Alkaloid Benzylisoquinolin
Senyawa yang paling dikenal adalah narkotika morfin sebagai analgesik, kodein sebagai,
papaverine sebagai relaksan otot dan agen antimikroba Sanguinarine dan berberin. Secara
kolektif alkaloid ini terdapat terutama di Papaveraceae, Ranunculaceae, Berberidaceae, dan
Menispermaceae, Papaver somniferum (opium), Eschscholzia californcia, spesies Thalictrum
dan Coptis japonica adalah spesies yang paling sering diteliti. Biosintesis Benzylisoquinolin
pada dasarnya melibatkan kondensasi dua turunan tirosin, dimulai dengan dekarboksilasi dari
tirosin menjadi tiramin atau dari dihidroksiphenilalanin dopamin oleh dekaboksilasi tirosin
(TYDC).
Alkaloid purin .
Alkaloid purin yang berasal dari nukleotida purin. Senyawa yang paling terkenal dari
golongan ini yaitu senyawa theobromine dan kafein. Biosintesis alkaloid purin dimulai
dengan N-metilasi xanthosine pada posisi 7 dengan 7-methylxanthosine synthase (XRS),
yang juga dikenal sebagai xanthosine 7-N-methyltanferaseN-(XMT).
Alkaloid pyrrolizidine
Alkaloid pyrrolizidine diproduksi secara konstitutif pada berbagai tanaman sebagai
pertahanan terhadap hebivor dan sebagai komponen ekologi kimia yang kompleks antara
tanaman dan hewan. Alkaloid ini terdiri dari basis necine dan satu atau lebih asam necic.
Biosintesis Necine dimulai dengan kondensasi spermidine dan menempatkan rescine untuk
membentuk homospermidine oleh homospermidine synthase.