBODI IgM DAN IgG

POSITIF NEGATIF POSITIF FASE INFEKSI LAMPAU DIMANA VIRUS BELUM CLEARENCE ATAU INFEKSI
REKURENS

NEGATIF POSITIF POSITIF 1. VIRUS TELAH DIBERSIHKAN DAN PASIEN DALAM MASA PEMULIHAN, TAPI
ANTIBODI IgM DAN IgG HARUS DIOBSERVASI BERULANG
2. HASIL PCR FALSE NEGATIF, DIMINTA UNTUK DETEKSI BERULANG ASAM
NUKLEAT DAN ANTIBODINYA

NEGATIF POSITIF NEGATIF MUNGKIN MASIH DALAM FASE INKUBASI INFEKSI, DIKEHENDAKI PEMERIKSAAN
ULANG PCR DAN ANTIBODI IgM DAN IgG, MUNGKIN PCR FALSE NEGATIF

NEGATIF NEGATIF POSITIF INI BUKTI INFEKSI SEBELUMNYA ATAU VIRUS SUDAH TAK ADA LAGI DIMANA
PASIEN DALAM MASA PEMULIHAN ATAU SUDAH SEMBUH
IgG MASIH TETAP ADA UNTUK WAKTU YANG LAMA DALAM TUBUH PASIEN

NEGATIF NEGATIF NEGATIF TAK ADA INFEKSI ATAU MUNGKIN DI MASA PERIODE INKUBASI INFEKSI, TETAP
DIKEHENDAKI PEMERIKSAAN ASAM NUKLEAT DAN ANTIBODI BILA ADA INDIKASI
 Kesimpulan

• Pandemi Covid-19 disebabkan SARS-CoV-2, dan

virus ini mudah mengalami mutasi
• Perlu perhatian dalam menginterpretasi hasil
Rapid test Ab  false positive/false negative
• Interpretasi kombinasi antibodi dan molekuler
bisa saling melengkapi
Arigatou Gozaimasu