Pengenalan jenis HIV, kelompok dan subtipe

HIV adalah virus yang sangat bervariasi bermutasi sangat cepat. Ini berarti
ada banyak jenis HIV, bahkan dalam tubuh satu orang yang terinfeksi.

Didasarkan pada kesamaan genetik, sejumlah strain virus dapat
diklasifikasikan ke dalam jenis, kelompok dan subtipe.

Apa perbedaan antara HIV-1 dan HIV-2?

Ada dua jenis HIV: HIV-1 dan HIV-2. Kedua jenis tersebut ditularkan
melalui hubungan seksual, melalui darah, dan dari ibu ke anak, dan
mereka tampak secara klinis tidak dapat dibedakan menyebabkan AIDS.
Namun, tampaknya bahwa HIV-2 kurang mudah menular, dan periode
antara infeksi awal dan penyakit yang lebih lama dalam kasus HIV-2.

Seluruh dunia, virus yang utama adalah HIV-1, dan umumnya ketika
orang-orang merujuk kepada HIV tanpa menentukan jenis virus mereka
akan mengacu pada HIV-1. Yang relatif jarang HIV-2 jenis terkonsentrasi
di Afrika Barat dan jarang ditemukan di tempat lain.

Berapa banyak subtipe HIV-1 yang ada?

Galur HIV-1 dapat diklasifikasikan ke dalam empat kelompok: "besar"
kelompok F, yang "outlier" Hai kelompok dan dua kelompok baru, N dan P.
empat kelompok ini dapat mewakili empat perkenalan terpisah dari monyet
immunodeficiency virus ke manusia.


Tingkat yang berbeda klasifikasi HIV.
Kelompok O tampaknya dibatasi ke barat-tengah Afrika dan kelompok N -
sebuah ketegangan yang ditemukan pada tahun 1998 di Kamerun - adalah
sangat jarang. Pada tahun 2009 galur baru yang berkaitan erat dengan
monyet gorila immunodeficiency virus ditemukan di Kamerun wanita. Saat
itu ditunjuk HIV-1 grup P.1 Lebih dari 90% dari infeksi HIV-1 termasuk HIV-
1 grup M dan, kecuali ditentukan, maka sisa halaman ini akan
berhubungan dengan HIV-1 grup M saja.

Dalam kelompok M ada diketahui setidaknya sembilan subtipe genetis
yang berbeda (atau clades) HIV-1. Ini adalah subtipe A, B, C, D, F, G, H, J
dan K.

Kadang-kadang, dua subtipe virus yang berbeda dapat bertemu di sel
orang yang terinfeksi dan bersama-sama mereka mencampur bahan
genetik untuk menciptakan hibrida baru virus (proses yang sama dengan
reproduksi seksual, dan kadang-kadang disebut "viral seks") .2 Banyak
dari baru strain tidak bertahan lama, namun orang-orang yang menginfeksi
lebih dari satu orang yang dikenal sebagai "bentuk rekombinan beredar"
atau CRFs. Sebagai contoh, CRF A / B adalah campuran dari subtipe A
dan B.

Klasifikasi HIV ke dalam subtipe dan strain CRFs merupakan masalah
yang kompleks dan definisi dapat berubah sebagai penemuan-penemuan
baru dibuat. Beberapa ilmuwan berbicara tentang subtipe A1, A2, A3, F1
dan F2, bukan A dan F, meskipun orang lain menganggap mantan sebagai
sub-subtipe.

Bagaimana dengan subtipe E dan aku?

Salah satu CRFs disebut A / E karena diperkirakan hasil dari hibridisasi
antara subtipe A dan beberapa lainnya "orang tua" subtipe E. Namun, tak
seorang pun pernah menemukan sebuah bentuk murni subtipe E.
membingungkan, banyak orang masih mengacu ke CRF A / E sebagai
"subtipe E" (sebenarnya itu yang paling benar disebut CRF01_AE) .3

Sebuah virus terisolasi di Siprus pada awalnya ditempatkan di subtipe
baru saya, sebelum direklasifikasi sebagai bentuk rekombinan A / G / I.
Sekarang berpikir bahwa virus ini mewakili lebih kompleks CRF terdiri dari
subtipe A, G, H, K dan unclassified daerah. Penunjukan "Aku" tidak lagi
used.4

Mana subtipe yang berbeda dan CRFs ditemukan?

HIV-1 subtipe dan CRFs sangat tidak merata di seluruh dunia, dengan
yang paling luas subtipe A dan C.

Subtipe A dan CRF A / G mendominasi di Afrika Tengah dan Barat,
dengan subtipe A mungkin juga menyebabkan banyak dari epidemic.5
Rusia
Secara historis, subtipe B telah subtipe yang paling umum / CRF di Eropa,
Amerika, Jepang dan Australia. Meskipun hal ini tetap terjadi, subtipe lain
menjadi lebih sering dan sekarang account untuk sekurang-kurangnya
25% dari infeksi HIV baru di Eropa.
Subtipe C berkuasa di Afrika Selatan dan Timur, India dan Nepal. Ini telah
menyebabkan terburuk di dunia epidemi HIV dan bertanggung jawab untuk
sekitar setengah dari semua infeksi.
Subtipe D umumnya terbatas Timur Tengah dan Afrika. CRF A / E adalah
lazim di Asia Tenggara, tetapi berasal dari Afrika Tengah. Subtipe F telah
ditemukan di Afrika Tengah, Amerika Selatan dan Eropa Timur. Subtipe G
dan CRF A / G telah diamati di Barat dan Afrika Timur dan Eropa Tengah.
Subtipe H hanya ditemukan di Afrika Tengah; J hanya di Amerika Tengah,
dan K hanya di Republik Demokratik Kongo dan Kamerun.
Subtipe lebih mungkin untuk "muncul"?

Hampir dapat dipastikan bahwa subtipe genetis HIV baru dan CRFs akan
ditemukan di masa depan, dan memang yang baru akan berkembang
sebagaimana virus rekombinasi dan mutasi terus terjadi. Subtipe saat ini
dan CRFs juga akan terus menyebar ke daerah-daerah baru sebagai
epidemi global terus berlanjut.

Implikasi dari variabilitas

Apakah subtipe mempengaruhi perkembangan penyakit?

Sebuah studi yang disajikan pada tahun 2006 menemukan bahwa Uganda
yang terinfeksi dengan subtipe D atau menggabungkan strain subtipe
rekombinan D dikembangkan AIDS lebih cepat dari mereka yang terinfeksi
dengan subtipe A, dan juga meninggal lebih cepat, jika mereka tidak
menerima ART. Para penulis penelitian menunjukkan bahwa subtipe D
adalah lebih ganas karena lebih efektif dalam mengikat untuk kekebalan
cells.6 Hasil ini didukung oleh penelitian lain yang dipresentasikan pada
tahun 2007, yang menemukan bahwa wanita Kenya terinfeksi subtipe D
memiliki lebih dari dua kali lipat risiko kematian lebih dari enam tahun
dibandingkan dengan mereka yang terinfeksi subtipe A.7 Sebuah studi
sebelumnya pekerja seks di Senegal, yang diterbitkan pada tahun 1999,
menemukan bahwa wanita yang terinfeksi subtipe C, D atau G lebih
cenderung berkembang menjadi AIDS dalam lima tahun menderita infeksi
daripada mereka yang terinfeksi dengan subtipe A.8

Beberapa studi yang dilakukan di Thailand menunjukkan bahwa orang
yang terinfeksi CRF A / E kemajuan lebih cepat menjadi AIDS dan
kematian daripada mereka terinfeksi subtipe B, jika mereka tidak
menerima antiretroviral treatment.9

Apakah ada perbedaan dalam transmisi?

Telah mengamati bahwa subtipe tertentu / CRFs sebagian besar adalah
berkaitan dengan cara penularan tertentu. Secara khusus, subtipe B
kebanyakan ditularkan oleh kontak homoseksual dan penggunaan
narkoba suntikan (pada intinya melalui darah), sedangkan subtipe C dan
CRF A / E cenderung untuk bahan bakar epidemi heteroseksual (melalui
rute mukosa).

Apakah ada penyebab biologis diamati perbedaan dalam rute transmisi
tetap menjadi subyek perdebatan. Beberapa ilmuwan, seperti Dr Max
Essex dari Harvard, percaya bahwa penyebab tersebut memang ada. Di
antara tuntutan mereka adalah bahwa subtipe C dan CRF A / E adalah
jauh lebih efisien ditularkan selama hubungan seks heteroseksual dari
subtipe B.10 11 Namun, teori ini belum konklusif proven.12 13

Kajian yang lebih mutakhir telah mencari variasi antara subtipe di tingkat
ibu-ke-anak transmisi. Salah satu ini menemukan bahwa transmisi
tersebut lebih sering terjadi dengan subtipe D daripada subtipe lain A.14
mencapai kesimpulan yang berlawanan (yang lebih buruk dari D), dan juga
menemukan bahwa subtipe C lebih sering ditularkan bahwa ketiga D.15
subtipe studi menyimpulkan bahwa C subtipe lebih menular daripada A.16
D atau peneliti lain tidak menemukan hubungan antara sub-tipe dan
tingkat dari ibu-ke-anak transmission.17 18 19 20

Apakah mungkin untuk bisa ketularan lebih dari sekali?

Sampai sekitar tahun 1994, secara umum berpikir bahwa individu tidak
terinfeksi dengan beberapa yang berbeda strain HIV-1. Sejak itu, banyak
kasus orang koinfeksi dengan dua atau lebih strain telah
didokumentasikan.

Semua kasus koinfeksi sekali diasumsikan sebagai hasil dari orang-orang
yang terkena strain yang berbeda kurang lebih secara bersamaan,
sebelum sistem kekebalan mereka punya kesempatan untuk bereaksi.
Namun, sekarang berpikir bahwa "superinfection" juga terjadi. Dalam
kasus ini, infeksi kedua terjadi beberapa bulan setelah yang pertama.
Akan tampak bahwa kekebalan tubuh terhadap virus pertama kadang-
kadang tidak cukup untuk mencegah infeksi dengan regangan kedua,
terutama dengan milik virus subtipe yang berbeda. Ini belum diketahui
bagaimana superinfection umum terjadi, atau apakah hal itu dapat terjadi
hanya dalam khusus circumstances.21 22

Apakah tes antibodi HIV mendeteksi semua jenis, kelompok dan subtipe?

Tes awal HIV biasanya dilakukan dengan menggunakan AMDAL (atau
ELISA) tes antibodi atau tes antibodi yang cepat.

EIA tes yang dapat mendeteksi salah satu atau kedua jenis HIV telah
tersedia selama beberapa tahun. Menurut US Centers for Disease Control
and Prevention, saat ini HIV-1 EIAs "dapat secara akurat mengidentifikasi
infeksi dengan hampir semua non-B subtipe dan banyak kelompok O
infeksi dengan HIV subtipe." 23 Akan tetapi, karena HIV-2 dan grup O
infeksi sangat jarang terjadi di banyak negara, program skrining rutin
mungkin tidak dirancang untuk menguji mereka. Siapa saja yang percaya
mereka mungkin telah tertular HIV-2, HIV-1 grup O atau salah satu subtipe
jarang kelompok M harus mencari nasihat ahli.

Tes cepat - yang dapat menghasilkan hasil dalam waktu kurang dari satu
jam - menjadi semakin populer. Cepat paling modern tes HIV-1 mampu
mendeteksi semua subtipe utama kelompok Rapid M.24 tes yang dapat
mendeteksi HIV-2 sekarang juga available.25

Apa implikasi pengobatan?

Meskipun sebagian besar HIV-1 saat ini obat antiretroviral dirancang untuk
digunakan terhadap subtipe B, tidak ada bukti kuat bahwa mereka kurang
efektif terhadap subtipe lainnya. Namun demikian, beberapa subtipe
mungkin lebih cenderung menjadi resisten terhadap obat-obatan tertentu,
dan jenis mutasi yang terkait dengan perlawanan mungkin bervariasi. Ini
adalah topik yang penting untuk penelitian masa depan.

Efektivitas pengobatan HIV-1 dimonitor menggunakan tes viral load. Telah
dibuktikan bahwa beberapa tes seperti itu hanya peka subtipe B dan dapat
menghasilkan meremehkan yang signifikan viral load jika digunakan untuk
memproses jenis lain. Tes terbaru melakukan klaim untuk menghasilkan
hasil yang akurat untuk sebagian besar Grup M subtipe, meskipun tidak
harus untuk Group O. Hal ini penting bahwa pekerja kesehatan dan pasien
sadar akan subtipe / CRF mereka untuk pengujian dan keterbatasan ujian
mereka berlaku.

Tidak semua obat yang dipakai untuk mengobati infeksi HIV-1 adalah
sebagai efektif terhadap HIV-2. Secara khusus, HIV-2 memiliki resistan
terhadap NNRTI alami obat antiretroviral dan karena itu mereka tidak
dianjurkan. Belum ada lisensi FDA-tes viral load HIV-2 dan yang dirancang
untuk HIV-1 yang tidak dapat diandalkan untuk memantau jenis lain.
Sebaliknya, respon terhadap pengobatan dapat dimonitor dengan
mengikuti CD4 jumlah sel dan sistem kekebalan indikator kemerosotan.
Lebih banyak penelitian dan pengalaman klinis diperlukan untuk
menentukan perawatan yang paling efektif untuk HIV 2,26

Apa implikasi untuk vaksin AIDS?

Pengembangan vaksin AIDS dipengaruhi oleh berbagai subtipe virus
maupun oleh berbagai macam populasi manusia yang membutuhkan
perlindungan dan yang berbeda, misalnya, dalam genetik mereka make-up
dan jalur mereka terpapar HIV. Secara khusus, terjadinya superinfection
menunjukkan bahwa respon kekebalan dipicu oleh vaksin untuk mencegah
infeksi oleh salah satu jenis HIV mungkin tidak melindungi terhadap semua
jenis lain. Efektivitas vaksin mungkin berbeda untuk setiap populasi kecuali
beberapa metode inovatif yang dikembangkan penjaga melawan banyak
strain virus.

Tak pelak lagi, berbagai jenis vaksin calon harus diuji terhadap berbagai
strain virus vaksin dalam beberapa percobaan, yang dilakukan di kedua
berpenghasilan tinggi dan negara-negara berkembang.